Attitudes and practices of travelers regarding COVID-19 vaccine and adverse reactions

Objective.In the context of the global COVID-19 pandemic, COVID-19 vaccines were made available to different countries. This study aimed to assess travelers' attitudes and practices toward the COVID vaccine and adverse events. Methods. A survey was conducted using a questionnaire from April 1 to June 30, 2021, among travelers who came for their COVID-19 test at the Institut Pasteur of Côte d'Ivoire.Results. A total of 527 travelers agreed to participate in this study, including 336 men and 161 women. Overall, 26% of respondents had already received their COVID-19 vaccine, while 76% of respondents responded they did not want to be vaccinated. The age of those most vaccinated (116) ranged from 25 to 64 years with a small proportion for those over 65 years (0.8%). Travelers (41) to France were the most vaccinated. All vaccinated persons (135) had a high level of education and were either Christian (89 persons), Muslim (45 persons) or animist (1 person). Adverse events related to the COVID vaccination were reported in seven individuals. These included muscle pain, fever and nausea. Conclusion.Negative attitudes towards vaccines are a major public health concern. In view of these results, for awareness raising, vaccination campaign may be focused on youthand people over 65 years of age. Public health messages containing information about vaccine safety should be tailored to address this vaccine hesitancy

Investigation of rodent reservoirs of emerging pathogens in Côte d'Ivoire, West Africa

Background: One of the main health problems in West Africa remains upsurge of emerging pathogens. Ebola virus disease outbreak occurred in 2014 in Liberia, Guinea and Sierra Leone, Monkeypox virus in Nigeria in 2017 and most recently Lassa virus in Nigeria, Togo and Benin in 2018. These pathogens have animal reservoirs as vectors for transmission. Proper investigation of the pathogens in their rodent vectors could help reduce and manage their emergence and spread. Methodology: This study was conducted with an approval from the Côte d'Ivoire Bioethics Community. Small mammal trappings were carried out in 9 sites within three zones namely, peri-urban, peri-rural and protected areas. Liver, lung and kidney tissues from trapped small mammals were sampled in accordance with the recommended conditions of biosafety and bioethics. The organs were transported in liquid nitrogen to the laboratory. Molecular tests were used to detect pathogens. Orthopoxviruses and Monkeypox virus were detected in the organs by PCR using consensus primers targeting the virus surface membrane haemagglutinin (HA) genes, while Leptospira species were detected by PCR using primers targeting the rrs and lfb1 genes. Results: Out of 4930 night-traps, 256 (5.19%) small mammals were trapped including Crocidura, Rattus, Lophuromys, Praomys, Mus and Mastomys. Leptospira species were detected in 6 genera from 7 study sites and the infected small mammals accounted for 13.3%. Leptospira sp was detected mainly in the rodent vector genera Rattus (32.3%), Lophuromys (29.0%), and Praomys (16.1%). Three species of Leptospira were detected and Leptospira interrogans was the most common frequent species (74.2%). Monkeypox virus was not detected from studied small mammals. Conclusion: The initial data from our investigation indicates the presence of Leptospira sp in rodent vectors, Rattus, Lophuromys and Praomys, which are the potential small mammalian reservoirs of this pathogen in Cote d'Ivoire.

Molecular Characterization of Hepatitis B Virus Circulating in Asymptomatic and Symptomatic Carriers in Côte d’Ivoire from 2010 to 2013.

