ABSTRACT
Museum collections have been widely used as sources of biological samples for molecular biology studies and there are several methodologies and techniques to obtain and analyze DNA from tissues archived in museums, but most of these protocols have been developed for a specific tissue or are commercial kits. We present a simple protocol for extracting and amplifying DNA segments from sloth museum specimens. With this simple protocol we analyzed DNA fragments from 64 percent of 64 skin samples from three-toed sloths (Bradypus variegatus and Bradypus tridactylus) archived in three different museums: 43 samples from the University of São Paulo Museum of Zoology (Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, MUZUSP) São Paulo, São Paulo, Brazil; 18 samples from the Emílio Goeldi Museum (Museu Paraense Emílio Goeldi, MPEG), Belém, Pará, Brazil; and 3 samples from the Museum of Vertebrate Zoology (MVZ) University of California, Berkeley, USA. The specimens sampled ranged in age from 18 to 108 years old. Our methodology allowed the recovery of up to 700 bp of mitochondrial DNA and 400 bp of nuclear genes. Thereafter, it is useful for genetic diversity studies of three-toed sloths and could be applied to other animals.
ABSTRACT
The bat species Platyrrhinus lineatus and P. recifinus (Phyllostomidae: Stenodermatinae) are ecologically important because of their capacity for seed dispersal. P. recifinus is endemic to the Atlantic rain forest and is considered vulnerable by the IUCN. The lack of distinct morphological features makes identification of the two species a difficult task. This study was aimed at testing the hypothesis that these are actually two distinct species by using PCR-RFLP of the mitochondrial cytocrome b gene. The results showed no shared haplotypes, demonstrating that these are, in fact, two distinct species. No polymorphism was obtained for P. recifinus, which could be a sign of low genetic diversity in this threatened species.
Subject(s)
Animals , Chiroptera , Polymerase Chain Reaction , Genetic Variation , Polymorphism, Genetic , Polymorphism, Restriction Fragment LengthABSTRACT
Two sibling species of Biomphalaria, B. tenagophila and B. occidentalis were identified using isozyme patterns obtained by horizontal gel electrophoresis. Six diagnostic enzymatic loci were identified in digestive gland homogenates. The results enable us to distinguish the species, calculate the Nei's coefficient of genetic similarity, and provide a basis for making inferences about the pattern of these two planorbid species colonization and distribution.
Subject(s)
Animals , Biomphalaria , Isoenzymes , Brazil , Electrophoresis, Polyacrylamide Gel , Electrophoresis, Starch Gel , Gene Frequency , Polymorphism, Genetic , Population DensityABSTRACT
Com a finalidade de se caracterizar o padräo de evoluçäo das desidrogenases alcoolicas de tefritídeos foram realizados diversos tipos de análise. Através de eletroforese em gel de amido, foram analisadas as ADHs de larvas de alguns tefritídeos e de famílias relacionadas (drosofilídeos e otitídeos). Esta análise revelou uma grande variaçäo quanto ao número de locos que produzem este tipo de enzima. Em Tomoplagia rudolfi, näo se observou qualquer atividade de ADH. Em Acinia fucata, Rachiptera limbata, Rhagoletis nova e R. conversa observou-se apenas um loco, sendo que nas duas primeiras espécies, a enzima correspondente apresentou migraçäo anódica e atividade fortemente preferencial em alcoois de cadeia longa. Esta enzima corresponde ao loco Adh-2 e apresenta comportamento semelhante ao da enzima produzida pelo loco Odh de Drosophila melanogaster. Nas duas espécies estudadas do gênero Rhagoletis, a enzima produzida pelo loco que foi denominado Adh-1 apresentou migraçäo catódica e menor especialidade por substratos alcoólicos, mas ativa principalmente em alcoois de cadeia curta, similar ao observado nas enzimas produzidas pelo loco Adh de Drosophila melanogaster. As larvas de Euxesta eluta (Otitidae)) apresentaram uma ADH que se comportava de modo similar àquela produzida pelas larvas das espécies estudadas de Rhagoletis. Em Ceratitis capitata, Anastrepha grandis, A. fraterculus e A. striata foram observados dois locos, com as características dos locos Adh-1 e Adh-2 já comentadas, mas com especificidade de substrato bem menos pronunciada. Em A. obliqua, A. serpentina e A. bistrigata, foram observados, além destes dois locos, um terceiro (Adh-3), produzindo enzimas com características de migraçäo e especificidade de substrato semelhantes às das enzimas produzidas pelo loco Adh-2. Em A. bistrigata, foi detectado, em parte dos indivíduos o que seria uma enzima correspondente a um quarto loco, com características semelhantes às da enzima produzida pelo loco Odh de D. melanogaster. Medidas de atividade específica de ADH e do conteudo de etanol (principal alcool encontrado) nos frutos hospedeiros de espécies de Anastrepha mostraram haver uma correlaçäo positiva e estatisticamente signioficante entre estes parâmetros