Detection of the Asian II genotype of dengue virus serotype 2 in humans and mosquitoes in Brazil

Abstract INTRODUCTION: DENV-2 is the cause of most dengue epidemics worldwide and is associated with severe cases. METHODS: We investigated arboviruses in 164 serum samples collected from patients presenting with clinical symptoms of dengue fever and 152 mosquito pools. RESULTS: We detected the Asian II genotype of DENV-2 in humans and mosquitoes. Our results confirmed the circulation of the Asian II genotype in Brazil, in addition to the prevalent Asian/American genotype. CONCLUSIONS: The detection of Asian II genotype of DENV-2 in mosquito pools collected in a forest park may be related to a spillback event of human dengue virus.

Dengue in Araraquara, state of São Paulo: epidemiology, climate and Aedes aegypti infestation / Dengue em Araraquara, SP: epidemiologia, clima e infestação por Aedes aegypti

ABSTRACT OBJECTIVE To describe the epidemiology of dengue in a medium-sized city in the state of São Paulo. METHODS Data, such as circulating serotypes, severe cases and deaths, age group, sex, among others, were obtained on reported and confirmed dengue cases in Araraquara, state of São Paulo, between 1991 and 2015. Climatic and infestation data were also analyzed. These variables were evaluated descriptively, using statistical measures such as frequencies, averages, minimum and maximum. Dengue incidence rates were calculated according to month, year, age and sex, and time series of dengue cases, infestation, and climatic variables. RESULTS Approximately 16,500 cases of dengue fever were reported between 1991 and 2015. The highest number of reports was recorded in 2015 (7,811 cases). In general, the age group with the highest number of reports is between 20 and 59 years old. The highest incidences, generally between March and May, occurred after the increase in rainfall and infestation in January. CONCLUSIONS Increased levels of infestation due to rainfall are reflected in incidence rates of the disease. It is fundamental to know the epidemiology of dengue in medium-sized cities. Such information can be extended to diseases such as Zika and Chikungunya, which are transmitted by the same vector and were reported in the city. The intensification of surveillance efforts in periods before epidemics could be a strategy to be considered to control the viral spread.

RESUMO OBJETIVO Descrever a epidemiologia da dengue em cidade de médio porte do estado de São Paulo. MÉTODOS Foram obtidas informações sobre os casos notificados e confirmados de dengue em Araraquara, SP, entre 1991 e 2015, como sorotipos circulantes, casos graves e óbitos, faixa etária, sexo, entre outras. Também foram levantadas as informações climáticas e de infestação pelo vetor. Essas variáveis foram trabalhadas descritivamente, utilizando-se medidas estatísticas como frequências, médias, mínimo e máximo. Calcularam-se taxas de incidência de dengue segundo mês, ano, idade e sexo, e série histórica de casos de dengue, infestação e variáveis climáticas. RESULTADOS Foram confirmados 16.431 casos de dengue entre 1991 e 2015. O maior número de notificações foi registrado em 2015 (7.811 casos). De forma geral, a faixa etária com o maior número de notificações encontra-se entre 20 e 59 anos. As maiores incidências, geralmente entre março e maio, ocorreram após o aumento da pluviosidade e infestação, em janeiro. CONCLUSÕES Os altos níveis de infestação que aumentam com as chuvas refletem-se nas taxas de incidência da doença. É fundamental conhecer a epidemiologia da dengue em cidades de médio porte. Seus resultados podem ser estendidos para doenças como Zika e Chikungunya (transmitidas pelo mesmo vetor e notificadas na cidade). A intensificação dos esforços de vigilâncias em períodos que precedem as epidemias poderia ser uma estratégia a ser considerada para o controle da dispersão viral.

Co-infection ofddengue virus by serotypes 1 and4 in patient from medium sized city from Brazil / Co-infeccao por virus dengue, sorotipos 1 e 4, em paciente de cidade de porte medio no Brasil

SUMMARY The natural co-infection with dengue virus can occur in highly endemic areas where different serotypes have been observed for many years. We report one case of DENV-1/DENV-4 co-infection in human serum detected by molecular tests. Phylogenetic analysis of the sequences obtained indicated the presence of genotype V and II for DENV-1 and DENV-4, respectively. .

