Modulation Agents of Wound Healing in Ocular Surgeries

@#Wound healing is a complex process that includes haemostasis and inflammation, followed by a proliferation period and repair and finally remodelling. Ocular surgeries, particularly in glaucoma cases, aim at minimal fibrosis to preserve the function of trabeculectomy as an alternative pathway for aqueous drainage. Hence, it is important to find an agent to modulate the wound healing process. This review presents compilation of wound modulation agents that have been tested in vitro, in vivo, or clinically on patients undergoing ocular surgeries, particularly for glaucoma. We identified agents into four groups, mostly for glaucoma filtration operations: anti-metabolites, anti-growth factors, mechanical barriers and rho kinases. The effect of these agents is highlighted in this review. In conclusion, despite recognized drawbacks of antimetabolites, they are still regarded as the gold standard and the most efficient treatment as anti-scarring agents use in ocular surgeries. More studies are needed to inquire agents that efficient yet has minimal adverse effects both in short and long term.

Obstacles and Facilitators in Daily Living Activities Among Persons with Spinal Cord Injury: A Systemic Review

@#Introduction: This systematic review aimed to investigate the level of participation, obstacles, and facilitator factors that influence activities of daily living among persons with spinal cord injury (SCI). Methods: A comprehensive search was conducted in four online databases, namely Google Scholar, PubMed, OT Seeker, and Cochrane Library covering the ten-years period from January 2012 to December 2022. Inclusion criteria encompassed original published studies in English focusing on daily activities, work, participation, obstacles, and facilitators in persons with SCI. Non-peer review sources (e.g., abstracts, grey literature, preprints), and studies unrelated to occupational therapy were excluded. The selected studies were assessed for quality using McMaster University Occupational Therapy Evidence-Based Practice critical review form. Results: Out of the 678 articles identified, ten studies were included after the screening, exploring participation in daily living activities, employment, return to work, leisure activities, family tasks, and community mobility among persons with SCI. Obstacles and facilitators influencing participation in activities of daily living were classified using the International Classification of Functioning, Disability, and Health (ICF) framework. This review highlighted that long-term participation is challenging for persons with SCI, affected by obstacles such as body functions, pain, low self-esteem, and environmental and social factors. Conclusion: The findings underscore the importance of adopting a multidisciplinary rehabilitation approach to enhance participation in daily activities for persons with SCI. Occupational therapy plays a significant role in improving participation levels among persons with SCI.

Improving the Waiting Time in Outpatient Clinics Using Lean Approach in Hospital: A Systematic Review

@#Introduction: The use of the lean approach in healthcare has rapidly gained popularity globally, although this approach was more routinely used in the manufacturing sector as opposed to health. Besides, recent studies confirm the suitability of the lean approach applications for improving the quality of medical care. This study aimed to determine the Lean approach’s capacity to improve the waiting time in outpatient clinics in hospitals. Methods: The systematic review approach was employed to help in the research procedures. Search databases used included Ovid, Google scholar, PubMed, MEDLINE, and archive. Besides, search terminologies such as the Lean approach, Hospital-implementation, waiting time, and patient flow were used to help identify sources that best suited the investigation process. Results: The review revealed that the lean approach is suitable for the reduction of waiting times as well as for improving efficiency in the clinic. The outcomes provide a basis for reducing the average waiting time within the hospital. Conclusion: This study recommended that healthcare facilities and departments should take a keen interest in implementing the Lean approaches, as they are crucial for reducing waiting time.

Identification of MicroRNAs Binding Site in the 3’Untranslated Region of Long Non-Coding RNA, MIR497HG: A Bioinformatic Prediction

@#Introduction: Prediction and identification of miRNAs target genes are crucial for understanding the biology of miRNAs. Amidst reported long-coding RNA (lncRNA), the microRNA 195-497 cluster host gene (MIR497HG) regulation is mediated by multiple non-coding RNAs (ncRNAs) such as microRNAs (miRNAs). MIR497HG has been implicated as a tumour suppressor in various cancers. However, the impact of MIR497HG and its derived miRNAs is largely unknown and still needs to be further explored. Employing an experimental approach is often challenging since some lncRNAs are difficult to identify and isolate by the current isolation technique. Thus, bioinformatic tools are introduced to aid these problems. This study sought to search and identify the miRNAs targeting the 3’untranslated region (3’UTR) of MIR497HG. Methods: Here, bioinformatic tools were adopted to identify a unique list of miRNAs that potentially target the 3’UTR of MIR497HG. Results: A total of 57 candidate miRNAs that target the 3’UTR of MIR497HG were extracted using the miRDB. Meanwhile, STarMir predicted 291 miRNAs that potentially target the 3’UTR of MIR497HG. A common list of 36 miRNAs was obtained using the Venny 2.1.0 and further narrowed down using the LogitProb score of StarMir. Finally, a total 4 miRNAs (hsa-miR-3182, hsa-miR-7156-5p, hsa-miR-452-3p and hsa-miR-2117) were identified. The mRNA target of identified miRNAs was identified by TargetScan. Finally, Gene Ontology (GO) and the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis of mRNA target was done using Enrichr. Conclusion: This finding could be useful in understanding the complex interaction between MIR497HG and its regulatory miRNA. In addition, a comparative analysis of computational miRNA-target predictions is provided in this study would potentially lay the foundations for miRNAs to be used for biomarkers in cancer research.

Multiple SNPs Downregulate Gene Expression of Matrix Metallopeptidase 2 in MCF7 Breast Cancer Cells

@#Introduction: On a global scale, breast cancer contributes the highest cancer-related deaths in women due to metastasis which renders the treatments ineffective and non-targeted. The members of Matrix Metallopeptidases, particularly Matrix Metallopeptidase 2 (MMP2), are among the key players in breast cancer metastasis. In most cases, MMP2 was markedly upregulated and linked to poor prognosis. In a previous study, in silico analyses revealed that several coding single nucleotide polymorphisms (SNPs) of MMP2 were shown to reduce gene expression and mRNA stability of MMP2 in Malaysian breast cancer patients. Therefore, to validate the in silico predictions, the objective of this study was to determine the effects of multiple coding SNPs of MMP2 on the gene expression and mRNA stability of MMP2 in breast cancer cells. Methods: In the current study, breast adenocarcinoma MCF7 cells were transfected with MMP2 wild type and variant containing the coding SNPs. After confirmation of transfection by DNA sequencing, the gene expression level of MMP2 was evaluated by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) whereas mRNA stability of MMP2 was determined following treatment with actinomycin D. Results: MMP2 wild type and variant were successfully transfected in MCF7 cells based on sequencing and PCR analysis. It was found that the presence of coding SNPs lowered the gene expression level of MMP2, but not the stability of MMP2 mRNA. Conclusion: This study supports the in silico effects of MMP2 coding SNPs on its gene expression in an in vitro model.

