Genomic and transcriptomic characterization of the human glioblastoma cell line AHOL1

Cancer cell lines are widely used as in vitro models of tumorigenesis, facilitating fundamental discoveries in cancer biology and translational medicine. Currently, there are few options for glioblastoma (GBM) treatment and limited in vitro models with accurate genomic and transcriptomic characterization. Here, a detailed characterization of a new GBM cell line, namely AHOL1, was conducted in order to fully characterize its molecular composition based on its karyotype, copy number alteration (CNA), and transcriptome profiling, followed by the validation of key elements associated with GBM tumorigenesis. Large numbers of CNAs and differentially expressed genes (DEGs) were identified. CNAs were distributed throughout the genome, including gains at Xq11.1-q28, Xp22.33-p11.1, Xq21.1-q21.33, 4p15.1-p14, 8q23.2-q23.3 and losses at Yq11.21-q12, Yp11.31-p11.2, and 15q11.1-q11.2 positions. Nine druggable genes were identified, including HCRTR2, ETV1, PTPRD, PRKX, STS, RPS6KA6, ZFY, USP9Y, and KDM5D. By integrating DEGs and CNAs, we identified 57 overlapping genes enriched in fourteen pathways. Altered expression of several cancer-related candidates found in the DEGs-CNA dataset was confirmed by RT-qPCR. Taken together, this first comprehensive genomic and transcriptomic landscape of AHOL1 provides unique resources for further studies and identifies several druggable targets that may be useful for therapeutics and biologic and molecular investigation of GBM.

Guía de práctica clínica para el diagnóstico y tratamiento del estreñimiento crónico funcional en población adulta / Clinical Practice Guideline for the Diagnosis and Management of Adult Patients with Functional Chronic Constipation

Objetivo: diseñar una guía de práctica clínica para orientar el diagnóstico, y establecer la clasificación y el tratamiento farmacológico y no farmacológico en los pacientes adultos con estreñimiento crónico funcional en Colombia. Materiales y métodos: el grupo desarrollador de la presente guía estuvo conformado por un equipo multidisciplinario con apoyo de la Asociación Colombiana de Gastroenterología, el Grupo Cochrane ITS y el Instituto de Investigaciones Clínicas de la Universidad Nacional de Colombia. Se desarrollaron preguntas clínicas relevantes y se realizó la búsqueda de guías nacionales e internacionales en bases de datos especializadas. Las guías existentes fueron evaluadas en términos de calidad y aplicabilidad; ninguna de ellas cumplió criterios de adaptación, por lo que se decidió desarrollar una guía de novo. El Grupo Cochrane realizó la búsqueda sistemática de la literatura. Las tablas de evidencia y recomendaciones fueron realizadas usando la metodología GRADE. Resultados: se desarrolló una guía de práctica clínica basada en la evidencia para el diagnóstico, clasificación y tratamiento farmacológico y no farmacológico de los pacientes con estreñimiento crónico funcional en Colombia. Conclusiones: se establecieron los criterios clínicos y signos de alarma, las pruebas diagnósticas y los esquemas terapéuticos que se recomiendan en la atención de los pacientes con estreñimiento crónico funcional en Colombia.

Objective: Design a clinical practice guideline to orient the diagnosis and establishing the classification and pharmacological and non-pharmacological treatment in adult patients with chronic functional constipation in Colombia. Materials and Methods: This guide was developed by a multidisciplinary team with the support of the Colombian Association of Gastroenterology, Cochrane STI Group and Clinical Research Institute of the Universidad Nacional de Colombia. Relevant clinical questions were developed and the search for national and international guidelines in databases was performed. Existing guidelines were evaluated for quality and applicability. None of the guidelines met the criteria for adaptation, so the group decided to develop a de novo guideline. Systematic literature searches were conducted by the Cochrane Group. The tables of evidence and recommendations were made based on the GRADE methodology. Results: A clinical practice based on evidence was developed for the diagnosis, classification and pharmacological and non-pharmacological treatment of patients with chronic functional constipation in Colombia. Conclusions: The clinical criteria and warning signs, diagnostic tests and therapeutic regimens that are recommended in the care of patients with chronic functional constipation were established in Colombia.

