Co-infecção HIV/HCV em pacientes de Botucatu e região / HIV/HCV co-infection in patients from Botucatu and region (Brazilian cities)

Devido à similaridade nas rotas de transmissão, a co-infecção HIV/HCV é freqüente, afetando em média 30 a 50 por cento dos portadores de HIV. O presente estudo visou avaliar uma possível associação entre os subtipos do HIV e genótipos do HCV em pacientes co-infectados, com base na análise das freqüências em pacientes mono e co-infectados. Para determinação da freqüência dos subtipos HIV e genótipos HCV, foram analisados respectivamente 124 e 496 pacientes mono-infectados. O estudo da co-infecção foi realizado num grupo de 150 pacientes HIV positivos e esteve presente em 22 (14,7 por cento) dos pacientes. A freqüência dos subtipos do HIV-1 em mono-infectados foi: subtipo B (85,5 por cento), subtipo F (12,9 por cento) e recombinante B/F (1,6 por cento), enquanto nos genótipos HCV foi: 1a (25 por cento), 1b (29,4 por cento), 1a/1b (3,6 por cento), 3a (35 por cento), 2 (1,8 por cento) e 5 (0,4 por cento). Nos co-infectados o padrão de distribuição dos subtipos HIV-1 é semelhante aos mono-infectados, ou seja, subtipo B (85,0 por cento), seguido do subtipo F (15,0 por cento). A distribuição de freqüência de genótipos HCV nos co-infectados foi: 1a (36,3 por cento), 1b (27,3 por cento), 1a/1b (9,1 por cento) e 3a (27,3 por cento) mostrando um aumento de 10 por cento na freqüência do genótipo 1, queda de 7,7 por cento no genótipo 3 e ausência de outros genótipos. A análise estatística de associação entre os subtipos HIV e genótipos HCV (Goodman) mostrou que no genótipo 1 (HCV) ocorreu predominância do subtipo B, enquanto no genótipo 3 (HCV) a distribuição dos subtipos B e F (HIV-1) foi casual. Isto aponta para a necessidade de mais estudos desse grupo e um maior valor amostral.

HIV/HCV co-infection is a frequent event due to the similarity of the means of transmission of both viruses; 30-50 percent of HIV infected individuals are co-infected¹. This paper assesses the possible association among HCV and HIV genotypes in co-infected patients based on frequency distribution in mono and co-infected patients. To determine HIV and HCV genotype frequency 124 and 496 respectively, mono infected patients were analyzed. The study of co-infection was performed in 150 HIV positive patients and 22 (14.7 percent) patients were found. The frequency of HIV-1 subtypes was 106 B subtype (85.5 percent), 16 F (12.9 percent), and 2 B/F recombinant (1.6 percent); HCV genotypes were 1a (25 percent), 1b (29.4 percent), 1a/1b (3.6 percent), 3a (35 percent), 2 (1.8 percent) and 5 (0.4 percent). The HCV genotype could not be determined in 6.3 percent of samples using the technique. The HIV-1 subtype distribution standard was B subtype (85.0 percent) and F subtype (15.0 percent) in mono-infected as in co-infected. The frequency distribution of HCV genotypes in co-infected was 1a (36.4 percent), 1b (27.3 percent), 1a/1b (9.1 percent) and 3a (27.3 percent). These results showed a 10 percent increase in frequency of 1a genotype, 7.7 percent decrease in 3 genotype and lack of other genotypes. The statistical analysis of association of HCV genotypes and HIV-1 subtypes (Goodman Test) showed a predominance of the B HIV subtype among HCV genotype 1, and among HCV genotype 3 the distribution of B and F HIV subtypes was casual. These results suggest the need for further studies in this group and larger samples.

Biologia molecular do HIV-1 e genética da resistência humana à AIDS / Molecular biology of the HIV-1 and genetics of human resistance to AIDS

A evolução da infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo 1 (HIV-1) é influenciada por fatores virais e pelo hospedeiro. Os fatores virais estão relacionados ao subtipo circulante, tropismo,citopatogenicidade, antigenicidade e mutações no genótipo viral que induzem a resistência às drogas utilizadas na terapêutica atual. Neste contexto os padrões de variabilidade de seqüências genômicas do HIV-1 podem ser utilizados como marcadores genéticos para avaliar a tendência da evolução da infecção e a eficácia terapêutica. Por outro lado os fatores relacionados ao hospedeiro incluem genótipo HLA, produção de anticorpos neutralizantes e presença de mutações genéticas que dificultam a interação do vírus com a célula hospedeira. Análises genômicas podem ser úteis no sentido de avaliar presença de fenótipo que predispões à progressão da infecção. Neste trabalho, apresenta-se uma revisão dos principais marcadores genéticos relacionados ao vírus e ao hospedeiro que podem ser utilizados para avaliar a evolução da infecção.

Host and viral factors may influence the course of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) infection. Theviral factors are related to circulating subtype, tropism, cytopathogenicity, antigenicity, and viral genotypemutations that prompt the resistance against the drugs used in the current therapy. In this situation, thevariability patterns of HIV-1 genomic sequences can be used as genetic markers to evaluate the trend ofinfection course and the effectiveness of the treatment. On the other hand, the determining factors related tothe host include HLA genotype, manufacture of neutralizing antibodies, and the presence of genetic mutationsthat make difficult the interaction of virus with the host cell. Genomic analyses can be useful in the sense ofassuring the phenotype presence, which predisposes to the development of the infection. In this study wepresent a review of the major genetic markers related to the virus and to the host that can be applied toevaluate the course of infection.

Distribuição dos genótipos de HCV em pacientes das regiões de Botucatu, Bauru e Assis, SP, Brasil / HCV genotypes distribution in patients from Botucatu, Bauru and Assis, São Paulo State, Brazil

Com objetivo de avaliar a distribuição dos genótipos do HCV em pacientes de Botucatu, Bauru, Assis e regiões, foram analisadas 1.018 amostras assim distribuídas: Botucatu (508), Bauru (415) e Assis (95)com sorologia anti-HCV reagente pela técnica ELISA (Enzyme - linked immunosorbent assay) e detectadas por Biologia Molecular RT-PCR (reverse transcription Polymerase Chain Reaction - Roche ). Genótipos foram determinados pela tecnologia LiPA (Line probe assay - Bayer) que permite detecção de 6 genótipos e subtipos mais comuns. Distribuição dos genótipos na região: genótipo 1 (62,9%) , genótipo 3 (34,5%),genótipo 2 presente nas regiões de Botucatu e Bauru (2,1%), genótipo 5 em Botucatu (0,2%). Distribuiçãodos subtipos: Região de Botucatu - subtipos: 1a (25,0%), 1b (29,3%), 1a/1b (3,5%), 2b (0,6%), 3a(35,0%), 5a (0,2%). Região de Bauru - subtipos: 1a (31,1%), 1b (27,2%),1a /1b (2,4%), 2 b (1,9%), 2 a/2c (0,2%), 3a (32,3%). Região de Assis - subtipos: 1a (26,3%), 1b (26,3%), 1a /1b (2,1%), 3a (41,1%). A técnica utilizada não permitiu a diferenciação dos subtipos em 5,1% das amostras. A distribuição dos genótipos nestas regiões foi similar às outras regiões do Brasil e do mundo ocidental (Europa Ocidental e Américas) apresentando algumas diferenças regionais relativas aos subtipos, como presença de genótipo africano (5) na região de Botucatu.