Signatures of Selection From Candidate Gene Polymorphisms Panel in Five Zebu Breeds

ABSTRACT The signals of selection using candidate genes polymorphism were studied in five zebu breeds of Mexico. Three loci from GHRH and complementarily Steroyl Co Desaturase F762, Dopamine Beta Hydroxilase 17299, and LEP3272 were identified under selection. Findings depict Zebu selection pressure mainly on Brahman breed resulting in a divergent structure pattern.

Crecimiento de Centrosema pubescens Benth bajo fertilización nitrogenada más azufre en Ecuador / Centrosema pubescens Benth growth under nitrogen and sulfur fertilization more sulfur in Ecuador

RESUMEN La calidad y disponibilidad del forraje, principalmente de las gramíneas, disminuye en las regiones tropicales durante la época seca, ya que al madurar incrementa el contenido de carbohidratos estructurales y disminuye el de proteínas y la digestibilidad. El objetivo de este trabajo fue evaluar el crecimiento inicial de Centrosema pubescens Benth, bajo fertilización nitrogenada y azufrada. La siembra de C. pubescens se realizó en bolsas negras de polietileno. Se evaluaron dos tratamientos de fertilización nitrogenada 0 kg/Nha-1 (-NS) y 44 kg/N-ha-1 (+NS), utilizando como fuente de nitrógeno sulfato de amonio. La fertilización se hizo al momento de la siembra, a los 15 d, 30 d y 60 d después de la siembra. El ensayo duró 12 semanas y se realizaron muestreos semanales de las siguientes variables: número de nódulos (NN), peso de nódulos (PN), longitud de raíz (LR), materia seca parcial (MSP), altura de planta (AP), índice de área foliar (IAF), tasa de acumulación neta (TAN), tasa de crecimiento del cultivo (TCC), tasa relativa de crecimiento (TRC) y área foliar específica (AFE). Se utilizó un análisis de regresión para estimar curvas de crecimiento y líneas de tendencia. El tratamiento +NS provocó la disminución significativa de NN (- 10) y PN (- 0.72 g) (P < 0.05). Resultados no significativos (P > 0.05) fueron observados en LR con 42.0 cm y 42.8 cm para +NS y -NS, respectivamente. Mientras que para MSP y AP, los tratamientos afectaron positivamente, el comportamiento (P < 0.05). El resto de las variables (IAF, TAN, TCC, TRC y AFE) no fueron afectadas por los tratamientos (P > 0.05). La fertilización con nitrógeno más azufre mejoró el establecimiento de C. pubescens con fines forrajeros.

ABSTRACT The quality and availability of forage, mainly from grasses, decreases in the tropical regions during the dry season, since when it matures it increases the content of structural carbohydrates and decreases the protein and the digestibility. The objective of this study was to evaluate the initial growth of Centro-sema pubescens Benth, under nitrogen and sulfur fertilization. The planting of C. pubescens was carried out in black polyethylene bags. Two treatments of nitrogen fertilization 0 kg/Nha-1 (-NS) and 44 kg/Nha-1 (+NS) were evaluated using ammonium sulfate as the nitrogen source. Fertilization was done at the time of planting, at 15 d, 30 d and 60 d after sowing. The experiment lasted 12 weeks and weekly sampling of the following variables was done: number of nodules (NN), nodule weight (NW), root length (RL), partially dry matter (PDM), plant height (PH), leaf area index (LAI), net accumulation rate (NAR), crop growth rate (CGR), relative growth rate (RGC) and specific leaf area (SLA). A regression analysis was used to estimate growth curves and trend lines. The +NS treatment caused a significant decrease of NN (- 10) and NW (- 0.72 g) (P < 0.05). Nonsignificant result was observed in RL (P > 0.05) with 42.0 cm and 42.8 cm for +NS and -NS, respectively. However, for PDM and PH the treatments affected positivity their behavior (P < 0.05). The rest of the variables (LAI, NAR, CGR, RGR and SLA) were not affected by the treatments (P > 0.05). Fertilization with nitrogen plus sulfur improved the establishment of C. pubescens for fodder purposes.

