Was the COVID-19 epidemic synchronous in space? An analysis in the health regions of the Rio de Janeiro state, 2020-2022 / A epidemia de COVID-19 foi síncrona no espaço? Uma análise nas regiões de saúde do estado do Rio de Janeiro, 2020-2022

ABSTRACT Objective: To analyze the spatio-temporal dynamics of COVID-19 in the Rio de Janeiro state within the nine health regions, between March 2020 and December 2022. Methods: The Poisson model with random effects was used to smooth and estimate the incidence of COVID-19 hospitalizations reported in the Influenza Epidemiological Surveillance Information System (SIVEP-Gripe) to verify the synchronicity of the epidemic in the state. Results: The COVID-19 epidemic in the state is characterized by the presence of seven peaks during the analyzed period corresponding to seven found. An asynchrony in hospitalizations was identified, varying according to the different virus variants in the nine health regions of the state. The incidence peaks of hospitalizations ranged from 1 to 12 cases per 100,000 inhabitants during the pandemic. Conclusion: This spatio-temporal analysis is applicable to other scenarios, enabling monitoring and decision-making for the control of epidemic diseases in different areas.

RESUMO Objetivo: Analisar a dinâmica espaço-temporal de COVID-19 no estado do Rio de Janeiro nas nove regiões de saúde, entre março de 2020 e dezembro de 2022. Métodos: Utilizou-se o modelo de Poisson com efeitos aleatórios para suavizar a curva de incidência de hospitalizações por COVID-19 notificadas no Sistema de Informação da Vigilância Epidemiológica da Gripe (Sivep-Gripe) para verificar a sincronicidade da epidemia no estado. Resultados: A epidemia de COVID-19 no estado é caracterizada pela presença de sete picos no período analisado correspondentes a sete variantes encontradas. Identificou-se uma assincronicidade nas hospitalizações, variando de acordo com as diferentes variantes do vírus nas nove regiões de saúde do estado. Os picos de incidência das hospitalizações variaram de 1 a 12 casos por 100 mil habitantes no decorrer da pandemia. Conclusão: Essa análise espaço-temporal é extensível em outros cenários, sendo possível o monitoramento e a tomada de decisões de controle de doenças epidêmicas em várias áreas.

A completeness indicator of gestational and congenital syphilis information in Brazil

ABSTRACT OBJECTIVE To evaluate the quality of information on gestational syphilis (GS) and congenital syphilis (CS) on the Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN-Syphilis Brazil - Notifiable Diseases Information System) by compiling and validating completeness indicators between 2007 and 2018. METHODS Overall, care, and socioeconomic completeness scores were compiled based on selected variables, by using ad hoc weights assigned by experts. The completeness scores were analysed, considering the region and area of residence, the pregnant woman's race/colour, and the year of case notification. Pearson's correlation coefficients were used to validate the scores obtained by the weighted average method, compared with the values obtained by principal component analysis (PCA). RESULTS Most selected variables presented a good or excellent degree of completeness for GS and CS, except for clinical classification, pregnant woman's level of education, partner's treatment, and child's race/colour, which were classified as poor or very poor. The overall (89.93% versus 89.69%) and socioeconomic (88.71% versus 88.24%) completeness scores for GS and CS, respectively, were classified as regular, whereas the care score (GS-90.88%, and CS-90.72%) was good, despite improvements over time. Differences in the overall, care and socioeconomic completeness scores according to region, area of residence, and ethnic-racial groups were reported for syphilis notifications. The completeness scores estimated by the weighted average method and PCA showed a strong linear correlation (> 0.90). CONCLUSION The completeness of GS and CS notifications has been improving in recent years, highlighting the variables that form the care score, compared with the socioeconomic scores, despite differences between regions, area of residence, and ethnic-racial groups. The weighted average was a viable methodological alternative easily operationalised to estimate data completeness scores, allowing routine monitoring of the completeness of gestational and congenital syphilis records.

