Perfil de resistencia genotípica y fenotípica presente en bacterias aisladas a partir de fómites en Armenia, Quindío-Colombia período junio-julio 2019 / Genotypic and phenotypic resistance profile present in bacteria isolated from fomites in Armenia, Quindío-Colombia period June-July 2019

Resumen Introducción: La antibiótico-resistencia es un fenómeno por el cual las bacterias logran sobrevivir al tratamiento con antimicrobianos; con incidencia en ambientes intra y extrahospitalarios como: fuentes hídricas, sector agrario/ganadero y fómites. Objetivo: Describir bacterias presentes en fómites de alta circulación en una región centro-occidental de Colombia junto a su perfil de sensibilidad fenotípica y presencia de genes para betalactamasas tipo TEM-full, OXA-3 y SHV-full. Metodología: Se aislaron cepas bacterianas de billetes, pasamanos de escaleras eléctricas y botones de cajeros automáticos; se evaluó su perfil de sensibilidad fenotípica por medio de concentración mínima inhibitoria-técnica automatizada/Vitek2® y genes para betalactamasas tipo TEM-full, OXA-3 y SHV-full mediante PCR convencional. Resultados: Se obtuvo 30 aislados; Acinetobacter baumannii complex, fue la más común; el fómite con mayor aislados y resistencia fueron los billetes; el 53% portó al menos uno de los genes estudiados. Se identificaron bacterias gramnegativas con resistencia frente a: Imipinem, Piperacilina/Tazobactam, Colistina, Ceftazidima, Tigeciclina y Ceftriaxona; bacterias grampositivas con resistencia frente a: Quinupristina/Dalfopristina, Minociclina, Tetraciclina, Teicoplanina, Nitrofuratoina, Oxacilina, Clindamicina, Trimetropina-sulfametoxazol, y Minociclina. Conclusión: Teniendo en cuenta la circulación de cepas con estas resistencias, es importante la educación en la comunidad para evitar la adquisición o propagación de infecciones por manipulación inadecuada de fómites.

Abstract Introduction: Antibiotic-resistance is a phenomenon by which bacteria manage to survive antimicrobial treatment; with incidence in intra and extra hospital environments such as: water sources, agricultural / livestock sector and fomites. Aim: To describe bacteria present in high circulation fomites in a central-western region of Colombia, with their phenotypic sensitivity profile and presence of genes beta-lactamases (TEM, OXA3 and SHV). Methodology: We isolate bacterial strains from banknotes, escalator handrails and ATM buttons. We evaluated its phenotypic sensitivity profile by minimal inhibitory concentration automated technique using Vitek 2® and presence of genes for beta-lactamases type TEM-full, OXA-3 and SHV-full by conventional PCR. Results: A total of 30 isolates were obtained; Acinetobacter baumannii complex, was the most common; banknotes were the form with the highest number of isolates and resistance. Of the total isolates, 53% carried at least one of the genes studied. Phenotypically, gram-negative bacteria were identified with resistance against: Imipinem, Piperacillin / Tazobactam, Colistin, Ceftazidime, Tigecycline and Ceftriaxone; Gram-positive bacteria with resistance to: Quinupristin / Dalfopristin, Minocycline, Tetracycline, Teicoplanin, Nitrofuratoin, Oxacillin, Clindamycin, Trimethropine-sulfamethoxazole, and Minocycline. Conclusion: Taking into account the circulation of strains with these resistances, it is important to educate the community to avoid the acquisition or spread of infections due to the inappropriate handling of this type of inanimate elements.

Análisis del uso de antibióticos en antibiogramas de urocultivos realizados por un laboratorio clínico de la región centro-occidental de Colombia / Analysis of the use of antibiotics in antibiograms of urine carried out by a clinical laboratory of the central-western region of Colombia

Resumen Introducción: Los antibióticos son moléculas bactericidas/bacteriostáticas que controlan infecciones bacterianas, su uso incorrecto favorece multirresistencia o falla terapéutica en el caso de cepas bacterianas naturalmente resistentes, generando así un riesgo para la salud. Objetivo: Analizar el uso de antibióticos en antibiogramas de urocultivos realizados por un laboratorio clínico (región centro-occidental, Colombia). Materiales y métodos: Estudio descriptivo-retrospectivo. Se tomaron datos de urocultivos y antibiogramas realizados entre abril de 2014 a junio de 2015 por un laboratorio clínico de la región centro-occidental de Colombia. Los datos obtenidos fueron confrontados con los protocolos descritos por el Instituto Nacional de Salud de Colombia. Resultados: Se analizaron 1815 reportes de urocultivos y antibiogramas, identificando 18 especies bacterianas. En el 22,3%(403) de casos se evaluaron y reportaron antibióticos sobre microorganismos naturalmente resistentes. Pseudomonas aeruginosa presentó mayor resistencia, el antibiótico con mayor resistencia fue ácido nalidíxico (66,7%). Conclusión: El estudio mostró que existe un problema en cuanto al manejo, reporte e interpretación de antibiogramas frente a microorganismos naturalmente resistentes, que podría favorecer el desarrollo de multirresistencia en microorganismos sensibles de la flora bacteriana. Una revisión de la bibliografía nacional e internacional, mostró reportes similares; ningún autor menciona resistencias intrínsecas, por lo que los datos de antibiótico resistencia serían sobreevaluados.

