Perspectivas en genómica poblacional: genes, poblaciones y arquitectura genética / Perspectives in population genomics: genes, populations and genetic architecture

La Arquitectura Genética (AG) se refiere a los patrones de los efectos genéticos que construyen y controlan un carácter fe no-típico dado y sus propiedades variacionales. Una descripción de AG puede incluir afirmaciones acerca del gen y número de alelos, la distribución de los efectos alélicos, mutacionales, y los patrones de pleiotropía, dominancia y epistasis. La Genética de poblaciones clásica tiende a tratar la AG como un grupo de parámetros invariantes y no como variables evolutivas. El paradigma Neo-Darviniano más o menos define la evolución como un cambio en las frecuencias alélicas y deja poco margen para la evolución de los efectos alélicos. Conceptos como la canalización genética, la evolución de la variabilidad genética reducida, y la asimilación genética-respuestas evolutivas basadas en la variación medioambiental inducidaeran difíciles de enmarcar en esta línea de trabajo y fue seguida por unos pocos investigadores, siendo tratada de manera empírica. La canalización ha tenido finalmente, una sóidal interpretación de genética poblacional en términos de evolución de los efectos reducidos de un gen, a través de las interacciones epis-táticas con un trasfondo genético evolutivo, y es actualmente el foco de considerable interés empírico y teórico. El rápido desarrollo de las tecnologías moleculares ha permitido la generación de un número casi ilimitado de marcadores que especifican la estructura y organización del genoma de cualquier organismo. La integración de la estadística con la genética molecular permitió tener la primera herramienta para disgregar un rasgo cuantitativo en sus componentes genéticos individuales (qTLs). Posterior a esto se han desarrollado múltiples métodos estadísticos para localizar rasgos complejos y su aplicación posterior a la genética vegetal, animal y humana.

Genetic Architecture (GA) refers to the patterns of genetic effects that build and control a given phenotypic character and their variation properties. A description of GA can include declarations about the gene and number of alleles, the distri-bution of the allelic and mutational effects, and the patterns of pleiotropy, dominance and epistasis. The classical population genetics tends to treat the GA as a group of invariable para-meters and not as an evolutionary variable. The Neon-Dar - winian paradigm more or less defines the evolution as a chan ge in the allelic frequencies and gives small scope for the evolution of the allelic effects. Concepts as the genetic canalization, the evolution of the reduced genetic variation, and the genetic assimilation -evolutionary answers based on the induced environmental variation- were difficult to frame in this line of work and were followed by a few investigators, being treated in an empirical way. The canalization has had finally; a solid interpretation in terms of population genetics and evolution of reduced effects of a gene, through epistatic interactions with an evolutionary genetic background, and actually is the focus of considerable theoretical and empirical interest. The fast development of the molecular technologies has permitted the generation of an almost unlimited number of markers that specify the structure and organization of the genome of any organism. The integration of the statistics with the molecular genetics permitted to have the first tool to disin-tegrate a quantitative characteristic in its individual genetic components (quantitative Trait Loci, qTL). After that, has been developed multiple statistical methods to locate com-plex characteristics and their applications to the animal, vegetal, and human genetics.

Bases genéticas de la susceptibilidad a enfermedades infecciosas humanas / Genetic Basis of Susceptibility to Human Infectious Diseases

Los diferentes componentes genéticos juegan un papel importante en la determinación diferencial de la susceptibilidad a las principales enfermedades infecciosas de los humanos, tales como la malaria, la lepra, VIH/SIDA, tuberculosis y enfermedades por micobacterias, entre otras. La genética epidemiológica, incluyendo los estudios de gemelos, proporciona evidencia fuerte de que la variación genética en las poblaciones humanas contribuye a la susceptibilidad a dichas enfermedades. La genética humana de las enfermedades infecciosas ha postulado que un raro grupo de inmunodeficiencias primarias confiere vulnerabilidad a múltiples enfermedades infecciosas (un gen, múltiples infecciones), mientras que las enfermedades infecciosas comunes están asociadas con la herencia poligénica de múltiples genes de susceptibilidad (una infección, múltiples genes). Simultáneamente, se ha determinado, en varias infecciones comunes, la herencia de un gen principal de susceptibilidad, al menos en algunas poblaciones. Este nuevo paradigma (un gen, una infección) desdibuja la distinción entre la genética mendeliana basada en pacientes, y la genética de enfermedades complejas basadas en estudios de población, lo cual nos da una nueva forma de abordaje conceptual para explorar las bases moleculares de la genética de enfermedades infecciosas en los humanos.

Several genetic factors play an important role in determining differential susceptibility to major infectious diseases in human populations, such as malaria, leprosy, HIV/AIDS, tuberculosis and mycobacterial infections. Genetic epidemiology, including twin studies, provides robust evidence that genetic variation in human populations contributes to susceptibility to infectious disease. The dominant paradigm in the human genetics of infectious diseases postulates that rare monogenic immunodeficiencies confer vulnerability to multiple infectious diseases (one gene, multiple infections), whereas common infections are associated with the polygenic inheritance of multiple susceptibility genes (one infection, multiple genes). In parallel, several common infections have been shown to reflect the inheritance of one major susceptibility gene, at least in some populations. This new point of view (one gene, one infection), distort the distinction between patient-based Mendelian genetics and population-based complex genetics, and provides a unified conceptual frame for exploring the molecular genetic basis of infectious diseases in humans.