Differential molecular approach and ESBL detection from Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli isolated from the supraglottic region of patients undergoing mechanical ventilation in an intensive care unit / Aproximación molecular diferencial y detección de BLEES a partir de Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli aisladas de la región supraglótica de pacientes sometidos a ventilación mecánica en una unidad de cuidados intensivos

Abstract Introduction: Given their ability for colonizing the supraglottic region, desiccation tolerance, resistance to β-lactam antibiotics, and adherence to both inert surfaces and epithelial cells, Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli are potentially pathogenic microorganisms for patients undergoing mechanical ventilation in an intensive care unit (ICU). Objective: To perform a molecular characterization and detection of extended spectrum β-lactamases (ESBL) in K. pneumoniae and E. coli strains isolated from the supraglottic region of patients undergoing mechanical ventilation in an ICU. Materials and methods: A descriptive study was conducted in 18 isolates. Disk diffusion technique was used for detecting ESBL-producing bacteria. Molecular characterization was made by BOX-PCR technique, while ESBL production was confirmed by testing the isolates against cefotaxime and ceftazidime, alone and in combination with clavulanic acid. Results: a K. pneumoniae strain and another E. coli strain were confirmed as ESBL producers. A divergence greater than 50% was observed in most of the strains; besides non-infectious origin strains resistant to third generation cephalosporins were found. Conclusion: The polyclonality found in this study might indicate that most of the strains belong to each patient's microbiota.

Resumen Introducción. Dada su capacidad para colonizar la región supraglótica, tolerar desecación, resistir los antibióticos β-lactámicos y adherirse tanto a superficies como a células epiteliales, la Klebsiella pneumoniae y la Escherichia coli son microorganismos potencialmente patógenos para los pacientes de la unidad de cuidados intensivos (UCI) sometidos a ventilación mecánica. Objetivo. Realizar la caracterización molecular y la detección de β-lactamasas de espectro extendido (BLEES) a cepas de K. pneumoniae y E. coli aisladas de la región supraglótica de pacientes internados en UCI y sometidos a ventilación mecánica. Materiales y métodos. Estudio descriptivo realizado en 18 aislamientos. Se utilizó la técnica de difusión en disco para detectar bacterias productoras de BLEES. La caracterización molecular se realizó mediante la técnica de BOX-PCR y la producción de ESBL fue confirmada mediante la prueba con cefotaxima y ceftazidima, solas y combinadas con ácido clavulanico. Resultados. Una cepa de K. pneumoniae y otra de E. coli resultaron productoras de BLEES. La mayoría de cepas presentaron una divergencia superior al 50%, evidenciándose, además, cepas de origen no infeccioso resistentes a cefalosporinas de tercera generación. Conclusión. La policlonalidad encontrada podría indicar que la mayoría de las cepas pertenecen a la microbiota de cada paciente.

Establecimiento de un sistema para el monitoreo y control de la contaminación cruzada en el laboratorio de análisis microbiológico de alimentos durante 2009 / Establishment of a System for Monitoring and Control of Cross Contamination in the Laboratory of Microbiological Analysis of Food during 2009 / Estabelecimento de um sistema para a monitoração e controle da contaminação cruzada no laboratório de análise microbiológico de alimentos durante 2009

Dentro de las actividades para el control de calidad en el laboratorio, los resultados finales de un analito en particular son considerados productos intermedios, dada la pertinencia otorgada al aseguramiento de la calidad como fin último de los programas de gestión de la calidad. Esta concepción precisa el establecimiento de instrumentos integrales para la detección de eventos como la contaminación cruzada y la adopción de medidas para evitar que se afecte la marcha analítica. Objetivo: el objetivo principal fue establecer un sistema para el monitoreo y control de la contaminación cruzada en el laboratorio de análisis microbiológico de alimentos. Materiales y métodos: la metodología empleada consistió en desarrollar diagramas de flujo para los procedimientos sobre el control de las poblaciones de mesófilos aerobios y mohos provenientes de la contaminación en los ambientes, superficies, material estéril y medios de cultivos. Dichos diagramas incluyeron un árbol de decisiones, diseñado para efectuar acciones de control con base en los intervalos de tolerancia, establecidos como herramienta objetiva hacia la toma de decisiones que normalicen los recuentos de las poblaciones microbianas en cuestión. Resultados: los límites de alerta más estrictos se obtuvieron para las poblaciones de mesófilos aerobios y mohos en los diferentes controles, excepto para el ambiente del área de preparación de medios y los correspondientes al material estéril. Conclusión: el proceso desarrollado permitió complementar el sistema de control de calidad interno en el laboratorio, al disponer de un medio objetivo para el cierre de no conformidades por contaminación cruzada.

Within the activities for quality control in the laboratory, the final results of a particular analyte are now recognized as intermediates, due to the relevance given to quality assurance, as the ultimate goal of programs for quality management. This concept makes it necessary to establishment of integral tools, to detect events such as cross-contamination, and measures to avoid affecting the analysis method. Objective: to established a system for monitoring and control of cross-contamination in the laboratory of microbiological analysis of food. Materials and methods: Flowcharts were developed to control the proceedings on the populations of aerobe mesophilics and molds originated from pollution in the environment, surfaces, sterile material and culture media, which included a decision tree designed to perform control actions based on tolerance intervals, which were established as objective tool to decision-making leading to normalize counts of microbial populations in question. Results: Warning limits stricter were obtained for aerobic mesophilic and mold populations in the different controls, except for environment of media preparation and the corresponding for sterile material. Conclusion: The process developed allowed to complement the system of internal quality control in the laboratory, to provide of an objective tool for closing nonconformities because of cross-contamination.

