Prevalence of pneumococcal serotypes and resistance to antimicrobial agents in patients with meningitis: ten-year analysis

OBJECTIVES: To determine the prevalence of pneumococcal serotypes and antimicrobial susceptibility in patients with meningitis, and to evaluate the implications for vaccine coverage. METHODS: Pneumococcal strains obtained from normally sterile fluids from patients admitted with meningitis were isolated at the Hospital de Clínicas of the Universidade Federal de Uberlândia, Minas Gerais State, and sent to the Instituto Adolfo Lutz, city of São Paulo, São Paulo State, for further identification, serotyping, and antimicrobial susceptibility determination. RESULTS: From April 1999 to April 2009, 338 pneumococcal strains were isolated, and 72 obtained from patients with meningitis, were analyzed. Patients' ages varied from one month to 82.2 years (mean of 18.4 ± 22.9 years; median of 5.2 years) and 46 (63.9 percent) patients were male. Strains were isolated from cerebrospinal fluid [66 occasions (91.7 percent)] and blood [6 occasions (8.3 percent)]. The most commonly identified serotypes were 14, 19F, 3, 7F, 6A, 6B, 10A, 18C, 23F, 5, and 34. Of the 20 [27.8 percent] oxacillin-resistant strains, 17 [23.6 percent] were resistant to penicillin and nine [12.5 percent] to ceftriaxone, both resistance patterns being more common in children aged two years or less and during the 2005-2009 period. CONCLUSIONS: Resistance to penicillin and ceftriaxone was detected in 23.6 percent and 12.5 percent of the strains, respectively, and predominated in children aged two years or less and during the 2005-2009 period. There were 24 different serotypes of pneumococcus and 79.8 percent of the serotypes were represented in the 7-valent conjugated vaccine [PVC7].

Prevalência de sorotipos e resistência antimicrobiana de cepas invasivas do pneumococo em crianças: análise de 9 anos / Prevalence of serotypes and antimicrobial resistance of invasive strains of pneumococcus in children: analysis of 9 years

OBJETIVO: Avaliar o perfil de sorotipos e a sensibilidade aos antimicrobianos de cepas de pneumococo obtidas de crianças e as implicações na formulação de vacinas pneumocócicas. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia (MG), a partir de pacientes com doença invasiva, foram enviadas ao Instituto Adolfo Lutz, São Paulo (SP), para confirmação da identificação, sorotipagem e determinação da sensibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a dezembro de 2008, foram avaliadas 142 cepas de pneumococo obtidas de crianças de até 5 anos de idade. Setenta e cinco (52,8 por cento) eram de pacientes do sexo masculino, e a idade variou de 1 a 60 meses (média de 19±15,4 meses e mediana de 15 meses). Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia [92 casos (64,8 por cento)] e meningite [33 casos (23,2 por cento)], e as principais fontes de recuperação foram sangue [61 amostras (43 por cento)], líquido pleural [52 (36,6 por cento)] e liquor [28 (19,7 por cento)]. Os sorotipos mais comuns foram o 14, 5, 6B, 1, 6A, 18C, 19A, 3, 9V, 19F, 23F, 9N e 10A. Foram detectadas 14 (9,9 por cento) cepas penicilina-resistentes, restritas aos sorotipos 14, 6B, 19F, 19A e 23F e predominantes no período de 2004 a 2008 (p = 0,000). Foi detectada sensibilidade diminuída ao cotrimoxazol (79,5 por cento), à eritromicina e à clindamicina (11,3 por cento cada) e à ceftriaxona (5,6 por cento). CONCLUSÕES: A resistência à penicilina foi detectada em 9,9 por cento das cepas e predominou no período de 2004 a 2008. Foram identificados 20 diferentes sorotipos de pneumococo, e a cifra de cobertura pela vacina 7-valente atualmente disponível (PN CRM7) é de 71,9 por cento.

