ABSTRACT
Objetivo: Analizar la asociación de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la diabetes tipo 2 en familias peruanas de Lima. Materiales y métodos: Veintitrés tríos familiares fueron captados en el Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Se extrajeron muestras de sangre periférica para obtener el ADN y luego las frecuencias alélicas y genotípicas de los SNP. La genotipificación de los SNP se realizó mediante secuenciación. El análisis de asociación basado en familias entre los SNP y la diabetes tipo 2 se realizó con el programa FBAT. Resultados: Se observaron los 3 genotipos posibles para cada SNP, rs941798 (A>G) y rs914458 (G>C). Las pruebas de asociación basada en familias a nivel alélico mostraron al alelo A del SNP rs941798 asociado a la diabetes tipo 2 (p = 0.023) bajo uno de los modelos evaluados; no obstante, tras la corrección de Bonferroni para comparaciones múltiples, esta asociación se perdió. No se evidenció asociación entre los SNP y la enfermedad en ningún nivel (alélico, genotípico o haplotípico). Conclusiones: No se encontraron evidencias de asociación significativa entre los SNP rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la DT2 en familias peruanas de Lima, en ninguno de los niveles estudiados (alélico, genotípico y haplotípico).
Objective: To analyze the association that PTPN1 gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs941798 and rs914458 have with type 2 diabetes in Peruvian families from Lima. Materials and methods: Twenty-three (23) families consisting of three members each were recruited at the Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Peripheral blood samples were collected to obtain the DNA, and then the allele and genotype frequencies of the SNPs. SNP genotyping was performed using the sequencing method. The family-based analysis of the association between SNPs and type 2 diabetes was conducted using the family-based association test (FBAT) program. Results: Three (3) possible genotypes were observed for each SNP, i.e. rs941798 (A>G) and rs914458 (G>C). In one of the assessed models, the family-based association tests showed at the allele level that allele A of SNP rs941798 is associated with type 2 diabetes (p = 0.023). However, after using the Bonferroni correction for multiple comparisons, this association was lost. No association was demonstrated between the SNPs and the disease at any level (allele, genotype or haplotype). Conclusions: No evidence of significant association was found between PTPN1 gene SNPs rs941798 and rs914458 and type 2 diabetes at the studied levels (allele, genotype or haplotype) in Peruvian families from Lima.
Subject(s)
Humans , Diabetes Mellitus, Type 2 , Genetic Markers , Polymorphism, Single Nucleotide , Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 1ABSTRACT
Objetivo: Investigar el cambio en la concentración de adiponectina circulante en plasma en 23 mujeres obesas premenopáusicas de la ciudad de Lima luego de la reducción de la masa corporal como resultado de un programa de actividad física aeróbica y una dieta baja en calorías.Materiales y métodos: Se llevó a cabo un estudio analítico y cuasi-experimental con el grupo de mujeres obesas. Adicionalmente, 24 mujeres se consideraron como control o de referencia de la concentración de adiponectina y otros marcadores bioquímicos. La cuantificación de adiponectina se realizó mediante la prueba de ELISA. La concentración de glucosa en ayunas en sangre, colesterol, lipoproteína de alta densidad y triglicéridos fueron cuantificados mediante análisis clínicos de rutina.Resultados: Antes del programa el grupo control mostró altos valores de adiponectina (mediana: 8,54 µg/mL; rango: 6,14 µg/mL a 13,49 µg/mL) en comparación con el grupo obesidad (mediana: 7,03 µg/mL, rango: 3;77 µg/mL a 17,23 µg/mL); sin embargo, la diferencia no fue estadísticamente significativa (P = 0.0563). Luego de la finalización del programa se observó que el grupo obesidad presentó una reducción estadísticamente significativa del índice de masa corporal (P = 5.98e-08) y de la circunferencia abdominal (P = 1.55e-08) así como un incremento estadísticamente significativo de los niveles de adiponectina (mediana, 8.79 µg/mL; rango, 5.50 µg/mL a 19.37 µg/mL) (P = 0.0127). Conclusiones: Basándonos en los resultados, concluimos que en mujeres obesas premenopáusicas la concentración de adiponectina se incrementa cuando la masa corporal se reduce como resultado de actividad física aeróbica y una dieta baja en calorías.