Background: Africa and Asia remain the continent most affected by viral hepatitis B with more than1 million deaths per year. These deaths are due to complications such as cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Several studies have shown that the rate of progression of hepatitis B to cirrhosis and liver cancer is related to the virus genotypes. Previous analyses of hepatitis B virus genome have revealed 10 genotypes (A-J) with distinct geographical distribution worldwide. Some studies have shown that the genotype E is predominant in West Africa. In Côte d'Ivoire, few data exist on the genotypes circulating. The presence of genotypes A, B, C and E has been proven but not their involvement in the development of liver complications. Aim of Study: To determine the hepatitis B virus genotypes circulating in asymptomatic and symptomatic carriers and to establish correlation between genotypes and clinical outcome in Côte d’Ivoire. Place and Duration of Study: Patients were recruited in different hospitals in Côte d’Ivoire and study was conducted in the National Reference Center for Viral Hepatitis of the Institute Pasteur from April 2010 to February 2013. Methodology: The study examined samples from 754 subjects using serological and molecular techniques. PCR and multiplex-nested PCR, using type-specific primers, were carried out to determine genotypes of hepatitis B virus in the study samples. Results: Hundred thirty nine were HBsAg-positive. Out of the 139, 49% were asymptomatic and 51% were symptomatic. Among the HBsAg-positive, the average age was 41years with 38.85% having HBV DNA in their blood samples. Sixty-four point eight percent of the latter were typeable with 97.1% as genotype E and 2.9% as genotype B. Conclusion: This study revealed a predominance of genotype E of HBV and revealed that genotype E was associated (P=0.03) with clinical Outcome.

Evaluation of Reverse Hybridization Diagnostic Strategy for Simultaneous Detection of Chlamydia Trachomatis and Neisseria Gonorrhoeae

We performed a non radioactive reverse hybridization assay for simultaneous detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae ; two pathogens influencing humain immunodeficiency virus (HIV) sexual transmission ; using 200 endo-cervical samples from pregnant women (Institute Pasteur n Cote d'Ivoire ).Diagnosis DNA sequences were amplified by multiplex polymerase chain reaction (PCR)using biotinylated primers. Amplified products were hybridized to different specific probes fixed as a line on membrane strips and visualized using a straptavidine /alkaline phosphatase conjugated system. The results were compared to Elisa (Enzyme linked Immunosorben Assay ) techniques and culture .The overall prevalence was 5and 15for N. gonerrhoeae and C. tranchomatis respectively and specificity of the reserve hybridization assay was high(100) .Additionally; PCR and radioactive hybridization reported here showed an increase in the sensitivity for detection of trichomonas vaginalis over conventional methods .The multiplex assays were highly effective for simultaneous detection of C. tranchomatis and N.gonorrhoeae in endocervical swab samples from women with without clinical signs of genitourinary infection .This technique allowing simultaneous diagnosis of pathogens could be great importance for epidemiological studies and management in public health interventions

Prevalence de Escherichia coli enteropathogenes dans le lait non pasteurise produit a Abidjan; Cote d'Ivoire

L'objectif de cette etude etait de determiner la prevalence de Escherichia coli enteropathogenes (ECEP) dans le lait non pasteurise. Un total de 207 echantillons ont ete analyses pour l'identification de E. coli. Les souches ont ete caracterisees par reaction de polymerisation en chaine (PCR) pour la detection des genes eaeA et bfp et un test a ete effectue sur lignee cellulaire Hep-2 pour la determination des phenotypes d'adhesion caracteristiques. La prevalence des E. coli presentant des genes de virulence dans le lait non Pasteurise est de 3;4(7 souches). La frequence des ECEP typiques (eaeA; bfp) est de 1;2. Les ECEP atypiques (eaeA+; bfp-) ont ete reveles dans 1;6des souches. Une adhesion localisee aux cellules Hep-2 a ete observee chez 3 (43) des souches possedant des facteurs de virulence. Le lait non pasteurise represente un facteur de risque de developpement d'infection a ECEP chez les enfants consommateurs

Evaluation du premier jet d'urine dans la detection de Neisseria gonorrhoeae chez des patients paucisymptomatiques a Abdidjan (Cote d'Ivoire)

