ABSTRACT
This review presents advances in the implementation of high - throughput se quencing and its application to the knowledge of medicinal plants. We conducted a bibliographic search of papers published in PubMed, Science Direct, Google Scholar, Scopus, and Web of Science databases and analyzed the obtained data using VOSviewer (versi on 1.6.19). Given that medicinal plants are a source of specialized metabolites with immense therapeutic values and important pharmacological properties, plant researchers around the world have turned their attention toward them and have begun to examine t hem widely. Recent advances in sequencing technologies have reduced cost and time demands and accelerated medicinal plant research. Such research leverages full genome sequencing, as well as RNA (ribonucleic acid) sequencing and the analysis of the transcr iptome, to identify molecular markers of species and functional genes that control key biological traits, as well as to understand the biosynthetic pathways of bioactive metabolites and regulatory mechanisms of environmental responses. As such, the omics ( e.g., transcriptomics, metabolomics, proteomics, and genomics, among others) have been widely applied within the study of medicinal plants, although their usage in Colombia is still few and, in some areas, scarce. (185)
El extracto de cloroformo (CE) y las fracciones obtenidas de las raíces de Aldama arenaria se evaluaron para determinar su actividad antiproliferativa in vitro contra 10 líneas ce lulares tumorales humanas [leucemia (K - 562), mama (MCF - 7), ovario que expresa un fenotipo resistente a múltiples fármacos (NCI/ADR - RES), melanoma (UACC - 62), pulmón (NCI - H460), próstata (PC - 3), colon (HT29), ovario (OVCAR - 3), glioma (U251) y riñón (786 - 0)]. CE presentó actividad antiproliferativa débil a moderada (log GI 50 medio 1.07), mientras que las fracciones 3 y 4, enriquecidas con diterpenos de tipo pimarane [ent - pimara - 8 (14), ácido 15 - dien - 19 - oico y ent - 8(14),15 - pimaradien - 3 ß - ol], presentaron activid ad moderada a potente para la mayoría de las líneas celulares, con un log GI 50 medio de 0.62 y 0.59, respectivamente. Los resultados mostraron una acción antiproliferativa in vitro prometedora de las muestras obtenidas de A. arenaria , con los mejores resul tados para NCI/ADR - RES, HT29 y OVCAR - 3, y valores de TGI que van desde 5.95 a 28.71 µg.mL - 1, demostrando que los compuestos de esta clase pueden ser prototipos potenciales para el descubrimiento de nuevos agentes terapéuticos
Subject(s)
Plants, Medicinal , Colombia , MultiomicsABSTRACT
La fibrilación auricular (FA), en ciertos casos, es mantenida por focos ectópicos de actividad automática, organización espacio temporal y de alta frecuencia. La ablación de estos sitios da como resultado la terminación de la FA en un alto porcentaje en paciente con FA paroxística, sin embargo, en pacientes con FA permanente estos sitios son difíciles de reconocer debido a la capacidad de las aurículas remodeladas para ser activadas a altas frecuencias. Es necesario un método más preciso para acotar mejor estas zonas. En el presente trabajo se plantea desarrollar un nuevo índice, a partir de los índices de frecuencia dominante (DF) e índice de organización (IO), para la identificación de estas zonas. Para esto, se simularon episodios de FA permanente mantenidos por focos ectópicos de actividad continua en tres diferentes regiones, implementando un modelo 3D de aurícula humana. Se obtuvieron electrogramas en toda la superficie auricular y se calculó su DF and IO. El índice OHF (Organization High Frequency), se calculó como el producto entre el valor de la DF y del IO de cada uno de los electrogramas y se crearon mapas de falso color sobre el modelo 3D. Los resultados muestran que el índice OHF es capaz de identificar el foco ectópico de actividad continua durante episodios de FA permanente simulados.
Atrial fibrillation in some cases is maintained by ectopic foci with automatic activity, spatiotemporal organization and high frequency. Ablating these sites results in the AF termination in a high percentage of patients with paroxysmal AF, however, in patients with permanent AF these sites are difficult to recognize due to the ability of the remodeled atria to be activated at high frequencies. A more accurate method is needed to delimit better these areas. In the present work, we developed a new index, based on dominant frequency (DF) and organization index (OI), to identify these areas. For this, we simulated permanent AF episodes maintained by ectopic foci with continuous activity in three different regions, implementing a 3D model of human atrium. Electrograms were obtained across the atrial surface and its DF and IO were calculated. The OHF index (Organization High Frequency), was calculated as the product of the DF and IO values of individual electrograms and we created false color maps in the 3D model. The results show that the OHF index is able to identify ectopic foci of continuous activity during simulated permanent AF episodes.
