ABSTRACT
ABSTRACT Objective. To determine the prevalence and antimicrobial resistance of Escherichia coli and Salmonella spp. in animal feed samples collected between 2018 and 2021 in Colombia. Methods. This was a laboratory-based cross-sectional study using routine data from the program for inspection, surveillance, and control of animal feed at the Colombian Agriculture Institute. Samples of animal feed for swine, poultry, canine, feline, leporine, piscine, and equine species were processed for detection of E. coli and Salmonella spp. using enrichment and selective culture methods. Isolates were tested for antimicrobial susceptibility using an automated microdilution method. Results. Of 1 748 animal feed samples analyzed, 83 (4.7%) were positive for E. coli and 66 (3.8%) for Salmonella spp. The presence of E. coli and Salmonella spp. was highest in feed for poultry (6.4% and 5.5%) and swine (6.1% and 4.3%). Antimicrobial resistance testing was performed in 27 (33%) E. coli isolates and 26 (39%) Salmonella isolates. Among E. coli, resistance was most frequently observed to ampicillin (44.5%) followed by cefazolin (33.3%), ciprofloxacin (29.6%), ampicillin/sulbactam (26%), and ceftriaxone (11.1%). The highest resistance levels in Salmonella spp. isolates were against cefazolin (7.7%) and piperacillin/tazobactam (7.7%). Conclusions. This is the first study from Colombia reporting on the prevalence and antimicrobial resistance of E. coli and Salmonella spp. in animal feed samples. Its results establish a baseline over a wide geographical distribution in Colombia. It highlights the need to integrate antimicrobial resistance surveillance in animal feed due to the emergence of resistant bacteria in this important stage of the supply chain.
RESUMEN Objetivo. Determinar la prevalencia y resistencia a los antimicrobianos de Escherichia coli y Salmonella spp. en muestras de piensos para animales tomadas entre el 2018 y el 2021 en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal realizado en el laboratorio a partir de los datos regulares del programa de inspección, vigilancia y control de alimentos para animales del Instituto Colombiano Agropecuario. Se procesaron muestras de alimentos utilizados en la cría de cerdos, aves de corral, cánidos, félidos, lepóridos, peces y equinos con el fin de detectar E. coli y Salmonella spp. por medio de métodos de enriquecimiento y cultivo selectivo. Se analizó la sensibilidad a los antimicrobianos de las cepas aisladas mediante microdilución automatizada. Resultados. De 1748 muestras de alimentos analizadas, 83 (4,7%) resultaron positivas para E. coli y 66 (3,8%) para Salmonella spp. La presencia de E. coli y Salmonella spp. fue mayor en los alimentos para aves de corral (6,4% y 5,5%) y cerdos (6,1% y 4,3%). Se realizaron pruebas de resistencia a los antimicrobianos en 27 (33%) cepas de E. coli y 26 (39%) de Salmonella. En las cepas de E. coli, se observó una mayor resistencia a la ampicilina (44,5%), seguida de la resistencia a la cefazolina (33,3%), la ciprofloxacina (29,6%), la ampicilina/sulbactam (26%) y la ceftriaxona (11,1%). En el caso de las cepas de Salmonella spp., los niveles de resistencia más elevados fueron para la cefazolina (7,7%) y piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusiones. Este es el primer estudio realizado en Colombia en el que se informa sobre la prevalencia y la resistencia a los antimicrobianos de E. coli y Salmonella spp. en muestras de alimentos para animales. Sus resultados establecen una línea de base para una zona geográfica mucho mayor dentro de Colombia. Se subraya la necesidad de integrar la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en los alimentos para animales debido a la aparición de bacterias resistentes en esta importante etapa de la cadena de suministro.
RESUMO Objetivo. Determinar a prevalência e a resistência a antimicrobianos de Escherichia coli e Salmonela spp. em amostras de ração animal coletadas entre 2018 e 2021 na Colômbia. Métodos. Estudo transversal de base laboratorial, usando dados de rotina do programa de inspeção, vigilância e controle de ração animal do Instituto Colombiano de Agricultura. Amostras de ração animal para as espécies suína, avícola, canina, felina, leporina, piscina e equina foram processadas para detecção de E. coli e Salmonella spp., usando métodos de enriquecimento e cultura seletiva. Os isolados foram testados quanto à suscetibilidade a antimicrobianos usando um método automatizado de microdiluição. Resultados. Das 1.748 amostras de ração animal analisadas, 83 (4,7%) foram positivas para E. coli e 66 (3,8%) para Salmonella spp. A presença de E. coli e Salmonella spp. foi maior em rações para aves (6,4% e 5,5%) e suínos (6,1% e 4,3%). O teste de resistência a antimicrobianos foi realizado em 27 (33%) isolados de E. coli e 26 (39%) isolados de Salmonella. Em E. coli, a resistência observada com maior frequência foi à ampicilina (44,5%), seguida da cefazolina (33,3%), ciprofloxacino (29,6%), ampicilina/sulbactam (26%) e ceftriaxona (11,1%). Os maiores níveis de resistência em isolados de Salmonella spp. foram contra cefazolina (7,7%) e piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusões. Este é o primeiro estudo da Colômbia a notificar a prevalência e resistência a antimicrobianos de E. coli e Salmonella spp. em amostras de ração animal. Os resultados estabelecem uma linha de base com ampla distribuição geográfica na Colômbia. Destaca-se a necessidade de integrar a vigilância da resistência a antimicrobianos na ração animal, devido ao surgimento de bactérias resistentes nesta importante etapa da cadeia de abastecimento.