Objective: To investigate the changes in the plasma-circulating adiponectin concentration in 23 premenopausal obese women living in Lima after a body mass reduction as a result of an aerobic physical activity program and a low-calorie diet.Materials and methods: An analytical and quasi-experimental study was conducted in a group of obese women. In addition, another 24 women were considered as control or reference group for comparing their adiponectin concentration and other biochemical markers. The quantification of adiponectin was carried out using the ELISA test. Fasting blood glucose concentration, cholesterol, high-density lipoprotein and triglycerides levels were quantified by routine clinical analysis.Results: Before beginning the program, the control group showed high adiponectin levels (median, 8.54 µg/mL; range, 6.14 µg/mL to 13.49 µg/mL) compared to the obesity group (median, 7.03 µg/mL; range, 3.77 µg/mL to 17.23 µg/mL). However, the difference was not statistically significant (P = 0.0563). Once the program was finished, the obesity group showed a statistically significant reduction in the body mass index (P = 5.98e-08) and abdominal circumference (P = 1.55e-08), and a statistically significant increase in the adiponectin levels (median, 8.79 µg/mL; range, 5.50 µg/mL to 19.37 µg/mL) (P = 0.0127). Conclusions: Based on the results, we conclude that the adiponectin concentration in premenopausal obese women increases when the body mass is reduced as a result of aerobic physical activity and a low-calorie diet.
Subject(s)
Female , Adiponectin , Body Mass Index , Diet, Reducing , Weight Reduction Programs , Motor ActivityABSTRACT
Determinar la asociación entre los microsatélites D4S2912, D4S230 y D4S3001 y diabetes tipo 2 (Dm2) en la población peruana. Material y método. En 99 diabéticos se analizaron los marcadores de los microsatélites D4S2912, D4S230 y D4S3001 y como controles: individuos sanos procedentes de lima, 120 para D4S2912, 129 para D4S230 y 133 para D4S3001. 5e procesó el a0n extraído de sangre endovenosa, amplificándose por la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (pcr) a los tres marcadores de la región 4p15.1. Finalmente, se analizó las frecuencias alélicas y genotípicas de los marcadores y determinó la homogeneidad genética de la población mediante la prueba de hardy-weinberg (h-w), continuándose con el estudio de asociación a dm2 en casos versus controles. Resultados. Se encontró en D4S2912 y D4S3001 ausencia de un alelo en el grupo control al compararlo con la población diabética. Al realizar el análisis de asociación utilizando el modelo de regresión logística condicional y la prueba de permutación de montecarlo, se observó asociación entre D4S3001 y población peruana con dm2. Conclusiones. esta investigación muestra al microsatélite D4S3001, localizado en la región cromosómica 4p15.1 como un marcador asociado a dm2 en la población peruana y que se encuentra en una región cromosómica que contendría un gen(es) que jugaría(n) un rol en la etiología de dm2...
To determine the association of microsatellite markers D4S2912, D4S230 and D4S3001 with diabetes type 2 (DM2) in the peruvian population. Material and methods. We analyzed the microsatellite markers D4S2912, D4S230 and D4S3001 in 99 diabetics and 120 healthy individuals to D4S2912, D4S230 and 129 to 133 for D4S3001 as controls from Lima. We processed the 0na extracted from blood intravenously, amplified by the technique of polymerase chain reaction (pcr) for the three markers in the region 4p15.1. Finally, we analyzed the polymorphisms of the markers and determined the genetic homogeneity of the population through proof of hardy-weinberg (hw), and continued in the study of association of DM2 in patients versus controls. Results. In D4S2912 and D4S3001 there was absence of an allele in the control group when compared with the diabetic population. When performing association analysis using conditional logistic regression model and the monte carlo permutation test, they showed an association between D4S3001 and peruvian population with DM2. Conclusions. this research shows the microsatellite D4S3001, located on chromosome 4p15.1 region as a marker associated with dm2 in the Peruvian population and is located in a chromosomal region that contain a gene(s) which would play a role in the etiology DM2...
Subject(s)
Humans , Male , Adolescent , Adult , Female , Middle Aged , Population Groups , Microsatellite InstabilityABSTRACT
Evaluar la posible asociación entre el SNP rs914458 (C>G) del gen PTPN1con la DM2 en una población de la zona urbana de Lima - Perú. Material y Métodos: El estudio incluyó un total de 216 personas de la zona urbana de Lima correspondientes a un grupo control (n = 123) y un grupo de pacientes diagnosticados con diabetes tipo 2 provenientes del Hospital A. Loayza (n = 93). La genotipificación del SNP se llevó a cabo mediante PCR y con un secuenciador ABI PRISM 310. El análisis de asociación se llevó a cabo con el uso de la herramienta web SNPStats para realizar cinco modelos de regresión logística. El efecto de la asociación genética se estableció con el valor de OR. Resultados: La frecuencia del MAF (alelo G) fue de 0.22 en el grupo de controles y en el grupo de pacientes. Ninguno de los modelos de regresión muestra valores de OR (considerando los CI) por encima o por debajo del valor de referencia. Conclusión: No se encontró asociación genética significativa entre el SNP rs914458 del gen PTPN1 y la DM2 para la población de la zona urbana de Lima - Perú...
