Unique synapomorphies and high diversity in South American Raji-related Epstein-Barr virus genomes

BACKGROUND Epstein-Barr virus (EBV) is a human gammaherpesvirus etiologically linked to several benign and malignant diseases. EBV-associated malignancies exhibit an unusual global distribution that might be partly attributed to virus and host genetic backgrounds. OBJECTIVES To assemble a new genome of EBV (CEMO3) from a paediatric Burkitt's lymphoma from Rio de Janeiro State (Southeast Brazil). In addition, to perform global phylogenetic analysis using complete EBV genomes, including CEMO3, and investigate the genetic relationship of some South American (SA) genomes through EBV subgenomic targets. METHODS CEMO3 was sequenced through next generation sequencing and its coverage and gaps were corrected through the Sanger method. CEMO3 and 67 EBV genomes representing diverse geographic regions were evaluated through maximum likelihood phylogenetic analysis. Further, the polymorphism of subgenomic regions of some SA EBV genomes were assessed. FINDINGS The whole bulk tumour sequencing yielded 23,217 reads related to EBV, which 172,713 base pairs of the newly EBV genome CEMO3 was assembled. The CEMO3 and most SA EBV genomes clustered within the SA subclade closely related to the African Raji strain, forming the South American/Raji clade. Notably, these Raji-related genomes exhibit significant genetic diversity, characterised by distinctive synapomorphies at some gene levels absent in the original Raji strain. CONCLUSION The CEMO3 represents a new South American EBV genome assembled. Albeit the majority of EBV genomes from SA are Raji-related, it harbours a high diversity different from the original Raji strain.

Variation of intraocular pressure comparing rebound (TONOVET Plus®) and applanation (TONO-PEN VET®) tonometry in New Zealand rabbits treated with Amlodipine® / Variación de la presión intraocular comparando la tonometría de rebote (TONOVET Plus®) y aplanación (TONO-PEN VET®) en conejos de Nueva Zelanda tratados con Amlodipino® / Variação da pressão intraocular comparando a tonometria de rebote (TONOVET Plus®) e de aplanação (TONO-PEN VET®) em coelhos da Nova Zelândia tratados com Amlodipina®

Abstract Rabbits have played an important role in ophthalmological research processes, however in the environment there has been a deficiency of sensitive equipment in measurement of intraocular pressure for this species. To compare intraocular pressure (IOP) measured with rebound (TONOVET Plus®) and applanation (TONO-PEN VET®) tonometry in healthy New Zealand rabbits treated with Amlodipine. Twelve healthy male New Zealand white rabbits, 5 months old; two groups with 6 individuals were used in this study. The experimental group was given Amlodipine® at a dose of 5 mg/kg, once a day for a month. Blood pressure and intraocular pressure were measurement before treatment and 6 h after treatment in a period of one month. A trend is noted where the group of animals treated with amlodipine® presents lower values than the control group, both in systolic and diastolic pressure. The systolic pressure of the control group showed an average of 116.5 ± 7.9 mmHg and 117.4 ± 8.9 mmHg and the treatment group showed an average of 113.6 ± 7.9 mmHg and 111.8 ± 10.0 mmHg (pretreatment and posttreatment respectively). Tonometry: the values obtained using the TONOVET Plus® (19 ± 3 mmHg) are on average higher than the values obtained using the TONO-PEN VET® (17 ± 3 mmHg). It was possible to demonstrate the relationship between systemic blood pressure and intraocular pressure in New Zealand white rabbits. Rebound tonometry showed less variability in results than applanation tonometry. This study confirmed that both tonometers are reliable for measuring IOP in rabbits.