Productive performance of hair lambs, fed with fresh lemon pulp as an energy source / Comportamiento productivo de corderas de pelo, alimentadas con pulpa fresca de limón como fuente energética

ABSTRACT Objective. Evaluate the effect of the inclusion of different levels of fresh lemon pulp (FLP) was determined as a substitute of sorghum grain in the feeding of hair sheep in parameters of daily weight gain (DWG), daily food consumption (DFC), and feed conversion (FC), the nutritional composition of the ration was also determined. Materials and methods. The study was carried out using 20 hair ewes individually fed on a period of 75 days. The treatments were as follows: T1=0% FLP; T2=10% FLP; T3=20% FLP; and T4=30% FLP based on DM. A totally randomized design was used with five replicates per treatment. Concentrate and FLP were offered ad libitum as a mixture, registering the amounts of feed offered and rejected daily. Body weight was registered every 21 days for the DWG and analysis of nutritional composition of rations was performed. And for an analysis of daily food consumption. The data were evaluated through ANOVA in an entirely randomized design. Results. There was no meaningful difference (p>0.05) for the DWG that scored 97, 108, 103 and 103 g or for the FC that scored 9.62, 8.68, 9.31 and 10.23, respectively. For each treatment and for each DFC based on DM, a meaningful difference was observed (p<0.05) for T4 by replacing sorghum to 30%. Conclusions. FLP is an alternative to replace partially or completely the grains for hair ewes without lessening the evaluated parameters.

RESUMEN Objetivo . Evaluar el efecto de la inclusión de diferentes niveles de pulpa fresca de limón (PFL), como sustituto del grano de sorgo en la alimentación de corderas de pelo, sobre los parámetros de ganancia diaria de peso (GDP), consumo diario de alimento (CDA, base materia seca, MS) y conversión alimenticia (CAL), y se determinó la composición bromatológica de las raciones. Materiales y métodos. El estudio se realizó, utilizando 20 corderas de pelo, alimentadas individualmente durante un periodo de 75 días, bajo condiciones de estabulación. Los tratamientos fueron: T1=0% PFL; T2=10% PFL; T3=20% PFL; y T4=30% PFL con base a MS. Se utilizó un diseño completamente al azar con cinco repeticiones por tratamiento. El concentrado y la PFL fueron ofrecidos de manera mezclada y a libre acceso, pesando el alimento ofrecido y rechazado diariamente, con pesajes cada 21 días para la GDP. Se realizó un análisis de composición nutricional de las raciones. Los datos se evaluaron mediante un ANOVA en un diseño completamente al azar. Resultados . No se encontró diferencia significativa (p>0.05) para la GDP que fueron de 97, 108, 103 y 103 g y las CAL fueron de 9.62, 8.68, 9.31 y 10.23, respectivamente, para cada tratamiento. Se observó un CDA con base en MS, mayor (p<0.05) para T4 al sustituir el sorgo hasta el 30%. Conclusiones. La PFL es una alternativa para sustituir parcial o totalmente a los granos en raciones para corderas de pelo, sin disminuir la productividad en los parámetros evaluados.

Meat tenderness genetic polymorphisms occurrence and distribution in five Zebu breeds in Mexico

Background The Zebu cattle are represented by a diverse group of breeds in México. Traditionally these breeds have been associated with the tough beef characteristic. Validated genetic markers have the potential to be included in marker-assisted selection and management programs in order to improve traits such as beef tenderness. The incidence and distribution of Calpain and Calpastatin polymorphisms strongly associated with beef tenderness were estimated in registered cattle of five Zebu breeds in Mexico. Results A low and in some cases null frequency of favorable C allele of CAPN316 was determined in all breeds. Conversely, a more equilibrated frequency in CAPN4751 and CAST loci was observed. Conclusions Although the relatively low occurrence of favorable alleles in assessed loci may limit their use in selection programs, genotyping availability might be a practical and comprehensive tool for introgression programs by marker assisted selection and management as to improve meat tenderness of Zebu breeds.

