Relevance of the ancestry for the variability of the Drug-Metabolizing Enzymes CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 polymorphisms in a multiethnic Costa Rican population / Relevancia de la ancestría para la variabilidad de polimorfismos de las enzimas metabolizadoras de fármacos CYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 en una población multiétnica de Costa Rica

Abstract:CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 metabolize around 40 % of drugs and their genes vary across populations. The Costa Rican population has a trihybrid ancestry and its key geographic location turns it into a suitable scenario to evaluate interethnic differences across populations. This study aims to describe the diversity of CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 polymorphisms in Costa Rican populations in the context of their ancestry. A total of 448 healthy individuals were included in the study: Bribri (n= 47), Cabécar (n= 27), Maleku (n= 16), Guaymí (n= 30), Huetar (n= 48), Chorotega (n= 41), Admixed/Mestizos from the Central Valley/Guanacaste (n= 189), and Afro-Caribbeans (n= 50) from Limón. CYP2C9 (alleles *2, *3, *6) and CYP2C19 (*2, *3, *4, *5, *17) genotypes were determined by Real-Time PCR. African, European and Native American ancestry were inferred using 87 ancestry informative markers. The frequency of the decreased activity allele CYP2C9*2 is lower in the self-reported Amerindian groups compared to the admixed population, and the highest frequencies of CYP2C19*2 (null activity) and the CYP2C19*17 (increased activity) were found in the self-reported AfroCaribbean population. Moreover, a frequency of 0.7 % CYP2C9 gPMs in the Admixed population and a variable frequency of CYP2C19 gUMs (0.0-32.6 %, more prevalent in Afro-Caribbeans) in Costa Rican populations, was found. Finally, the following alleles were positively correlated with genomic African ancestry and negatively correlated with genomic Native American ancestry: CYP2D6*5 (null activity), CYP2D6*17 (decreased activity), CYP2D6*29 (decreased activity) and CYP2C19*17 (increased activity). No correlation for CYP2C9 polymorphisms and genomic ancestry was found. Further studies assessing the CYP2C9 and CYP2C19 sequence in these populations, preferentially by sequencing these genes, are warranted. Rev. Biol. Trop. 64 (3): 1067-1076. Epub 2016 September 01.

ResumenCYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 metabolizan aproximadamente el 40 % de los fármacos y los genes que las codifican varían en las distintas poblaciones humanas. La población costarricense posee ancestría trihíbrida y su posición geográfica estratégica la convierten en un escenario idóneo para evaluar la variabilidad interétnica en sus poblaciones multiétnicas. El presente estudio tiene como objetivo describir la diversidad de los polimorfismos CYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 en las poblaciones costarricenses en el contexto de su ancestría. Un total de 448 individuos sanos fueron incluidos: Bribri (n= 47), Cabécar (n= 27), Maleku (n= 16), Guaymí (n= 30), Huetar (n= 48), Chorotega (n= 41), mestizos del Valle Central y Guanacaste (n= 189) y afrocaribeños de Limón (n= 50). Los genotipos CYP2C9 (alelos *2, *3, *6) y CYP2C19 (*2, *3, *4, *5 y *17) fueron determinados mediante PCR tiempo real. Las ancestrías africana, europea y nativa americana fueron inferidas usando 87 marcadores informativos de ancestría. La frecuencia del alelo de actividad disminuida CYP2C9*2 fue menor en los grupos autodefinidos de amerindios que en la población mestiza y las frecuencias más altas de CYP2C19*2 (actividad nula) y CYP2C19*17 (actividad incrementada) se encontraron en la población autodefinida afrocaribeña. Asimismo, se encontró una frecuencia de gPMs CYP2C9 de 0.7 % en la población mestiza y una frecuencia variable de gUMs CYP2C19 (0.0 a 32.6 %, más prevalente en afrocaribeños) en las poblaciones costarricenses. Por último, los siguientes alelos fueron positivamente correlacionados con la ancestría africana y negativamente con la ancestría nativa americana: CYP2D6*5 (actividad nula), CYP2D6*17, CYP2D6*29 (ambos de actividad disminuida) y CYP2C19*17 (actividad incrementada). No se encontró correlación entre los polimorfismos CYP2C9 y la ancestría. Se requieren estudios posteriores que evalúen la secuencia de CYP2C9 y CYP2C19 en estas poblaciones, preferiblemente mediante la secuenciación de estos genes.

Marcadores autoinmunes en el lupus eritematoso sistémico / Autoinmune markers in Systemic Lupus Erythemathosus

