Clinical significance of BRD-containing protein members in hepatocellular carcinoma progression / 中国肿瘤生物治疗杂志

@#目的：通过检索挖掘多个肿瘤公共数据库中肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）的相关数据，从转录本、蛋白质、基因突变、蛋白相互作用及相应的信号通路和功能富集等不同层面，揭示BRD（bromodomain）蛋白家族与HCC的相关性，探索BRD蛋白家族作为HCC的肿瘤进展及预后判断的潜在生物标志物价值。方法：从UALCAN数据库中获取BRD蛋白家族所有成员在HCC患者组织样本中的mRNA表达数据和患者临床信息并进行相关性分析。从TCGA数据库中获取BRD蛋白家族mRNA表达水平与HCC患者预后的数据并进行相关性分析。从The Human Protein Atlas数据库中获取BRD蛋白家族在HCC组织和正常肝组织中的免疫组化结果并进行对比分析。使用STRING数据库获取BRD蛋白家族的相互作用蛋白网络，并利用CYTOSCAPE软件对获取的相互作用蛋白进行KEGG和GO分析。结果：BRD家族7个成员均在HCC组织中高表达（P<0.01），并且与HCC患者肿瘤分级和临床分期正相关（P<0.01）,同时BRD8和BRD9的低表达提示HCC患者预后较好（P<0.05）。BRD相互作用蛋白主要参与组蛋白乙酰化修饰，并高度富集于HCC相关的信号通路。TP53基因突变HCC患者的BRD1、BRD3、BRD4、BRD7、BRD8和BRD9表达水平显著高于非突变患者（P<0.05）。结论：BRD蛋白家族分子能够作为HCC患者肿瘤分级、临床分期和预后判断的潜在靶标。