DNA sequencing in the classroom: complete genome sequence of two earwig (Dermaptera; Insecta) species

BACKGROUND: Despite representing the largest fraction of animal life, the number of insect species whose genome has been sequenced is barely in the hundreds. The order Dermaptera (the earwigs) suffers from a lack of genomic information despite its unique position as one of the basally derived insect groups and its importance in agroecosystems. As part of a national educational and outreach program in genomics, a plan was formulated to engage the participation of high school students in a genome sequencing project. Students from twelve schools across Chile were instructed to capture earwig specimens in their geographical area, to identify them and to provide material for genome sequencing to be carried out by themselves in their schools. RESULTS: The school students collected specimens from two cosmopolitan earwig species: Euborellia annulipes (Fam. Anisolabididae) and Forficula auricularia (Fam. Forficulidae). Genomic DNA was extracted and, with the help of scientific teams that traveled to the schools, was sequenced using nanopore sequencers. The sequence data obtained for both species was assembled and annotated. We obtained genome sizes of 1.18 Gb (F. auricularia) and 0.94 Gb (E. annulipes) with the number of predicted protein coding genes being 31,800 and 40,000, respectively. Our analysis showed that we were able to capture a high percentage (≥ 93%) of conserved proteins indicating genomes that are useful for comparative and functional analysis. We were also able to characterize structural elements such as repetitive sequences and non-coding RNA genes. Finally, functional categories of genes that are overrepresented in each species suggest important differences in the process underlying the formation of germ cells, and modes of reproduction between them, features that are one of the distinguishing biological properties that characterize these two distant families of Dermaptera. CONCLUSIONS: This work represents an unprecedented instance where the scientific and lay community have come together to collaborate in a genome sequencing project. The versatility and accessibility of nanopore sequencers was key to the success of the initiative. We were able to obtain full genome sequences of two important and widely distributed species of insects which had not been analyzed at this level previously. The data made available by the project should illuminate future studies on the Dermaptera.

HIDROGENACIÓN ASIMÉTRICA DE 4-METOXIACETOFENONA SOBRE CATALIZADORES DE Pt/TiO2 MODIFICADOS CON CINCONIDINA / ASYMMETRIC HYDROGENATION OF 4-METHOXYACETOPHENONE OVER Pt/TiO2 CATALYSTS MODIFIED WITH CHINCHONIDINE / HIDROGENADLO DE 4-METOXIACETOFENONA EM CATALISADORES Pt/TiO2 MODIFICADOS COM CINCONIDINE

Se estudió la hidrogenación enantio selectiva de 4-metoxiacetofenona sobre catalizadores de Pt/TiO2 reducidos a 773K y modificados con cinconidina (CD). Los catalizadores se caracterizaron por fisiadsorción de N2, quimiadsorción de H2, DRX y XPS. Las transformaciones se llevaron a cabo en un reactor tipo STR a distintas concentraciones de cinconidina (CD) con el propósito de evaluar la incidencia de algunos parámetros de reacción como el orden de adición del modificador y la presión de hidrógeno. Se demostró que a bajas concentraciones de CD es posible obtener excesos enantioméricos cercanos al 30%. Se encontró que la estructura de la molécula puede afectar el comportamiento observado.

The enantioselective hydrogenation of 4-methoxyacetophenone over Pt/TiO2 catalyst reduced to 773 K in the presence of cinchonidine (CD) was studied. The catalysts were characterized by N2 physisorption, H2 chemisorption, XRD and XPS. The reactions were carried out in a STR reactor at various concentrations of CD. The effect of several reaction parameters was investigated, such as the addition order of the modifier and hydrogen pressure. Lower concentrations of CD can produce an enantiomeric excess near to 30%. The structure of the molecule can influence the behavior observed.

Neste trabalho, foi estudada a hidrogenação enantioselective do 4-metoxiaceto-fenona em catalisadores Pt/TiO2 reduzidos a 773 K e modificados com cinconidina (CD). Os sólidos foram caracterizados por adsorção de nitrogênio a 77K, quimisorção de hidrogênio a temperatura ambiente, DRX, TEM e XPS. As reações foram realizadas em um reator STR a diferentes concentrações de CD. Alem de isso o efeito de vários parâmetros de reação foi estudado, como ordem de adição do modificador e pressão do hidrogênio. Baixas concentrações do CD podem produzir excesso enantiomêricos próximos aos 30%. A estrutura da molécula pode influenciar o comportamento obtido.