RESUMO A co-infecção por dengue vírus pode ocorrer em áreas com circulação endêmica, nas quais diferentes sorotipos vêm circulando durante muitos anos. Neste trabalho relatamos um caso de co-infecção por DENV-1/DENV-4 em soro humano, detectado por testes moleculares. Análises filogenéticas das sequências obtidas indicaram a presença do genótipo V e II de DENV-1 e DENV-4, respectivamente. .

Serological detection of West Nile virus in horses and chicken from Pantanal, Brazil

In an effort to detect West Nile virus (WNV) in Brazil, we sampled serum from horses and chickens from the Pantanal region of the state of Mato Grosso and tested for flavivirus-reactive antibodies by blocking ELISA. The positive samples were further confirmed for serological evidence of WNV infection in three (8%) of the 38 horses and one (3.2%) of the 31 chickens using an 80% plaque-reduction neutralisation test (PRNT80). These results provide evidence of the circulation of WNV in chickens and horses in Pantanal.

Concurrent dengue and malaria in the Amazon region / Co-infecção por dengue e malária na região Amazônica

INTRODUCTION: The Amazon region has extensive forested areas and natural ecosystems, providing favorable conditions for the existence of innumerous arboviruses. Over 200 arboviruses have been isolated in Brazil and about 40 are associated with human disease. Four out of 40 are considered to be of public health importance in Brazil: Dengue viruses (1-4), Oropouche, Mayaro and Yellow Fever. Along with these viruses, about 98 percent of the malaria cases are restricted to the Legal Amazon region. METHODS: This study aimed to investigate the presence of arboviruses in 111 clinical serum samples from patients living in Novo Repartimento (Pará), Plácido de Castro (Acre), Porto Velho (Rondônia) and Oiapoque (Amapá). The viral RNA was extracted and RT-PCR was performed followed by a Multiplex-Nested-PCR, using Flavivirus, Alphavirus and Orthobunyavirus generic and species-specific primers. RESULTS: Dengue virus serotype 2 was detected in two patients living in Novo Repartimento (Pará) that also presented active Plasmodium vivax infection. CONCLUSIONS: Despite scant data, this situation is likely to occur more frequently than detected in the Amazon region. Finally, it is important to remember that both diseases have similar clinical findings, thus the diagnosis could be made concomitantly for dengue and malaria in patients living or returning from areas where both diseases are endemic or during dengue outbreaks.

INTRODUÇÃO: A região Amazônica possui extensas áreas florestadas e ecossistemas naturais, provendo condições favoráveis para a existência de diversos arbovírus. Aproximadamente, 200 arbovírus foram isolados no Brasil, e 40 estão associados com doenças em humanos. Quatro destes 40 são considerados ser de importância para a saúde pública no Brasil: vírus da dengue (1-4), Oropouche, Mayaro e febre amarela. Juntamente com estes vírus, aproximadamente 98 por cento dos casos de malária estão restritos à região da Amazônia Legal. MÉTODOS: O objetivo deste estudo foi investigar a presença de arbovírus em 111 amostras clínicas de sangue de pacientes que residiam em Novo Repartimento (Pará), Plácido de Castro (Acre), Porto Velho (Rondônia) and Amapá (Macapá). O RNA viral foi extraído, RT-PCR foi realizada seguida de uma Multiplex-Nested-PCR, usando primers genéricos e espécie-específicos para Flavivirus, Alphavirus and Orthobunyavirus. RESULTADOS: Detectamos o vírus da dengue, sorotipo 2, em dois pacientes que residiam em Novo Repartimento (Pará), que também tinham infecção por Plasmodium vivax. CONCLUSÕES: Apesar de dados escassos, esta situação, provavelmente, ocorre mais frequência que a detectada na região Amazônica. Definitivamente, é importante lembrar que ambas as doenças possuem achados clínicos similares, assim o diagnóstico deveria ser feito concomitantemente para dengue e malária em pacientes que residem ou estão voltando de áreas onde ambas as doenças são endêmicas.