Non-genetic effects on growth characteristics of Brahman cattle / Efectos no genéticos sobre caracteres de crecimiento del ganado Brahman

Objective. To determine how some non-genetic factors influence weights at birth (BW), weaning (WW) and yearling (YW) of Brahman calves. Materials and methods. Data corresponding to 58257, 57045 and 40364 for BW, WW and YW, respectively, were analyzed. The models included the effects of year and season of birth and sex, and were considered simple interactions. Results. All effects were significant (p<0.05) for BW, WW and YW. Only the season of birth didn’t have a significant effect (p>0.05) on WW. The average general BW, WW and YW were 32±3.2, 188±37.7 and 291±56.8 kg, respectively. Variables evaluated that take into account the year of birth show a trend to increase weight each year. In relation to the birth season on BW and YW, it was observed that calves born during the rainy season were heavier than those born during the dry season. Similarly, male calves were heavier than females at birth, weaning and one year of age. The effects of the analyzed interactions were significant (p<0.05) for the three variables, except for the season of birth per sex interaction, which did not have a significant effect (p>0.05) for BW and WW. Conclusions. The studied non-genetic factors were important and should be taken into account in management strategies when striving to increase the efficiency of the productive system.

Objetivo. Determinar cómo influyen algunos factores no genéticos sobre los pesos al nacer (PN), al destete (PD) y al año (PA) de terneros Brahman. Materiales y métodos. Se analizaron 58257; 57045 y 40364 datos para PN, PD y PA, respectivamente. Los registros fueron de animales nacidos durante los años 1994 a 2012. El modelo incluyó los efectos de año y época de nacimiento y sexo, también se consideraron las interacciones simples. Resultados. Todos los efectos resultaron significativos (p<0.05) para PN, PD y PA. Sólo el efecto de época de nacimiento no tuvo efecto significativo (p>0.05) para el PD. Las medias generales de PN, PD y PA fueron de 32±3.2, 188±37.7 y 291±56.8 kg, respectivamente. Para las variables evaluadas sobre el año de nacimiento se observó una tendencia de aumento del peso conforme transcurrieron los años de estudio. Con relación a la época de nacimiento sobre el PN y PA se observó que los terneros nacidos durante la época de lluviosa fueron más pesados, que los nacidos durante la época seca. De igual modo, los terneros machos fueron más pesados que las hembras al nacimiento, destete y al año de edad. Los efectos de las interacciones analizadas fueron significativas (p<0.05) para las tres variables, a excepción, de la interacción época de nacimiento por sexo que no tuvo efecto significativo (p>0.05) para el PN y PD. Conclusiones. Los factores no genéticos estudiados fueron importantes y deben ser tenidos en cuenta en las estrategias de manejo cuando se quiere incrementar la eficiencia del sistema productivo.

Comportamiento predestete de cabritos cruzados en Guanajuato, México / Pre-weaning performance of crossbred goat kids from Guanajuato, Mexico

Objetivo. Los pesos al nacimiento y al destete fueron registrados para evaluar el comportamiento pre-destete de cabritos cruzado en ocho pequeñas fincas de producción de leche de cabra en Guanajuato, México. Materiales y métodos. Se usaron 234 registros de cabritos, las cabras fueron mantenidas en condiciones de pastoreo con suplementación de un concentrado comercial. Los cabritos eran cruzados, de las razas Sannen, Alpina y Toggenburg, los datos fueron analizados con un modelo estadístico que considero los efectos de rebaño (RE), grupo contemporáneo (GC), número de parto (NP), tipo parto (TP) y sexo del cabrito (SC). Resultados. Las medias de peso al nacer, peso a los 60 días de edad y la ganancia diaria de peso fueron 3.4±0.5 (rango 2.0 a 5.5), 13.7±1.8 (rango 8.0 a 17.5) y 0.17±0.02 (0.08 a 0.23 kg). El peso al nacimiento fue afectado (p<0.01) por RE, GC, NP, TP y SC. Sin embargo, el peso a 60 días y ganancia diaria de peso fueron afectadas (p<0.05) por RE y SC. Conclusiones. El rebaño afectó el comportamiento de los cabritos.

