Whole genome sequence of Mycobacterium kansasii isolates of the genotype 1 from Brazilian patients with pulmonary disease demonstrates considerable heterogeneity

Mycobacterium kansasii is an opportunistic pathogen and one of the most commonly encountered species in individuals with lung disease. We here report the complete genome sequence of 12 clinical isolates of M. kansasii from patients with pulmonary disease in Brazil.

Next-generation sequencing virulome analysis of a Yersinia enterocolitica subsp. palearctica bioserotype 4/O: 3 ST18 isolated from human blood in Brazil

Abstract Yersinia enterocolitica is a widespread Gram-negative bacterium that causes gastrointestinal disease and other clinical manifestations in humans. Potentially pathogenic Y. enterocolitica has been isolated in Brazil, from human, environmental, food, and animal sources. Herein we report a genome sequence of Y. enterocolitica subsp. palearctica strain YE 19, serotype O:3, biotype 4, sequence type 18, with virulence determinants isolated from human blood in Rio de Janeiro in 2005. The results corroborate other findings that this strain harbors a set of virulence determinants that could play a role in host pathoadaptation and may also justify the successful dissemination of bioserotype 4/O:3 in Brazil. The presence of strains harboring all of these virulence genes in Brazil is a potential threat to young children and immunocompromised individuals, for whom yersiniosis are a significant source of morbidity and mortality. The results of a genomic data analysis will help understand the virulence of Brazilian strains and provide data for Y. enterocolitica studies worldwide.

Survey of glycine-rich proteins (GRPs) in the Eucalyptus expressed sequence tag database (ForEST)

The occurrence of quasi-repetitive glycine-rich peptides has been reported in different organisms. Glycine-rich regions are proposed to be involved in protein-protein interactions in some mammalian protein families. In plants, a set of glycine-rich proteins (GRPs) was characterized several years ago, and since then a wealth of new GRPs have been identified. GRPs may have very diverse sub-cellular localization and functions. The only common feature among all different GRPs is the presence of glycine-rich repeat domains. The expression of genes encoding GRPs is developmentally regulated, and also induced, in several plant genera, by physical, chemical and biological factors. In addition to the highly modulated expression, several GRPs also show tissue-specific localization. GRPs specifically expressed in xylem, phloem, epidermis, anther tapetum and roots have been described. In this paper, the structural and functional features of these proteins in Eucalyptus are summarized. Since this is the first description of GRPs in this species, particular emphasis has been given to the expression pattern of these genes by analyzing their abundance and prevalence in the different cDNA-libraries of the Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium (ForEST). The comparison of GRPs from Eucalyptus and other species is also discussed

Ocorrência de enteroparasitoses em alunos da escola pública de ensino fundamental do município de Catanduva (São Paulo, Brasil) / Survey of parasitic diseases in students at a public primary school at Catanduva city (São Paulo, Brazil)

Este trabalho objetivou levantar as parasitoses intestinais mais freqüentes na faixa etária de 6 a 11 anos, relacionando-as ao nível sócio-econômico e aos hábitos de vida das crianças de uma escola pública de primeiro grau no município de Catanduva. Iniciou-se com palestras sobre educação sanitária para pais e alunos. Posteriormente, foi aplicado um questionário sócio-econômico e colheram-se amostras de fezes de 250 crianças, sendo 138 do sexo masculino e 112 do sexo feminino. Foram feitos exames parasitológicos de fezes; as crianças, que apresentaram resultados positivos, foram tratadas. Das crianças analisadas, 12,80% estavam parasitadas, principalmente aquelas na faixa etária de 8 a 9 anos (40,62%) e 62,50% eram do sexo masculino. As 84,37% de crianças parasitadas das crianças parasitadas e 67,88% das crianças não parasitadas relataram que tinham animais de estimação. Os parasitas mais encontrados foram Giardia lamblia (43,75%); Entamoeba coli (31,25%); Enterobius vermicularis (18,75%); Endolimax nana (15,62%); ancilostomídeos (3,12%); Strongyloides stercoralis (3,12%) e Entamoeba hystolitica (3,12%).Das crianças positivas, 81,25% eram monoparasitadas e 18,7% poliparasitadas ; e 77,27% bebiam água diretamente da torneira. Concluiu-se que a incidência de parasitoses diminuiu no município de Catanduva se comparada a dos anos anteriores, mostrando ter havido melhoria na qualidade de vida e maior conhecimento das pessoas em relação à educação sanitária e saneamento básico

Estudo de associaçäo entre o polimorfismo serina-9-glicina do receptor dopaminérgico D3 e esquizofrenia / Study of association between the ser-9-gly polymorphism of the D3 dopaminergic receptor and schizophrenia

