Primer aislamiento y caracterización de la cepa prototipo del virus SARS-CoV-2 a inicios de la pandemia de la COVID-19 en el Perú

Introducción: Actualmente los contagios por el virus del SARS-CoV-2 supera los 600 millones de casos en el mundo. Objetivo: Aislar y caracterizar el virus SARS-CoV-2 causante de la COVID-19 a inicios de la pandemia en el Perú. Materiales y métodos: Se realizó el aislamiento viral a partir de 20 muestras de hisopado nasal y faríngeo positivas a SARS-CoV-2 por RT-PCR. El aislamiento se realizó en las líneas celulares Vero ATCC CCL-81 y Vero E6, evaluando el efecto citopático, la presencia del virus por RT-PCR, inmunofluorescencia indirecta (IFI) y posterior identificación por secuenciación genómica. Posteriormente, uno de los aislamientos de mayor circulación fue seleccionado y denominado cepa prototipo (PE/B.1.1/28549/2020), realizándose 10 pasajes sucesivos en células Vero ATCC CCL-81 para evaluar la dinámica de mutaciones. Resultados: Se observaron 11 aislamientos de virus por efecto citopático confirmándose por RT-PCR e IFI, de los cuales 6 fueron secuenciados identificándose los linajes B.1, B.1.1, B.1.1.1 y B.1.205, según el comité Pango de los genomas. La cepa prototipo corresponde a la variante B.1.1 y el análisis de las secuencias de los pasajes sucesivos mostró mutaciones a nivel de la proteína de la espiga (S) del virus, sin variación en la identidad del linaje. Conclusiones: Se aislaron 4 linajes en la línea celular Vero ATCC CCL-81. Los subcultivos en la misma línea celular muestran mutaciones en la proteína de la espiga, lo que indica mayor adaptabilidad a la célula hospedera y variación de la patogenicidad in vitro, comportamiento que le permite tener más éxito de supervivencia.

Introduction: Currently, infections caused by the SARS-CoV-2 virus exceed 600 million cases in the world. Objective: Isolation and characterization of the SARS-CoV-2 virus causing COVID-19 at the beginning of the pandemic in Peru. Materials and methods: Twenty nasal and pharyngeal swab samples were isolated from SARS-CoV-2 using two cell lines, Vero ATCC CCL-81 and Vero E-6; virus identification was performed by RT-PCR and the onset of cytopathic effect (CPE) was evaluated by indirect immunofluorescence and subsequent identification by genomic sequencing. One of the most widely circulating isolates were selected and named the prototype strain (PE/B.1.1/28549/2020). Then 10 successive passages were performed on Vero ATCC CCL-81 cells to assess mutation dynamics. Results: We detected 11 virus isolates by cytopathic effect, and subsequently confirmed by RT-PCR and indirect immunofluorescence. Of these, six were sequenced and identified as the lineages B.1, B.1.1, B.1.1.1, and B.1.205 according to the Pango lineage nomenclature. The prototype strain corresponded to lineage B.1.1. The analysis of the strains from the successive passages showed mutations mainly at in the spike (S) protein of the virus without variation in the identity of the lineage. Conclusions: Four lineages were isolated in the Vero ATCC CCL-81 cell line. Subcultures in the same cell line show mutations in the spike protein indicating greater adaptability to the host cell and variation in pathogenicity in vitro, a behavior that allows it to have more survival success.

Neumomediastino espontáneo asociado a episodio grave y persistente de hipo / Spontaneous pneumomediastinum associated with severe and persistent episode of hiccups

Resumen Introducción: El neumomediastino espontáneo es la presencia de aire libre en el mediastino que no ocurre por un trauma torácico o esofágico directo. Es un padecimiento muy raro, que usualmente ocurre en pacientes con asma, infecciones respiratorias o aspiración de cuerpo extraño. Se reportan pocos casos asociados a eventos de singultos por reflujo grave. Caso clínico: Se presenta el caso de una paciente de 10 años con neumomediastino espontáneo y extensión al cuello secundario a un episodio grave y persistente de hipo sin antecedentes de asma, trauma, cirugía, infección aguda, aspiración de cuerpo extraño ni ejercicio intenso con Vasalva. Conclusiones: La irritación del tercio distal del esófago produjo los episodios graves y persistentes de hipo que incrementaron la presión intratorácica, que a su vez por efecto Macklin, desencadenó el neumomediastino. El diagnóstico se realiza con estudios de imagen. El tratamiento es conservador, con resolución del cuadro clínico entre 5 y 7 días después de la hospitalización.