Objective: Evaluate the association between SNP rs914458 (C>G) of PTPN1 gene with T2DM in a population from the urban area of Lima - Peru. Material and Methods: This study included a total of 216 subjects from the urban area of Lima. The number of subjects in control group was 123, and 93 patients diagnosed with type 2 diabetes from Hospital A. Loayza. SNP genotyping was performed by PCR and sequencing using ABI PRISM 310 DNA sequencer. The association analysis was carried out using the web tool SNPStats and five logistic regression models were performed. The effect of genetic association was established with the OR. Results: The frequency of MAF (allele G) was 0.22 in both control and patient groups. The OR values were not different from the reference values considering the respective confidence interval. Conclusion: No significant association was found between the SNP rs914458 and the PTPN1 gene with T2DM for the urban population of Lima - Peru...
Subject(s)
Humans , Genetic Association Studies , Gene Frequency , Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 1 , PeruABSTRACT
Las translocaciones robertsonianas son las anomalías cromosómicas más frecuentes en seres humanos. En pacientes portadores sanos de esta translocación se pueden generar gametos no balanceados y progenie con la trisomía y disomía uniparental y, por lo tanto, problemas reproductivos. En el presente artículo se estudió a una pareja con antecedentes de abortos recurrentes. Se realizó un estudio citogenético obtenido a partir de un cultivo estandarizado de linfocitos, resultando en ambos pacientes un cariotipo normal. Posteriormente, se analizó el producto de un aborto espontáneo de nueve semanas de edad gestacional, encontrándose un resultado 46,XY, t(21;21)(q10;q10), +21 correspondiente a una trisomía 21 por translocación. Una posible explicación al aborto por translocación robertsoniana, se obtuvo después de revisar las placas metafásicas del hombre y la mujer, observándose asociaciones entre los cromosomas acrocéntricos de la mujer. Al relacionarse el antecedente de abortos recurrentes, el resultado de la trisomía 21 por translocación y las asociaciones entre cromosomas acrocéntricos en la mujer nos llevó a considerar a esta asociación como un factor causal de los abortos en la pareja.
Robertsonian translocations are the most frequent chromosomal anomalies in humans. Healthy carriers of these translocations can generate unbalanced gametes and off spring with trisomy and uniparental disomy and therefore, reproductive problems. In the present article, a couple with antecedents of recurrent abortions was studied. Cytogenetic analysis performed after standard lymphocyte cultures, resulted in a normal karyotype for the couple. Analysis of the nine weeks of gestational age spontaneous abortion, resulted in a 46,XY, t(21;21)(q10;q10), +21 corresponding to a trisomy 21 due to translocation. A possible explanation for the abortion due to robertsonian translocation was obtained after checking metaphases of the man and the woman's cultures, associations being observed between the acrocentric chromosomes of the woman. Attempting to relate recurrent abortions to the result of trisomy 21 due to translocation and the associations between acrocentric chromosomes in the woman, led us to consider this association, as a causal factor for abortions in the couple.
Subject(s)
Humans , Male , Adult , Female , Abortion, Habitual/genetics , Cytogenetic Analysis , Down Syndrome/genetics , Translocation, Genetic/geneticsABSTRACT
Alchornea castaneifolia (Will) Jussieu es una planta medicinal perteneciente a la familia Euforbiáceae, conocida con numerosos nombres populares y múltiples usos en la Medicina Tradicional. En el presente trabajo, se evaluó la acción citotóxica del extracto metanólico al 10 por ciento p/v, en modelos del CYTED, siguiendo la técnica de De la Torre y la evaluación de la acción embriotóxica por la técnica de Gustafson y Estus. Observamos un retardo en el desarrollo del ciclo celular de Allium cepa y un retardo del desarrollo embrionario del erizo de mar, a nivel de blástula y gástrula, así como un aumento significativo de la mortalidad. En el análisis fitoquímico, de acuerdo a la Metodología de Ciulei, se pudo observar la presencia de: alcaloides, esteroides, triterpenos, azúcares reductores, saponinas, fenoles, taninos, quinonas, flavonoides, antocianidinas y principios amargos.