Efecto del control biológico por antagonistas sobre fitopatógenos en vegetales de consumo humano / Biological control effect by antagonist on plant pathogens in vegetables for human consumption

Tomando en consideración el efecto adverso que provocan los pesticidas al medio ambiente y la salud y la posibilidad de al menos minimizar su uso, se investigó el efecto del control biológico de tres antagonistas microbianos (Trichoderma viride, Pseudomonas aeruginosa y Bacillus subtilis), sobre fitopatógenos causantes de enfermedades en vegetales como: tomate, cebolla y pimentón. Los ensayos se realizaron en semillas de estos tres rubros infectadas experimentalmente con tres fitopatógenos (Phytophthora spp, Fusarium monilliforme y Rhyzoctonia solani). Inicialmente, el efecto de los antagonistas sobre los fitopatógenos se determinó en medios de cultivo Sabouraud sólido (agar) y líquido (caldo). Posteriormente, 35 semillas de cada una de las especies vegetales seleccionadas se sometieron a diferentes tratamientos: I-Grupo control, sin ninguna adición; II-Grupo tratado con los antagonistas y III-Grupo infectado con los fitopatógenos. Todos los grupos se sembraron en tierra abonada, a cielo abierto y a temperatura ambiente y regados dos veces diariamente con agua. Adicionalmente, al grupo III se le agregó diariamente un inóculo de 0,1 mL de antagonista (10(4) UFC/mL). El desarrollo de las plantas se monitoreo por dos semanas determinándose el número de semillas germinadas, la longitud de las plántulas y el follaje. Los resultados se analizaron a través de Statistix 8.0, pruebas Tukey y Kruskal-wallis. Los antagonistas inhibieron la proliferación de los fitopatógenos en medio Sabouraud. Los experimentos con semillas demostraron una mayor estimulación de la germinación y tamaño de las plántulas en el grupo tratado con fitopatógenos y antagonistas respecto al grupo control (p<0,1).

Taking in account the negative actions of pesticides exert on natural environment and health and due to the possibility to minimize/eliminate its use, the effect of microbial antagonist (Trichoderma viride, Pseudomonas aeruginosa and Bacillus subtilis), were evaluated on tomato, onion and pimento seeds experimentally infected with three known phytopatogens (Phytophthora spp, Fusarium monilliforme and Rhyzoctonia solani). Initially, the antagonist effect on the phytopatogens were studied on Sabouraud solid (agar) and liquid (broth) media. Further 35 seeds of each vegetable were treated according to the following experimented protocol group I (control): no addition and water, group II (treated): antagonist and water, group III (infected): antagonist, water and phytopathogens. All groups were grown on soil, under sun light, at room temperature and water was added twice a day. Group III was daily infected with 0,1 mL of the antagonist suspensions (10(4) UFC/mL). The plant development was followed for 2 weeks, determining number of germinated seeds (germination index), plantule length and foliage. The results obtained was analyzed with Statistix 8.0, Tukey and Kruskal-Wallis. The antagonist inhibited the proliferation of the phytopathogens in Sabouraud media. The seed treated and infected showed a higher index of germination and plantule respect to the control and treated groups (p<0,1).

Evaluación de bioaerosoles en ambientes de centros de salud de la ciudad de Valencia, Venezuela / Evaluation of bioaerosoles in health center environments in the city of Valencia, Venezuela

Los establecimientos de atención en salud son entornos donde se congregan pacientes que en menor o mayor grado presentan compromisos inmunológicos. En este contexto, el ambiente hospitalario resulta un espacio donde podrían adquirir infecciones nosocomiales con el consiguiente deterioro del cuadro clínico preexistente. En el presente estudio se realizaron evaluaciones en ambientes hospitalarios de centros de salud ubicados en la ciudad de Valencia, Venezuela, tomando en cuenta áreas críticas como quirófanos. Para la captación de las muestras se tomó en cuenta las metodologías establecidas en las Normas Técnicas Españolas. La captación del aire sobre los medios de cultivo Nutritivoy Sabouraud se incubaron a 37°C de 24-72 horas, para determinar UFC/m3 de aire. Conjuntamente se midió la temperatura y humedad relativa. La identificación microbiológica se realizó utilizando galerias bioquímicas automatizadas (API). De los 6 centros hospitalarios evaluados, 5 quirófanos presentaron más de 10 UFC/m3 de aerobios mesófilos y más de 20 UFC/m3 de población fúngica, cuyo rango debería ser menor a 10UFC/m3. Los microorganismos identificados con mayor frecuencia fueron: Staphylococcus spp, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus spp., Acinetobacter lowfii, Aspergillus nidulans, A. terreus y Geotrichum candidum. Las medidas de temperatura fueron mayores a 20°C y la humedad relativa mayor a 45%, siendo el rango establecido por la NTP 409 para la temperatura entre 15-18°C, y 50-70% en cuanto a la humedad relativa. Se infiere que existe poco compromiso en aplicar las medidas correctas para cumplir a cabalidad con las normas de manipulación de pacientes en áreas críticas, lo que propicia un entorno favorable para el desarrollo microbiano, además de factores como temperatura, humedad relativa, sistemas de climatización, que no cumplen con lo indicado según las normas técnicas Internacionales