Introgression of bacterial leaf blight (BLB) resistant gene, Xa7 into MARDI elite variety, MR219 by marker assisted backcrossing (MABC) approach / Introdução do gene resistente à ferragem da folha bacteriana (BLB), xa7 na variedade MARDI elite, MR219 por abordagem de backcrossing assistida por marcador (MABC)

Abstract Bacterial leaf blight (BLB) is one of the major rice diseases in Malaysia. This disease causes substantial yield loss as high as 70%. Development of rice varieties which inherited BLB resistant traits is a crucial approach to promote and sustain rice industry in Malaysia. Hence, this study aims were to enhance BLB disease resistant characters of high yielding commercial variety MR219 through backcross breeding approach with supporting tool of marker-assisted selection (MAS). Broad spectrum BLB resistance gene, Xa7 from donor parent IRBB7 were introgressed into the susceptible MR219 (recurrent parent) using two flanking markers ID7 and ID15. At BC3F4, we managed to generate 19 introgressed lines with homozygous Xa7 gene and showed resistant characteristics as donor parent when it was challenged with Xanthomonas oryzae pv. oryzae through artificial inoculation. Recurrent parent MR219 and control variety, MR263 were found to be severely infected by the disease. The improved lines exhibited similar morphological and yield performance characters as to the elite variety, MR219. Two lines, PB-2-107 and PB-2-34 were chosen to be potential lines because of their outstanding performances compared to parent, MR219. This study demonstrates a success story of MAS application in development of improved disease resistance lines of rice against BLB disease.

Resumo A mancha bacteriana das folhas (BLB) é uma das principais doenças do arroz na Malásia. Essa doença causa perdas substanciais de rendimento de até 70%. O desenvolvimento de variedades de arroz que herdaram características de resistência ao BLB é uma abordagem crucial para promover e sustentar a indústria do arroz na Malásia. Portanto, o objetivo deste estudo foi aumentar os caracteres BLB resistentes a doenças da variedade comercial MR219 de alto rendimento por meio de uma abordagem de cruzamento retrocruzamento com ferramenta de apoio de seleção assistida por marcador (MAS). O gene de resistência a BLB de amplo espectro, Xa7 do pai doador IRBB7, foi introgressado no MR219 suscetível (pai recorrente) usando dois marcadores flanqueadores ID7 e ID15. No BC3F4, conseguimos gerar 19 linhagens introgressadas com o gene Xa7 homozigoto e apresentamos características de resistência como genitor doador quando desafiado com Xanthomonas oryzae pv. oryzae por inoculação artificial. O pai recorrente MR219 e a variedade controle, MR263, estavam gravemente infectados pela doença. As linhas melhoradas exibiram características morfológicas e de desempenho de rendimento semelhantes às da variedade elite, MR219. Duas linhas, PB-2-107 e PB-2-34, foram escolhidas como linhas potenciais por causa de seus desempenhos excelentes em comparação com a mãe, MR219. Este estudo demonstra uma história de sucesso de aplicação de MAS no desenvolvimento de linhas de arroz melhoradas com resistência a doenças contra a doença BLB.

Prevalence of parasites in selected captive bird species / Prevalência de parasitas em espécies de pássaros em cativeiro selecionados

Abstract Blood and fecal samples of chukar partridge (Alectoris chukar), albino pheasant (Phasianus colchicus), silver pheasant (Lophura nycthemera), rose-ringed parakeet (Psittacula krameri) and turkeys (Meleagris gallopavo) were analyzed to check parasitic prevalence. To record parasites these five avian species were placed kept in separate cages at Avian Conservation and Research Center, Department of Wildlife an Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Pakistan. 100 fecal and 100 blood samples for each bird species were inspected to analyze internal parasites. During present study, 17 species of endoparasites 14 from fecal samples and three from blood were examined. Two species of ectoparasites i.e. mite Dermanyssus gallinae 42% and fowl ticks Args persicus 41%were studied. Blood parasites included Plasmodium juxtanucleare 50%, Leucoctoyzoon simond having parasitic prevalence 40%, and Aegyptinella pullorum having parasitic prevalence of 40%. Parasitic species recorded from fecal samples included 6 species of nematodes viz. Allodpa suctoria 2%. Syngamus trachea with parasitic prevalence of 60%, Capillaria annulata 37.5%, Ascardia galli 24%, Capillaria anatis 40% and Heterakis gallinarum 28.3%. Similarly, two species of trematodes viz. Prosthogonimus ovatus having parasitic prevalence of 50% and Prosthogonimus macrorchis 21% were also documented from fecal avian samples . Single cestode species Raillietina echinobothrida having parasitic prevalence of 72% and 3 protozoan species i.e. Eimeria maxima having parasitic prevalence of 21%, Giardia lamblia 41% and Histomonas meleagridis 18% were documented during corpological analysis. In our recommendation, proper sanitation, medication and vaccination of bird's enclousres are suggested to avoid parasites.