Identificação de grupos prioritários para a vacinação contra COVID-19 no Brasil / Identificación de grupos prioritarios para la vacunación contra la COVID-19 en Brasil / Identification of priority groups for COVID-19 vaccination in Brazil

Em um contexto de transmissão comunitária e escassez de vacinas, a vacinação contra a COVID-19 deve focar na redução direta da morbidade e da mortalidade causadas pela doença. Portanto, é fundamental a definição de grupos prioritários para a vacinação pelo Programa Nacional de Imunizações (PNI), baseada no risco de hospitalização e óbito pela doença. Para tal, calculamos o sobrerrisco por sexo, faixa etária e comorbidades por meio dos registros de hospitalização e óbito por síndrome respiratória aguda grave com confirmação de COVID-19 (SRAG-COVID) em todo o Brasil nos primeiros seis meses de epidemia. Apresentaram maior sobrerrisco pessoas do sexo masculino (hospitalização = 1,1 e óbito = 1,2), pessoas acima de 45 anos para hospitalização (SRfe variando de 1,1 a 8,5) e pessoas acima de 55 anos para óbitos (SRfe variando de 1,5 a 18,3). Nos grupos de comorbidades, doença renal crônica, diabetes mellitus, doença cardiovascular e pneumopatia crônica conferiram sobrerrisco, enquanto para asma não houve evidência. Ter doença renal crônica ou diabetes mellitus e 60 anos ou mais mostrou-se um fator ainda mais forte, alcançando sobrerrisco de óbito 14 e 10 vezes maior do que na população geral, respectivamente. Para todas as comorbidades, houve um sobrerrisco mais alto em idades maiores, com um gradiente de diminuição em faixas mais altas. Esse padrão se inverteu quando consideramos o sobrerrisco em relação à população geral, tanto para hospitalização quanto para óbito. O presente estudo forneceu evidências a respeito do sobrerrisco de hospitalização e óbito por SRAG-COVID, auxiliando na definição de grupos prioritários para a vacinação contra a COVID-19.

En un contexto de transmisión comunitaria y escasez de vacunas, la vacunación contra la COVID-19 debe enfocarse en la reducción directa de la morbilidad y de la mortalidad causadas por la enfermedad. Por lo tanto, es fundamental la definición de grupos prioritarios para la vacunación por el Programa Nacional de Inmunizaciones (PNI), basada en el riesgo de hospitalización y óbito por la enfermedad. Para tal fin, calculamos el sobrerriesgo por sexo, franja de edad y comorbilidades mediante los registros de hospitalización y óbito por síndrome respiratorio agudo grave con confirmación de COVID-19 (SRAG-COVID) en todo Brasil, durante los primeros seis meses de epidemia. Presentaron mayor sobrerriesgo personas del sexo masculino (hospitalización = 1,1 y óbito = 1,2), personas por encima de 45 años para hospitalización (SRfe variando de 1,1 a 8,5) y personas por encima de 55 años para óbitos (SRfe variando de 1,5 a 18,3). En los grupos de comorbilidades, enfermedad renal crónica, diabetes mellitus, enfermedad cardiovascular y neumopatía crónica ofrecieron sobrerriesgo, mientras que para el asma no hubo evidencia. Sufrir una enfermedad renal crónica o diabetes mellitus y tener 60 años o más mostró un factor todavía más fuerte, alcanzando sobrerriesgo de enfermedad 14 y 10 veces mayor que en la población general, respectivamente. Para todas las comorbilidades, hubo un sobrerriesgo más alto en edades mayores, con un gradiente de disminución en franjas más altas. Este patrón se invirtió cuando consideramos el sobrerriesgo en relación con la población general, tanto para hospitalización como para óbito. El presente estudio proporcionó evidencias respecto al sobrerriesgo de hospitalización y óbito por SRAG-COVID, ayudando en la definición de grupos prioritarios para la vacunación contra la COVID-19.