Evaluation of oviposition traps as an entomological surveillance method for Aedes aegypti (Diptera, Culicidae) / Avaliação das armadilhas de oviposição como método de vigilância entomológica para Aedes aegypti (Diptera, Culicidae)

This study aimed to describe the behavior of oviposition traps for Aedes aegypti over time, to compare it with the larval survey and to investigate the association with climatic variables. It was conducted in São José do Rio Preto city, São Paulo. Daily climatic data and fortnightly measurements for oviposition traps and larval infestation were collected from October 2003 to September 2004. Three different periods were identified in the behavior of oviposition traps' positivity and mean number of eggs: increase, plateau and decrease in values. These measurements followed the variation of climatic data from the first and third periods. High correlation was obtained between the positivity and the mean number of eggs. The oviposition traps showed higher capacity to detect the vector than did larval survey. It was observed that the first (October to December) and third (May to September) periods were considered to be the most suitable to use oviposition traps than larval surveys.

O estudo teve como objetivos descrever o comportamento da armadilha de oviposição para Aedes aegypti ao longo do tempo, comparar com a pesquisa larvária e investigar sua associação com variáveis climáticas. O trabalho foi realizado em São José do Rio Preto, São Paulo. Entre outubro de 2003 a setembro de 2004, as armadilhas e a pesquisa larvária forneceram dados quinzenais e foram obtidos dados climáticos. Três períodos distintos foram identificados no comportamento da positividade das armadilhas e no número médio de ovos: aumento, patamar e decréscimo dos valores. Estas medidas acompanharam as variações climáticas. Alta correlação foi obtida entre a positividade e número de ovos. As armadilhas de oviposição apresentam maior capacidade para detectar o vetor do que a pesquisa larvária. Foi observado que o primeiro (outubro a dezembro) e terceiro (maio a setembro) períodos foram os mais adequados para utilização das armadilhas de oviposição em comparação à pesquisa larvária.

Variáveis socioeconômicas e a transmissão de dengue / Socioeconomic variables and dengue transmission / Socioeconomic variables and dengue transmission

OBJETIVO: Avaliar a relação entre o risco de ocorrência de dengue e os níveis socioeconômicos. MÉTODOS: Os casos autóctones de dengue confirmados entre setembro de 1990 a agosto de 2002 foram geocodificados e agrupados segundo setores censitários urbanos de São José do Rio Preto, estado de São Paulo. Um fator socioeconômico foi gerado por meio da técnica de análise de componentes principais, agrupando os setores censitários em quatro níveis socioeconômicos. Os coeficientes de incidência foram calculados, por ano e quadriênio, para cada um dos agrupamentos de setores censitários, considerando-se o período entre setembro de um ano a agosto do ano seguinte. São apresentados mapas temáticos dos setores agrupados nos quatro níveis socioeconômicos com os respectivos coeficientes de incidência da doença. RESULTADOS: A análise de componentes principais produziu um fator socioeconômico responsável por 87 por cento da variação total. Esse fator esteve associado com as incidências de dengue apenas no ano de 1994-1995. CONCLUSÕES: A ausência de associação encontrada entre risco de ocorrência de dengue e níveis socioeconômicos na quase totalidade dos anos estudados mostra que esta é uma questão que precisa ser mais bem estudada e, talvez, dependa da realidade de cada município. É importante que sejam verificadas as relações espaciais entre a transmissão de dengue e outras variáveis, como o grau de imunidade da população; a efetividade das medidas de controle; o grau de infestação pelo vetor; os hábitos e atitudes da população, entre outros.

