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1.
Biomédica (Bogotá) ; 42(3): 541-545, jul.-set. 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1403605

ABSTRACT

Introduction: Monkeypox virus (MPXV) is an enveloped double-stranded DNA virus with a genome of approximately 197.209 bp. The current classification divides MPXV into three clades: Clade I (Central African or Congo Basin clade) and clades IIa and IIb (West African clades). Objective: To report the complete genome and phylogenetic analysis of a human monkeypox case detected in Colombia. Materials and methods: Exudate from vesicular lesions was obtained from a male patient with recent travel history to Spain. A direct genomic approach was implemented in which total DNA from the sample was purified through a column-based method, followed by sequencing on the Nanopore GridION. Reads were aligned against the MPXV reference genome using minimap2 v.2.24 and phylogenetic inference was performed using maximum likelihood estimation. Results: A total of 11.951 reads mapped directly to a reference genome with 96.8% of coverage (190.898 bp). Conclusion: Phylogenetic analysis of the MPXV circulating in Colombia demonstrated its close relationship to clade IIb responsible for the multi-country outbreak in 2022.


Introducción. El virus de la viruela del mono (MPXV) está compuesto por un genoma de ADN bicatenario, aproximadamente, de 197.209 pb. La clasificación actual agrupa el MPXV en tres clados: clado I (de la cuenca del Congo en África central), y clados IIa y IIb (de África occidental). Objetivo. Reportar el genoma completo y el análisis filogenético de un caso humano de viruela símica detectado en Colombia. Materiales y métodos. Se obtuvo exudado de lesiones vesiculares de un paciente varón con el antecedente de un viaje reciente a España. Se implementó un enfoque directo, en el cual se purificó el ADN total de la muestra mediante un método basado en columnas, seguido de la secuenciación directa en la plataforma Nanopore GridION. Las lecturas se alinearon con el genoma de referencia del MPXV, utilizando minimap2, v.2.24, y la inferencia filogenética fue realizada mediante la estimación por máxima verosimilitud. Resultados. Un total de 11.951 lecturas se alinearon directamente con el genoma de referencia con una cobertura del 96,8 % (190.898 pb). Conclusión. El análisis filogenético del MPXV circulante en Colombia demostró su estrecha relación con el clado de África occidental (clado IIb) responsable del brote en múltiples países en el 2022.


Subject(s)
Monkeypox virus , Nanopore Sequencing , Phylogeny , Colombia
2.
VozAndes ; 17(1): 46-49, 2006.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1100708

ABSTRACT

La membrana Pre- pilórica es una malformación es una malformación congénita poco frecuente que se asocia a vómito progresivo y alteraciones en el peso y la talla es importante definir que el vómito puede tener múltiples orígenes entre los cuales tenemos: técnica defectuosa de la alimentación, infecciones, entidades neurológicas, endocrinol{ogicas, renales, etc. lo que hace indispensable manejar una historia clínica minuciosa. Se evidencia la gran capacidad de hemeorresis del ser humano que pese a no recibir el aporte nutricional adecuado, se adapta a las circunstancias creando una nueva curva de crecimiento muy por debajo de lo normal pero paralela. Se presenta la evolución de un paciente masculino con Membrana Pre-pilórica tratado quirúrgicamente a los 6 años 8 meses de edad, determinándose la historia natural de la patología, su diagnóstico diferencial y las consecuencias pondo estaturales que pueden cursar sin dar alteraciones concurrentes del desarrollo psicomotor, como en éste caso. Conclusión: El vómito progresivo asociado a deterioro pondo-estatural en neonatos y lactantes deben estudiarse detalladamente debido a que su etiología puede ser secundaria a múltiples patologías.


The Pyloric membrane is a malformation is a rare congenital malformation that is associated with progressive vomiting and changes in weight and height, it is important to define that vomiting can have multiple origins, among which we have: defective feeding technique, infections , neurological entities, endocrinol {ogicas, renal, etc. which makes it essential to manage a thorough medical history. It is evident the great capacity of hemeorresis of the human being that despite not receiving the adequate nutritional contribution, adapts to the circumstances creating a new growth curve well below normal but parallel. The evolution of a male patient with a Pre-pyloric Membrane treated surgically at 6 years 8 months of age is presented, determining the natural history of the pathology, its differential diagnosis and the post-statural consequences that can occur without giving concurrent alterations of psychomotor development. , as in this case. Conclusion: Progressive vomiting associated with fundus-statural impairment in neonates and infants should be studied in detail because its etiology may be secondary to multiple pathologies.


Subject(s)
Humans , Child , Congenital Abnormalities , Weight by Height , Malnutrition , Vomiting , Feeding and Eating Disorders , Gastric Outlet Obstruction
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