ARTICLESARS-CoV-2 and Chlamydia pneumoniae co-infection:A review of the literature / Coinfección por Chlamydia pneumoniae y SARS-CoV-2: Una revisión de la literatura

Abstract Bacterial co-pathogens are commonly identified in viral respiratory infections and are important causes of morbid-mortality. The prevalence of Chlamydia (C.) pneumoniae infection in patients infected with SARS-CoV-2 has not been sufficiently studied. The objective of the present review was to describe the prevalence of C. pneumoniae in patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19). A search in MEDLINE and Google Scholar databases for English language literature published between January 2020 and August 2021 was performed. Studies evaluating patients with confirmed COVID-19 and reporting the simultaneous detection of C. pneumoniae were included. Eleven articles were included in the systematic review (5 case cross-sectional studies and 6 retrospective studies). A total of 18450 patients were included in the eleven studies. The detection of laboratory-confirmed C. pneumoniae infection varied between 1.78 and 71.4% of the total number of co-infections. The median age of patients ranged from 35 to 71 years old and 65% were male. Most of the studies reported one or more pre-existing comorbidities and the majority of the patients presented with fever, cough and dyspnea. Lymphopenia and eosinopenia were described in COVID-19 co-infected patients. The main chest CT scan showed a ground glass density shadow, consolidation and bilateral pneumonia. Most patients received empirical antibiotics. Bacterial co-infection was not associated with increased ICU admission and mortality. Despite frequent prescription of broad-spectrum empirical antimicrobials in patients with coronavirus 2-associated respiratory infections, there is a paucity of data to support the association with respiratory bacterial co-infection. Prospective evidence generation to support the development of an antimicrobial policy and appropriate stewardship interventions specific for the COVID-19 pandemic are urgently required.

Resumen Los patógenos bacterianos pueden detectarse en las infecciones respiratorias virales y son una causa importante de morbimortalidad. La prevalencia de Chlamydia pneumoniae en pacientes infectados con SARS-CoV-2 ha sido poco estudiada. El objetivo de la presente revisión fue describir la prevalencia de C. pneumoniae en pacientes con enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19). Para ello se realizó una búsqueda bibliográfica en Medline y Google Académico, entre enero de 2020 y agosto de 2021. De la revisión surgieron 11 artículos (cinco estudios de casos transversales y seis estudios retrospectivos), que incluyeron un total de 18.450 pacientes. La detección de C. pneumoniae varió entre el 1,78 y 71,4% del total de las coinfecciones. La media de edad de los pacientes osciló entre los 35 y 71 años y el 65% fueron hombres. En la mayoría de los estudios se informaron comorbilidades preexistentes y la mayor parte de los pacientes presentó fiebre, tos y disnea. Además, se describió linfopenia y eosinofilopenia en pacientes con COVID-19 coinfectados. La principal manifestación en la tomografía computarizada fue densidad de vidrio esmerilado, consolidación y neumonía bilateral. La mayoría de los pacientes recibió antibióticos de manera empírica. La coinfección bacteriana no se asoció con un aumento de ingresos en cuidados intensivos ni mortalidad. A pesar de la prescripción de antimicrobianos empíricos en pacientes con infecciones respiratorias asociadas a coronavirus existen pocos reportes de detección de coinfección bacteriana. Es necesario generar evidencia para el desarrollo de políticas antimicrobianas e intervenciones de administración apropiadas y específicas en la pandemia de COVID-19.

Detección y caracterización molecular de Chlamydia psittaci y Chlamydia abortus en psitácidos mascotas en la provincia de Buenos Aires, Argentina / Detection and molecular characterization of Chlamydia psittaci and Chlamydia abortus in psittacine pet birds in Buenos Aires province, Argentina

In order to determine the presence and genetic diversity of Chlamydia spp. in the north-eastern area of Buenos Aires province, Argentina, conjunctival, oropharyngeal, cloacal swab and tissues were collected from a total of 90 psittacine pet birds of different age and clinical manifestations. Through molecular methods, Chlamydiaceae was detected in 30% (27/90) of the samples, out of which 70.3% (19/27) were positive for Chlamydia psittaci and 14.9% (4/27) for Chlamydia abortus. Nine C. psittaci positive samples were genotyped by ompA gene sequences, 8 clustered within genotype A and 1 within genotype B. A significant association was observed between the presence of Chlamydia spp. and the manifestation of clinical signs compatible with chlamydiosis, as well as with the age of the birds (younger than one year old). This report contributes to the improvement of our understanding of chlamydial agents in our country.

