Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica / Bioinformatic resources applied on the omic sciences as genomic, transcriptomic, proteomic, interatomic and metabolomic

As ciências ômicas tratam da análise global dos sistemas biológicos, integrando diferentes áreas do conhecimento, como a bioquímica, genética, fisiologia e computação, com o objetivo de isolar e caracterizar genes, proteínas e metabólitos, assim como estudar as interações entre eles, com base em técnicas experimentais, softwares e bancos de dados. A bioinformática por sua vez, propõe novas formas de ciência baseada na experimentação in silico, sendo muito dinâmica na sua atualização e fornecendo a base para geração de novos dados e conhecimentos que podem ser aplicados na pesquisa básica e na aplicada com o desenvolvimento de novos produtos e soluções. Este processo está intimamente relacionado à inovação tecnológica, que é conseguida unindo-se a biotecnologia e a bioinformática. Contudo, o objetivo desta revisão é apresentar uma pequena abordagem dos recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas, como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica, metabolômica, farmacogenômica, dentre outras.

The omic sciences had a wide point of view of the biological systems, integrating different knowledgement areas, as biochemistry, genetics and physiology, with the aim of isolation and characterization of genes, proteins and metabolites as well study their interactions, based on experimental techniques, softwares and data banks. Bioinformatics proposes a new science, which is based on in silico experimentation, being very dynamic in its update and also can provides the basis for generation of new data and knowledge that can be applied in basic research and applied to the development of new products and solutions. This process is closely related to technological innovation, which is achieved joining biotechnology and bioinformatics. However, the objective of this review is to present a small approach of bioinformatics resources applied to the omics science, like genomics, transcriptomics, proteomics, interatomics, metabolomics, pharmacogenomics, among others.

Aspectos epidemiológicos da Leishmaniose Tegumentar Americana no município de Juína, Mato Grosso, Brasil / Epidemiological aspects of American Cutaneous Leishmaniasis in the city of Juína, Mato Grosso state, Brazil

Objetivos: o objetivo deste trabalho foi estudar possíveis consequências da ação antrópica nas regiões urbana e rural do Município de Juína, estado de Mato Grosso, descrever aspectos epidemiológicos da Leishmaniose Tegumentar Americana e investigar a relação desta doença com atividades ocupacionais. Métodos: foram analisadas as notificações de Leishmaniose Tegumentar Americana no Município no período entre 2004 e 2006, fornecidas pela Secretaria Municipal de Saúde. Resultados: observou-se que entre os 458 casos notificados de Leishmaniose Tegumentar Americana foi maior a proporção de indivíduos do sexo masculino (89,10% dos casos), da faixa etária entre 20 a 39 anos (49,10%) e de atividades ocupacionais voltadas para a agropecuária e para o garimpo (62,90%). Ao analisar o possível local da fonte de infecção observou-se que a grande maioria dos indivíduos infectados esteve em contato com a zona rural (95,40%). Em relação ao tipo de lesão, observou-se predomínio das lesões do tipo cutâneo (94,10%). Conclusões: a análise dos dados revelou que a Leishmaniose Tegumentar Americana é uma parasitose importante no município de Juína. Os dados sugerem relação com a atividade laboral e um perfil de transmissão predominantemente silvestre, o que deve ser levado em conta ao definir medidas de controle da doença na região.

Aims: To assess the possible consequences of anthropic action and to describe the epidemiological aspects of American Cutaneous Leishmaniasis, as its relationship to occupational activities, in urban and rural areas of Juína County, state of Mato Grosso, Brazil. Methods: Data from the City Department of Health of Juína were analyzed. From 2004 to 2006, 458 notifications of the disease were analyzed. Results: We observed that among the notified cases of American Cutaneous Leishmaniasis there were more male individuals (89.10% of the cases). Age group between 20 to 39 years (49.10%) was the most frequent, and most people worked in farming and mine exploration (62.90%). When analyzing the possible source of infection, it has been observed that the great majority had previous contact with agricultural zone (95.40%). Cutaneous type lesions were the most frequent (94.10%). Conclusions: Our study showed that American Cutaneous Leishmaniasis is an important parasitosis in Juína County. Our data points to a relationship between the occurrence of the disease and occupational activities, and suggests that transmission occurs mainly in the forest zone, which is worth of attention for defining control measures in Juína region.

Trabalho e síndrome da estafa profissional (Síndrome de Burnout) em médicos intensivistas de Salvador / Professional Burnout Syndrome among intensive care physicians in Salvador, Brazil

OBJETIVO: Descrever a prevalência da Síndrome de Burnout em médicos intensivistas de Salvador, associando-a a dados demográficos e aspectos da situação de trabalho (demanda) psicológica e controle sobre o trabalho. MÉTODOS: Um estudo de corte transversal investigou a associação entre aspectos psicossocias do trabalho e a síndrome da estafa profissional em uma população de 297 médicos intensivistas de Salvador, Bahia. Um questionário individual autoaplicável avaliou aspectos psicossociais do trabalho, utilizando o modelo demanda-controle (Job Content Questionnaire) e a saúde mental dos médicos, usando Inventário de Burnout de Maslach (MBI). RESULTADOS: Constatou-se elevada sobrecarga de trabalho e de trabalho em regime de plantão. A prevalência da Síndrome da Estafa Profissional (Burnout) foi de 7,4 por cento e estava mais fortemente associada com aspectos da demanda psicológica do trabalho do que com o controle deste por parte dos médicos intensivistas. CONCLUSÃO: Médicos com trabalho de alta exigência (alta demanda e baixo controle) apresentaram 10,2 vezes mais burnout que aqueles com trabalho de baixa exigência (baixa demanda e alto controle).