HIDROGENACIÓN DE CITRONELAL SOBRE CATALIZADORES DE Ir/TiO2/SiO2 / HYDROGENATION OF CITRONELLAL OVER Ir/TiO2/SiO2 CATALYSTS / HIDROGENAÇÃO DE CITRONELAL EM CATALISADORES Ir/TiO2/SiO2

En este trabajo se estudió la hidrogenación selectiva de citronelal sobre sistemas de Ir/TiO2, Ir/SiO2, e Ir soportado en óxidos mixtos (Ir/TiO2-SiO2) reducidos a 473 y 773 K. Se analizó el efecto de la adición de TiO2 al soporte y de las temperaturas de reducción de los catalizadores para evaluar el posible efecto de especies TiOx parcialmente reducidas, sobre la actividad y selectividad de la reacción. Los sólidos resultantes se caracterizaron por quimisorción de hidrógeno a temperatura ambiente, adsorción de nitrógeno a 77 K, DRX, TEM y XPS. Los resultados indican que los catalizadores reducidos a alta temperatura (HT: 773 K) favorecen la producción del alcohol insaturado debido al efecto de interacción fuerte metal-soporte conocido como SMSI. Los catalizadores reducidos a baja temperatura (LT: 473 K) llevan a la ciclización del anillo produciendo isopulegol. Estos catalizadores mostraron una alta actividad y una menor selectividad hacia el alcohol insaturado.

Catalytic hydrogenation of citronellal over Ir/TiO2, Ir/SiO2, and Ir supported on mixed oxides (Ir/TiO2/SiO2) reduced at 473 y 773 K was studied. The effects of the partially reducible support species, the reduction temperatures (473 K or 773 K) and the successive TiO2 addition were analyzed. The catalysts were characterized by H2 chemisorption at room temperature, N2 adsorption at 77 K, XRD, TEM and XPS. The results showed that the high temperature reduction treatment (HT: 773 K) favored the production of the unsaturated alcohol, which can be explained in terms of the so-called strong metalsupport interaction (SMSI) effect. Catalysts reduced at low temperature (LT: 473 K) mainly led to a cyclization reaction producing isopulegol. These catalysts showed high activity but low selectivity to the unsaturated alcohol.

Nesse trabalho, foi estudada a hidrogenação seletiva do citronelal em catalisadores Ir/TiO2, Ir/SiO2 e Ir suportado em óxidos mistos (Ir/TiO2-SiO2) reduzidos a 473 e 773 K. Foi analisado o efeito da adição da TiO2 no suporte e das temperaturas de redução dos catalisadores para evaliar o possível efeito das espécies TiOx parcialmente reduzidas, sobre a atividade e seletividade da reação. Os sólidos resultantes foram caracterizados por quimisorção de hidrogênio a temperatura ambiente, adsorção de nitrogênio a 77 K, DRX, TEM e XPS. Os resultados indican que os catalisadores reduzidos a alta temperatura (HT: 773 K) favorecem a produção do álcool insaturado pelo efeito da interação forte metal-suporte conhecido como SMSI. Os catalisadores reduzidos a baixa temperatura (LT: 473 K) conduzen para a ciclização do anel produzindo isopulegol. Esses catalisadores mostraram uma alta atividade e uma baixa seletividade para álcool insaturado.

Fístulas perilinfáticas por trauma y por barotrauma: informe de cinco casos / Perilymphatic fistulas by trauma and barotrauma: information of 5 cases

Se presentan cinco casos con el diagnóstico presuntivo de fístula perilinfática explorados quirúrgicamente. En cuatro se comprobó la presencia de fístula (una en ventana oval y tres en ventana redonda) originadas por barotrauma y trauma sobre el oído. Se logró una recuperación útil de la audición en tres de los cinco casos. No hubo recuperación en el caso intervenido tardíamente y en el que la exploración quirúrgica no reveló fístula. Se adoptó una conducta dinámica en cuanto a la premura en la decisión quirúrgica, la cual se efectuó no más allá del octavo día de ocurrida la ruptura en cuatro de los cinco casos. Se insiste en una conducta de sospecha de fístula ante toda sordera súbita, por un interrogatorio detallado sobre cualquier forma de esfuerzo físico, barotrauma, trauma craneano o sobre el oído e impactos acústicos. La timpanotomía exploradora sigue siendo el único medio de diagnóstico y de tratamiento con expectativas de recuperación de la audición, cuando se realiza oportunamente.