OBJECTIVE: To evaluate the relationship between risk of occurrence of dengue and socioeconomic level. METHODS: All confirmed autochthonous cases of dengue between September 1990 and August 2002 were geocoded and grouped according to the urban census tracts of the municipality of São José do Rio Preto, Southeastern Brazil. A socioeconomic factor generated by principal component analysis was used to group census tracts into four socioeconomic levels. Incidence rates were calculated for each year and four-year period for each of the census sectors, considering the period from September of one year to August of the next. Thematic maps of sectors, grouped into each of the four socioeconomic levels and their respective disease incidences, are presented. RESULTS: Principal component analysis generated a socioeconomic factor that accounted for 87 percent of total variation. This factor was associated with dengue incidence only for the 1994-95 period. CONCLUSIONS: The lack of an association between risk of occurrence of dengue and socioeconomic levels in almost all years studied indicates that this issue deserves further study, and may vary depending on the settings found in each municipality. It will be important to determine the spatial relationship between dengue transmission and other variables, such as degree of immunity in the population, effectiveness of control measures, degree of infestation by the vector; and population habits and behaviors, among others.

O Programa de Controle do Dengue em São José do Rio Preto, São Paulo, Brasil: dificuldades para a atuação dos agentes e adesão da população / Dengue Control Program in São José do Rio Preto, São Paulo State, Brazil: problems with health agents' work and population adherence

O objetivo do trabalho foi identificar aspectos que interferem na atuação dos agentes de controle de vetores e comunitários de saúde no Programa de Controle do Dengue e na adesão da população. Utilizou-se metodologia de grupos focais, nos quais foi discutida a relação agente-serviço-população. O controle e prevenção do dengue foram considerados atividades de menor importância, e o agente ideal seria aquele capaz de encaminhar todas as demandas e não só aquelas relacionadas ao dengue. Os agentes de controle de vetores apontaram para problemas como recusa e falta de adesão, identificação como coletores de lixo, diferenciação de status em relação aos agentes comunitários de saúde. Entre as mulheres, identificaram-se a relação de culpabilização entre vizinhos, a associação do problema do dengue à falta de higiene e a relação entre casa limpa e ausência de criadouros. Os aspectos destacados interferem negativamente na atuação dos agentes e são condicionados pela característica vertical do programa. Encaminhamentos possíveis: incorporação dos agentes de controle às Unidades de Saúde, investimento na integração intersetorial e criação de condições para que os agentes atuem sobre o meio ambiente.

This study aimed to identify the aspects that interfere with the performance of vector control agents and community health workers and population adherence to dengue control programs. The focal group methodology was applied to discuss the relations between the program, health agents, and population. According to the results, dengue control and prevention were considered relatively unimportant activities, i.e., ideal community health workers would be capable of solving other (supposedly more important) problems. Vector control agents emphasized the population's lack of adherence and the fact that they (the control agents) were confused with garbage collectors (considered less important than community health workers, and with a focus more on productivity than quality). Women frequently blamed neighbors for the dengue problem and associated the disease with lack of hygiene. These aspects have a negative impact on dengue control agents' work and result from the program's vertical structure. Possible solutions would be to incorporate the agents into community health clinics, encourage cooperation between departments, and provide the conditions for them to intervene in the environment.

Controle do dengue em uma área urbana do Brasil: avaliacão do impacto do Programa Saúde da Família com relacão ao programa tradicional de controle / Dengue control in an urban area of Brazil: impact of the Family Health Program on traditional control

Avaliaram-se os resultados da integracão do Programa Saúde da Família (PSF) e do Programa de Controle do Dengue em São José do Rio Preto, São Paulo, Brasil. O estudo foi realizado em uma área com PSF e outra sem PSF. Na primeira, os agentes comunitários de saúde, de modo integrado com as suas atribuicões, orientavam os moradores sobre as medidas de controle de dengue, incentivando-os a realizá-las. Na segunda área, os agentes de controle de vetores orientavam os moradores e realizavam as atividades de controle de criadouros. Conduziram-se, de outubro de 2001 a janeiro de 2003, levantamentos para mensurar conhecimentos e práticas dos moradores sobre dengue. Na área com PSF comparativamente com a sem PSF as proporcões de entrevistados que afirmaram ter como fonte de informacão o servico de saúde apresentaram aumento significante. Nas duas áreas ocorreram mudancas significantes em termos de ganhos de conhecimento e diminuicão de recipientes. Os resultados mostraram que a integracão entre os dois programas é viável, representa otimizacão de recursos ao evitar a duplicidade das visitas e possibilita um maior envolvimento da comunidade no controle do dengue.