OBJECTIVE: Describe prevalence of the Burnout syndrome in intensive care physicians of Salvador, associated to demographic data and aspects of the work environment (psychological demand and job control). METHODS: This cross sectional study has investigated the association between work conditions and Burnout Syndrome in a population of 297 Intensive Care Physicians from Salvador, Bahia, Brazil. An individual, self-report questionnaire evaluated the physicians' psychological aspects of work, using the demand-control model (Job Content Questionnaire) and their mental health, using the Maslash Burnout Inventory (MBI). RESULTS: The study found work overload,a high proportion of on duty physicians and low income for the hours worked. Prevalence of the Burnout Syndrome was 7.4 percent and it was more closely associated with aspects of the job's psychological demand than with its control. CONCLUSION: Physicians under great stress (high demand and low control) presented prevalence of the Bornout Syndrome 10.2 times higher than those under low stress (low demand and high control) jobs.

Médicos plantonistas de unidade de terapia intensiva: perfil sócio-demográfico, condições de trabalho e fatores associados à síndrome de burnout / Intensive care unit physicians: socio-demographic profile, working conditions and factors associated with burnout syndrome

OBJETIVOS: A síndrome de Burnout é uma reação de estresse excessivo relacionada ao trabalho que se apresenta em três dimensões: exaustão emocional, despersonalização e ineficácia. O objetivo deste estudo foi descrever o perfil de médicos plantonistas de unidades de terapia intensiva e avaliar os fatores associados à presença de síndrome de Burnout nessa população. MÉTODOS: Estudo descritivo de corte transversal, avaliando os médicos que trabalham em unidades de terapia intensiva adulto de Salvador-BA com carga mínima de 12 horas de plantão semanal. Foi distribuído um questionário auto-aplicável dividido em duas partes: a primeira referente a características sóciodemográficas e a segunda composta da avaliação da síndrome de Burnout através do Maslach Burnout Inventory. RESULTADOS: Foram avaliados 297 plantonistas, sendo 70 por cento homens. A média de idade e de tempo de formado foi de 34,2 e 9 anos, respectivamente. Níveis elevados de exaustão emocional, despersonalização e ineficácia foram encontrados em 47,5 por cento, 24,6 por cento e 28,3 por cento, respectivamente. A prevalência da síndrome de Burnout, considerada como nível elevado em pelo menos uma dimensão, foi de 63,3 por cento. Esta prevalência foi significativamente menor nos médicos que possuíam título de especialista em medicina intensiva, com mais de nove anos de formado e que ainda pretendem trabalhar por mais de 10 anos em unidades de terapia intensiva. A prevalência foi maior nos médicos com mais de 24 horas de plantão ininterrupto em terapia intensiva por semana. CONCLUSÕES: A prevalência de síndrome de Burnout foi elevada entre os médicos avaliados, sendo mais freqüente nos plantonistas mais jovens, com elevada carga de trabalho e sem especialização em medicina intensiva.

OBJECTIVES: Burnout syndrome is a response to prolonged occupational stress that involves three main dimensions: emotional exhaustion, depersonalization, and reduced personal accomplishment. The aim of this study was to describe socio-demographic characteristics of intensive care unit physicians and evaluate factors associated to the presence of Burnout syndrome in this population. METHODS: A cross-sectional study was performed to evaluate physicians who have worked in intensive care units from the city of Salvador (Bahia - Brazil) with a minimum weekly workload of 12-hour. An anonymous self-reported questionnaire was used and it was divided into two parts: socio-demographic characteristics and evaluation of Burnout syndrome through Maslach Burnout Inventory. RESULTS: We studied 297 physicians and most of them were male (70 percent). The mean age and time of graduation were, respectively, 34.2 and 9 years. High levels of emotional exhaustion, depersonalization, and reduced personal accomplishment were found in respectively, 47.5 percent, 24.6 percent and 28.3 percent. The prevalence of Burnout syndrome, considered as high level in at least one dimension, was of 63.3 percent. This prevalence was statistically lower in physicians specialized on intensive care, those with more than nine years of graduation and those who intend to continue working in intensive care units for more than 10 years. The prevalence was higher in the doctors with more than 24-hours of uninterrupted intensive care work per week. CONCLUSIONS: Burnout syndrome was common among intensive care physicians and it was more frequent in the youngest doctors, with higher workload and without specialization on intensive care.