In a context of community transmission and shortage of vaccines, COVID-19 vaccination should focus on directly reducing the morbidity and mortality caused by the disease. It was thus essential to define priority groups for vaccination by the Brazilian National Immunization Program (PNI in Portuguese), based on the risk of hospitalization and death from the disease. We calculated overrisk according to sex, age group, and comorbidities using hospitalization and death records from severe acute respiratory illness with confirmation of COVID-19 (SARI-COVID) in all of Brazil in the first 6 months of the epidemic. Higher overrisk was associated with male sex (hospitalization = 1.1 and death = 1.2), age over 45 years for hospitalization (OvRag ranging from 1.1 to 8.5), and age over 55 year for death (OvRag ranging from 1.5 to 18.3). In the groups with comorbidities, chronic kidney disease, diabetes mellitus, cardiovascular disease, and chronic lung disease were associated with overrisk, while there was no such evidence for asthma. Chronic kidney disease or diabetes and age over 60 showed an even stronger association, reaching overrisk of death 14 and 10 times greater than in the general population, respectively. For all the comorbidities, there was higher overrisk at older ages, with a downward gradient in the oldest age groups. This pattern was reversed when examining overrisk in the general population, for both hospitalization and death. The current study provided evidence of overrisk of hospitalization and death from SARI-COVID, assisting the definition of priority groups for COVID-19 vaccination.

COVID-19 e hospitalizações por SRAG no Brasil: uma comparação até a 12ª semana epidemiológica de 2020 / COVID-19 y las hospitalizaciones por el SRAG en Brasil: una comparación hasta la 12ª semana epidemiológica de 2020 / COVID-19 and hospitalizations for SARI in Brazil: a comparison up to the 12th epidemiological week of 2020

Resumo: A vigilância de síndrome respiratória aguda grave (SRAG) no Brasil visa a caracterizar a circulação dos vírus Influenza A e B em casos hospitalizados e óbitos, tendo sido ampliada em 2012 para incluir outros vírus respiratórios. A COVID-19 foi detectada no Brasil pela primeira vez na 9ª semana epidemiológica de 2020 e o teste para o vírus SARS-CoV-2 foi incluído no protocolo de vigilância a partir da 12ª semana epidemiológica. O objetivo deste estudo foi investigar o padrão de hospitalizações por SRAG no país após a entrada do SARS-CoV-2, comparando o perfil temporal, etário e de resultados laboratoriais com os anos de 2010 a 2019. Em 2020, a hospitalização por SRAG, contabilizada desde a data do primeiro caso de COVID-19 confirmado até a 12ª semana, superou o observado, no mesmo período, em cada um dos 10 anos anteriores. A faixa etária acima de 60 anos foi a mais acometida, em nível acima do histórico. Houve um aumento considerável de testes laboratoriais negativos, sugerindo a circulação de um vírus diferente dos presentes no painel. Concluímos que o aumento das hospitalizações por SRAG, a falta de informação específica sobre o agente etiológico e a predominância de casos entre idosos, no mesmo período de tempo em que cresce o número de casos novos de COVID-19, é coerente com a hipótese de que os casos graves da doença já estejam sendo detectados pela vigilância de SRAG com sobrecarga para o sistema de saúde. A inclusão da testagem para SARS-CoV-2 no protocolo de vigilância de SRAG e sua efetiva implementação são de grande importância para acompanhar a evolução dos casos graves da doença no país.