Abstract Introduction: Antibiotics are bactericidal/bacteriostatic molecules that control bacterial infections, its misuse favors multidrug or therapeutic failure in the case of naturally resistant bacterial strains, thus generating a health risk. Objective: To analyze the use of antibiotics in urine antibiograms carried out by a clinical laboratory (central-western region, Colombia). Materials and methods: A descriptive-retrospective study was made. Urine and antibiograms data were collected from April 2014 to June 2015 by a clinical laboratory in the central-western region of Colombia. The obtained data was confronted with the protocols described by the National Institute of Health of Colombia. Results: 1815 reports of urine and antibiograms were analyzed, identifying 18 bacterial species. In the 22.3% (403) of cases, antibiotics were evaluated and reported on naturally resistant microorganisms. Pseudomonas aeruginosa showed greater resistance and the antibiotic with the highest resistance was nalidixic acid (66.7%). Conclusion: The study showed that there is a problem in managing, reporting and interpreting antibiograms against naturally resistant microorganisms, which could favor the development of multidrug in sensitive microorganisms of bacterial flora. A review of national and international bibliography showed similar reports; however, no author mentions intrinsic resistances, so the data of antibiotic resistance would be over evaluated.

Manifestaciones clínicas y hallazgos de laboratorio de una serie de casos febriles agudos con diagnóstico presuntivo de infección por el virus dengue. Quindío (Colombia) / Clinical manifestations and laboratory findings on a case series of acute febrile syndrome with a presumptive diagnosis of dengue virus infection. Quindio, Colombia

Objetivo: Describir las manifestaciones clínicas y hallazgos de laboratorio de una serie de casos febriles agudos con diagnóstico presuntivo de infección por el virus dengue. en Quindío (Colombia). Materiales y métodos: Se realizó un estudio de corte transversal, en pacientes con sospecha clínica de dengue en el periodo comprendido entre enero y agosto de 2013, en algunos centros hospitalarios del departamento del Quindío. Se tomaron muestras de sangre para diagnóstico de dengue, leptospira, malaria, hepatitis B, y rickettsiosis. Como pruebas confirmatorias para dengue se realizó aislamiento viral en células C6/36HT y serotipificación para dengue por RTPCR; pruebas de función hepática, cuadro hemático y niveles de citocinas. Resultados: Se caracterizaron 149 casos, de los cuales el 43% presentaron infección por dengue, 4% leptospira, 6,8% rickettsias, un caso de malaria y uno de hepatitis B. En 5 casos se logró el aislamiento del DENV2 y DENV3. Mediante la RT-PCR, se evidenció cocirculación de serotipos 2, 3, 4. Se encontró que las enzimas AST/ALT, el conteo de plaquetas, la erupción y el dolor abdominal fueron marcadores característicos de la infección por dengue, mientras la ictericia y el dolor lumbar se correlacionaron con la leptospirosis. Los valores de citocinas mostraron que la IL-10, TNF α variaron significativamente en casos con dengue frente a otros diagnósticos, y la IL-17 a presentó diferencias significativas en individuos con dengue grave. Conclusiones: El dengue se confirmó como causa etiológica importante de síndrome febril icterohemorrágico en el departamento del Quindío, pero la leptospirosis y la rickettsiosis tienen también una participación importante. Sin embargo, en el 44% de los casos fueron catalogados como síndrome febril indeterminado.

Objective: To characterise the clinical and laboratory findings on a series of febrile cases with a presumptive diagnosis of dengue virus infection in Quindío, Colombia. Materials and methods: This study was conducted from January to July 2013. Blood samples were obtained from patients suspected of dengue virus infection from Quindío department hospitals. These samples were tested for dengue, leptospira, malaria, hepatitis B and rickettsiosis. To confirm dengue infection, we performed viral isolation in C6/36HT cells and dengue serotyping by RT-PCR; liver function tests, complete blood counts and cytokine levels. Results: Of 149 cases, 43% were infected by dengue, 4% leptospira, 6.8% rickettsia, one case of malaria and one case of hepatitis b. We obtained 5 clinical isolates of DENV2 and DENV3 that evidenced co-circulation of serotypes 2, 3, and 4. We found that AST/ALT levels, platelet count, rash and abdominal pain were good markers of infection by dengue, while jaundice and lumbar pain suggested leptospirosis. Cytokine levels revealed that IL-10, TNF a varied significantly in dengue compared with other diagnostics and that IL-17 α showed significant differences in individuals with severe dengue. Conclusions: Dengue was confirmed as an important aetiology of acute febrile icterohaemorrhagic syndrome in Quindío, but leptospirosis and rickettsia also play an important role. However, 44% of the cases were classified as undetermined febrile syndrome.