OBJECTIVE: To determine the prevalence of serotypes and antimicrobial susceptibility of strains of pneumococcus in children and to evaluate the implications for vaccine formulation. METHODS: Strains of pneumococcus obtained from children admitted with invasive diseases were isolated at Hospital de Clínicas of Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, Brazil, and sent to Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil, for further identification, serotyping, and determination of antimicrobial susceptibility. RESULTS: From April 1999 to December 2008, 142 strains of pneumococcus, obtained from children under 5 years of age, were analyzed. Seventy-five (52.8 percent) patients were male, and the age ranged from 1 to 60 months (mean age = 19±15.4 months; median = 15 months). The most common diagnoses were pneumonia [92 cases (64.8 percent)] and meningitis [33 cases (23.2 percent)]. The strains were mostly isolated from blood [61 samples (43 percent)], pleural fluid [52 samples (36.6 percent)], and cerebrospinal fluid [28 samples (19.7 percent)]. The most common serotypes were 14, 5, 6B, 1, 6A, 18C, 19A, 3, 9V, 19F, 23F, 9N, and 10A. There were 14 [9.9 percent] penicillin-resistant strains, which was detected only in the following serotypes: 14, 6B, 19F, 19A, and 23F, being predominant from 2004 to 2008 (p = 0.000). There was reduced susceptibility to co-trimoxazole (79.5 percent), erythromycin and clindamycin (11.3 percent each), and ceftriaxone (5.6 percent). CONCLUSIONS: Penicillin resistance was detected in 9.9 percent of the strains, being predominant from 2004 to 2008. Twenty different pneumococcal serotypes were identified, and 71.9 percent of the serotypes were represented in the 7-valent conjugate vaccine (PN CRM7) currently available.

Novos pontos de corte de sensibilidade nas taxas de resistência antimicrobiana de cepas invasivas de pneumococo / New susceptibility breakpoints in antimicrobial resistance rates of invasive pneumococcal strains

OBJETIVO: Avaliar impacto dos novos pontos de corte de sensibilidade à penicilina nas taxas de resistência de cepas de pneumococo obtidas de crianças com pneumonia. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no laboratório de análises clínicas do Hospital de Clínicas de Uberlândia, Uberlândia (MG), a partir de amostras de pacientes internados foram enviadas ao Instituto Adolfo Lutz, Sao Paulo (SP), para confirmação da identificação, sorotipagem e determinação da sensibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a dezembro de 2008 foram enviadas ao Instituto Adolfo Lutz 330 cepas de pneumococo, sendo 195 (59 por cento) provenientes de pacientes com diagnóstico de pneumonia. Destas, foram analisadas 100 cepas de pacientes com idade ≤ 12 anos; a idade dos pacientes variou de 1 a 12,6 anos, com média de 2,4 e mediana de 1,7 anos; 47 pacientes eram do sexo masculino; as fontes de recuperação foram sangue (42 por cento) e líquido pleural (58 por cento). Foram detectadas 35 cepas oxacilina-resistentes: segundo os critérios do Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) de 2007 [concentração inibitória mínima (CIM) ≤ 0,06 µg/mL para sensibilidade (S), 0,12 a 1 µg/mL para resistência intermediária (RI) e ≥ 2 µg/mL para resistência plena (RP)], 22 cepas apresentaram RI e 11, RP para penicilina. De acordo com os critérios atuais do CLSI de 2008 (≤ 2 µg/mL para S, 4 µg/mL para RI e ≥ 8 µg/mL para RP) apenas uma cepa confirmou RI à penicilina. Detectou-se resistência a cotrimoxazol (80 por cento), tetraciclina (21 por cento), eritromicina (13 por cento), clindamicina (13 por cento) e ceftriaxona (uma cepa, simultaneamente resistente a penicilina). CONCLUSÕES: Com a aplicação dos novos pontos de corte para sensibilidade in vitro, as taxas de resistência a penicilina caíram 97 por cento, de 33 para 1 por cento.