RESUMO Amostras de sangue e fezes de perdiz chukar (Alectoris chukar), faisão-albino (Phasianus colchicus), faisão-prateado (Lophura nycthemera), periquito-de-rosa (Psittacula krameri) e perus (Meleagris gallopavo) foram analisadas para verificar a prevalência de parasitas. Para registrar os parasitas, essas cinco espécies de aves foram colocadas em gaiolas separadas no Centro de Conservação e Pesquisa de Aves, Departamento de Vida Selvagem e Ecologia, Universidade de Veterinária e Ciências Animais, Lahore, Paquistão. Cem amostras fecais e 100 amostras de sangue para cada espécie de ave foram inspecionadas para analisar os parasitas internos. Durante o presente estudo, foram examinadas 17 espécies de endoparasitas, 14 de amostras fecais e 3 de sangue. Foram estudadas duas espécies de ectoparasitas, ou seja, o ácaro Dermanyssus gallinae 42% e o carrapato aviário Args persicus 41%. Os parasitas sanguíneos incluíram Plasmodium juxtanucleare 50%, Leucoctoyzoon simond com prevalência parasitária de 40% e Aegyptinella pullorum com prevalência parasitária de 40%. As espécies parasitas registradas em amostras fecais incluíram 6 espécies de nematoides viz. Allodpa suctoria 2%, Syngamus traqueia com prevalência parasitária de 60%, Capillaria annulata 37,5%, Ascardia galli 24%, Capillaria anatis 40% e Heterakis gallinarum 28,3%. Da mesma forma, duas espécies de trematódeos viz. Prosthogonimus ovatus com prevalência parasitária de 50% e Prosthogonimus macrorchis 21% também foram documentados em amostras fecais de aves. Espécies de cestoide único Raillietina echinobothrida com prevalência parasitária de 72% e 3 espécies de protozoários, isto é, Eimeria maxima com prevalência parasitária de 21%, Giardia lamblia 41% e Histomonas meleagridis 18% foram documentadas durante a análise corpológica. Em nossa recomendação, o saneamento adequado, medicação e vacinação de invólucros de pássaros são sugeridos para evitar parasitas.

Up-regulation of GINS1 highlighted a good diagnostic and prognostic potential of survival in three different subtypes of human cancer / A regulação positiva de GINS1 destacou um bom potencial diagnóstico e prognóstico de sobrevivência em três subtipos diferentes de câncer humano

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados ​​usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados ​​no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Prediction of soil seed bank of piedmont and alluvial environments of Dera Ghazi Khan, Punjab, Pakistan / Predição do banco de sementes do solo do piemonte e ambientes aluviais de Dera Ghazi Khan, Punjab, Paquistão

Abstract The current focus is on the overall pattern of seed storage present in the fragments of the soil of piedmont and alluvial landscapes of the environment. The present study predicted the seed banks of both soils of alluvial and piedmont zones in different ecological conditions and evaluate the potential of seeds in the restoration of both environments. The composition of the seed bank of soil is mainly affected by the alluvial environment and the structure of cleared area shows that more species of germinating annual grasses and growable seeds with the higher total number. Extant vegetation structures have an important role in the diversity of soil seed reservoirs, whose composition corresponded with the openness of the site. When in situ soil seed bank is recruited, it helps to restore only some components of the plant community in an alluvial environment. In our current research, it was confirmed that seed richness was higher in number at lower elevation (alluvial) than that at high elevation (piedmont). Seed richness showed a significant negative correlation with anions, cations, while significantly positive with altitude that suggests the richness pattern of the overall seed bank of the area is influenced by various environmental factors.

Resumo O foco atual está no padrão geral de armazenamento de sementes presente nos fragmentos de solo do Piemonte e nas paisagens aluviais do meio ambiente. O presente estudo previu os bancos de sementes de ambos os solos das zonas aluvial e piemontesa em diferentes condições ecológicas e avaliou o potencial das sementes na restauração de ambos os ambientes. A composição do banco de sementes do solo é afetada principalmente pelo ambiente aluvial e a estrutura da área desmatada mostra que mais espécies de gramíneas anuais em germinação e sementes cultiváveis ​​apresentam o maior número total. As estruturas da vegetação existente têm um papel importante na diversidade dos reservatórios de sementes do solo, cuja composição correspondeu à abertura do local. Quando o banco de sementes do solo in situ é recrutado, o mesmo ajuda a restaurar apenas alguns componentes da comunidade de plantas em um ambiente aluvial. Em nossa pesquisa atual, foi confirmado que a riqueza de sementes era maior em número em altitudes mais baixas (aluviais) do que em altitudes elevadas (Piemonte). A riqueza de sementes mostrou uma correlação negativa significativa com ânions, cátions, enquanto significativamente positiva com a altitude, o que sugere que o padrão de riqueza do banco geral de sementes da área é influenciado por vários fatores ambientais.

A comparative assessment of air pollutants of smog in wagah border and other sites in Lahore, Pakistan / Uma avaliação comparativa de poluentes do ar do smog na fronteira de wagah e outros sites em Lahore, Paquistão

Abstract Smog has become the fifth season of Pakistan especially in Lahore city. Increased level of air pollutants (primary and secondary) are thought to be responsible for the formation of smog in Lahore. Therefore, the current study was carried out for the evaluation of air pollutants (primary and secondary) of smog in Wagah border particularly and other sites (Jail road, Gulburg) Lahore. For this purpose, baseline data on winter smog from March to December on primary and secondary air pollutants and meteorological parameters was collected from Environmental Protection Department and Pakistan Meteorological Department respectively. Devices being used in both departments for analysis of parameters were also studied. Collected data was further statistically analyzed to determine the correlation of parameters with meteorological conditions and was subjected to air quality index. According to results, PM 10 and PM 2.5 were found very high above the NEQS. NOx concentrations were also high above the permissible limits whereas SO2 and O3 were found below the NEQS thus have no roles in smog formation. Air Quality Index (AQI) of pollutants was PM 2.5(86-227), PM 10 (46-332), NOx (26-110), O3 (19-84) and SO2 (10-95). AQI of PM 2.5 remained between moderate to very unhealthy levels. AQI of PM 10 remained between good to hazardous levels. AQI of NOx remained between good to unhealthy for sensitive groups' levels. AQI of O3 and SO2 remained between good to moderate levels. Pearson correlation showed that every pollutant has a different relation with different or same parameters in different areas. It is concluded from the present study that particulate matter was much more responsible for smog formation. Although NOx also played role in smog formation. So there is need to reduce sources of particulate matter and NOx specifically in order to reduce smog formation in Lahore.