Resumen Los conejos han jugado un papel importante en los procesos de investigación oftalmológica, sin embargo, en el medio ha existido una deficiencia de equipos sensibles en la medición de la presión intraocular para esta especie. Para comparar la presión intraocular (PIO) medida con la tonometría de rebote (TONOVET Plus®) y aplanación (TONO-PEN VET®) en conejos Nueva Zelanda sanos y tratados con Amlodipino, fueron usados doce conejos Nueva Zelanda, machos, sanos, de 5 meses de edad y distribuidos en dos grupos con 6 individuos cada uno. El grupo experimental recibió Amlodipino® en una dosis de 5 mg/kg, una vez al día durante un mes. La presión arterial y la presión intraocular se midieron antes del tratamiento y 6 h después del tratamiento en un período de un mes. Se observa una tendencia donde el grupo de animales tratados con amlodipino® presenta valores más bajos que el grupo control, tanto en presión sistólica como diastólica. La presión sistólica del grupo control mostró un promedio de 116,5 ± 7,9 mmHg y 117,4 ± 8,9 mmHg y el grupo de tratamiento mostró un promedio de 113,6 ± 7,9 mmHg y 111,8 ± 10,0 mmHg (pretratamiento y postratamiento respectivamente). Tonometría: los valores obtenidos con el TONOVET Plus® (19 ± 3 mmHg) son en promedio superiores a los valores obtenidos con el TONO-PEN VET® (17 ± 3 mmHg). Fue posible demostrar la relación entre la presión arterial sistémica y la presión intraocular en conejos blancos Nueva Zelanda. La tonometría de rebote mostró menos variabilidad en los resultados que la tonometría de aplanamiento. Este estudio confirmó que ambos tonómetros son confiables para medir la PIO en conejos.

Resumo Os coelhos têm desempenhado um papel importante nos processos de pesquisa oftalmológica, porém no meio tem havido uma deficiência de equipamentos sensíveis na medida da pressão intraocular para esta espécie. Comparar a pressão intraocular (PIO) medida com tonometria de rebote (TONOVET Plus®) e de aplanação (TONO-PEN VET®) em coelhos saudáveis da Nova Zelândia tratados com Amlodipina®. Foram utilizados neste estudo doze coelhos brancos da Nova Zelândia, machos saudáveis, 5 meses de idade; distribuído em dois grupos com 6 indivíduos cada um. O grupo experimental recebeu Amlodipina® na dose de 5 mg / kg, uma vez ao dia durante um mês. A pressão arterial e a pressão intraocular foram medidas antes do tratamento e 6 horas após o tratamento em um período de um mês. Nota-se uma tendência onde o grupo de animais tratados com amlodipina® apresenta valores inferiores ao grupo controle, tanto na pressão sistólica quanto na diastólica. A pressão sistólica do grupo controle apresentou média de 116,5 ± 7,9 mmHg e 117,4 ± 8,9 mmHg e o grupo tratamento apresentou média de 113,6 ± 7,9 mmHg e 111,8 ± 10,0 mmHg (pré-tratamento e pós-tratamento, respectivamente). Tonometria: os valores obtidos com o TONOVET Plus® (19 ± 3 mmHg) são em média superiores aos valores obtidos com o TONO-PEN VET® (17 ± 3 mmHg). Foi possível demonstrar a relação entre a pressão arterial sistêmica e a pressão intraocular em coelhos brancos da Nova Zelândia. A tonometria de rebote mostrou menos variabilidade nos resultados do que a tonometria de aplanação. Este estudo confirmou que ambos os tonômetros são confiáveis para medir a PIO em coelhos.

