Expanded distribution of orthohantavirus Pergamino genotype: First record in Entre Rios province, Argentina / Ampliación de la distribución del Orthohantavirus genotipo Pergamino: Primer registro en la Provincia de Entre Ríos, Argentina

Abstract Hantavirus Pulmonary Syndrome (HPS) is an emerging infectious disease of the Americas. Eight native rodent species have been identified as HPS virus reservoirs in Argentina. The aim of this work was to detect the orthohantavirus genotypes present in a rodent commu-nity that inhabits a zone where a fatal HPS case occurred within an endemic locality of Central Argentina. We captured 27 rodents with a trapping effort of 723 trap nights. We detected 14.3% of infected Akodon azarae with the Pergamino genotype. This result expands the known distribution of this orthohantavirus. Although the Pergamino genotype has not been associated with human cases, the information about its distribution is relevant for risk assessment against potential changes in the virus infectivity.

Resumen El síndrome pulmonar por hantavirus (SPH) es una enfermedad infecciosa emergente en América. Ocho especies de roedores nativos han sido identificadas como reservorios del virus causante del SPH en la Argentina. El objetivo de este trabajo fue detectar los genotipos de orthohantavirus presentes en una comunidad de roedores que habita en una zona donde ocurrió un caso fatal de SPH, en una localidad endémica de Argentina central. Se capturaron 27 individuos con un esfuerzo de 723 trampas-noche. Se detectó un 14,3% de Akodon azarae infectados con el genotipo pergamino. Este resultado amplía el conocido rango de distribución de este orthohantavirus. A pesar de que el genotipo pergamino no ha sido asociado con casos humanos hasta el momento, la información sobre su distribución es relevante para analizar el riesgo ante un potencial cambio en la infectividad del virus.

Hantavirus pulmonary syndrome in Tucumán province associated to an unexpected viral genotype

We describe the characterization of the viral genotype involved in the first case of hantavirus pulmonary syndrome reported in Tucumán, a Northwestern province of Argentina. A 23-year-old woman, with no record of travel history and previously diagnosed with an antiphospholipid syndrome, died after 11 days of severe cardiopulmonary insufficiency. Among the four endemic regions of hantavirus pulmonary syndrome in Argentina, the Northwest Region has the highest incidence, exceeding 50% of all reported cases in the country. Until now, only Salta and Jujuy (2 out of the 6 provinces composing the Northwest Region), reported cases of hantavirus pulmonary syndrome, all of which occurred in the Yungas Forest area. Remarkably, the viral genotype characterized in this case showed higher nucleotide identity with the Andes-BsAs genotype most prevalent in Buenos Aires province, located 1400 km apart from Tucumán, than with any of the commonly found genotypes in the Northwest Region. The Andes-BsAs genotype has been associated with 30% lethality and interhuman transmission in Buenos Aires province. Interhuman transmission cannot be ruled out in the present case.

Se describe la caracterización del genotipo viral del primer caso de síndrome pulmonar por hantavirus reportado en la Provincia de Tucumán. Una mujer de 23 años, con diagnóstico previo de síndrome antifosfolipídico y sin antecedente de viaje reciente, falleció tras 11 días de enfermedad. De las cuatro regiones endémicas para este síndrome, la región Noroeste es la de mayor incidencia del país, concentrando más del 50% de los casos informados en Argentina. Hasta el momento, solamente dos de las seis provincias que componen la región Noroeste, Salta y Jujuy, habían registrado síndrome pulmonar por hantavirus con casos en áreas pertenecientes a la Selva de las Yungas. Desde ahora, se suma a dicha región la provincia de Tucumán. Llamativamente, el genotipo viral caracterizado en este caso mostró mayor identidad con el genotipo más prevalente en la provincia de Buenos Aires llamado Andes-BsAs, y no como se esperaba, con los genotipos comúnmente encontrados en la región Noroeste. El genotipo Andes-BsAs se ha asociado a letalidad próxima al 30% y también a transmisión interhumana en la provincia de Buenos Aires. No se puede descartar transmisión interhumana en el presente caso.