Resumen: La vigilancia del síndrome respiratorio agudo grave (SRAG) en Brasil tiene como objetivo caracterizar la circulación de los virus de la Influenza A y B en casos y muertes hospitalizadas, y se expandió en 2012 para incluir otros virus respiratorios. La COVID-19 se detectó en Brasil por la primera vez en la 9ª semana epidemiológica de 2020, y el examen test para el virus SARS-CoV-2 se incluyó en el protocolo de vigilancia a partir de la 12ª semana epidemiológica. El objetivo de este estudio fue investigar el patrón de hospitalizaciones por SRAG en Brasil desde la entrada de SARS-CoV-2, comparando el perfil temporal y de edad y los resultados de laboratorio entre los años 2010 a 2019. En 2020, las hospitalizaciones por SRAG, compiladas a partir de la fecha del primer caso confirmado de COVID-19 hasta la 12ª semana, excedió los números observados durante el mismo período en cada uno de los 10 años anteriores. El grupo de edad mayor de 60 años fue el más afectado, a niveles superiores a los históricos. Hubo un aumento considerable en las pruebas de laboratorio negativas, lo que sugiere la circulación de un virus diferente de los que ya están presentes en el panel. Se concluye que el aumento de las hospitalizaciones por SRAG, la falta de información específica sobre el agente etiológico y el predominio de casos entre los ancianos en el mismo período en que hubo un aumento de casos nuevos de COVID-19 se entiende que con esta hipótesis de que los casos graves de COVID-19 ya estén siendo monitorados por la vigilancia de SRAG, lo que genera una sobrecarga en el sistema de salud. La inclusión de los exámenes para SARS-CoV-2 en el protocolo de vigilancia de SRAG y la eficacia de implementación son de grande importancia para monitorear la evolución de los casos graves de COVID-19 en Brasil.

Abstract: Surveillance of the severe acute respiratory illness (SARI) in Brazil aims to characterize the circulation of the Influenza A and B viruses in hospitalized cases and deaths, having been expanded in 2012 to include other respiratory viruses. COVID-19 was detected in Brazil for the time in the 9th epidemiological week of 2020, and the test for the SARS-CoV-2 virus was included in the surveillance protocol starting in the 12th epidemiological week. This study's objective was to investigate the pattern of hospitalizations for SARI in Brazil since the entry of SARS-CoV-2, comparing the temporal and age profiles and laboratory results to the years 2010 through 2019. In 2020, hospitalizations for SARI, compiled from the date of the first confirmed case of COVID-19 up to the 12th week, exceeded the numbers observed during the same period in each of the previous 10 years. The age bracket over 60 years was the most heavily affected, at higher than historical levels. There was a considerable increase in negative laboratory tests, suggesting circulation of a different virus from those already present in the panel. We concluded that the increase in hospitalizations for SARI, the lack of specific information on the etiological agent, and the predominance of cases among the elderly during the same period in which there was an increase in the number of new cases of COVID-19 are all consistent with the hypothesis that severe cases of COVID-19 are already being detected by SARI surveillance, placing an overload on the health system. The inclusion of testing for SARS-CoV-2 in the SARI surveillance protocol and the test's effective nationwide deployment are extremely important for monitoring the evolution of severe COVID-19 cases in Brazil.

SRAG por COVID-19 no Brasil: descrição e comparação de características demográficas e comorbidades com SRAG por influenza e com a população geral / IRAG por COVID-19 en Brasil: descripción y comparación de características demográficas y comorbilidades con el IRAG por influenza y con la población general / Description and comparison of demographic characteristics and comorbidities in SARI from COVID-19, SARI from influenza, and the Brazilian general population