Tratamiento contemporáneo de la litiasis renal piélica: a propósito de un caso / Contemporary treatment of renal pyelic lithiasis: a case report

Resumen Introducción La enfermedad litiásica renal es un padecimiento común que afecta a casi una de cada 11 personas. El tratamiento médico-quirúrgico de la enfermedad litiásica ha experimentado una dramática evolución durante las últimas 3 décadas. La laparoscopia se convirtió en una alternativa a la cirugía abierta y se ha considerado una herramienta útil para manejar muchas condiciones urológicas. Objetivo Conocer las indicaciones, diagnóstico y tratamiento actual de los litos renales piélicos. Presentación del caso Mujer de 47 años de edad con dolor lumbar izquierdo acompañado de polaquiuria, tenesmo, urgencia y hematuria. Se le efectuó una urotomografía en la que se apreció una imagen hiperdensa en la pelvis renal izquierda. Se indicó un tratamiento quirúrgico por pielolitotomía laparoscópica izquierda. Conclusiones Los procedimientos laparoscópicos se han convertido en una opción en el armamento del urólogo para el tratamiento de la litiasis del tracto urinario superior.

Abstract Introduction Renal lithiasis is a common disease, affecting almost one in 11 people. The medical-surgical treatment of stone disease has experienced a dramatic evolution during the last three decades. Laparoscopy became an alternative to open surgery and has been considered as a useful tool to handle many urological conditions. Objective To know the indications, diagnosis and current treatment of renal pelvis stones. Case report A 47-year-old female patient presented with left lower back pain accompanied by pollakiuria, tenesmus, urgency and hematuria. A urotomography was performed identifying a hyperdense image in the left renal pelvis. Surgical treatment was indicated by laparoscopic pyelolithotomy. Conclusions Laparoscopic procedures have become an option in the urological armament for the treatment of upper urinary tract lithiasis.

Candidosis vaginal: Revisión de la literatura y situación de México y otros países latinoamericanos / Vaginal Candidiasis: current situation of Mexico and other Latin American countries

Las levaduras del género Candida causan enfermedades en los humanos que abarcan desde infecciones superficiales no graves, hasta sistémicas y potencialmente mortales. La candidiasis o candidosis, es el origen común de enfermedad vaginal y aunque es una infección no considerada como incapacitante, suele causar síntomas molestos que alteran la conducta del paciente. En México se considera la única micosis de reporte obligatorio ante las autoridades sanitarias. Por lo anterior, en este trabajo se efectuó una revisión bibliográfica para conocer el estado del arte de la vulvovaginitis causada por Candida spp. (VVC), y ofrecer una breve descripción acerca de la frecuencia presentada por esta infección en diversos países de Latinoamérica, con especial énfasis en México. Se muestra que las frecuencias de VVC en Latinoamérica, son muy parecidas a las reportadas en países como Estados Unidos de América; asimismo, Candida albicans sigue prevaleciendo como el principal agente etiológico. Las diferencias encontradas entre países desarrollados con respecto a los latinoamericanos, consisten básicamente en los métodos diagnósticos y el tipo de tratamiento. Desafortunadamente, en México, a pesar de que la VVC ocupa el noveno lugar entre las 20 principales causas de enfermedad del país, en muy pocos casos se efectúa la identificación de la especie causante, lo que constituye un dato de importancia epidemiológica, considerado como la base para investigar los factores que aumentan el riesgo de contagio, en especial por especies Candida no-albicans y para determinar si la enfermedad es prevenible o controlable

Yeasts of the genus Candida cause diseases in humans ranging from superficial, non-serious, to systemic and potentially life-threatening infections. Candidiasis or thrush, is the common origin of vaginal disease and although it is not considered disabling, infection usually cause troublesome symptoms that alter the behavior of the patient. In Mexico it is considered the unique mycosis of mandatory reporting to health authorities. Therefore, in this work a literature review was conducted to know the state of the art of the vulvovaginitis caused by Candida spp. (VVC), as well as provide a brief description about the frequency presented by this infection in different countries of Latin America, with special emphasis on Mexico. It shows that the frequencies of VVC in Latin America, are very similar to those reported in countries such as the United States of America; in addition, Candida albicans still prevails as the main etiologic agent. The differences found between developed countries with respect to Latin American countries basically consist of the diagnostic methods and the type of treatment. Unfortunately, in Mexico, while the VVC ranks ninth among the 20 principal causes of disease in the country, in very few cases is carried out the identification of the causative species, which constitutes a fact of epidemiological importance, considered as the basis for investigating the factors that increase the risk of infection, especially by Candida nonalbicans species and to determine if the disease is preventable or controllable