Con el objetivo de determinar la presencia de Chlamydia spp. en psitácidos del área noreste de la provincia de Buenos Aires y conocer su diversidad genética, se recolectaron y analizaron mediante métodos moleculares hisopados conjuntivales, orofaríngeos, cloacales y tejidos de un total de 90 psitácidos de diferentes edades y con diversas manifestaciones clínicas. El 30% (27/90) de las muestras procesadas fueron positivas para Chlamydiaceae; el 70,3% (19/27) de estas resultaron positivas para Chlamydia psittaci y el 14,9% (4/27) para Chlamydia abortus. Nueve muestras positivas para C. psittaci fueron genotipificadas por secuenciación del gen ompA: 8 correspondieron al genotipo Ay una al genotipo B. Se observó una asociación significativa entre la presencia de Chlamydia spp. y la manifestación de signos clínicos compatibles con clamidiosis, como así también con la edad de las aves (menores de un ano). Este informe contribuye a mejorar nuestro conocimiento de los agentes clamidiales en nuestro país.

Encefalomielitis aguda diseminada por Mycoplasma pneumoniae en un niño previamente sano / Acute disseminated encephalomyelitis due to Mycoplasma pneumoniae in a previously healthy boy

Se presenta el caso de un niño de 5 años sin antecedentes de enfermedad, que se internó en terapia intensiva por convulsiones tónico-clónicas focalizadas en la cara y en el hemicuerpo derecho, con documentación de temperatura axilar de 37,4°C. Se descartó la presencia de gérmenes comunes y la etiología viral a través de estudios de muestras de líquido cefalorraquídeo (LCR). Se sospechó la presencia de Mycoplasma pneumoniae por comprobarse inmunofluorescencia positiva en suero para anticuerpos de clase IgM. El diagnóstico se confirmó mediante la detección del ADN de dicho patógeno sobre la biopsia cerebral efectuada por el método de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y una histología compatible con encefalomielitis aguda diseminada. El paciente recibió tratamiento con claritromicina y su evolución fue favorable. Al menos dentro de nuestros conocimientos, este es el primer caso en el que se detectó ADN de M. pneumoniae en una biopsia cerebral por el método de PCR.

We present here the case of a previously healthy 5 year-old boy hospitalized in an intensive care unit due to tonic-clonic seizures focused on the face and right side of the body, and axillary temperature of 37.4 °C. Common bacterial and viral etiology was ruled out through studies of cerebrospinal fluid (CSF) samples. Mycoplasma pneumoniae was suspected by a positive immunofluorescence serum test for IgM class antibodies. Finally, with a brain biopsy, M. pneumoniae was confirmed by polymerase chain reaction (PCR) and acute disseminated encephalomyelitis by pathological anatomy. The patient was treated with clarithromycin and had an uneventful evolution. At least to our knowledge, this is the first case in which M. pneumoniae DNA was detected by PCR in a brain biopsy.

Epidemiological and molecular characteristics of Chlamydia psittaci from 8 human cases of psittacosis and 4 related birds in Argentina / Características epidemiológicas y moleculares de Chlamydia psittaci provenientes de 8 casos humanos de psitacosis y de 4 aves relacionadas en la Argentina

In Argentina, the epidemiological and molecular characteristics of Chlamydia psittaci infections are still not sufficiently known. A total of 846 respiratory and 10 ocular samples from patients with suspected human psittacosis were tested for C. psittaci from January 2010 to March 2015. Four samples of birds related to these patients were also studied. Forty-eight samples were positive for C. psittaci by a nested PCR. The molecular characterization of twelve C. psittaci PCR-positive samples received in the National Reference Laboratory INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán", Buenos Aires, Argentina was performed. Eight positive samples from humans and four from birds were genotyped by ompA gene sequencing. C. psittaci genotype A was found in all human samples and in the related birds. This report contributes to our increasing knowledge of the epidemiological and molecular characteristics of C. psittaci to conduct effective surveillance of its zoonotic infections.