ABSTRACT
ABSTRACT Objectives. To determine the proportion of Salmonella enterica in fecal samples of live pigs with suspected salmonellosis analyzed at the diagnostic unit of the University of Antioquia, Colombia between 2019 and 2021, and examine the serotypes and antimicrobial resistance patterns. Methods. This was a laboratory-based cross-sectional study of routine data on fecal samples received from pig farms in all nine subregions of Antioquia state, Colombia. Salmonella spp. detection at the university is done using enrichment, selective culture, and polymerase chain reaction. Serotypes were identified using the Kauffmann-White scheme and isolates were tested for antimicrobial susceptibility using broth microdilution. Results. Of 653 samples tested, 149 (23%) were positive for S. enterica. Nine serotypes were identified. The most common were Salmonella Typhimurium (56%) and its monophasic variant (35%). Resistance to ampicillin (70%) was most frequently observed, followed by ciprofloxacin (55%), and sulfamethoxazole-trimethoprim (52%). No isolates were resistant to amikacin and gentamicin. Multidrug resistance (resistance to ≥ 3 classes of antibiotics) was observed in 61 (44%) isolates. Multidrug resistance was highest in S. Typhimurium (57%) compared with the other serotypes. Serotype was associated with multidrug resistance (p = 0.01), but age of the pig and sub-region were not. Conclusions. The proportion of Salmonella spp. and the associated high levels of multidrug resistance are of concern and may indicate irrational use of antimicrobials and poor management practices in pig production systems in the region. Strengthened surveillance is needed to monitor and improve farm management practices and the use of antimicrobials in farms in Colombia.
RESUMEN Objetivos. Determinar la proporción de Salmonella enterica en muestras fecales de cerdos vivos con presunta salmonelosis analizadas en la unidad de diagnóstico de la Universidad de Antioquia (Colombia) entre el 2019 y el 2021, así como examinar los serotipos y los patrones de resistencia a los antimicrobianos. Métodos. Se trata de un estudio transversal de laboratorio sobre datos ordinarios de muestras fecales provenientes de granjas porcinas de las nueve subregiones del departamento de Antioquia (Colombia). La detección de Salmonella spp. en la universidad se realiza mediante el enriquecimiento, el cultivo selectivo y la reacción en cadena de la polimerasa. Se identificaron los serotipos con el esquema de Kauffmann-White y se examinaron las cepas aisladas para determinar la susceptibilidad antimicrobiana mediante microdilución en caldo. Resultados. De las 653 muestras analizadas, 149 (23%) dieron un resultado positivo para S. enterica. Se identificaron nueve serotipos. Los más comunes fueron Salmonella typhimurium (56%) y su variante monofásica (35%). La resistencia a la ampicilina fue la observada con mayor frecuencia (70%), seguida de la resistencia al ciprofloxacino (55%) y al sulfametoxazol-trimetoprima (52%). Ninguna cepa aislada fue resistente a la amikacina y la gentamicina. Se observó resistencia a múltiples fármacos (resistencia a tres o más clases de antibióticos) en 61 cepas (44%). La resistencia a múltiples fármacos fue más elevada en el caso de S. typhimurium (57%) en comparación con los otros serotipos. Se asoció el serotipo con la resistencia a múltiples fármacos (p = 0,01), a diferencia de la edad del cerdo y la subregión. Conclusiones. La proporción de Salmonella spp. y los elevados niveles asociados de resistencia a múltiples fármacos son preocupantes y pueden ser un indicativo de uso irracional de antimicrobianos y malas prácticas de gestión en los sistemas de producción porcina de la región. Es necesario reforzar la vigilancia para dar seguimiento y mejorar las prácticas de gestión agropecuaria y el uso de antimicrobianos en las granjas en Colombia.
RESUMO Objetivos. Determinar a proporção de Salmonella enterica em amostras de fezes de suínos vivos com suspeita de salmonelose analisadas na unidade de diagnóstico da Universidade de Antioquia, Colômbia, entre 2019 e 2021, e examinar seus sorotipos e padrões de resistência a antimicrobianos. Métodos. Estudo transversal, de base laboratorial, utilizando dados de rotina de amostras de fezes recebidas de suinocultores em todas as nove sub-regiões do estado de Antioquia, Colômbia. A detecção de Salmonella spp. na Universidade é feita por enriquecimento, cultura seletiva e reação em cadeia da polimerase. Os sorotipos foram identificados usando o esquema de Kauffmann-White, e os isolados foram testados quanto à suscetibilidade aos antimicrobianos pelo método de microdiluição em caldo. Resultados. Das 653 amostras testadas, 149 (23%) foram positivas para S. enterica. Foram identificados nove sorotipos. Os mais comuns foram Salmonella Typhimurium (56%) e sua variante monofásica (35%). A resistência à ampicilina (70%) foi observada com maior frequência, seguida pela resistência ao ciprofloxacino (55%) e ao sulfametoxazol/trimetoprima (52%). Nenhum isolado apresentou resistência à amicacina ou gentamicina. Multirresistência (resistência a ≥ 3 classes de antibióticos) foi observada em 61 isolados (44%). A multirresistência foi mais comum em S. Typhimurium (57%), em comparação aos outros sorotipos. Foi constatada associação da multirresistência com sorotipos (p = 0,01), mas não com idade do suíno ou sub-região. Conclusões. A proporção de Salmonella spp. e os níveis elevados associados de multirresistência a antimicrobianos aqui constatados são preocupantes, e podem indicar uso irracional de antimicrobianos e práticas inadequadas de manejo nos sistemas de suinocultura da região. É preciso fortalecer a vigilância para monitorar e melhorar as práticas de manejo agrícola e o uso de antimicrobianos em fazendas na Colômbia.