Resumo Smog tornou-se a quinta estação do Paquistão, especialmente na cidade de Lahore. Acredita-se que o aumento do nível de poluentes atmosféricos (primários e secundários) seja responsável pela formação de poluição atmosférica em Lahore. Portanto, o presente estudo foi realizado para a avaliação dos poluentes atmosféricos (primários e secundários) do smog na fronteira de Wagah em particular e em outros locais (Jail road, Gulburg) Lahore. Para este propósito, os dados de referência sobre a poluição atmosférica de inverno de março a dezembro sobre poluentes atmosféricos primários e secundários e parâmetros meteorológicos foram coletados do Departamento de Proteção Ambiental e do Departamento Meteorológico do Paquistão, respectivamente. Dispositivos sendo usados ​​em ambos os departamentos para análise de parâmetros também foram estudados. Os dados coletados foram posteriormente analisados ​​estatisticamente para determinar a correlação dos parâmetros com as condições meteorológicas e foram submetidos ao índice de qualidade do ar. De acordo com os resultados, PM 10 e PM 2,5 foram encontrados muito acima do NEQS. As concentrações de NOx também estavam muito acima dos limites permitidos, enquanto SO2 e O3 foram encontrados abaixo do NEQS, portanto, não têm papéis na formação de smog. O índice de qualidade do ar (AQI) de poluentes foi PM 2,5 (86-227), PM 10 (46-332), NOx (26-110), O3 (19-84) e SO2 (10-95). O AQI de PM 2,5 permaneceu entre níveis moderados a muito prejudiciais à saúde. O AQI de PM 10 permaneceu entre níveis bons e perigosos. AQI de NOx permaneceu entre bom e não saudável para os níveis de grupos sensíveis. O AQI de O3 e SO2 permaneceu entre níveis bons a moderados. A correlação de Pearson mostrou que cada poluente tem uma relação diferente com parâmetros diferentes ou iguais em áreas diferentes. Conclui-se do presente estudo que o material particulado foi muito mais responsável pela formação de smog. Embora o NOx também tenha desempenhado um papel na formação do smog. Portanto, é necessário reduzir as fontes de partículas e NOx, especificamente para reduzir a formação de smog em Lahore.

Drinking water quality of various sources in Peshawar, Mardan, Kohat and Swat districts of Khyber Pakhtunkhwa province, Pakistan / Qualidade de água potável de váris fontes dos distritos de Peshawar, Mardan, Kohat e Swat da província de Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Abstract The present study involves the chemical and bacteriological analysis of water from different sources i.e., bore, wells, bottle, and tap, from Peshawar, Mardan, Swat and Kohat districts of Khyber Pakhtunkhwa (KP) province, Pakistan. From each district, 50 water samples (10 samples from each source), regardless of urban and rural status, were collected from these sources and analysed for sulphates, nitrates, nitrites, chlorides, total soluble solids and coliforms (E. coli). Results indicated that majority of the water sources had unacceptable E. coli count i.e.> 34 CFU/100mL. E. coli positive samples were high in Mardan District, followed by Kohat, Swat and Peshawar district. Besides this, the some water sources were also chemically contaminated by different inorganic fertilizers (nitrates/nitrites of sodium, potassium) but under safe levels whereas agricultural and industrial wastes (chloride and sulphate compounds) were in unsafe range. Among all districts, the water quality was found comparatively more deteriorated in Kohat and Mardan districts than Peshawar and Swat districts. Such chemically and bacteriologically unfit water sources for drinking and can cause human health problems.

Resumo O presente estudo envolve a análise química e bacteriológica de água de diferentes fontes, ou seja, furo, poços, garrafa e torneira, dos distritos de Peshawar, Mardan, Swat e Kohat da província de Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. De cada distrito, 50 amostras de água (10 amostras de cada fonte), independentemente do status urbano e rural, foram coletadas dessas fontes e analisadas para sulfatos, nitratos, nitritos, cloretos, sólidos solúveis totais e coliformes (E. coli). Os resultados indicaram que a maioria das fontes de água tinha uma contagem inaceitável de E. coli, ou seja, > 34 UFC / 100 mL. As amostras positivas para E. coli foram elevadas no distrito de Mardan, seguido por Kohat, Swat e distrito de Peshawar. Além disso, algumas fontes de água também foram contaminadas quimicamente por diferentes fertilizantes inorgânicos (nitratos/nitritos de sódio, potássio), mas em níveis seguros, enquanto os resíduos agrícolas e industriais (compostos de cloreto e sulfato) estavam em níveis inseguros. Entre todos os distritos, a qualidade da água foi considerada comparativamente mais deteriorada nos distritos de Kohat e Mardan do que nos distritos de Peshawar e Swat. Essas fontes de água química e bacteriologicamente impróprias para beber podem causar problemas à saúde humana.

Effects of Se nanoparticles supplementation on growth performance, hematological parameters and nutrient digestibility of Labeo rohita fingerling fed sunflower meal based diet / Efeitos da suplementação de nanopartículas de Se no desempenho de crescimento, parâmetros hematológicos e digestibilidade de nutrientes da dieta baseada em farinha de girassol alimentada com alevinos de Labeo rohita

Abstract The aim of the present study is to assess the effects of selenium nanoparticles on the growth, hematology and nutrients digestibility of Labeorohita fingerlings. Fingerlings were fed with seven isocaloric sunflower meal-based diet supplemented with different concentrations of nanoparticles naming T1 to T7 (0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, and 3 mg/kg), with 5% wet body weight while chromic oxide was used as an indigestible marker. After experimentation for 90 days T3 treated group (1mg/kg -1Se-nano level) showed the best result in hematological parameters (WBC's 7.97 ×103mm-3, RBC's 2.98 ×106 mm-3 and Platelet count 67), nutrient digestibility (crude protein: 74%, ether extract: 76%, gross energy: 70%) and growth performance (weight gain 13.24 g, weight gain% 198, feed conversion ratio 1.5, survival rate 100%) as compared to the other treatment groups. Specific growth rates were found significantly higher in T5 than in other groups. The present study indicated positive effect of 1 mg/kg Se-nanoparticles on growth advancement, hematological parameters, and nutrients digestibility of L. rohita fingerlings.