Objective. Birth and weaning weights were recorded, to valuate pre-weaning performance of crossbred kids, in eighth small milk goat flocks, from Guanajuato, Mexico. Materials and methods. Records of 234 kid dings were used; the goats were kept under grazing rangeland with supplementation of commercial concentrate. The kids were crossbred between Sannen, Alpine and Toggenburg breeds. Data was analyzed by a statistical model in which the flock effects (FL), contemporary group (CG), parity number (PN), litter size (LS) and sex of the kid (SK) were considered. Results. Birth weights averaged 3.4±0.5 kg (range 2 to 5.5 kg) and weight at 60 days of age averaged 13.7±1.8 kg (range 8.0 to 17.5 kg); and daily weight gain averaged 0.17±0.02 kg (range 0.08 to 0.23 kg). Birth weights were affected (p<0.01) by FL, CG, PN, LS and SK. However, weight at 60 days and daily weight gain were affected (p<0.05) by FL and SK. Conclusions. The flock affected the performance of the kids.

Genomic and phenotypic beef quality indicators of Charolais cattle in México / Indicadores genómicos y fenotípicos para calidad de la carne en bovinos Charolais de México / Indicadores genómicos e fenotípicos na qualidade da carne do gado Charolês no México

Tenderness and marbling are polygenic traits used as indicators of good meat quality. Among different genes related to meat quality, µ-calpaine (CAPN1) and thyroglobulin (TG5) have been specifically linked to tenderness and marbling, respectively. Objectives: to estimate the allelic and genotypic frequencies of markers in CAPN1 and TG5 genes, and relate their presence to beef carcass quality. Methods: CAPN1 and TG5 polymorphisms were identified by PCR-ACRS and PCR-RFLP, respectively, validating their putative effects on beef carcass using real time ultrasound in Charolais candidate sires (n=80). Results: computed genotypic frequencies in CAP4751 and TG5 showed Hardy-Weinberg equilibrium, while CAP316 expressed deviation from equilibrium. Association analysis indicated a significant effect of CAP4751 on rib eye area (REA) (p<0.05) and intramuscular fat (IMF) (p<0.10), while TG5 showed a significant trend on yield grade (YG). Conclusions: these results support the use of these markers for assessing traits related to meat quality, and warrant further studies to validate their use in cattle herds for breeding purposes.

La terneza y el marmoreo son características poligénicas e indicadoras de calidad en la carne bovina. Uno de los genes relacionados con la terneza en la carne es el gen de µ-calpaína (CAPN), en el cual se han identificado dos polimorfismos CAPN316 y CAPN4751 asociados significativamente a esta característica. En el gen de la Tiroglobulina (TG5) relacionado con el marmoleo, se ha identificado un polimorfismo en la posición -537del gen, asociado a la deposición de grasa intramuscular en bovinos. Objetivo: estimar las frecuencias genotípicas y alélicas de tres marcadores genéticos y su asocación con carcaterísticas de calidad de la carne bovina. Métodos: a partir de muestras de sangre de 80 toretes Charolais de 12 meses de edad mantenidos en pruebas de comportamiento, se caracterizaron polimorfismos en los marcadores CAPN316 y CAPN4751 identificados mediante el diseño de oligonucleótidos y la creación de sitios de restricción en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR-ACRS) y de TG5 identifificado mediante PCR- RFLP, se utilizaron cebadores previamente reportados. Resultados: las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismo de CAPN4751 y TG5 mostraron estar en equilibrio genético; más no para CAPN316. Los análisis de asociación mostraron una diferencia significativa del marcador CAPN4751 sobre el área del músculo Longissimus dorsi (REA) (p<0.05) y grasa intramuscualr (IMF) (p<0.10); mientras que para TG5 hubo una tendencia significativa sobre el grado de rendimiento (YG). Conclusiones: dichos resultados sugieren el efecto potencial de estos marcadores comerciales sobre características de la carne, el estudio propone su uso sinérgico como complemento informativo de indicadores de la calidad en animales reproductores, pero resalta la necesidad de validación extensiva en poblaciones particulares para fomentar su uso en el mejoramiento de la ganadería para carne.