Síndrome pulmonar por hantavirus en Buenos Aires, 2009-2014 / Hantavirus pulmonary syndrome in Buenos Aires, 2009-2014

El virus Andes es el agente causante del síndrome pulmonar por hantavirus en Argentina y países limítrofes. Existen varios genotipos característicos en las cuatro regiones endémicas del país. En la provincia de Buenos Aires, zona central, co-circulan tres genotipos: AND-BsAs, AND-Lechiguanas y AND-Plata. A partir de los casos confirmados por ELISA y PCR en tiempo real durante el período 2009-2014 en Buenos Aires, se evaluó la distribución anual, la letalidad y la distribución geográfica dentro de la provincia; mediante RT-PCR y secuenciación nucleotídica se analizaron los genotipos implicados. También se estudió la evidencia epidemiológica para determinar la ruta de infección en casos agrupados. Se analizaron 1386 muestras de casos sospechosos de la provincia de Buenos Aires, confirmándose 88 casos de Síndrome Pulmonar por Hantavirus durante el período 2009-2014. El promedio general fue de 14.3 casos por año. El análisis del genotipo viral se realizó en el 30.7% de los casos confirmados, AND-BsAs fue el de mayor incidencia, caracterizado en el 72% de los casos estudiados. Se confirmó la ocurrencia de un brote de síndrome pulmonar por hantavirus Buenos Aires durante el año 2013, con un registro de casos 3 veces mayor respecto al promedio anual del período 2009-2012, con tendencia a normalizarse durante 2014. La letalidad general fue del 25.6%, con un valor máximo de 45.5% en 2011. Se evaluaron los datos epidemiológicos y los resultados obtenidos del análisis de comparación de genomas virales en 3 agrupamientos de 2 casos cada uno, sugiriendo fuertemente transmisión persona a persona.

Andes virus is the causative agent of hantavirus pulmonary syndrome (HPS) in Argentina and neighboring countries. In our country four different areas are affected: Northwest, Southwest, Central and Northeast, where distinct Andes virus genotypes were characterized. Three genotypes were described in Buenos Aires province (Central area): AND-Buenos Aires, AND-Lechiguanas and AND-Plata. In this work, we considered all HPS cases confirmed by ELISA and real time RT-PCR during the period 2009-2014 in Buenos Aires province. The annual distribution, fatality rate and geographic distribution were analyzed. We also analyzed the genotypes involved by RT-PCR and nucleotide sequencing. Finally we evaluated epidemiological data in order to establish the route of transmission. We analyzed 1386 suspect cases of hantavirus infection from Buenos Aires province and we confirmed 88 cases of Hantavirus Pulmonary Syndrome during 2009-2014. The overall average was 14.3 cases per year. The occurrence of a HPS outbreak was confirmed in Buenos Aires province during 2013, showing a 3 fold increase in case number compared to the annual average between 2009 and 2012, tending to normalize during 2014. The overall lethality was 25.6%, with a maximum value of 45.5% in 2011. Genotype analysis was performed in 30.7% of confirmed cases, AND-BsAs show the highest incidence, it was characterized in 72% of the studied cases. Epidemiological data and results of viral genome comparison strongly suggest person-to-person transmission in the three clusters of two cases described in our study.

Nueva evidencia epidemiologica y molecular a favor de la transmision interhumana para el linaje sout del hantavirus Andes / New epidemiologic and molecular evidence of person to person transmission of hantavirus Andes sout