Resumo O objetivo do presente estudo é avaliar os efeitos das nanopartículas de selênio no crescimento, hematologia e digestibilidade dos nutrientes de alevinos de Labeo rohita. Os alevinos foram alimentados com sete dietas isocalóricas à base de farinha de girassol suplementada com diferentes concentrações de nanopartículas, nomeando T1 a T7 (0, 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5 e 3 mg / kg), com 5% do peso corporal úmido enquanto o óxido crômico foi usado como um marcador indigesto. Após a experimentação por 90 dias, o grupo tratado com T3 (nível 1mg / kg -1Se-nano) mostrou o melhor resultado em parâmetros hematológicos (WBC's 7,97 × 103mm-3, RBC's 2,98 × 106mm-3 e contagem de plaquetas 67), digestibilidade dos nutrientes (proteína bruta: 74%, extrato de éter: 76%, energia bruta: 70%) e desempenho de crescimento (ganho de peso 13,24 g, ganho de peso % 198, taxa de conversão alimentar 1,5, taxa de sobrevivência 100%) em comparação com os outros grupos de tratamento. As taxas de crescimento específicas foram encontradas significativamente mais altas em T5 do que em outros grupos. O presente estudo indicou efeito positivo de 1 mg / kg de nanopartículas de Se no avanço do crescimento, parâmetros hematológicos e digestibilidade de nutrientes de alevinos de L. rohita.

Efficacy of Citrullus colocynthis seed extract on Earias vittella, Fabricius, (Lepidoptera: Noctuidae): environment sustainable approach / Eficácia do extrato de semente de Citrullus colocynthis em Earias vittella Fabricius (Lepidoptera: Noctuidae): abordagem ambiental sustentável

Abstract Earias vittellaFabricius, 1794 (Noctuidae: Lepidoptera) is deliberated to be one of the most destructive pests of cotton and okra vegetation in the world including Asia. The pest has established resistance to various synthetic insecticides. The use of bio-pesticide is one of the unconventional approaches to develop a vigorous ecosystem without harming non- target pests and beneficial natural insect fauna. In the present study, the toxicity levels of Citrullus colocynthis seed extract have been evaluated against the populations of E. vittellaunder standardized laboratory conditions. The toxic effects of C. colocynthis on development periods, protein contents and esterase activity of the life stages of E. vittella were also evaluated. The toxicity levels of methanol, ethanol, hexane, water and profenofos were evaluated on the 1st instar larvae of E. vittella. LC30 and LC80 concentrations exhibited the effectiveness of methanol-based C. colocynthis seed extract against 1st instar larvae of E. vitella. The enhanced larval and pupal periods were revealed in treated samples during the comparison with untreated samples. The intrinsic rate of increase, net reproductive rate in the LC30 and LC80 concentrations exposed larvae remained less than the control treatment. Fecundity, the esterase activity and protein contents were declined in LC30 and LC80 treated samples as compared to the control. The present findings suggest that C. colosynthis extracts based botanical insecticides are beneficial, ecosystem sustainable and can be integrated with insect management programs from environment safety perspective.

Resumo Earias vittella Fabricius, 1794 (Noctuidae: Lepidoptera) é considerada uma das pragas mais destrutivas de algodão e quiabo no mundo, incluindo a Ásia. Essa praga estabeleceu resistência a vários inseticidas sintéticos. O uso de biopesticidas é uma das abordagens não convencionais para desenvolver um ecossistema saudável sem prejudicar as pragas não alvo e a fauna natural benéfica de insetos. No presente estudo, os níveis de toxicidade do extrato de semente de Citrullus colocynthis foram avaliados nas populações de E. vittella em condições de laboratório padronizadas. Os efeitos tóxicos de C. colocynthis nos períodos de desenvolvimento, conteúdo de proteína e atividade esterase das fases de vida de E. vittella também foram avaliados. Os níveis de toxicidade de metanol, etanol, hexano, água e profenofós foram avaliados em larvas de 1º instar de E. vittella. As concentrações de LC30 e LC80 apresentaram eficácia do extrato de sementes de C. colocynthis à base de metanol contra larvas de 1º instar de E. vittella. Os períodos larval e pupal aumentados foram revelados nas amostras tratadas durante a comparação com as amostras não tratadas. A taxa intrínseca de aumento e a taxa reprodutiva líquida nas concentrações de larvas expostas LC30 e LC80 permaneceram menores do que o tratamento controle. A fecundidade, a atividade da esterase e o conteúdo de proteína diminuíram nas amostras tratadas com LC30 e LC80 em comparação com o controle. As presentes descobertas sugerem que os extratos de C. colocynthis à base de inseticidas botânicos são benéficos, sustentáveis ​​para o ecossistema e podem ser integrados com programas de manejo de insetos do ponto de vista da segurança ambiental.

Effects of Solanum lycopersicum L. (tomato) against isoniazid and rifampicin induced hepatotoxicity in wistar albino rats / Efeitos de Solanum lycopersicum L. (tomate) contra hepatotoxicidade induzida por isoniazida e rifampicina em ratos albinos wistar

Anti-tuberculosis drugs are reported to cause hepatotoxicity, which varies from asymptomatic rise of the hepatic enzymes. Hepatoprotective plants plays important role to protect liver. This study investigated the hepatoprotective potential of the Solanum lycopersicum in rats intoxicated with Isoniazid and Rifampicin (INH+RIF) to induce hepatotoxicity. Thirty wistar albino rats were divided into five groups of six animals each. Group 1 rats were kept control while groups II, III, IV and V were administered with INH+RIF (75+150 mg/kg) orally, for seven consecutive days. For treatment, rats in group III received silymarin while animals in group IV and V were provided with 40 mg/kg and 80 mg/kg of Solanum lycopersicum extract, respectively. On day 0 and 8th blood samples were collected for the analysis of hepatic biomarkers. The data were subjected to one-way ANOVA and Bonferroni's post hoc test for statistical analysis. Hepatotoxicity induced by INH+RIF resulted in significant elevation of serum hepatic enzymes including Aspartate aminotransferase (AST), Alanine aminotransferase (ALT), Alkaline phosphatase (ALP), and total bilirubin while decreased the albumin level. The Solanum lycopersicum at dose of 80 mg/kg significantly reduced the hepatic enzymes AST, ALT, ALP and bilirubin while the albumin level was significantly increased. The treatment had non-significant effect on body and liver weight. Drug induced hepatotoxicity can be effectively treated with Solanum lycopersicum at 80 mg/kg dose.