En este trabajo se determinó el valor clínico de varios marcadores en el lupus eritematoso sistémico (LES). Muestras de suero de 33 pacientes fueron estudiadas para la presencia de anticuerpos antinucleares (inmunofluorescencia indirecta, ANA-IFI) y de las especificidades siguientes: anti-DNA de doble cadena (radioinmunoensayo, anti-Sm/RNP, anti-Ro, anti-Scl-70 y anti-Jo-1 (ensayo inmunoenzimático). También se evaluó la presencia del factor reumatoide (FR, aglutinación de latex) y de los inmunocomplejos circulantes; estos últimos, determinados por los métodos de precipitación con polietilenglicol (ICC-PEG) y el inmunoenzimático basado en el reconocimiento del Ciq (ICC-Ciq). Resultados. Todos los pacientes fueron identificados por ANA-IFI y el 82 por ciento fueron positivos para los antiDNA. Los anti-Sm/RNP se encontraron en el 46 por ciento, los anti-Ro en el 30 por ciento, los anti-Scl-70 en el 15 por ciento, los anti-Jo-1 en el 3 por ciento y el FR en el 6 por ciento de los pacientes. La presencia de los ICC-PEG caracterizó el 39 por ciento y los ICC-Clq al 15 por ciento de los casos. Ninguno de los marcadores inmunológicos se asoció a la actividad de la enfermedad ni al daño renal. Conclusiones. No obstante haber encontrado múltiples marcadores serológicos autoinmunes en el LES, no ha resultado evidente que éstos sean indicadores de la afección tisular de esta enfermedad

Determinación de los anticuerpos anti-DNA de doble cadena por los métodos de inmunofluorescencia indirecta y por radioinmunoanálisis de fase líquida / Determination of double chain anti-DNA antibodies by indirect immunofluorescence and liquid phase radioimmunoassay

Con el objetivo de validar las láminas de Crithidia luciliae (CL) de producción nacional (Centro Nacional de Biopreparados, Cuba) se estudió la presencia de los anticuerpos anti-DNA de doble cadena (anti-DNAdc) en las muestras séricas de 408 pacientes con enfermedades reumáticas, por los métodos de inmunofluorescencia indirecta con el empleo de CL (IFI-CL) y el radioinmunoanálisis (RIA) de fase líquida, U.K. Se observó una concordancia en el 85,05 % de los resultados obtenidos por ambos métodos, lo que se corresponde con un coeficiente Kappa de 0,662 (p<0,0001). La concordancia entre IFI-CL y el RIA resultó más alta (Kappa igual a 0,776, p<0,0001) cuando se consideraron los valores de anti-DNAdc menores de 20 U/mL y mayores de 50 U/mL obtenidos por RIA. La sensibilidad del método de IFI-CL para el diagnóstico del lupus eritematoso sistémico (LES) alcanzó el 61,17 %, y la especificidad el 73,39 %, mientras que la sensibilidad diagnóstica del RIA en relación con las cifras de anti-DNAdc superiores a 25 U/mL, rsultó del 60,19 % y la especificidad del 81,65

Monitoreo inmunológico con anticuerpos monoclonales de pacientes trasplantados de corazón: estudio preliminar / Immunologic monitoring with monoclonal antibodies of heart transplanted patients: preliminary study

Se estudiaron de forma seriada las poblaciones linfocitarias en sangre periférica reactiva con los anticuerpos monoclonales Behring Monoclonal Antibodies (BMA)-030 (pan-T), BMA-040 (T4) y BMA-081 (T8) en 15 pacientes trasplantados de corazón en nuestro centro. Se observaron diferencias significativas con tendencia al descenso de los valores relativos de los linfocitos T3 y T8 asociados a episodios de rechazo histológico y clínico del órgano aloinjertado. El cociente T4/T8 se comportó de forma dispersa e independiente del estado clínico. Se encontraron valores bajos de ciclosporina en sangre (* 250 ng/mL) en el 33,3 % de determinaciones correspondientes a rechazo y en el 13,3 % de las de funcionamiento estable del corazón. Se encontró una ligera tendencia al movimiento inverso entre los niveles de ciclosporina en sangre y los valores relativos de linfocitos T3 (p < 0,05), T4 (p < 0,01) y el cociente T4/T8 (p < 0,01). Se señala la importancia del estudo de una muestra numéricamente mayor que permita la valoración definitiva de la aplicación del monitoreo inmunológico inespecífico en el tratamiento clínico del paciente trasplantado de corazón

La evaluación de ritmos biológicos mediante el cosinor / Assessment of life rhythms by cosinor

Se analiza la técnica para la evaluación estadística de ritmos biológicos. Son señaladas sus principales características y posibilidades. A modo de ilustración, la técnica es aplicada a las series de tiempo de la fructosa y la dihidrotestosterona en un grupo de 7 hombres normales

Evaluación de la mortalidad infantil según condiciones higienicosociales en el município: un enfoque multivariado / Evaluation of infantile mortality according to sociohygienic conditions at the municipalities: a multivariate analysis

Se realiza una evaluación relativa de la mortalidad infantil por municipios. Se indica que la práctica usual consiste básicamente en comparar las tasas correspondientes, y ocasionalmente en delimitar la posición de cada cual, con respecto de la media provincial o nacional. Se ofrece un enfoque menos simplista que reposa en la consideración de que en los valores de las tasas influyen, además de la gestión de salud, las condiciones higienicosociales de cada territorio. Se contempla, mediante la técnica de regresión múltiple, el efecto de diversas variables inherentes al nivel de desarrolo de cada municipio y por ese conducto se obtienen tasas teóricas para sus condiciones higienicosociales específicas. Se discute, con datos de 1981, la posición relativa de los 169 municipios del país, luego de haberse controlado el efecto de 10 factores higienicosociales. Se obtienen resultados que avalan el método como herramienta complementaria para el análisis