A maciez e o marmoreio são características poligênicas e indicadoras de qualidade da carne. Um dos genes relacionados à maciez da carne é o gene da -calpaína (CAPN1), no qual se tem identificados dois polimorfismos CAPN316 e CAPN4751 associados significativamente com esta característica. No gene da tiroglobulina (TG5) relacionado com o marmoreio, se tem identificado um polimorfismo na posição -537. Objetivo: estimar as frequências genotípicas e alélicas de três marcadores genéticos (SNP) e fazer a respectiva associação dos genótipos e alelos com os indicadores de qualidade da carne, obtendo um efeito significativo sobre algumas características de carcaça estimada pela ultrassonografia em tempo real em touros Charolês no noroeste do México. Métodos: foram identificados polimorfismos em três marcadores SNP a partir de 80 amostras de sangue de novilhos Charolês, sendo os SNP CAPN4751 e CAPN316 identificados após o desenho de oligonucleotídeos iniciadores e a criação de sítios de restrição na reação em cadeia da enzima polimerase (PCR-ACRS). O marcador TG5 foi identificado por PCR-RFLP com sequencias de oligonucleotídeos previamente reportadas. Resultados: Os polimorfismos CAPN4751 e TG5 mostraram estar em equilíbrio genético, mas o CAPN316 esta em desequilíbrio. A análise de associação demonstrou uma diferença estatística significativa para o marcador CAPN4751 em área do músculo Longissimus dorsi (REA) (p< 0.05) e gordura intramuscular (MI) (p<0.10), enquanto que para TG5 houve efeito significativo sobre rendimento (YG). Conclusões: Estes resultados sugerem o efeito potencial destes marcadores comerciais para melhorar as características de qualidade da carne. O estudo propõe a utilização das informações sinergicamente com os indicadores fenotípicos de qualidade da carne, mas salienta a necessidade da validação extensiva em populações específicas para incentivar a sua utilização no melhoramento de gado de corte.

Convenient genotyping of nine bovine K-casein variants

K-casein gene polymorphisms are of major importance in the dairy industry due to their association with different quality and productive traits (i.e., milk protein). Several methods for genotyping this gene have been proposed; however, none are focused on the simultaneous discrimination of nine K-casein variants. A strategy based on PCR-RFLP was designed to characterize nine K-casein variants (A, B, C, E, F², G, H, I and J) and used to genotype three cattle populations: Gyrholando (3/8 Gyr x 5/8 Holstein), Charolais and Carora. The B variant was the most frequent in the Charolais and Carora breeds, with allelic frequencies of 0.60 and 0.59, respectively. In the Gyrholando breed, four variants were found, with the A variant being the most frequent and E and H the least. The genotyping strategy was effective in detection and differentiation of K-casein variants, and it is proposed for use in laboratories with minimal molecular biology equipment for genotyping and evaluation of the phenotypic effects of nine K-casein variants on milk production and quality.

Prevalencia de Dientes Supernumerarios / Prevalence of supernumerary teeth

La presencia de dientes supernumerarios es relativamente escasa en la población general. Estos generalmente se presentan en la parte anterior – mesiodens- y más común mente en el maxilar que en la mandíbula. Ocurren en su mayoría de manera única aunque tambien s encuentran en pares o múltiples. Son más comunes en hombres que en mujeres. Una vez encontrados deben ser extraídos lo más pronto posible para evitar que causen daño.