As drogas antituberculose são relatadas como causadoras de hepatotoxicidade, ocasionando o aumento assintomático das enzimas hepáticas. As plantas hepatoprotetoras desempenham um papel importante na proteção do fígado. Este estudo investigou o potencial hepatoprotetor de Solanum lycopersicum em ratos que foram intoxicados com isoniazida e rifampicina (INH + RIF) para induzir hepatotoxicidade. Trinta ratos wistar albinos foram divididos em cinco grupos de seis animais cada. Os ratos do grupo 1 representaram o grupo controle, enquanto os ratos dos grupos II, III, IV e V receberam INH + RIF (75 + 150 mg/kg) por via oral, por sete dias consecutivos. Para o tratamento, os ratos do grupo III receberam silimarina, enquanto os animais do grupo IV e V receberam 40 mg/kg e 80 mg/kg de extrato de S. lycopersicum, respectivamente. Nos dias 0 e 8, foram coletadas amostras de sangue para análise de biomarcadores hepáticos. Os dados foram submetidos a teste unilateral (ANOVA) e post hoc de Bonferroni para análise estatística. A hepatotoxicidade induzida por INH + RIF resultou em elevação significativa das enzimas hepáticas séricas, incluindo aspartato aminotransferase (AST), alanina aminotransferase (ALT), fosfatase alcalina (ALP) e bilirrubina total, enquanto houve a diminuição do nível de albumina. O S. lycopersicum, na dose de 80 mg / kg, reduziu significativamente as enzimas hepáticas AST, ALT, ALP e bilirrubina, enquanto o nível de albumina aumentou de forma significativa. O tratamento não teve efeito significativo no peso corporal e hepático. A hepatotoxicidade induzida por drogas pode ser tratada de forma eficaz com S. lycopersicum na dose de 80 mg/kg.

Mutations in the bone morphogenetic protein 15 gene causing defective protein secretion in Cholistani infertile sheep / Mutações no gene da proteína morfogenética óssea 15 causadoras de defeitos na secreção proteica em ovelhas inférteis Cholistani

Naturally occurring mutations in morphogenetic protein 15 (BMP15) are associated with decreased ovulation rate (OR), litter size (LS), and sterility. It is of a great interest to elucidate BMP15 gene in Cholistani sheep breed to uplift socio-economic status and the knowledge of Cholistani sheep breeding in Southern Punjab, Pakistan. In our study, a total of 50 infertile Cholistani sheep aged between 2-6 years and having no blood relation were screened for BMP15 mutations. For this purpose, a high-quality DNA was extracted from the blood of sheep followed by primer designing, Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification, DNA sequencing, and in silico analyses. Out of total 50 samples, 9 samples including case 1 (T3), case 2 (T8), case 3 (T17), case 4 (T22), case 5 (T25), case 6 (T33), case 7 (T40), case 8 (T44), and case 9 (T47) were found positive for a variety of already reported and novel BMP15 mutations. Further in silico analyses of the observed mutations have shown the functional impact of these mutations on different characteristics (molecular weight, theoretical PI, estimated half-life, instability index, sub-cellular localization, and 3D confirmation) of the encoded proteins, possibly altering the normal functionality. In a nutshell, findings of this study have confirmed the possible essential role of the BMP15 mutations in the infertility of the Cholistani sheep.

Mutações de ocorrência natural na proteína morfogenética 15 (BMP15) estão associadas à diminuição da taxa de ovulação (TO), tamanho da ninhada (TN) e esterilidade. Estudar a BMP15 na raça Cholistani para elevar o status socioeconômico e o conhecimento da criação de ovinos Cholistani no sul de Punjab, Paquistão. Em nosso estudo, 50 ovelhas Cholistani inférteis sem parentesco sanguíneo foram rastreadas para mutações BMP15. Para tanto, um DNA de alta qualidade foi extraído do sangue dessas ovelhas, seguido de concepção do primer, amplificação da reação em cadeia da polimerase (PCR), sequenciamento de DNA e análises in silico. Do total de 50 amostras, 9, incluindo caso 1 (T3), caso 2 (T8), caso 3 (T17), caso 4 (T22), caso 5 (T25), caso 6 (T33), caso 7 (T40), caso 8 (T44) e caso 9 (T47), foram consideradas positivas para uma variedade de mutações BMP15 novas e já relatadas. Mais análises in silico das mutações observadas mostraram o impacto funcional dessas mutações em diferentes características (peso molecular, PI teórico, meia-vida estimada, índice de instabilidade, localização subcelular e confirmação 3D) das proteínas codificadas, possivelmente alterando a funcionalidade normal. Nossos achados confirmaram o possível papel essencial das mutações BMP15 na infertilidade de ovelhas Cholistani.

Variations in soil physico-chemical properties, soil stocks, and soil stoichiometry under different soil layers, the major forest region Liupan Mountains of Northwest China / Variações nas propriedades físico-químicas do solo, estoques e estequiometria do solo sob diferentes camadas de solo, a principal região florestal das montanhas Liupan do noroeste da China

Liupan Mountains are an important region in China in the context of forest cover and vegetation due to huge afforestation and plantation practices, which brought changes in soil physio-chemical properties, soil stocks, and soil stoichiometries are rarely been understood. The study aims to explore the distribution of soil nutrients at 1-m soil depth in the plantation forest region. The soil samples at five depth increments (0-20, 20-40, 40-60, 60-80, and 80-100 cm) were collected and analyzed for different soil physio-chemical characteristics. The results showed a significant variation in soil bulk density (BD), soil porosity, pH, cation exchange capacity (CEC), and electric conductivity (EC) values. More soil BD (1.41 g cm-3) and pH (6.97) were noticed in the deep soil layer (80-100 cm), while the highest values of porosity (60.6%), EC (0.09 mS cm-1), and CEC (32.9 c mol kg-1) were reflected in the uppermost soil layer (0-20 cm). Similarly, the highest contents of soil organic carbon (SOC), total phosphorus (TP), available phosphorus (AP), total nitrogen (TN), and available potassium (AK) were calculated in the surface soil layer (0-20 cm). With increasing soil depth increment a decreasing trend in the SOC and other nutrient concentration were found, whereas the soil total potassium (TK) produced a negative correlation with soil layer depth. The entire results produced the distribution of SOCs and TNs (stocks) at various soil depths in forestland patterns were 0→20cm > 20→40cm > 40→60cm ≥ 60→80cm ≥ 80→100 cm. Furthermore, the stoichiometric ratios of C, N, and P, the C/P, and N/P ratios showed maximum values (66.49 and 5.46) in 0-20 cm and lowest values (23.78 and 1.91) in 80-100 cm soil layer depth. Though the C/N ratio was statistically similar across the whole soil profile (0-100 cm). These results highlighted that the soil depth increments might largely be attributed to fluctuations in soil physio-chemical properties, soil stocks, and soil stoichiometries. Further study is needed to draw more conclusions on nutrient dynamics, soil stocks, and soil stoichiometry in these forests.