A fibrilação atrial (FA), em alguns casos, é mantida por focos de actividade ectópica automático, organização e espaço de alta frequência temporal. Ablação desses locais determina a resolução da FA em uma alta porcentagem de pacientes com FA paroxística, no entanto, em pacientes com fibrilação atrial permanente desses sites são difíceis de reconhecer devido à capacidade dos átrios remodelado para ser ativado em alta frequências. Essas áreas para melhor abordagem é necessário um limite mais preciso. Neste artigo propõe-se a desenvolver uma freqüência novos índices com base em índice dominante (DF) e índice de organização (OI) para a identificação dessas áreas. Para isso, episódios de FA permanente mantido por focos ectópicos de atividade contínua em três regiões diferentes, implementando um modelo 3D de átrios humanos foram simulados. Eletrocardiogramas foram obtidos ao longo da superfície auricular e calculado o DF e IO. O OHF (Organização High Frequency) índice foi calculado como o produto do valor do DF e IO de eletrocardiogramas individuais e falsos mapas de cores do modelo 3D é criado. Os resultados mostram que o índice de OHF é capaz de identificar o foco ectópico de actividade contínua durante episódios de FA permanentes simulados.
ABSTRACT
La fibrilación auricular (FA) es la arritmia más común. Algunos episodios de FA son mantenidos por rotores. La FA paroxística (FAp) se refiere a episodios recurrentes que se autolimitan. Si la FAp no se trata puede convertirse en crónica. Se ha demostrado que la inhibición de las corrientes I KACh e I K1 contribuye a la terminación de la FA. El fármaco antimalárico cloroquina, al inhibir estas corrientes podría ser un fármaco antiarrítmico eficaz en humanos. El objetivo del trabajo es simular los efectos de la cloroquina y estudiar su eficacia en la terminación de un rotor en condiciones de FAp. Para esto, se desarrolló un modelo 2D de tejido auricular en condiciones de FAp. Se implementó un modelo del efecto de la cloroquina sobre las corrientes I K1 e I KACh para estudiar su eficacia en la terminación de un rotor simulado. La cloroquina alargó el potencial de acción a medida que se incrementó su concentración. A concentraciones de 0.3 µM y superiores, finalizó la actividad del rotor. Este es el primer trabajo que ha desarrollado modelos matemáticos del fármaco cloroquina para estudiar su efecto en la terminación de un rotor. Los resultados sugieren que la cloroquina podría ser un potente agente antiarrítmico en el tratamiento de la FAp.
Atrial fibrillation (AF) is the most common arrhythmia. Some AF episodes are maintained by rotors. Paroxysmal AF (pAF) refers to self-limiting recurrent episodes. If the pAF is not treated it could become chronic. It has been demonstrated that inhibition of the I K1 and I KACh currents contributes to AF termination. Antimalarial drug chloroquine by inhibiting these currents could be an effective antiarrhythmic drug in humans. The aim of this work is to simulate the effects of chloroquine and study their effectiveness in the rotor termination in pAF conditions. For this, we developed a 2D model of atrial tissue under pAF conditions. We implemented a model of the effect of chloroquine on I K1 and I KACh currents to study its effectiveness in the termination of a simulated rotor. Chloroquine lengthened the action potential as the concentration increased. At concentrations of 0.3 µM and higher, the activity of the rotor finished. This is the first work that developed a chloroquine mathematical models to study its effect on the rotor termination. The results suggest that chloroquine could be a potent antiarrhythmic drug for the pAF treatment.
A fibrilhação auricular (FA) é a arritmia mais comum. Alguns episódios de FA são mantidos por rotores. A FA paroxística (FAp) refere-se a episódios recorrentes que são autolimitantes. Se a FAP não tem nenhum tratamento, pode se tornar crônica. Tem sido demonstrado que a inibição das correntes I KACh e I K1 contribui para o término da AF. O medeicamento antimalárico cloroquina, para inibir essas correntes poderia ser um medicamento anti-arrítmico eficaz em seres humanos. O objetivo deste trabalho é simular os efeitos da cloroquina e estudar a sua eficácia na terminação de um rotor capaz em condições FAp. Para isso, um modelo 2D foi desenvolvido de tecido auricular em condições de FAp. foi implementado um modelo do efeito da Cloroquina sobre as corrente I K1 e I KACh para estudar a sua eficácia na terminação de um rotor simulado. A Cloroquina alongou o potencial de ação na medida em que foi aumentada a sua concentração. Em concentrações de 0,3 µM e superiores, terminou a atividade do rotor. Este é o primeiro trabalho que desenvolveu modelos matemáticos do medicamento cloroquina para estudar seu efeito sobre a terminação de um rotor. Os resultados sugerem que a cloroquina poderia ser um potente agente anti-arrítmico para o tratamento de FAp.