En la Argentina, aún no se conocen suficientemente las características epidemiológicas y moleculares de las infecciones por Chlamydia psittaci. Entre enero del 2010 y marzo del 2015 se estudiaron 846 muestras respiratorias y 10 oculares de pacientes con sospecha de psitacosis para la búsqueda de C. psittaci. También se estudiaron 4 muestras de aves relacionadas con estos pacientes. De ese total, 48 muestras fueron positivas para C. psittaci mediante una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada. Posteriormente, se realizó en el INEI-ANLIS «Dr. Carlos G. Malbrán¼ la caracterización molecular de 12 muestras positivas para C. psittaci, 8 de humanos y 4 de aves, que fueron genotipificadas por secuenciación del gen ompA. C. psittaci genotipo A se encontró en todas esas muestras. Este informe contribuye a mejorar nuestro conocimiento de las características epidemiológicas y moleculares de C. psittaci para lograr una vigilancia efectiva de la zoonosis que produce.

Eco-epidemiología de las Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae y Chlamydia pecorum: impacto en la salud pública / Eco Epidemiology of Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae and Chlamydia pecorum: impact on public healthpneumoniae by in vitro neutralization and microimmunofluorescence assays. Zentralbl Bakteriol 1996; 284(1):52-57.20. Phoon MC, Yee GW, Koh WP, Chow VT. Comparative Seroepidemiologic Analysis of Chlamydophila pneumoniae Infection using Microimmunofluorescence, Enzyme Immunoassay and Neutr

ntroducción: Las infecciones zoonóticas son una creciente amenaza para la salud mundial. Varias especies de Chlamydia y sus implicancias son poco conocidas. Objetivo: Profundizar el conocimiento eco-epidemiológico de Chla-mydia en Córdoba.Materiales y métodos: Se implementaron técnicas serológicas y mo-leculares para la detección de Chlamydia en 314 individuos sanos, 44 con nexo epidemiológico asociado a Psitacosis, 505 aves silvestres, 288 aves cautivas, 30 reptiles y 30 equinos. Resultados: En humanos se detectó C. pneumoniae, C. pecorum, C. psittaci, y co-infecciones asociadas a mayor cuantificación bac-teriana. La prevalencia de anticuerpos en indivi-duos sanos fue de 14,3 % y en pacientes 68,2 %. Se evidenció una respuesta inmune exacerbada en trabajadores en contacto con reptiles infectados con C. pneumoniae. En aves cautivas se identificó C. pneumoniae, C. psittaci, C. pecorum, C. galliná-cea y co-infecciones con mayor concentración de ADN. Las aves silvestres no excretaban Chlamydia. En equinos se halló C. pneumoniae, también en Su-ricata suricatta y Atelerix albiventris. El genotipo A se halló en humanos, reptiles, aves, mamíferos no humanos y B en equinos. Conclusiones: C. psittaci genotipo WC se detectó en aves y humanos; en menor frecuencia los genotipos E/B y A. Este hallazgo sugiere que los animales pueden representar una fuente subestimada de C. psittaci. El hallazgo de C. pneumoniae y C. pecorum en pacientes y en animales, plantea posibles ciclos zoonóticos y la necesidad de diagnóstico diferencial. Estos resultados avalaron el decreto de ley provincial de tenencia y comercialización de animales, promovido por la Secretaría de Am-biente de Córdoba