Duas abordagens genético-moleculares foram realizadas para investigar a possível associaçäo entre o polimorfismo serina-9-glicina no receptor dopaminérgico D3 e esquizofrenia. Na primeira análise, um grupo de 141 pacientes com esquizofrenia foi comparado a um grupo-controle de 189 indivíduos pareado para sexo e origem étnica. No outro estudo, foi realizada análise de 35 trios (pai e mäe näo afetados e paciente com esquizofrenia). Os resultados desses estudos näo apresentaram associaçäo alélica ou genotípica estatisticamente significante com esquizofrenia. Pode-se concluir que o polimorfismo serina-9-glicina no receptor dopaminérgico D3 näo é um fator de risco para desenvolver esquizofrenia na populaçäo estudada

Sugarcane expressed sequences tags (ESTs) encoding enzymes involved in lignin biosynthesis pathways

Ligninas säo compostos fenólicos encontrados nas paredes secundárias do sistema vascular vegetal e desempenham importantes papéis biológicos, reduzindo a permeabilidade da parede celular em relaçäo à água, estando também envolvidas em mecanismos de defesa contra patógenos. A via metabólica da lignina e as enzimas envolvidas na sua síntese vem sendo caracterizadas nos últimos anos. Uma série de genes que codificam diferentes enzimas envolvidas na biossíntese da lignina foram identificados em diferentes espécies de plantas. A biossíntese de lignina está acoplada ao metabolismo dos fenilpropanóides, apresentando enzimas compartilhadas com outros processos metabólicos tais como fenilalanina amônio liase (PAL), cinnamato 4-hidroxilase (C4H) and ácido caféico O-metiltransferase (COMT) assim como enzimas específicas como cinamoil-CoA redutase (CCR) e cinamil álcool dehidrogenase (CAD). Em certos tipos de mutantes de milho e sorgo, um aumento na digestibilidade foi associado a uma reduçäo no teor de lignina. Uma reduçäo na atividade de CAD e COMT, importantes enzimas envolvidas na biossíntese de lignina vem sendo demonstrada. Estas observações tem motivado diferentes grupos de pesquisa e alterarem o conteúdo ou a composiçäo da lignina em plantas modelo, assim como culturas de interesse econômico, através de engenharia genética. O principal objetivo prático destes projetos é uma otimizaçäo da utilizaçäo destas plantas levando a uma maior produçäo de papel e digestibilidade da raçäo animal. No presente trabalho foi realizado um inventário das seqüências de ESTs, que codificam enzimas envolvidas no metabolismo de lignina, presentes no Projeto Genoma de Cana-de-açúcar (SUCEST). A análise foi realizada com as enzimas chaves ferulato-5-hidroxilase (F5H), ácido caféico O-metiltransferase (COMT), cafeoil CoA O-metiltransferase (CCoAOMT), hidroxicinamato CoA ligase (4CL), cinamoil-CoA redutase (CCR) and cinamil álcool dehidrogenase (CAD). A análise comparativa destes genes com os descritos em outras espécies poderá servir para a identificaçäo de marcadores moleculares em programas de melhoramento genético, assim como em projetos que visem a manipulaçäo do metabolismo de lignina em cana-de-açúcar.

Classification, expression pattern and comparative analysis of sugarcane expressed sequences tags (ESTs) encoding glycine-rich proteins (GRPs)

Desde o isolamento da primeira proteína rica em glicina (GRP) em plantas, um grande número de novas GRPs vem sendo identificado. Seu padräo de expressäo altamente específico, embora variado, em conjunto com as diferentes localizações sub-celulares de alguns dos tipos de GRPs, claramente indica que estas proteínas encontram-se envolvidas em diversos processos fisiológicos independentes. Embora ainda sem uma clara definiçäo do papel de GRPs na célula vegetal, estudos realizados com estas proteínas têm resultado em novos e interessantes esclarecimentos da biologia celular e molecular de plantas. Promotores com regulaçäo complexa, assim como distintos mecanismos de regulaçäo da expressäo gênica tem sido demonstrados. Novas vias de endereçamento de proteínas tais como a exportaçäo de GRPs para diferentes tipos celulares, tem sido observados. Estes dados mostram que as GRPs podem constituir marcadores e/ou modelos interessantes para a compreensäo de distintos aspectos da biologia vegetal. Neste trabalho, características estruturais e funcionais deste tipo de proteínas em cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) foram analisadas. Uma vez que esta é a primeira descriçäo deste tipo de proteínas, em cana-de-açúcar, especial atençäo foi dada para o padräo de expressäo destes genes, analisando-se a abundância e prevalência de cada um dos genes nas diferentes bibliotecas de cDNA do projeto Sequenciamento de ESTs de cana-de-açúcar (SUCEST). A comparaçäo das GRPs de cana-de-açúcar com as GRPs descritas em outras espécies também será discutida.