Il existe differentes methodes de diagnostic sur differents types de prelevement pour mettre en evidence Neisseria gonorrhoeae. Le prelevement de premier jet d'urine presente l'avantage d'etre non invasif; facilement reproductible et est deja utilise dans la detection de N. gonorrhoeae par des techniques moleculaires. L'objectif de cette etude etait d'evaluer le premier jet d'urine dans la detection de N. gonorrhoeae par les methodes classiques de bacteriologie chez des patients paucisymptomatiques. Elle a porte sur les prelevements de premier jet d'urine et de secretions uretrales de 87 patients de sexemasculin recus pour le diagnostic etiologique d'un syndrome d'infections sexuellement transmissibles. Un examen direct du frottis colore par la technique de Gram et des cultures sur le milieu de Thayer et Martin modifie et sur gelose au sang cuit enrichie en polyvitamines ont ete realises sur chacun des echantillons. La frequence des uretrites etait de 58;0. La gonococcie representait 7;5des cas. Le premier jet d'urines avait une sensibilite de 85;7et une specificite de 97;5dans la mise en evidence des diplocoques Gram negatif a l'examen direct. Par contre; il etait moins sensible que le prelevement de secretions uretrales dans la mise en evidence des uretrites microscopiques (sensibilite de 44;4et specificite de 100) et de la flore uretrale d'accompagnement (sensibilite de 59et specificite de 96;9). Les bonnes performances du premier jet d'urines dans la mise en evidence microscopique des diplocoques Gram negatif pourraient justifier son utilisation dans la detection deNeisseria gonorrhoeae dans un laboratoire de niveau 1. Il pourrait egalement etre utilise dans les etudes epidemiologiques et dans les enquetes de depistage a grande echelle

Les infections urinaires neonatales a Abidjan : problematique de la resistance bacterienne

Les infections neonatales sont frequentes avec un taux de letalite de 20 a 70dans les pays en voie de developpement. Parmi ces infections neonatales; l'infection urinaire peut etre grave chez le nouveaune car elle met en jeu aussi bien le pronostic renal; avec l'atrophie ou l'insuffisance renale en l'absence de traitement adequat; que le pronostic vital. Le diagnostic de l'infection urinaire repose sur l'examen cytobacte-riologique des urines. Mais il est rarement effectue a cause de la pauperisation de nos populations. Le but de cette etude etait d'identifier les germes responsables des infections urinaires chez le nouveau-ne afin d'adapter le traitement. Patients et methodes : De juillet a decembre 2004; 720 nouveau-nes hospitalises en neonatalogie au service de pediatrie pour infection neonatale ont fait l'objet de prelevements d'urines en vue d'examen cytobacteriologique. Resultats La culture bacterienne a ete positive pour 136 echantillons soit 18;. Concernant les etiologies des infections urinaires; les bacilles a Gram negatif de la famille des Enterobacteriaceae etaient predominantes avec 77;5contre 26;5pour les cocci a Gram positif Streptococcus et Staphylococcus. La frequence d'isolement dans l'ordre decroissant des enterobacteries etait la suivante : Escherichia coli; Klebsiella; Enterobacter et Levinea avec respectivement 32; 28; 28et 12. Les taux de resistance globale des enterobacteries aux antibiotiques usuels variaient de 66;7a 85;7pour l'amoxicilline associee a l'acide clavulanique ; de 25a 66;7pour la ceftriaxone ; et de 0 a 33;3pour l'amikacine

Evaluation de la qualite des prelevements des patients ambulatoires dans un laboratoire de bacteriologie medicale : cas de l'Institut Pasteur de Cote d'Ivoire