Introduction: Zoonotic infections are a growing threat to global health. Chlamydia and its implications are not well known.The aim of this study was to further the eco-epidemiological knowledge of Chlamydia in Cordoba.Materials and methods: Serological and molecular techniques was implemented for detection of Chlamydia in 314 healthy individuals, 44 individuals associated with Psittacosis, 505 wild birds, 288 captive birds, 30 reptiles and 30 equine.Results: In humans were detected C. pneumoniae, C. pecorum, C. psittaci and co-infections associated with increased bacterial quantification.The prevalence of antibodies in healthy individuals was 14.3% and 68.2% patients. Exacerbated immune response was detected in workers with contact infected with C. pneumoniae evidenced reptiles.In captive birds we detected C. pneumoniae, C. psittaci, C. pecorum, C. gallinácea and co-infections with the highest concentration of DNA. Wild birds did not excrete Chlamydia.In horses we found C. pneumoniae, also in Suricata suricatta and Atelerix albiventris. The genotype was found in humans, reptiles, birds, mammals and non-human equine B.Conclusions: C. psittaci WC genotype was detected in birds and humans; less frequently genotypes E/B and A. This finding suggests that animals can be a source of C. psittaci underestimated.The discovery of C. pneumoniae and C. pecorum in patients and animals raises potential zoonotic cycles and the need for differential diagnosis.These results endorsed the decree of provincial law to possess and marketing of animals, promoted by Secretaría de Ambiente de Córdoba

Infección Respiratoria Aguda por metapneumovirus humano en Ushuaia, Argentina: descripción del primer caso / Acute lower respiratory infection by human metapneumovirus in Ushuaia, Argentina: description of the first patient

RESUMEN Hacia fines del año 2003, en la ciudad de Ushuaia resultó llamativa la cantidad de niños internados con cuadros respiratorios graves y estudios virológicos negativos. Sobre la base de publicaciones acerca de la circulación de un nuevo virus respiratorio, metapneumovirus humano, se decidió investigar su presencia en tres muestras respiratorias de niños internados con infección respiratoria aguda en el Hospital Regional de Ushuaia. Los aspirados nasofaríngeos, previamente negativos para los virus respiratorios comunes por la técnica de inmunofluorescencia, fueron estudiados mediante la técnica de transcripción inversa y amplificación genómica por reacción en cadena de la polimerasa para metapneumovirus humano. Una de las muestras resultó positiva para metapneumovirus humano. En ninguno de los pacientes se detectaron anticuerpos de clase IgM para Chlamydia spp y Mycoplasma pneumoniae, por la técnica de inmunofluorescencia. La descripción del presente caso enfatiza la necesidad de ampliar el espectro diagnóstico en niños internados que resulten negativos para los virus respiratorios más comunes.

Neumonia adquirida en la comunidad en dos poblaciones hospitalarias / Community-acquired pneumonia in patients from two different hospitals

Patients hospitalized with community acquired pneumonia were studied prospectively in two hospitals located in the surroundings of Buenos Aires city. Fifty two patients from General Hospital Manuel Belgrano (HMB) were included from March 1998 to February 1999 and 23 patients from Hospital Dr A. Cetrangolo (HCET) for respiratory disease, were included from June 2000 to May 2001. Patients with lung tuberculosis, lung neoplasia and HIV infection were excluded. Clinical background, signs and symptoms were recorded. Microbiological examinations performed included bacteria, respiratory viruses and mycobacteria. Studies for "atypical" bacteria (Chlamydia spp., Coxiella burnetii, Mycoplasma pneumoniae and Legionella spp.) were carried out by serological methods. No differences in age and gender were observed between both groups. Most frequently observed comorbidities in the HMB group included COPD, diabetes and cardiac failure while in the HCET group these were COPD, asthma and lung fibrosis. Etiology was established in 48% and 65.2% of the patients in the first and second group, respectively. Most frequent agents were Mycoplasma pneumoniae, Streptococcus pneumoniae, influenza A and Legionella spp.; the last one was detected in 12% of the patients. Most of these patients were from HMB and presented a good outcome. Mortality was similar in both groups (13.3%). In the HBM group it was related to the presence of comorbidities in 7 out of 8 cases, and in the HCET group it was a consequence of the worsening of their chronic respiratory failure