Alchomea castaneifoUa (WiU) Jussieu is a medicinal plant of the Euforbiaceae family, known for its many popular names and use in Traditional Medicine. We evaluated the cytotoxic and embryotoxic action of the methanolic extract at 10% w/v on Allium cepa L cells and on sea urchin embryos, using CYTED models. We found cytotoxic action supported by the marked delay of cell cycle in Allium cepa. The embryotoxic action consisted mainly of blastula and gastrula-arrested embryos and a statistically increased mortality. Phytochemical analysis was made using the Ciulei's method where alkaloids, steroids, phenols, saponines, flavonoids, quinines, antocyanidins and bitter principIes were found.
Subject(s)
Antineoplastic Agents , Euphorbiaceae/chemistry , Euphorbiaceae/toxicity , Plant Extracts , Plants, Medicinal/toxicity , TeratogensABSTRACT
La Abuta grandifolia es una planta nativa de zonas tropicales húmedas de Sudamérica, perteneciente a la familia Menispermaceae, con múltiples usos en la Medicina Tradicional. Se evaluó la acción antimitótica del extracto metanólico en células de Allium cepa L (cebolla), mediante la técnica de De La Torre y la acción embriotóxica en erizo de mar, mediante la técnica de Gustafson; utilizando modelos del CYTED. Nuestros resultados indican acción antimitótica evidenciada por un retardo de las diferentes fases del ciclo celular. Asimismo, apreciamos acción embriotóxica, más no teratogénica. Los análisis estadísticos de la diferencia del número de células en las diferentes fases del ciclo celular, entre el grupo control y el tratado con Abuta grandifolia, fueron altamente significativos.
Abuta grandifolia is a native plant of tropical and humid zones of South America, that belongs to the family Menispermaceae, and which has many uses in Traditional medicine. We evaluated the antimitotic and embryotoxic action of methanolic extracts, on Allium cepa L cells and on sea urchin embryos, using CYTED models. We found antimitotic action supported by the marked delay on different phases of cell cycle pf Allium cepa L. embryotoxic action consisted mainly of blastula and gastrula-arrested embryos, but we did not appreciate teratogenis action. The results on differences of number of cells and on the different phases of the cell cycle between the control and the Abuta grandifolia treated groups were statistically significant.
Subject(s)
Antineoplastic Agents , Plant Extracts/toxicity , Menispermaceae/classification , Plants, Medicinal/chemistry , Plants, Medicinal/toxicity , Teratogens , Onions , Cell CycleABSTRACT
La diabetes tipo 2 es una enfermedad compleja que tiene un componente genético. Calpaina 10 (CAPN10) es un gen de susceptibilidad para este gen y está localizado en 2q37.3. Pacientes de algunas poblaciones de origen amerindio presentan las frecuencias alélicas de los SNP19, 43 y 63 del gen CAPN10, que sugiere una relación causal entre este gen y la biabetes tipo 2. El origen filogenético común, nos permite suponer que CAPN10 también sería un gen de susceptibilidad en la población peruana nativa y mestiza, lo cual nos motivó a investigar esta relación en nuestra población. Se obtuvieron resultados de la frecuencia alélica de los SNP19, 43 y 63 de CAPN10 en 129 controles normales de Lima, la mayoría de origen mestizo. Además de la prueba del equilibrio de Hardy-Weinberg (H-W) para determinar si la población tiene una distribución genéticamente homogénea en dichos marcadores. Se puede concluir que la prueba de H-W sugiere fuertemente que nuestra población control es adecuada para un estudio de asociación y desequilibrio de ligamiento en pruebas caso-control. Esto a su vez es la base para futuros estudios de asociación y desequilibrio de ligamiento, postulando a CAPN10 como gen de susceptibilidad de diabetes tipo 2 en la población peruana.