O presente estudo tem o objetivo de descrever os pacientes hospitalizados por síndrome respiratória aguda grave (SRAG) em decorrência da COVID-19 (SRAG-COVID), no Brasil, quanto às suas características demográficas e comorbidades até a 21ª Semana Epidemiológica de 2020. Buscou-se comparar essas características com as dos hospitalizados por SRAG em decorrência da influenza em 2019/2020 (SRAG-FLU) e com a população geral brasileira. As frequências relativas das características demográficas, comorbidades e de gestantes/puérperas entre os pacientes hospitalizados por SRAG-COVID e SRAG-FLU foram obtidas por meio do Sistema de Informação de Vigilância Epidemiológica da Gripe (SIVEP-Gripe), e as estimativas para a população geral brasileira foram obtidas por meio de projeções populacionais realizadas pelo Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística, dados do Sistema de Informações sobre Nascidos Vivos e de pesquisas de âmbito nacional. Entre os hospitalizados por SRAG-COVID, observou-se uma elevada proporção, em relação ao perfil da população geral brasileira, de indivíduos do sexo masculino, idosos ou com 40 a 59 anos, com comorbidades (diabetes mellitus, doença cardiovascular, doença renal crônica e pneumopatias crônicas) e de gestantes/puérperas. Já entre os hospitalizados por SRAG-FLU, observou-se prevalências superiores às populacionais de indivíduos de 0 a 4 anos de idade ou idosos, de raça ou cor branca, com comorbidades (diabetes mellitus, doença renal crônica, asma e outras pneumopatias crônicas) e de gestantes/puérperas. Esses grupos podem estar evoluindo para casos mais graves da doença, de forma que estudos longitudinais na área são de extrema relevância para investigar esta hipótese e melhor subsidiar políticas públicas de saúde.

El objetivo del presente estudio es describir a los pacientes hospitalizados por infección respiratoria aguda grave (IRAG) a consecuencia de la COVID-19 (IRAG-COVID), en Brasil, respecto a sus características demográficas y comorbilidades hasta la 21ª Semana Epidemiológica de 2020. Se buscó comparar estas características con las de los hospitalizados por SRAS, a consecuencia de la influenza en 2019/2020 (IRAG-FLU) y con la población general brasileña. Las frecuencias relativas de las características demográficas, comorbilidades y de embarazadas/puérperas entre los pacientes hospitalizados por IRAG-COVID y IRAG-FLU se obtuvieron mediante el Sistema de Información de la Vigilancia Epidemiológica de la Gripe (SIVEP-Gripe), y las estimaciones para la población general brasileña se consiguieron mediante proyecciones poblacionales realizadas por el Instituto Brasileño de Geografía e Estadística, datos del Sistema de Informaciones sobre Nascidos Vivos y de investigaciones de ámbito nacional. Entre los hospitalizados por IRAG-COVID, se observó una elevada proporción, respecto al perfil de la población general brasileña, de individuos del sexo masculino, ancianos o con 40 a 59 años, con comorbilidades (diabetes mellitus, enfermedad cardiovascular, enfermedad renal crónica y neumopatías crónicas) y de embarazadas/puérperas. Ya entre los hospitalizados por IRAG-FLU, se observaron prevalencias superiores a las poblacionales de individuos de 0 a 4 años de edad o ancianos, de raza o color blanco, con comorbilidades (diabetes mellitus, enfermedad renal crónica, asma y otras neumopatías crónicas) y de embarazadas/puérperas. Estos grupos pueden estar evolucionando hacia casos más graves de la enfermedad, por ello, los estudios longitudinales en esta área son de extrema relevancia para investigar esta hipótesis y apoyar mejor las políticas públicas de salud.

The study aims to describe patients hospitalized for severe acute respiratory illness (SARI) due to COVID-19 (SARI-COVID) in Brazil according to demographic characteristics and comorbidities up to the 21st Epidemiological Week of 2020. The study aimed to compare these characteristics with those of patients hospitalized for SARI due to influenza in 2019/2020 (SARI-FLU) and with the Brazilian general population. The proportions of demographic characteristics, comorbidities, and pregnant and postpartum women among patients hospitalized for SARI-COVID and SARI-FLU were obtained from the SIVEP-Gripe database, and the estimates for the Brazilian population were obtained from the population projections performed by Brazilian Institute of Geography and Statistics, Information System on Live Birth data, and nationwide surveys. Compared to the Brazilian population, patients hospitalized for SARI-COVID showed a higher proportion of males, elderly individuals and those aged 40 to 59 years, comorbidities (diabetes mellitus, cardiovascular disease, chronic kidney disease, and chronic lung diseases), and pregnant/postpartum women. Compared to the general population, Brazilians hospitalized for SARI-FLU showed higher prevalence rates of ages 0 to 4 years or over 60 years, white race/color, comorbidities (diabetes, chronic kidney disease, asthma, and other chronic lung diseases), and pregnant/postpartum women. The data suggest that these groups are evolving to more serious forms of the disease, so that longitudinal studies are extremely relevant for investigating this hypothesis and supporting appropriate public health policies.