Atividades de controle do dengue na visão de seus agentes e da população atendida, São José do Rio Preto, São Paulo, Brasil / Dengue control as viewed by agents and the target population in São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil

O objetivo foi identificar, no contexto da atuação dos agentes responsáveis pelo controle do dengue e na sua relação com moradores, situações vivenciadas no dia-a-dia de suas funções. Realizou-se estudo transversal com aplicação de questionários à população dos agentes de controle de vetores (ACV), à dos agentes comunitários de saúde (ACS) e a uma amostra de mulheres. As respostas dadas pelos agentes foram agrupadas nos âmbitos do trabalho, particular e coletivo. As mulheres foram abordadas sobre a relação mantida com os agentes. As dificuldades citadas nos âmbitos particular e trabalho pelos ACV diferiram das citadas pelos ACS. No coletivo foram coincidentes e mostraram que ambos não estão preparados para lidar com estas questões. Das mulheres entrevistadas, 87,0 por cento afirmaram estar bem ou muito bem informadas sobre dengue, 84,0 por cento afirmaram que os trabalhos dos agentes ajudam sempre e 54,0 por cento apontaram como dificuldade o horário impróprio da visita realizada pelo agente. Identificou-se a necessidade de um novo profissional que reconheça e respeite as particularidades dos locais onde atua e desenvolva suas atividades de forma integrada às questões sócio-ambientais da comunidade.

Identification of the best ovitrap installation sites for gravid Aedes (Stegomyia) aegypti in residences in Mirassol, state of São Paulo, Brazil

This study aimed at identifying the best ovitrap installation sites for gravid Aedes aegypti in Mirassol, state of São Paulo, Brazil. Ovitraps were installed in ten houses per block over ten blocks. Four ovitraps were placed per residence, one in the bedroom, one in the living room, and two outdoors with one in a sheltered area and one in an outside site. Each week for eleven weeks, visits were made to examine the ovitraps and to change the paddles used for egg-laying. Eggs were analyzed according to the trap location. The results showed that the outdoor sites received significantly more oviposition than indoor sites. Additionally, in respect to the outdoor sites, the outside site received significantly more oviposition than the sheltered site. A b correlation was observed between positive traps and egg numbers. The results are discussed with respect to the best installation site of the traps and their implications in surveillance and control of dengue vectors.

Análise espacial da transmissão de dengue em cidade de porte médio do interior paulista / Spatial analysis of dengue transmission in a medium-sized city in Brazil

OBJETIVO: Analisar espacialmente a transmissão de dengue entre setembro de 1990 e agosto de 2002 em cidade de porte médio do interior paulista. MÉTODOS: Utilizaram-se casos autóctones confirmados laboratorialmente e dados populacionais de São José do Rio Preto, obtidos da Fundação Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística e da Prefeitura Municipal. Os casos foram geocodificados a partir do eixo de logradouros e agrupados segundo os 432 setores censitários do município, resultando em mapas temáticos. RESULTADOS: Notou-se tendência ascendente das incidências anuais com pico em 2000/2001. Entre 1990 e 1994 a duração da transmissão atingiu, no máximo, cinco meses em cada período, com aumento nos anos seguintes. No último período, ocorreu nos 12 meses, sem interrupção. A análise do período de maior incidência mostrou que a transmissão não ocorreu uniformemente. Enquanto 29 por cento dos setores registraram incidências inferiores a mil casos por 100 mil habitantes, 5 por cento deles ultrapassaram os cinco mil casos. CONCLUSÕES: Observou-se o processo da endemização, com transmissão durante todo o ano, sem a necessidade de introdutores. A característica endêmica da transmissão e a ocorrência diferenciada segundo áreas devem ser levadas em conta na estruturação de estratégias para o controle de dengue.