Detection of enteric viruses in recreational waters of an urban lagoon in the city of Rio de Janeiro, Brazil

The aim of this study was to determine the occurrences of the group A rotavirus (RVA), norovirus (NoV) and human adenovirus (HAdV) in the surface waters of an urban lagoon (Rodrigo de Freitas Lagoon) in the city of Rio de Janeiro, Brazil. During one year of surveillance, water samples were obtained from the lagoon and other interconnected ecosystems (river and beach). The samples were concentrated using an adsorption-elution method with a negatively charged membrane and tested by qualitative and quantitative polymerase chain reaction assays. RVA was the most prevalent virus detected (24.3%) with a viral load ranging from 3.0 x 10¹-5.6 x 10(4) genome copies/L, followed by NoV (18.8%) and HAdV (16.7%). Considering water samples suitable for bathing, according to Escherichia coli criterion (< 2,000 most probable number/100 mL), viruses were detected in 50% (57/114) of them. Physicochemical parameters were also measured and showed possible correlations between turbidity and RVA presence and between pH and NoV presence. These data demonstrate the importance of considering viral parameters to ensure water quality and the utilisation of these parameters as additional tools for the characterisation of environmental contamination.

Monitoramento do vírus da hepatite A na Lagoa Rodrigo de Freitas do Município do Rio de Janeiro / Monitoring of hepatitis A in the Lagoa Rodrigo de Freitas in Rio de Janeiro, RJ

O vírus da hepatite A (HAV) é um dos vírus entéricos mais estáveis no meio ambiente, permanecendo infeccioso mesmo após os processos de tratamento e desinfecção da água. Surtos de hepatite A associados à contaminação de reservatórios hídricos têm sido descritos em muitos países. No entanto, a importância do HAV permanece negligenciada, principalmente, devido à dificuldade em se recuperar o vírus em águas ambientais. Este estudo teve como objetivo avaliar a disseminação do HAV em águas de recreação de contato primário, utilizando, para concentração viral, um método de adsorção-eluição de vírus em membrana carregada negativamente, associado à detecção do genoma viral por reação em cadeia pela polimerase precedida da transcrição reversa (RT-PCR) e à quantificação viral pela PCR em tempo real (qRT-PCR). A caracterização dos isolados foi realizada por análise filogenética de 218 pares de bases da região VP1/2A do genoma do HAV. A Lagoa Rodrigo de Freitas foi utilizada como modelo de estudo para monitoramento ambiental por ser regulamentada como uma área de proteção permanente, sendo um ponto turístico e de lazer de grande expressão na estrutura urbana da cidade do Rio de Janeiro. De um total de 144 amostras de água coletadas nesse estudo o HAV foi detectado em 31 (21,53 por cento) pelo método de qRT-PCR, com títulos variando entre 13 e 243 cópias/mL. E em apenas cinco (3,47 por cento) pelo método qualitativo (RT-nested PCR), todas caracterizadas como genótipo IB, porém apresentando pequena diferença genética entre elas, o que demonstra que existe uma variedade de cepas circulantes na Lagoa Rodrigo de Freitas. Considerando as 25 amostras de água com altos títulos de coliformes fecais, foi observada forte correlação positiva estatisticamente significante entre os níveis de coliformes fecais e a detecção quantitativa do HAV. Uma correlação positiva fraca foi também observada entre os parâmetros condutividade, salinidade e turbidez e a detecção quantitativa do HAV. A associação dos dois métodos (qRT-PCR e RT-nested PCR) utilizados nesse estudo possibilitou evidenciar a presença de HAV nos diferentes pontos da Lagoa Rodrigo de Freitas, demonstrando ser uma importante ferramenta tanto na avaliação da qualidade da água como no esclarecimento de surtos de veiculação hídrica.