L'importance de l'assurance qualite a toutes les etapes de l'analyse medicale n'est plus a demontrer; mais peu de laboratoire medical en Afrique s'engage dans ce processus. L'objectif de l'etude etait de contribuer a l'amelioration de la qualite des prelevements recus au laboratoire de bacteriologie de l'Institut Pasteur de Cote d'Ivoire. Materiel et Methodes : Une etude descriptive a ete menee dans ce laboratoire sur une periode de 6 mois. Ont ete inclus dans l'etude; tous les echantillons d'urines; de selles et d'expectorations bronchiques provenant de patients ambulatoires; recus au laboratoire de bacteriologie pendant la duree de l'etude. Les prelevements de patients hospitalises ont ete exclus. Au total; 300 echantillons ont ete repertories. Un questionnaire elabore a partir du Guide de Bonne Execution des Analyses et de la norme ISO 15189 a ete utilise pour l'evaluation de la qualite des prelevements. Resultats : Sur un total de 300 echantillons biologiques enregistres; 224 soit 74;7etaient nonconformes. Dans 87;5des cas de non-conformites; il s'agissait d'un traitement antibiotique prealable au prelevement. Des actions correctives ont ete menees au laboratoire sur 30 echantillons avec 56;6pour les urines; 26;7pour les selles et 16;7pour les expectorations bronchiques. Conclusion : Au terme de cette etude; il ressort que la qualite des prelevements recus au laboratoire de bacteriologie medicale est a ameliorer

Evaluation of 17 Medical Plants from Northern Cote d'Ivoire for their in vitro Activity Againts Streptococcus Pneumoniae

Twenty crude extracts from 17 species out of 11 families were assessed for their antibacterial activity against Streptococcus pneumoniae (Pneumococcus). The selected plants are used in Northern Cote d'Ivoire to treat various infections including respiratory track diseases. From all the tested extracts; only 7 from 6 plants showed a promising in vitro bactericidal activity against Peumococcus; including strains resistant to penicillin. The most active extracts were from Erythrina senegalensis (Fabaceae); Piliostigma thonningii (Caesalpiniaceae); Waltheria indica (Sterculiaceae); Andira inermis (Fabaceae); Uapaca togoensis (Euphorbiaceae); Keetia hispida (Rubiaceae) and Combretum molle (Combretaceae). This is the first time that the antipneumococcal activity of the tested plants is reported. The results of this preliminary investigation support the traditional use of these plants in the treatment of pneumococcal infections. The most active of them could be candidates for isolation of compounds which could serve as lead structures for the development of new drugs against Streptococcus pneumoniae

Activité antibactérienne des extraits de Mitracarpus Scaber sur la croissance in vitro des streptocoques hemolytiques

Nous avons teste l'action des extraits (extrait total aqueux; extrait ethanolique 70; residu insoluble dans l'ethanol 70; extrait ethanolique 100et extrait butanolique) de Mitracarpus scaber (Rubiaceae) sur la croissance in vitro des streptocoques ? hemolytiques en milieu liquide et sur milieu solide de Milieu-Hinton. Cette plante codifiee MISCA dans notre etude; a toujours ete utilisee dans la pharmacopee ivoirienne contre les infections cutanees. Les resultats de notre etude montrent que les souches des treptocoques ? hemolytiques sont sensibles a tous les extraits testes. Cependant; seul l'extrait butanolique a une meilleure activite bactericide sur la croissance in vitro de ces souches. Les parametres antibacteriens obtenus sont les suivants : CMI = 3;13 mg/ml; CMB = 0;39 mg/ml et CI50 = 0;02 mg/ml

Electropherotypes of rotaviruses in children less than 5 years old in Abidjan, Côte d'Ivoire in 1997

Rotaviruses Are associated with gastroenteritis in human infants and the young of many species. In this study, we analysed the circulating strains of human rotavirus isolated from young children in Abidjan by electrophoresis of the viral RNA genome in agarose gels. Rotavirus strains were identified in 33 children less than two years of age in the Yopougon district of Abidjan, Cote d'lvoire. Viral RNA was extracted from the stools by phenol-chloroform treatment at 56 degrees C, followed by centrifugation at 12 OOOrpm. The electrophoresis was performed in 1.5 % agarose gels stained with 5 % ethidium bromide and Tris-acetate as the running buffer. Ten ul of each sample was loaded onto the gels which were run at lOOv for 30min. In total, 17 of the 33 specimens yielded an RNA electropherotype. Seven different RNA profiles were observed with 14 (82.4% ) long profiles and 3 (17%) short profiles. These RNA profiles represented the group A rotavirus pattern. No mixed infections were seen. There was no correlation between the age and sex of the patient with the RNA electropherotype. Serogroup A rotaviruses were the principle strains circulating in this study. Further characterization of these strains at the subgroup and serotype level will be conducted