Health center facilities are areas where patients who have a greater or lesser degree of immunological compromise congregate. In this context, the hospital environment is a space where nosocomial diseases could be acquired causing deterioration of the preexistent clinical condition. This study carried out evaluations in hospital environments at health centers in the city of Valencia, Venezuela, taking into account critical areas such as operating theatres. For sample collection, methodologies established by the Spanish Technical Standards were taken into account. The air samples taken over Nutritivo and Sabouraud cultivation media were incubated at 37°C for 24-72 hours, to determine the UFC/m3 for the air. Following a 24-hour incubation at 37°C, the bacterial charges (UFC/m3) were determined. Additionally, temperature and relative humidity were measured. Taxonomical identification was achieved through a computerized biochemical test (API galleries). Five out of the six health centers evidenced more than 10UFC/m3 and 20 UFC/m3 for the bacterial and fungal charges, respectively. These values are higher than those allowed by official legislation. The most frequently detected microorganisms were Staphylococcus spp, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus spp., Acinetobacter lowfii, Aspergillus nidulans, A. terreus and Geotrichum candidum. The temperature and relative humidity were always higher than 20°C and 45%, whereas ranges established by the NTP 409 norm are 15-18ºC and 50-70%, respectively. It seems there is little commitment to applying correct measures to comply fully with standards for patient handling in critical areas, favoring an environment conducive to microbial development, as well as factors such as temperature, relative humidity and air conditioning systems, which do not comply with what is indicated in international technical standards

Recidiva en intestino delgado de tumor de GIST de bajo riesgo: caso clínico y revisión de la literatura / Recurrence of low risk small bowel GIST tumor: case report and revision of the literature

Gastrointestinal stromal tumors (GIST) are the most common mesenchymatic neoplasm in the digestive tract, representing about 1 percent of malignant gastrointestinal lesions. Seventy to eighty percent are benign according to their size and mitotic index as predictors of malignancy. However, in the presence of relapses in patients with low risk according to the current classification and in light of new adjuvant therapies (Imatinib Mesylate), have defined new parameters for estimation of malignant potential.

Los tumores del estroma gastrointestinal (GIST) son las neoplasias mesenquemáticas más comunes del tracto digestivo representando cerca del 1 por ciento de las lesiones neoplásicas gastrointestinales. El 70 por ciento-80 por ciento de ellas son benignas siendo clasificados según su tamaño e índice mitótico como predictores de malignidad. Sin embargo, ante la presencia de recidivas en pacientes con bajo riesgo según la clasificación actual y a la luz de nuevas terapias adyuvantes (Mesilato de Imatinib), se han definido nuevos parámetros para su estimación de potencial maligno.

Reparación con malla de hernia paracolostómica por vía laparoscópica: presentación de dos casos clínicos y revisión de la literatura / Parastomal hernia repair with mesh: case Report and review of the literature

La Hernia Paracolostómica (HP) es una patología frecuente en pacientes portadores de una ostomía definitiva y presenta grandes desafíos en su tratamiento, lo que está determinado principalmente por el alto porcentaje de recidiva a pesar de las distintas técnicas utilizadas en su reparación. Dentro de las más recientes, la reparación con malla intraperitoneal por vía laparoscópica aparece como una alternativa promisoria dada las características del procedimiento: Mínima tensión y mínima invasión. Se presentan dos pacientes, con colostomías definitivas y hernias paracolostómicas secundarias, en quienes se reparó el defecto con una malla para uso intraperitoneal mediante técnica laparoscópica. Ninguno de los pacientes presentó complicaciones intra ni postoperatorias. En un seguimiento a corto plazo no se ha observado recidiva. Se revisa y discute bibliografía reciente al respecto.