A partir de un brote de síndrome pulmonar por hantavirus ocurrido en 1996 en el sur de Argentina un nuevo mecanismo de infección quedó demostrado para el virus Andes (AND): la transmisión viral de persona a persona. La sospecha de ocurrencia de este mecanismo de transmisión ha sido restringida a la zona endémica del linaje AND Sout. Describimos el caso de un paciente (caso A) residente en Buenos Aires, que desarrolló una infección por hantavirus sin haber tenido ningún otro riesgo epidemiológico más que el contacto con un caso previo (caso I) en un viaje al sur de Argentina. Posteriormente un tercer caso (caso B) residente de la provincia de Buenos Aires, desarrolló un síndrome pulmonar por hantavirus (SPH) teniendo como antecedente de riesgo varios encuentros con A. La confirmación de la enfermedad en los tres pacientes se realizó mediante diagnóstico serológico y caracterización genética viral. El linaje viral en los tres casos fue el AND Sout siendo idéntica la cepa viral. Entre los hallazgos clínicos del caso A es destacable el gran compromiso general, con síntomas gastrointestinales pero sin evidencia clínica de daño pulmonar. En el presente informe presentamos nueva evidencia para el mecanismo de transmisión interhumana del linaje AND Sout, con las características particulares de haber ocurrido por un contacto ocasional, no repetido, pero prolongado como un viaje en ómnibus de larga distancia y fuera del área endémica.

Hantavirus en poblacion humana y de roedores de un area endemica para el hantavirus pulmonary syndrome in Argentina / Hantavirus in human and rodent population in an endemic area for hantavirus pulmonary syndrome in Argentina

This paper analyzed the prevalence and distribution of serological reactivity to hantavirus (antibody against ANDES virus) of human population exposed to hantavirus and rodents trapped in the studied area. This study was developed in Salta (Oran and San Martin Departments), area with the highest incidence for Hantavirus Pulmonary Syndrome (HPS) in Argentina. In December 1997, 453 healthy people were studied by serology and 39 rodents by serology and PCR. The studied individuals were distributed as: 145 farm inhabitants (FI), 212 people living in the same dwelling with healthy individuals (controls) (Cco), 87 people living in the same dwelling with persons undergoing SPH in 1997 (cases) (Cca). Moreover, 19 physicians and nurses who cared for patients with SPH in 1997 were also studied. The prevalence of hantavirus infection among the studied population was 6.3 percent. The prevalence was 10.3 percent among FI, 6.9 percent among Cca and 3.3 percent among Cco (p < 0.02). There was no serological reactivity among PS. The prevalence in 39 trapped rodents was 10.2 percent, with infection only for Oligoryzomys chacoensis, O. flavescens and Akodon varius species.The prevalence of human cases with asymptomatic infection in Salta is higher than in other regions of the country, and we are presenting a hypothesis to explain these differences. The analyzed data suggest that in this region up to the time this study was performed, there would not have been person to person transmission of hantavirus. The transmission would be from rodent contact exclusively and mainly in ongoing deforestation areas and domestic habitat surrounding rural dwellings.

Sindrome pulmonar por hantavirus en la provincia de Buenos Aires / Hantavirus pulmonary syndrome in Buenos Aires Province

En Argentina los primeros casos de Síndrome Pulmonar por Hantavirus (SPH) se caracterizaron en 1995 y apartir de entonces es el país de Sudamérica con mayor número de casos notificados. Esta enfermadad se distribuye en varias provincias del país en las zonas Norte, Sur y Centro siendo, en esta última, Buenos Aires la provincia más afectada. En este estudio presentamos la distribución geográfica y estacional de casos de SPH, su asociación a los diversos linajes virales presentes y características serológicas de la infección por hantavirus en la provincia de Buenos Aires entre los años de 1997 y el primer semestre del 2000. Se observó un aumento del número de casos de SPH hasta 1999 y un gradual descenso de la mortalidad en todo el período. Los casos ocurrieron entre primavera y otoño, con el máximo en verano. Se estudió la respuesta serológica en 58 casos confirmados de SPH a distintos tiempos después del inicio de la enfermedad. Los genomas virales provenientes de 39 casos fueron caracterizados como virus Andes (AND): AND Cent Plata 16 porciento, AND Cent Lec 21 porciento y AND Cent Bs.As. 60 porciento. La Plata fue el único partido donde cocircularon linajes. Estos resultados contribuirán a estabelecer un mapa de riesgo que permita optimizar las estrategias de prevención.