As montanhas de Liupan são uma região importante na China no contexto de cobertura florestal e vegetação devido às enormes práticas de florestamento e plantação, que trouxeram mudanças nas propriedades físico-químicas do solo, e estoques e estequiometrias do solo raramente são compreendidos. O estudo visa explorar a distribuição de nutrientes do solo a 1 m de profundidade do solo na região da floresta plantada. As amostras de solo em cinco incrementos de profundidade (0-20, 20-40, 40-60, 60-80 e 80-100 cm) foram coletadas e analisadas para diferentes características físico-químicas do solo. Os resultados mostraram uma variação significativa nos valores de densidade do solo (BD), porosidade do solo, pH, capacidade de troca catiônica (CEC) e condutividade elétrica (CE). Mais DB do solo (1,41 g cm-3) e pH (6,97) do solo foram observados na camada profunda do solo (80-100 cm), enquanto os maiores valores de porosidade (60,6%), CE (0,09 mS cm-1) e CEC (32,9 c mol kg-1) foram refletidos na camada superior do solo (0-20 cm). Da mesma forma, os maiores teores de carbono orgânico do solo (SOC), fósforo total (TP), fósforo disponível (AP), nitrogênio total (TN) e potássio disponível (AK) foram calculados na camada superficial do solo (0-20 cm). Com o aumento do incremento da profundidade do solo, uma tendência decrescente no SOC e na concentração de outros nutrientes foi encontrada, enquanto o potássio total do solo (TK) produziu uma correlação negativa com a profundidade da camada do solo. Todos os resultados produziram a distribuição de SOCs e TNs (estoques) em várias profundidades de solo em padrões de floresta 0 → 20cm> 20 → 40cm> 40 → 60cm ≥ 60 → 80cm ≥ 80 → 100 cm. Além disso, as relações estequiométricas de C, N e P, as relações C / P e N / P, apresentaram valores máximos (66,49 e 5,46) em 0-20 cm, e valores mais baixos (23,78 e 1,91) em solo de 80-100 cm profundidade da camada. Embora a relação C / N fosse estatisticamente semelhante em todo o perfil do solo (0-100 cm). Esses resultados destacaram que os incrementos de profundidade do solo podem ser amplamente atribuídos a flutuações nas propriedades físico-químicas do solo, estoques e estequiometrias do solo. Mais estudos são necessários para tirar conclusões adicionais sobre a dinâmica dos nutrientes, estoques de solo e estequiometria do solo nessas florestas.

Distribution and diversity of aquatic insects in different water bodies of Qatar / Distribuição e diversidade de insetos aquáticos em diferentes corpos de água do Catar

Aquatic insect fauna remains an important tool for bio indication of environmental disturbance, while maintaining a healthy aquatic system. The purpose of the study was to document and to identify the diversity and distribution patterns of aquatic insect, a highly ignored aspect from the Qatar. Following the standard procedures, the samples were collected from aquatic habitats during the period October 2015 to May 2017 on monthly basis. A total of 11,287 individuals, belonging to 6 orders were captured. Dipterans were the abundant with the percentages of 71.01 (n=8,015), while the lowest percentage was observed for Coleoptera 0.04 (n=05). Twelve insects families were identified, among these five were reported under Diptera, followed by Hemiptera (03), while Coleoptera, Tricoptera, Odonata, and Ephemeroptera were represented by single families. Among the selected localities, Dipterans were collected from 10 stations, followed by Hemiptera (9), Coleoptera (4), Odonota (4), Ephemeroptera (3) and Trichoptera (1) respectively. Among the water bodies samples, streams were the most preferred habitats (n=2,767), while drinking water pools were the least (27). Moreover, the highest Simpson diversity index of 1.48 and lowest of 0.47 was recorded for flooded sewage pool and plastic containers respectively, while the low evenness values were observed for ponds, and less than 1 Margalef's diversity values were seen for all habitats. This study documents the patterns of the diversity and distribution of aquatic insects, and provides a baseline for the future studies from Qatar.

A fauna aquática de insetos continua sendo uma ferramenta importante para a bioindicação de distúrbios ambientais, ao mesmo tempo em que mantém um sistema aquático saudável. O objetivo do estudo foi documentar e identificar a diversidade e os padrões de distribuição dos insetos aquáticos, um aspecto altamente ignorado no Catar. Seguindo os procedimentos padrão, as amostras foram coletadas em hábitats aquáticos durante o período de outubro de 2015 a maio de 2017, mensalmente. Um total de 11.287 indivíduos, pertencentes a seis ordens, foram capturados. Dípteros foram os mais abundantes, com as porcentagens de 71,01 (n = 8.015), enquanto a menor porcentagem foi observada para Coleópteros 0,04 (n = 05). Doze famílias de insetos foram identificadas, destas, cinco foram registradas sob Diptera, seguido por Hemiptera (03), enquanto Coleoptera, Tricoptera, Odonata e Ephemeroptera foram representados por famílias únicas. Dentre as localidades selecionadas, Dipterans foram coletados em 10 estações, seguidos por Hemiptera (9), Coleoptera (4), Odonota (4), Ephemeroptera (3) e Trichoptera (1), respectivamente. Entre as amostras de corpos d'água, os riachos foram os hábitats mais preferidos (n = 2.767), enquanto as piscinas de água potável foram os menos (27). Além disso, o maior índice de diversidade de Simpson de 1,48 e o menor de 0,47 foi registrado para piscina de esgoto inundada e recipientes de plástico, respectivamente, enquanto os valores de baixa uniformidade foram observados para lagoas e menos de 1 valores de diversidade de Margalef foram observados para todos os hábitats. Este estudo documenta os padrões de diversidade e distribuição de insetos aquáticos e fornece uma linha de base para os estudos futuros do Catar.