Introdução: dentro das atividades para o controle de qualidade no laboratório, os resultados finais de um analito em particular são considerados produtos intermédios, dada a pertinência outorgada à asseguração da qualidade como fim último dos programas de gestão de qualidade. Esta concepção precisa o estabelecimento de instrumentos integrais para a detecção de eventos como a contaminação cruzada e a adoção de medidas para evitar que se afete a marcha analítica. Objetivo: o objetivo principal foi estabelecer um sistema para a monitoração e controle da contaminação cruzada no laboratório de análise microbiológico de alimentos. Metodologia: a metodologia empregada consistiu em desenvolver diagramas de fluxo para os procedimentos sobre o controle das populações de mesófilos aeróbios e mofos provenientes da contaminação nos ambientes, superfícies, material estéril e meios de cultivos. Estes diagramas incluíram uma árvore de decisões, criado para efetuar ações de controle com base nos intervalos de tolerância, estabelecidos como ferramenta objetiva para a tomada de decisões que normalizem os recontos das populações microbianas em questão. Resultados: os limites de alerta mais estritos se obtiveram para as populações de mesófilos aeróbios e mofos nos diferentes controles, exceto para o ambiente da área de preparação de meios e os correspondentes ao material estéril. Conclusão: o processo desenvolvido permitiu complementar o sistema de controle de qualidade interno no laboratório, ao dispor de um meio objetivo para o fecho de não conformidades por contaminação cruzada.

Virtualización de los semilleros de investigación: acaso un modelo de continuidad / Virtualization of seed research: perhaps a continuity model / Virtualização dos "Semilleros" de pesquisa: acaso um modelo de continuidade

Los semilleros de investigación fungen como una iniciativa concebida con el propósito de coadyuvar al rompimiento de paradigmas de aprehensión del conocimiento, soportados en un modelo intangible de discernimiento que supere el desaborido método de aprendizaje tradicional en el aula. La idea es que ese conocimiento trascienda hacia percepciones críticas transformantes del entorno, bajo un espacio autónomo que aporte herramientas para que el ente en formación logre una verdadera apropiación de competencias, en esencia científicas, pero con criterio ético y compromiso social. Tal concepción, sin embargo, podría percibirse locuaz, e incluso metafórica al contraste de una realidad puramente versátil, en la que el neófito no sólo pretende saciarse del fruto del conocimiento, sino que además requiere que se esgriman estrategias apropiadas de aprehensión para alcanzarlo. Surge entonces, a partir de la entelequia formativa, el uso de herramientas tecnológicas fundamentadas en los ambientes virtuales de aprendizaje, en aras de potenciar la motivación como alternativa frente al desenfoque de perspectivas y la incipiente actividad dentro de algunos prototipos de semilleros, de actitud encallada, que en ocasiones no distan del modelo magistral.

The research nurseries serve as a initiative designed for the purpose of contribute to the breakdown of seizure paradigms of knowledge, supported by a theoretical model of discernment that exceed the traditional method of learning in the classroom, to transcend critical insights into transforming the environment under an autonomous space to provide tools essentially scientific, but with ethical criterion and social commitment. Such a conception, however, could be perceived as talkative, and even metaphorical, at the contrast of reality purely versatile in which the neophyte not only tries to get enough of the fruit of knowledge, but also requires that appropriate strategies are put forward to achieve seizure. Then arises, from the formative entelechy the use of technological tools based on virtual learning environments, in order to enhance motivation as an alternative against the blurring of perspectives and the emerging business in some types of nurseries, stranded attitude, that sometimes not far from the master model.

Os "semilleros" de pesquisa exercem como uma iniciativa concebida com o propósito de coadjuvar ao rompimento de paradigmas de apreensão do conhecimento, suportados em um modelo intangível de discernimento que supere o insosso método de aprendizagem tradicional na aula. A ideia é que esse conhecimento transcenda a percepções críticas transformantes do entorno, sob um espaço autônomo que aporte ferramentas para que o ente em formação logre uma verdadeira apropriação de competências, essencialmente científicas, mas com critério ético e compromisso social. Tal concepção, entretanto, poderia se perceber loquaz, e inclusive metafórica ao contraste de uma realidade puramente versátil, na que o neófito não só pretende se saciar do fruto do conhecimento, senão que, além disso, requere que se esgrimam estratégias apropriadas de apreensão para alcançá-lo. Surge então, a partir da enteléquia formativa, o uso de ferramentas tecnológicas fundamentadas nos ambientes virtuais de aprendizagem, em ordem de potenciar a motivação como alternativa frente à falta de foco de perspectivas e a incipiente atividade dentro de alguns protótipos de "semilleros", de atitude encalhada, que em ocasiões não distam do modelo magistral.