Type 2 diabetes is a complex genetic disorder, where the gene calpain 10 (CAPN10) located in 2q37.3, plays an important role. Allele frequencies of SNP19, 43 and 63 are present in affected Amerindian populations and might suggest a possible relationship between CAPN10 and type 2 diabetes. The fact that Amerindian populations has a common phyllogenetic origin was our main motivation for studying this possible relation, because it would suggest' that CAPN10 is a susceptibility gene for native and admixed Peruvian populations. Allelic frequencies of SNP19, 43 and 63 of calpain 10 was obtained of 129 normal controls from Lima, most of them admixed population. Hardy-Weinberg test (H-W) was used in order to determine if the population had a genetically homogenous distribution for the employed molecular markers. It can be concluded that the H-W test strongly suggests that the control population is adequate for an association and linkage disequilibrium in case-control studies. Furthermore, this would mean be thstart of future association and linkage disequilibrium studies where CAPN10 would be considered as a susceptibility gene for type 2 diabetes in Peruvian population.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Calpain/genetics , Linkage Disequilibrium/genetics , /genetics , Gene Frequency/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide/genetics , Genetic Predisposition to Disease/genetics , Case-Control Studies , Haplotypes/geneticsABSTRACT
La diabetes tipo 2 es una enfermedad compleja que tiene un componente genético. Se ha comprobado que calpaína 10 (CAPN10) localizado en 2q37.3, constituye un gen de susceptibilidad para esta enfermedad. La asociación alélica y haplotípica con diabetes, observada en poblaciones amerindias (México-americana, pima, surui y maya), y algunas europeas (finlandesas y alemanas), confirmarían estos resultados. El origen ancestral amerindio nos hace suponer que CAPN10 constituiría un gen de susceptibilidad en población peruana nativa y mestiza. Para utilizar los alelos del CAPN10 como factores de riesgo genético necesitamos establecer la frecuencia en la población normal. En el presente trabajo se observa la frecuencia de los alelos SNP19 en 116 controles normales de Lima, mayormente de origen mestizo. La frecuencia alélica analizada es similar a la descrita en las poblaciones mexico-americanas.
Type 2 diabetes is a complex disorder where genetic factors play an important role. Several studies suggest that some genetic variants of calpain 10 (CAPN10) increase susceptibility to type 2 diabetes. Some allelic and haplotype combinations are associated with increased risk in Amerindian populations (Mexican American, Pima and Surui) and Finnish and German groups. The ancestral Amerindian origin suggests that CAPN10 is a susceptibility gene in native and admixed Peruvian populations. To use CAPN10 alleles as genetic risk factors, we need to establish their baseline frequencies in normal populations. Allele frequencies of SNP19 in 116 individuals of Lima (admixed population) are similar to those reported for Mexican American groups.
Subject(s)
Humans , Calpain , Risk Factors , Gene Frequency , Polymorphism, Single NucleotideABSTRACT
El objetivo de la presente investigación fue probar la posible asociación de uno o más microsatélites localizados en 4q25-4q33 y FLPNS. Se analizó una muestra de 51 genealogías extensas. A partir de estas genealogías se obtuvieron 51 tríos caso-progenitores, que se estudiaron con el programa extended transmisión disequilibrium test (ETDT). Además se colectó a 51 probandos y 94 controles para un estudio caso-control en población chilena y se postuló comprobar las diferencias entre ambos estudios de asociación. Se analizaron los microsatélites D4S1570, D4S1615, FGA, UCP1 y D4S1597 ubicados en 4q, utilizándose la técnica de la polimerasa en cadena (PCR) para el análisis de ADN, marcandose la hebra líder con un fluorocromo. Los resultados electroforeticos fueron analizados en un secuenciador automático ABIPRISM 377. Observándose que FGA en el grupo control y FGA, D4S1570 y D4S1597 en los pacientes estaban en equilibrio de H-W. Estos resultados implican que un estudio caso-control no es adecuado para el estudio de estos marcadores. Para obviar este problema se utilizó el programa ETDT, observándose que los microsatélites D4S1570, UCP1 y D4S1597 presentaron una asociación tipo alélica en familias multiples. Estos resultados sugiere que estos microsatélites se encontrarían cerca de 1 o más genes candidatos de esta malformación en la región eq24-4q31.
The objective of this investigation is to test the hypothesis of the possible association of one or more microsatellites located on 4q25-4q33 with NSCLP. In this study a sample of 51 extended pedigrees were analyzed. From these pedigrees a sample of 51 case-parents trios was obtained. A novel genetic analysis was carried out using the Extended Transmission Disequilibrium Test (ETDT). Also a case control study was carried out with the 51 probands of the case-parents trios plus a sample of 94 controls of the Chilean population to test if differences were observed resulting from the methods used for the association studies. Microsatellites D4S1570, D4S1615, FGA, UCPI and D4S1597 located in 4q were analyzed. The polymerase chain reaction (PCR) was used for analysis of DNA. Forward primers were marked with fluorescent-dye-Iabel. Electrophoresis and analyses were carried out in an ABI PRISM 377 automatic sequencer. In the case-control study, only FGA was in H-W equilibrium in controls, whereas FGA, D4S1570 y D4S1597 were in H-W equilibrium in cases. These results imply that a case control study does not represent an adequate procedure to carry out an association study between the aforementioned micro satellites and NSCLP. In order to obviate this problem the ETDT program was used. From all of the analyzed microsatellites, D4S1570, UCPl and D4S 1597 presented significant allele wise association in those case-parents trios to multiplex families. This result suggests that these microsatellites would be located close to one or more candidate genes for this malformation in 4q24-4q31.