Biodiversity, distributions and isolation of microplastics pollution in finfish species in the Panjkora River at Lower and Upper Dir districts of Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan / Biodiversidade, distribuição e isolamento de poluições por microplásticos em espécies de peixes no rio Panjkora nos distritos de Lower e Upper Dir da província de Khyber Pakhtunkhwa do Paquistão

The basic aim of this study was aimed to determine the ichthyofaunal diversity of River Panjkora in both upper and lower Dir districts in Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan.Fish samples were collected by using fishnets from March to September 2020. A total of 724 specimens were collected and classified into 5 families, 14 genera, and 18 species. The overall results revealed that most fish fauna of river Panjkora contains 8 species of family Cyprinidae (56.49%) followed by 4 species of Nemacheilidae (24.44%), 2 species of Channidae (10.63%), and Sisoridae (7.04%), and 1 species of Mastacembelidae (1.38%), respectively. Among all kinds of fish species, Schizothorax plagiostomus (16.57%) was highly dominated and followed by Carassius auratus (11.87%) and Racoma labiata (9.66%) and were reported as highly abundant, especially during April, May, and June. The least abundant species were Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii, and Mastacembelus armatus, that constituting 2.48%, 2.20%, and 1.38% of the total fish samples. The Overall Simpson's diversity (1-D= 0.919) and Simpson's Reciprocal index values (1/D= 12.3876), and Shannon's index (H= 2.68) were indicating that river Panjkora contains a quite rich and diverse group of fish species. The highest microplastics observed in site 7 compared to other study area. Conservation steps should be taken as a top priority to protect and conserve the marine environment and natural heritage from further loss, extinction and stop or minimize losses incurred through irresponsible fishery practices

O objetivo básico deste estudo foi determinar a diversidade ictiofaunística do rio Panjkora nos distritos de Lower e Upper de Dir, na província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Amostras de peixes foram coletadas com redes de arrasto de março a setembro de 2020. Foram coletados 724 espécimes, classificados em 5 famílias, 14 gêneros e 18 espécies. Os resultados gerais revelaram que a maioria da ictiofauna do rio Panjkora contém 8 espécies da família Cyprinidae (56,49%), seguidas por 4 espécies de Nemacheilidae (24,44%), 2 espécies de Channidae (10,63%) e Sisoridae (7,04%) e 1 espécie de Mastacembelidae (1,38%). Entre todas as espécies de peixes, Schizothorax plagiostomus (16,57%) foi altamente predominante, seguida por Carassius auratus (11,87%) e Racoma labiata (9,66%), e elas foram relatadas como altamente abundantes, especialmente nos meses de abril, maio e junho. As espécies menos abundantes foram Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii e Mastacembelus armatus, que constituíram 2,48%, 2,20% e 1,38%, respectivamente, do total de peixes amostrados. O índice de diversidade de Simpson (1-D = 0,919), o índice recíproco de Simpson (1/D = 12,3876) e o índice de Shannon (H = 2,68) indicaram que o rio Panjkora contém um grupo bastante rico e diversificado de espécies de peixes. Os microplásticos mais altos foram observados no local 7 em comparação com outra área de estudo. Medidas de conservação devem ser tomadas como prioridade máxima para proteger e conservar o ambiente marinho e o patrimônio natural de novas perdas e extinção e para parar ou minimizar as perdas ocorridas por práticas de pesca irresponsáveis.

Genomic characterization of Puccinia triticina using molecular marker technology / Caracterização genômica de Puccinia triticina usando tecnologia de marcadores moleculares

Leaf rust, caused by Puccinia triticina, is the most common rust disease of wheat. The fungus is an obligate parasite capable of producing infectious urediniospores. To study the genetic structure of the leaf rust population 20 RAPD primers were evaluated on 15 isolates samples collected in Pakistan. A total of 105 RAPD fragments were amplified with an average of 7 fragments per primer. The number of amplified fragments varied from 1 to 12. GL Decamer L-07 and GL Decamer L-01 amplified the highest number of bands (twelve) and primer GL Decamer A-03 amplified the lowest number of bands i.e one. Results showed that almost all investigated isolates were genetically different that confirms high genetic diversity within the leaf rust population. Rust spores can follow the migration pattern in short and long distances to neighbor areas. Results indicated that the greatest variability was revealed by 74.9% of genetic differentiation within leaf rust populations. These results suggested that each population was not completely identical and high gene flow has occurred among the leaf rust population of different areas. The highest differentiation and genetic distance among the Pakistani leaf rust populations were detected between the leaf rust population in NARC isolate (NARC-4) and AARI-11and the highest similarity was observed between NARC isolates (NARC-4) and (NARC-5). The present study showed the leaf rust population in Pakistan is highly dynamic and variable.

A ferrugem da folha, causada por Puccinia triticina, é a ferrugem mais comum do trigo. O fungo é um parasita obrigatório, capaz de produzir urediniósporos infecciosos. Para estudar a estrutura genética da população de ferrugem da folha, 20 primers RAPD foram avaliados em 15 amostras de isolados coletadas no Paquistão. Um total de 105 fragmentos RAPD foram amplificados com uma média de 7 fragmentos por primer. O número de fragmentos amplificados variou de 1 a 12. GL Decamer L-07 e GL Decamer L-01 amplificaram o maior número de bandas (doze), e o primer GL Decamer A-03 amplificou o menor número de bandas, ou seja, um. Os resultados mostraram que quase todos os isolados investigados eram geneticamente diferentes, o que confirma a alta diversidade genética na população de ferrugem da folha. Os esporos de ferrugem podem seguir o padrão de migração em distâncias curtas e longas para áreas vizinhas. Os resultados indicaram que a maior variabilidade foi revelada por 74,9% da diferenciação genética nas populações de ferrugem. Esses resultados sugeriram que cada população não era completamente idêntica e um alto fluxo gênico ocorreu entre a população de ferrugem da folha de diferentes áreas. A maior diferenciação e distância genética entre as populações de ferrugem da folha do Paquistão foram detectadas entre a população de ferrugem da folha no isolado NARC (NARC-4) e AARI-11 e a maior similaridade foi observada entre os isolados NARC (NARC-4) e (NARC-5). O presente estudo mostrou que a população de ferrugem da folha no Paquistão é altamente dinâmica e variável.