OBJECTIVE: To evaluate the impact of new penicillin susceptibility breakpoints on resistance rates of pneumococcal strains collected from children with pneumonia. METHODS: Pneumococcal strains collected from patients admitted with pneumonia were isolated at the clinical analysis lab of Hospital de Clínicas de Uberlândia, Uberlândia, Brazil, and sent to Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil, for further identification, serotyping and determination of antimicrobial susceptibility. RESULTS: From April 1999 to December 2008, 330 strains of pneumococcus were sent to Instituto Adolfo Lutz; of these, 195 (59 percent) were collected from patients with pneumonia. One hundred strains collected from patients ≤ 12 years old were analyzed. The patients' age ranged from 1 to 12.6 years old (with mean age of 2.4 and median of 1.7 years). Forty-seven patients were male. The strains were isolated from blood (42 percent) and pleural fluid (58 percent). There were 35 oxacillin-resistant strains: according to the criteria defined by the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) in 2007 [minimum inhibitory concentration (MIC) ≤ 0.06 µg/mL for susceptibility (S), 0.12 to 1 µg/mL for intermediate resistance (IR), and ≥ 2 µg/mL for full resistance (FR)], 22 strains had IR and 11 strains had FR. According to the current breakpoints defined by the CLSI in 2008 (≤ 2 µg/mL for S, 4 µg/mL for IR and ≥ 8 µg/mL for FR), only one strain had IR to penicillin. There was resistance to co-trimoxazole (80 percent), tetracycline (21 percent), erythromycin (13 percent), clindamycin (13 percent), and ceftriaxone (one strain simultaneously resistant to penicillin). CONCLUSIONS: When the new breakpoints for in vitro susceptibility were applied, penicillin resistance rates dropped 97 percent, from 33 to 1 percent.

Prevalência de sorotipos e resistência antimicrobiana de cepas invasivas do Streptococcus pneumoniae / Prevalence of serotypes and antimicrobial resistance of invasive strains of Streptococcus pneumoniae

OBJETIVO: Avaliar o perfil de sorotipos e a susceptibilidade aos antimicrobianos de cepas de Streptococcus pneumoniae obtidas em espécimes clínicos de pacientes com doença invasiva, bem como suas implicações na formulaçäo de vacinas pneumocócicas. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no Laboratório de Análises Clínicas do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia a partir de amostras clínicas de pacientes com doença invasiva foram identificadas e enviadas ao Instituto Adolfo Lutz em São Paulo para confirmaçäo da identificaçäo, sorotipagem e determinaçäo da susceptibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a março de 2003, foram isoladas 148 cepas invasivas de pneumococo, sendo 84 (56,7 por cento) provenientes de pacientes do sexo masculino. A idade variou de um dia a 88,83 anos, com média de 21,33+25,82 anos e mediana de 4,42 anos. Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia (91 casos; 61,4 por cento), meningite (32 casos; 21,6 por cento) e bacteremia sem foco evidente (15 casos; 10,1 por cento). As principais fontes de recuperaçäo foram sangue (76 amostras; 51,3 por cento), líquido pleural (39; 26,3 por cento) e liquor (30; 20,2 por cento). No total, foram identificados 23 diferentes sorotipos entre 143 amostras testadas, sendo os mais comuns os seguintes: 14, 3, 1, 5, 6A, 6B e 18C. Dentre 30 (20,2 por cento) cepas oxacilina-resistentes, 23 (15,5 por cento) confirmaram a resistência à penicilina (12,8 por cento com nível intermediário e 2,7 por cento, com nível pleno), que esteve restrita aos sorotipos 14, 23F, 19A e 6B, predominando em indivíduos com até dois anos de idade (p = 0,0008). Foi detectada susceptibilidade diminuída ao cotrimoxazol (63,4 por cento), à eritromicina (8,3 por cento), à clindamicina (8,7 por cento) e à ofloxacina (0,8 por cento). A resistência à cefotaxima foi detectada em três das 30 cepas testadas (2 por cento das 148), todas elas com resistência confirmada à penicilina. Näo foi observada resistência a cloranfenicol, rifampicina ou vancomicina. CONCLUSÕES: A resistência à penicilina foi detectada em 15,5 por cento das cepas e predominou em crianças abaixo de dois anos de idade. Foram identificados 23 diferentes sorotipos de Streptococcus pneumoniae em pacientes internados com doença invasiva, e a maioria dos sorotipos (82,6 por cento) e das cepas (90,2 por cento) está incluída na vacina polissacarídica 23-valente