Abstract Background: Spontaneous pneumomediastinum is the presence of free air in the mediastinum that does not occur from direct thoracic or esophageal trauma. It is a very rare condition usually related to patients with asthma, respiratory infections, or foreign body aspiration. Only a few cases are reported to be associated with severe reflux events. Case report: We present the case of a 10-year-old female with spontaneous pneumomediastinum extending to the neck secondary to severe and persistent hiccups, with no history of asthma, trauma, surgery, acute infection, foreign body aspiration, and intense exercise with Vasalva. Conclusions: The irritation of the distal third of the esophagus produced severe and persistent episodes of hiccups that increased the intrathoracic pressure, which in turn triggered the pneumomediastinum by Macklin effect. The diagnosis is made with imaging studies. The treatment is conservative with resolution of the clinical picture between five and seven days after hospitalization.

Síndrome pulmonar por Hantavirus (Virus Río Mamoré) en la Amazonía Peruana / Hantavirus pulmonary syndrome (Rio Mamore Virus) in the Peruvian Amazon region

La hantavirosis es una infección viral zoonótica transmitida por roedores cuya forma clínica más letal es el síndrome pulmonar por Hantavirus (SPH). La variante río Mamoré es autóctona de Sudamérica y fue descrita en roedores sin asociarla a enfermedad en humanos. Se presenta dos casos de SPH causados por hantavirus río Mamoré en la Amazonía peruana en noviembre de 2011. En ambos casos, el diagnóstico confirmatorio fue molecular, efectuados en el Instituto Nacional de Salud de Perú. Se realizó análisis filogenético del fragmento de genoma viral y la evaluación histopatológica. Ambos pacientes evolucionaron a síndrome de distrés respiratorio del adulto y estado de choque refractario. Un paciente falleció y el otro se recuperó a los doce días.

Hantavirus infection is a viral zoonotic infection borne by rodents which most letal form clinical is the Hantavirus Pulmonary Syndrome (SPH, Spanish abbreviation). The Mamore River variant originates in South America and was found in rodents without any association to human diseases. Two cases of SPH were identified in the Peruvian Amazon region in November 2011. In both cases, a molecular diagnostic testing was conducted by the Instituto Nacional de Salud from Peru. A phylogenetic analysis of a viral genome fragment and a histopathological evaluation were conducted. Both patients developed adult respiratory distress syndrome and refractory shock. A patient died and another one recovered 12 days later.

Incidencia de bloqueo neuromuscular residual al ingreso en la unidad de recuperación postanestésica / Incidence of residual neuromuscular block when entering post-anesthesia recovery unit

Introducción: Se denomina bloqueo neuromuscular residual a la condición clínica determinada por la persistencia de los efectos farmacológicos de los bloqueantes neuromusculares no despolarizantes. El objetivo de este estudio fue cuantificar la incidencia de bloqueo neuromuscular residual al ingreso en la unidad de recuperación postanestésica (URPA) tras la administración de atracurio o pancuronio durante el acto anestésico. Pacientes y métodos: Diseño prospectivo observacional, con un muestreo no probabilístico, consecutivo intencional. Se definió bloqueo neuromuscular residual como la presencia de una relación T4/T1 < 0.9 medida en el aductor del pulgar por acelerometría (TOF-GUARD-Organon Teknika). Se estudiaron 140 pacientes sometidos a anestesia general para cirugía programada que habían recibido como BNMND atracurio (n = 125) o pancuronio (n = 15). Resultados: Considerando la definición tradicional (T4/T1 < 0.7), el 13 por ciento de los pacientes (18 de 140) presentó bloqueo neuromuscular residual. Considerando la definición actual (T4/T1 < 0,9), el 49 por ciento de los pacientes (69/140) presentó bloqueo neuromuscular residual. Para ambas definiciones, la incidencia de bloqueo neuromuscular residual al ingreso en la URPA fue significativamente mayor para el pancuronio (53 y 93 por ciento) que para el atracurio (8 y 44 por ciento), respectivamente (p < 0.00005). Se había administrado en quirófano antiacetilcolinesterásicos al 47 por ciento del total de los pacientes observados (66 de 140): 42 por ciento de los pacientes del grupo atracurio (53 de 125) y 87 por ciento del grupo pancuronio (13 de 15). De los 74 pacientes que no recibieron antiacetilcolinesterásicos, 34 (46 por ciento del subgrupo) presentaron bloqueo neuromuscular residual, en tanto que entre los 66 pacientes que sí recibieron la reversión del bloqueo neuromuscular, 35 (53 por ciento del subgrupo) también presentaron bloqueo neuromuscular residual. Estos niveles de incidencia entre los que