Análisis de expresión global del cáncer cérvico uterino: rutas metabólicas y genes alterados / Global expression analysis in uterine cervical cancer: Metabolic pathways and altered genes

High risk human papillomavirus (HPV) infection is considered to be the most important etiological factor of Cervical Uterine Cancer. In order to determine the global expression pattern and to identify possible molecular markers of cervical cancer, cDNA arrays with probe sets complementary to 8,000 human genes were used to examine the expression profiles among 5 cell lines derived from human cervical cancer, three HPV16(+) tumor samples and three normal cervical tissues HPV(-). The levels of expression of different cellular processes were identified. Hierarchical clustering was performed and the gene expression using RT-PCR was confirmed. Two genes were found to be consistently overexpressed in invasive cervical cancer biopsies; one of them, IL-6 was previously reported to be overexpressed in cervical cancer and one novel gene, MMP10, previously not known to be related to cervical cancer. Hierarchical clustering of the expression data revealed that samples with common HPV type infection grouped together, maybe this could mean that differences between HPV types could be indirectly determined by expression profiles.

La infección por virus de papiloma de alto riesgo (VPH) es considerada como el factor etiológico más importante del cáncer cérvico uterino (CaCU). Con el fin de determinar el patrón de expresión global e identificar algunos posibles genes marcadores del CaCU, se utilizaron microhileras de DNA que contenían 8,000 secuencias que codificaban para transcritos diferentes, para estudiar los perfiles de expresión de cinco líneas celulares derivadas de CaCU, tres muestras tumorales conteniendo VPH 16 y tres muestras normales negativas para la presencia de VPH. Se identificaron los niveles de expresión de genes relacionados con diferentes rutas metabólicas. Se llevó a cabo el análisis de agrupamiento jerárquico y posteriormente se confirmó la sobrexpresión de dos genes mediante RT-PCR. Estos dos genes se encontraron sobrexpresados en biopsias tumorales cervicales. Uno de ellos, el gen de IL6, que ha sido previamente reportado en relación con CaCU, así como el gen de la matriz-metaloproteasa 10 (MMP10) por primera vez relacionado con esta neoplasia. El análisis de agrupamiento jerárquico, además, reveló que las muestras que contienen el mismo tipo viral están asociadas, sugiriendo posibles diferencias en expresión entre tipos virales.

Estrategias de análisis global. Hacia el manejo genético de las neoplasias / Global analysis strategies. In direction to genetic management of neoplastic diseases

La investigación biomédica en las enfermedades oncológicas, particularmente enfocada al estudio y entendimiento de los mecanismos moleculares involucrados en la transformación celular, está permitiendo el desarrollo de nuevas estrategias de diagnóstico y tratamiento más eficaces. La obtención y aplicación práctica de los resultados derivados del estudio de la genética molecular del cáncer, ha avanzado paralelamente con el desarrollo de herramientas tecnológicas que permiten obtener una visión global de diversos procesos celulares, tanto en condiciones normales como en los procesos patológicos. Esta combinación de investigación y aplicación tecnológica, ha creado metodologías que en estos momentos nos permiten analizar en su conjunto los tres principales niveles de la Genética Molecular: el genoma (DNA, archivo de la información genética), el transcriptoma (RNA, expresión de la información genética) y finalmente el proteoma (proteínas, aspecto funcional de la información genética). La información obtenida gracias a estos avances ha empezado a modificar nuestra visión fundamental sobre las enfermedades oncológicas; y sumándose a las herramientas de análisis tradicional, prometen modificar de manera importante la forma en que clasificamos, detectamos, diagnosticamos y tratamos a las diversas neoplasias. En esta revisión se presentan algunas de estas metodologías de análisis global, que involucran los tres niveles de organización genética: el genoma, con el proyecto genoma humano, la hibridación genómica comparativa y el pintado cromosómico, el transcriptoma, con el análisis en serie de expresión génica y microarreglos de DNA y el proteoma, con el análisis bidimensional de proteínas y los microarreglos de anticuerpos. En cada caso, además de una breve descripción de cada uno de los métodos, se expone el impacto de ellos en el estudio y manejo de las enfermedades neoplásicas.