Malária e dengue no Acre: análise da dinâmica espacial e temporal em um estado em transformação

O objetivo desta tese é caracterizar as alterações ocorridas na dinâmica espaço-temporal damalária e da dengue nos municípios do estado do Acre no período de 2000 a 2015. Dados secundáriosde notificação de malária e de dengue, dados populacionais e de rede viária do Acre foram utilizadosem dois estudos ecológicos, um para malária e outro para dengue. Dados primários foram coletados apartir de um estudo transversal realizado na região do Alto Juruá, endêmica para malária e comregistro recente de epidemia de dengue. Os resultados estão apresentados em 4 artigos e uma notapreliminar. O primeiro artigo avaliou o padrão de endemicidade da malária quanto ao perfil etário eestimou através de modelos matemáticos de transmissão, a força de infecção da malária nosmunicípios acreanos por zona urbana e rural em dois recortes no tempo, período pré e pós epidemia de2006. Os resultados mostraram que há heterogeneidade na transmissão de malária que resultam emperfis etários distintos na população de infectados em ambas as zonas e períodos do estudo e que naregião com alta transmissão de malária a exposição parece ocorrer independentemente da idade. Nasáreas rurais há um sobre risco na idade adulta jovem, com potencial associação com o trabalho. Osegundo artigo apresenta resultados do inquérito domiciliar realizado para caracterizar o bolsão deendemicidade de malária no Acre, mais especificamente em Mâncio Lima e Rodrigues Alves (AltoJuruá), quanto ao perfil de malária ao longo do eixo urbano-rural-silvestre e sua associação com apresença de áreas desmatadas, população assentada recentemente, diferentes graus de urbanização erenda. Encontramos que atividades como agricultura e determinadas condições socioeconômicas estãoassociadas ao risco de malária, assim como viver nas áreas rurais, e que esses fatores estão distribuídosao longo do gradiente rural-urbano-silvestre...

This thesis aims at characterizing the spatial-temporal dynamics of malaria and dengue in themunicipalities of Acre State from 2000 to 2015. Notification data on malaria and dengue, demographicdata and the Acre road and airline network data were used in two ecological studies, one for malariaand the other for dengue to investigate factors associated with the geographical reduction of malariadistribution and geographical expansion of dengue distribution. A cross-sectional study was conductedin a area encompassing urban, rural and riverine populations within a endemicity pocket of malaria,where a large dengue epidemic occurred in 2014 for the first time. The results are presented in 4articles and a preliminary note. The first article assessed evidence of shifts in the malaria endemicitypattern in terms of age profile and force of infection among urban and rural areas of Acre, before andafter the large epidemic of 2006, when new malaria control policies were implemented in the State.The results showed heterogeneities in malaria transmission that result in distinct age profiles ofPlasmodium vivax infected individuals in both zones and periods. While in high malaria transmissionregions, the exposure seems to be age-independent, in rural areas, we observe an overexposure of inyoung adults, with potential association with work. The second article presents the results of ahousehold survey conducted to characterize the endemicity pocket of malaria in Acre, in urban-ruralforestaxis and its association with the presence of deforested areas, recently settled population,different degrees of urbanization and income. We find that activities work as agriculture and somesocioeconomic conditions are associated with malaria, as well as living in rural areas increased the riskfor malaria...