Candidosis vaginal. primera parte: revisión de la clínica, epidemiología y situación de México / Vaginal candidiasis. first part: epidemiology and current state of Mexico

En esta sección se presentan los datos de diversos autores en cuanto a etiología, epidemiología, fisiopatogenia y el perfil clínico de la candidosis o candidiasis vulvo vaginal, con especial atención al escenario actual en México, país en donde es la única micosis de reporte obligatorio ante las autoridades sanitarias, situación que nos motivó a efectuar la presente revisión bibliográfica. La literatura evaluada contempló el período 2007-2013. La vulvovaginitis por Candida spp (VVC), es una infección que habitualmente no se considera incapacitante, aunque sus manifestaciones clínicas pueden dar lugar a gran estrés en las pacientes. En México, los estudios epidemiológicos, han estado enfocados, principalmente, a describir la frecuencia con la que Candida se asocia a casos de vulvo vaginitis y la respuesta clínica a diferentes terapias; sin embargo, es evidente la falta de estudios que relacionen la presencia de Candida con diversos factores de riesgo, la frecuencia de mujeres que recurren a la automedicación y estudios enfocados a la fisiopatología de la vulvo vaginitis causada por este patógeno. Según la literatura consultada, todas estas circunstancias son conocidas y siguen siendo motivo de estudio en países desarrollados.

This section presents data from different authors in terms of etiology, epidemiology, physiopathogeny and the clinical profile of vulvovaginal candidiasis or vulvovaginal candidosis, with special attention to the current scenario in Mexico, a country where it is the only mycosis of mandatory reporting to health authorities, situation that motivated us to carry out the present literature review. The assessed literature took into account the 2007- 2013 period. The vulvovaginitis by Candida spp. (VVC), is an infection that usually is not considered disabling, but its clinical manifestations can give rise to great stress in patients. In Mexico, the epidemiological studies have been focused, primarily, in describing the frequency with which Candida is associated with cases of vulvovaginitis and the clinical response to different therapies; However, it is evident the lack of studies that relate the presence of Candida with different risk factors, the frequency of women who resort to selfmedication and studies focused on the pathophysiology of the vulvovaginitis caused by this pathogen. According to the literature consulted, these circumstances are known and are still cause for study in developed countries.

DISEÑO DE PROTOTIPO DE SIMULADOR PARA ENTRENAMIENTO EN CIRUGÍA LAPAROSCÓPICA

Las restricciones éticas impuestas al entrenamiento en cirugía laparoscópica en seres humanos y animales han impulsado la tendencia a utilizar, con mayor frecuencia, dispositivos de simulación. Los simuladores comerciales en cirugía laparoscópica, disponibles en el mercado, pueden mejorarse en virtud de la necesidad específica de los profesionales. La línea de simuladores biomecatrónicos del grupo de investigación en ingeniería biomédica GIBEC, ha desarrollado varios prototipos de simulación para cirugía laparoscópica, los cuales han evolucionado con base en las recomendaciones de los profesionales de la salud de la Universidad CES. En este artículo se presenta un resumen de cómo se han construido las bases de esta línea y cómo se han observado las necesidades que la escuela de medicina tiene para el desarrollo de simuladores, en donde la ingeniería juega un papel protagónico.

The ethical constraints imposed on the training in laparoscopic surgery in humans and animals have led to the increasingly common trend of using simulation devices. Commercially available simulators for laparoscopic surgery can be improved if tailored to the specific needs of professionals. The line of Biomechatronics Simulators of the biomedical engineering research group GIBEC, has developed several prototypes of simulation for laparoscopic surgery, which have evolved based on the recommendations from health professionals at the CES University. The results presented here demonstrate the group's progress in developing those devices.