Dynamics of allochthonous organic matter in a tropical Brazilian headstream

The species composition of the riparian vegetation and the seasonal contribution of input and storage of fine and coarse particulate organic matter were assessed in a 3rd order stretch. Fourteen tree species in the riparian zone were identified, with 3 species contributing with 68 percent of total litter input: Miconia chartacea Triana (43 percent), Miconia cyathanthera Triana (16 percent) and Erythroxylum pelletarianum St. Hil (9 percent). The allochthonous input of coarse particulate organic matter (CPOM) was composed mainly by leaves (over 50 percent). Species composition and the contribution of each plant species biomass for vertical, lateral and soil inputs and benthic stocks varied along the study period. The maximum values found in September, November and December coincided with the beginning of the rainy season. There were no differences between the allochthonous vertical and lateral inputs of CPOM to the stream. Differently to other studies, this result was probably due to the peculiar composition of streamÆs riparian vegetation at Serra do Cipó.

Foram determinadas as espécies que compõem a vegetação ripária e avaliada a variação sazonal da entrada e o estoque de matéria orgânica particulada grossa (MOPG) em um trecho de 3ª ordem. Três espécies dentre 14 identificadas foram as mais abundantes na região ripária: Miconia chartacea Triana (43 por cento), Miconia cyathanthera Triana (16 por cento) and Erythroxylum pelletarianum St. Hil (9 por cento). A matéria orgânica particulada alóctone foi composta principalmente por folhas (acima de 50 por cento) Foi observado que MOPG e MOPF no estoque bêntico aumentou de julho a dezembro de 2001, sendo mais elevado em setembro, novembro e dezembro com o início da estação chuvosa. A composição de espécies e a biomassa de cada espécie no aporte de matéria orgânica vertical, lateral, no solo e estoque bêntico variaram ao longo do período estudado. Não foram encontradas diferenças significativas entre os aportes de matéria orgânica vertical, lateral e no solo. Este resultado contraria os encontrados em outros estudos, o que provavelmente expressa um caráter peculiar da vegetação ripária dos riachos de altitude na Serra do Cipó.

Fluoride release by restorative materials before and after a topical application of fluoride gel

The release of fluoride from restorative materials (Vitremer, Ketac-Fil, Fuji II LC and Freedom) was evaluated during two 15-day periods, before and after a topical application of acidulated phosphate fluoride gel (APF). For each material, 6 specimens were made, which were immersed in 2 ml of deionized water. The fluoride concentration dosages in the solutions were read at intervals of 24 hours for 15 days. After this period, the specimens of each material received treatment with APF gel for 4 minutes and the fluoride released was analyzed at 24-hour intervals during the following 15 days. The analysis of variance and the Tukey test (p < 0.05) showed that the total mean fluoride released during the initial 15 days was greater for Vitremer and Ketac-Fil and lower for Fuji II LC and Freedom; and in the final 15 days there was a difference in release readings, with the greatest value for Vitremer, followed by Fuji II LC, Ketac-Fil and Freedom. The comparison of the results between the 1st day and the 16th day (after gel application) showed a greater fluoride release on the 16th day for Vitremer, Fuji II LC and Freedom and was equal for Ketac-Fil. Although all the materials evaluated gained fluoride with the application of APF, the data suggest that the resin-modified ionomers are more efficient in releasing fluoride to the medium than the other materials

Liberação de flúor por materiais restauradores antes e após a aplicação tópica de flúor em gel / Liberação de flúor por materiais restauradores antes e após a aplicação tópica de flúor em gel

Avaliou-se a liberação de flúor de materiais restauradores (Vitremer, Ketac-Fil, Fuji II LC e Freedom) durante 2 períodos de 15 dias, antes e após a aplicação tópica de fluorfosfato acidulado (FFA). Foram confeccionados, para cada material, 6 corpos-de-prova que foram imersos em 2 ml de água deionizada. As dosagens da concentração de flúor das soluções foram realizadas em intervalos de 24 horas durante 15 dias. Após esse período, os corpos-de-prova de cada material receberam tratamento com gel de FFA durante 4 minutos. O flúor liberado foi analisado em intervalos de 24 horas durante 15 dias. A análise de variância e o teste de Tukey (p < 0,05) mostraram que a média total de flúor liberado durante os 15 dias iniciais foram maiores para o Vitremer e o Ketac-Fil e menores para o Fuji II LC e Freedom; e nos 15 dias finais apresentaram diferença de liberação, com maior valor para o Vitremer, seguido pelo Fuji II LC, Ketac-Fil e Freedom. A comparação dos resultados entre o 1º dia e o 16º dia (após aplicação do gel) mostrou uma maior liberação de flúor no 16º para o Vitremer, Fuji II LC e Freedom e igual para o Ketac-Fil. Embora todos os materiais avaliados tenham ganhado flúor pela aplicação de fluorfosfato acidulado, os dados sugerem que os cimentos de ionômero de vidro modificados por resina são mais eficientes para liberar o flúor do que os outros materiais