DNA extraction from bristles and quills of Chaetomys subspinosus (Rodentia: Erethizontidae) using a novel protocol

DNA extraction protocols are as varied as DNA sources. When it comes to endangered species, it is especially important to pay attention to all details that ensure the completion of the study goals and effectiveness in attaining useful data for conservation. Chaetomys subspinosus (Rodentia: Erethizontidae) is a secretive arboreal porcupine endemic to certain ecosystems of the Brazilian Atlantic Forest. A multidisciplinary study (including genetic data) was performed to create a management plan for the conservation of this species. Individuals from natural populations of the states of Bahia, Espírito Santo and Sergipe were sampled. To obtain a reliable and abundant amount of starting material, non-destructive methods were tested, extracting DNA from the bristles and quills that comprise most of this animal’s hide. This method has also been innovative in adapting a DNA extraction protocol traditionally used for plants. Digestion using proteinase K was followed by protein precipitation with CTAB, a chloroform-isoamyl alcohol cleaning and DNA precipitation with isopropyl alcohol. This protocol supplies good-quality DNA for genetic analysis with molecular markers based on PCR.

Efecto del potencial rédox sobre los parámetros del cultivo de Trypanosoma cruzi desarrollado en medio líquido agitado / Effect of redox potential on culture parameters of Trypanosoma cruzi developed in liquid stirred media.

El potencial rédox (Eh) es una propiedad fisicoquímica que presentan los solutos capaces de intercambiar electrones con un electrodo inerte. El potencial rédox influye en el crecimiento bacteriano en forma independiente del oxígeno disuelto. Es escasa la información disponible en relación a cultivos in vitro de protozoarios, en particular de Trypanosoma cruzi. Para determinar el efecto del Eh sobre los parámetros de cultivos, se empleó la cepa Tulahuén 0, desarrollada en medio CIEN líquido en agitación y se ensayaron valores de Eh entre 310 mV (testigo) y 110 mV en 11 réplicas diferentes y duplicadas. Se determinaron pH, velocidad específica de desarrollo (µ), Eh, rH, velocidad de consumo de glucosa y rendimiento. Los resultados muestran que µ varía en forma directa con el Eh. Se establece una alta correlación (r = 0,93; P < 0,01) entre rH [rH = (Eh(V)+ 0,06 pH)/0,03] y µ, manteniendo constante la concentración de oxígeno disuelto. Los otros parámetros del medio no mostraron variaciones significativas. Se concluye que variaciones en el Eh del medio de cultivo afectan en forma significativa la µ del T. cruzi y que es una variable a tener en cuenta cuando se ensayan sustancias con probable efectos tripanocidas.

The redox potential (Eh) is a physico-chemical property presented by solutes able to interchange electrons with an inert electrode. The redox potential influences bacterial growth in an independent way from dissolved oxygen. The available information about protozoaries in vitro grown is scarce, being Trypanosoma cruzi main example. T. cruzi Tulahuén 0 strain, developed in CIEN liquid stirred media, was used to determine the Eh effect on growth parameters. Eh values between 310 mV (reference) and 110 mV were measured in 11 different samples and by duplicate. pH, m, Eh, rH, consume glucose rate and efficiency were determined. Results show that specific rate of development (µ) varies in a direct way with Eh. A high correlation (r = 0.93; P < 0.01) between rH (rH = Eh(V)+ 0.06 pH) and µ was established, even when dissolved oxygen concentration remained constant. Other parameters in the growing medium showed no significant variations. It is concluded that changes on Eh in the medium significantly affect of T. cruzi's growth being a variable to take into account when potential trypanocide substances are analyzed.

Clínica gastrointestinal y su asociación con la severidad en Dengue / Association between clinical gastrointestinal with severe severity in dengue

Objetivo: establecer el grado de asociación existente entre la clínica gastrointestinal de los pacientes con dengue y la severidad de la enfermedad. Diseño: observacional analítico de corte transversal. Población y métodos: pacientes hospitalizados con diagnóstico de dengue clásico (DC) y dengue hemorrágico (DH), en las instituciones de salud del departamento de Santander durante 1994 - 1998. Inicialmente se consideraron casos los pacientes con DH y controles aquellos con DC; luego, se definieron como casos los pacientes con DH más hipotensión, edemas o derrames serosos (Dengue Hemorrágico Severo) y controles a aquellos con DH sin los anteriores signos evaluados fueron: vómito, dolor abdominal, hemátemesis, hepatomegalia mediante una análisis estadístico univariado, bivariado y de regresión logística múltiple. Resultados: en total se incluyeron 1.132 pacientes, 487 con DC y 645 con DH. Todos los signos gastrointestinales evaluados se encontraron asociados con DH: vómito (OR=1.52; IC95 por ciento=1.11-2.07) dolor abdominal (OR=1-77; IC95 por ciento=1.19-2.63) hepatomegalia (OR=2.35; IC95 por ciento=1.55-3.59), y hematemesis (OR=3.93; IC95 por ciento=2.41-6.39); (p < 0.05). En el análisis multivariado para DH Severo, sólo hubo asociación con dolor abdominal. Los demás síntomas no se asociaron con una forma más grave de la enfermedad. conclusión: en el presente estudio se demuestra que síntomas y signos gastrointestinales se asocian con la severidad del dengue y que su presencia debe alertar al clínico acerca de un eventual deterioro de las condiciones clínicas del paciente