Parastomal hernias are frecuent pathology in patients with definitive colostomy. Laparoscopic repair with a composed mesh technique seems to be a promising procedure for these patients. We present two patients with a mesh installation by laparoscopy. We did not observe intraoperative or postoperative complications, and after a short follow-up, no recurrence has been observed.

Accidentes domésticos en peditría / Pediatric household accidents

Estudio descriptivos retrospectivos, fueron incluidos 206 casos, la edad de los niños en el momento del accidente fue en promedio de 5 años, (4m-14 años) Los tipos de accidentes fueron: traumatismo 59,2 porcientos, quemaduras 41,7 porcientos, cuerpos extraños 26,7 porcientos, electricidad 17,5 porcientos, intoxicaciones 11,6 porcientos, punzocortantes 8,7 porcientos, ahogamiento 7,3 porcientos y sofocamiento 2,9 porcientos Los elementos que los causaron también fueron investigados. El momento del día en que ocurrió con más frecuencia fue la tarde 39,3 porcientos, encontrándose al cuidado de la madre 39,3 porcientos, niñera 25,7 porcientos, niños mayores 9,2 porcientos y otros en menor proporción. Un total de 68 porcientos precisaron atensión médica y 23,6 porcientos necesitaron internación. En 27 porcientos de los niños quedó algún tipo de secuela, 37.6 porcientos de padres perdieron horas de trabajo para cuidar a sus hijos. Solo 27,7 porcientos recibieron consejo sobre prevención de accidentes de parte de los pediatras El tipo de accidentes domésticos más frecuente fue el ocasionado por traumatismo, lo más frecuente es que ocurra a la tarde, bajo el cuidado materno o de niñera principalmente. Un alto porcentaje requirió atención médica e internación. Las horas perdidas de trabajos de los padres como consecuencia de los accidentes implican pérdidas económica, el pediatra hace prevención primaria de accidentes en muy bajo porcentaje

Síndrome de asherman. Factores asociados. Diagnóstico y manejo, Profamilia Medellín. 1983–1989 / Asherman Syndrome. Associated factors. Diagnosis and handling. Profamilia, Medellín 1983 – 1989

El síndrome de Adherencias Intrauterinas (Síndrome de Asherman) es una entidad que no ha sido estudiada en nuestro medio y por lo tanto no existen protocolos para diagnóstico y manejo ante un paciente con factores de riesgo para desarrollar la enfermedad. Se realizó un estudio descriptivo retrospectivo para evaluar incidencia, factores de riesgo, hallazgos histeroscópicos, tratamientos y resultados en pacientes con síndrome de Asherman en Profanilla Medellín desde enero de 1983 hasta abril de 1989. Se presentaron 68 casos, pero sólo fue posible recolectar datos en 55 pacientes. Los dos principales motivos de consulta o de remisión fueron amenorrea e infertilidad, presentándose en el 92 por ciento de las pacientes. El principal factor de riesgo encontrado fue el traumatismo intrauterino, de origen obstétrico o ginecológico encontrándose en el 81.8 por ciento de los casos. Todas las pacientes fueron evaluadas mediante histeroscopia, encontrándose en la mayoría de ellas (67.27) adherencias corporales, siguiendo en importancia adherencias combinadas, atrepsia total y adherencias ístmicas. Para el tratamiento se utilizaron procedimientos histeroscópicos, inserción de dispositivo intrauterino y terapia hormonal en la gran mayoría de las pacientes. En el 64.8 por ciento de las pacientes se documentó reaparición de la menstruación y en el 43 por ciento de las pacientes que deseaban embarazo se logró este objetivo. Al comparar la respuesta al tratamiento se vio que hubo una respuesta más favorable cuando se realizó ruptura con instrumento romo de las adherencias e inserción del dispositivo intrauterino, siendo esta diferencia estadísticamente significativa. Once pacientes lograron 16 embarazos de los cuales 7 fueron a término, 5 presentaron ruptura prematura de membranas y parto prematuro y 4 abortos del primer trimestre. Los factores de riesgo encontrados, los resultados y dificultades en el tratamiento, nos obligan a replantear tanto la indicación como la técnica p.