Place de l'infection a chlamydia trachomatis dans les oligoasthenospermies a Abidjan

Dans le but de rechercher la prevalence de l'infection a chlamydia trachomatis dans les oligoasthenospermies a Abidjan; 58 patients africains; de sexe masculin; sans symptomes uretraux et presentant une oligoasthenospermie ont ete analyses. L'age moyen des patients etait de 34;8 ans et 55;17 avaient un antecedent de maladie sexuellement transmissible (uretrite d'etiologie non determinee). La presence de Chlamydia trachomatis a ete recherchee par la coloration de Giemsa et la technique Elisa. A l'examen direct (coloration de Gram); 79;3 pour cent des patients presentaient des signes d'uretrite (polynucleaires neutrophiles superieurs a 5 par champ X 1000). Parmi ceux-ci; 45;65 pour cent avaient des cellules a inclusion et 19 pour cent etaient positifs pour l'antigene chlamydia en Elisa. La severite de l'oligoasthenospermie; semble liee a l'infection a Chlamydia trachomatis et la place de Neisseria gonorrhoeae n'est pas negligeable (26 pour cent)

L'antibioprophylaxie dans un service de chirurgie générale en milieu africain: étude préliminaire de 120 cas au CHU de Treichville

Les auteurs rapportent leur experience a propos de l'antibioprophylaxie en milieu chirurgical; devant les problemes poses et le cout de l'antibiotherapie l'ATB systematique de couverture. 120 patients ont ete soumis a ce protocole en fonction du degre de leur septicite de leur intervention. Le taux global d'infection post-operatoire etait de 6;6 pour cent avec une mortalite de 1;6 pour cent des cas

Les résidus d'antibiotiques dans les effluents hospitaliers de Bamako (Mali)

L'objectif de ce travail était de déterminer la concentration des résidus d'antibiotiques dans les effluents de deux hôpitaux de Bamako. Méthodes : La collecte des échantillons des effluents hospitaliers a été réalisée trois fois par jour à des heures précises : 9 heures, 15 heures et 21 heures conformément au moment des rejets de la station d'épuration, trois jours consécutifs par semaine et pendant un mois. L'analyse des échantillons a été faite par chromatographie phase liquide (HPLC), Agilent 1100 sur colonne C18. La concentration des antibiotiques a été mesurée à l'aide d'un spectrophotomètre UV-Visible Hewlett Packard.Résultats : Quatre antibiotiques ont été détectés et quantifiés dont trois régulièrement dans les effluents hospitaliers. Il s'agit de l'amoxicilline (0,066 ± 0,08 µg/l), l'érythromycine (0,04 ± 0,0 µg/l), sulfaméthoxazole + triméthoprime (0,06 ± 0,21 / 0,08 ± 0,006 µg/l) et du métronidazole (0,02 ± 0,0 µg/l). L'amoxicilline et le sulfaméthoxazole ont été détectés et quantifiés sur les deux points, l'érythromycine et le métronidazole seulement au CHU du Point « G ». Le sulfaméthoxazole a été dosé aux différentes heures dans les effluents des deux hôpitaux, il n'est pas détecté dans les eaux du canal de « Chikoroni ». Le chloramphénicol, la ciprofloxacine et la tétracycline n'ont été détectés à aucun point de prélèvement. Les concentrations d'antibiotiques observées aux différentes heures de prélèvements montrent des pics en général semblables au niveau des différents sites. Conclusion : La qualité de nos effluents n'est pas aussi alarmante. Des mesures doivent être prises en vue de l'évaluation du risque sanitaire et du développement des méthodes nécessaires pour limiter les rejets de résidus médicamenteux dans l'environnement. Mots-clés : résidus d'antibiotiques ; effluents hospitaliers ; Bamako