DNA rare copy number alterations in Reinke's Edema

Abstract Introduction: Reinke's Edema (RE) is a laryngeal lesion related to excessive tobacco smoking, voice overuse, and laryngopharyngeal reflux. Although the risk of malignancy has been considered low in literature, RE is classified among precancerous lesions. Objectives: We investigated DNA Copy Number Alterations (CNAs) in specimens of RE and its potential association with malignant progression. Methods: We used array-based comparative genomic hybridization (aCGH, Agilent 4 × 180 K platform) to study eight RE cases. All patients were heavy tobacco users for at least 30 years, and none of them progressed to cancer in the follow-up (>8 years). Two RE presented mild dysplasia, one moderate dysplasia, and no histological alterations were found in the remaining five cases. CNAs were compared with the Database of Genomic Variants (DGV) and genes mapped on altered regions had their functions annotated. Results: Six of eight patients showed different rare copy number alterations on chromosomes 2q37.3, 4q13.1, 4q13.3, 7q11.22, 10p14, and 13q34. A gain of the whole chromosome 8 were detected in one case. Of interest, four of eight RE cases showed copy number imbalances involving genes previously described in several tumor types (RASA3, COL6A3, LINC00707, LINP1, SMR3A, and SMR3B). Conclusion: The genomic imbalances herein found in RE have the potential to contribute to the phenotype but with limited or no risk of cancer. A long-term follow-up in a large series of patients could clarify the mechanisms involved in the malignant progression of RE. Level of evidence: 4.

Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrome with deforming lipomatous hamartomas in infant - Case report / Sindrome de Bannayan-Riley-Ruvalcaba com hamartomas lipomatosos deformantes em lactente - Relato de caso

Bannayan-Riley-Ruvalcaba Syndrome is a rare condition caused by mutations in the PTEN gene. It displays association of multiple lipomas, macrocephaly, hemangiomas, hamartomatous intestinal polyposis, developmental delay and speckled pigmented maculae on the male genitalia. We report the case of a nine-month-old boy who had fast growing and progressive tumors for three months, macrocephaly and lentigines on the penis. Imaging tests showed extensive lipomatosis with invasion of paraspinal muscles, enlargement of the spinal canal and spinal cord compression; after surgical excision of the mass, the pathology was consistent with lipoma. Adipocyte culture karyotype demonstrated PTEN mutation. We present this case for its rarity and exuberance.

A síndrome de Bannayan-Riley-Ruvalcaba é afecção rara, causada por mutações no gene PTEN. Apresenta associação de múltiplos lipomas, macrocefalia, hemangiomas, polipose hamartomatosa intestinal, atraso do desenvolvimento e máculas salpicadas na genitália masculina. Relatamos o caso de um menino de nove meses com lesões tumorais de crescimento rápido e progressivo em três meses de evolução, macrocefalia e lentigos no pênis. Exames de imagem demonstraram extensa lipomatose com invasão da musculatura paraespinhal, alargamento do canal vertebral e compressão medular. Depois da excisão cirúrgica da massa, o anatomopatológico foi compatível com lipoma. A análise do cariótipo em cultura de adipócitos demonstrou mutação do PTEN. Apresentamos este caso por sua exuberância e raridade.

Polimorfismo do gene do receptor de insulina (INSR) em pacientes com síndrome dos ovários policísticos / Polymorphims of the insulin receptor gene (INSR) in patients with polycystic ovary syndrome

OBJETIVO: Avaliar a freqüência do polimorfismo do gene (INSR), localizado no éxon 17 do cromossomo 19, quanto ao seu envolvimento na predisposição genética da SOP e a associação com a sensibilidade à insulina e hiperandrogenismo. MATERIAL E MÉTODOS: Foram estudadas 57 pacientes com SOP e 50 mulheres normais com ciclos menstruais regulares (controle) quanto à frequência de polimorfismos de nucleotídeo único (Single Nucleotide Polymorphisms–SNPs) do gene INSR, através da análise de comprimento do fragmento de restrição (Restriction Lengh Fragment Polymorphisms-RFLPs). Para avaliar a sensibilidade à insulina, utilizou-se os seguintes métodos matemáticos: relação glicemia/insulina de jejum (G/I), Homeostasis Model Assessment (HOMA) e Quantitative Sensitivity Check Index (QUICKI). Foram considerados normais, G/I maior ou igual a 4,5, HOMA menor que 3,8, e QUICKI maior ou igual a 0,34. RESULTADOS: O polimorfismo (C/T, T/T) na SOP não apresentou diferenças significativas com o grupo controle. Quanto a insulinemia, não observamos diferenças entre as pacientes com genótipos (C/T, T/T) e (C/C). CONCLUSÕES: As frequências do polimorfismo do gene INSR, são semelhantes tanto em pacientes com SOP, como em mulheres normais. Esses genótipos (C/T e T/T) não influenciam a sensibilidade à insulina e o hiperandrogeninsmo na SOP

Chromosomal imbalances detected in primary bone tumors by comparative genomic hybridization and interphase fluorescence in situ hybridization

We applied a combination of comparative genomic hybridization (CGH) and fluorescence in situ hybridization (FISH), to characterize the genetic aberrations in three osteosarcomas (OS) and one Ewing's sarcoma. CGH identified recurrent chromosomal losses at 10p14-pter and gains at 8q22.3-24.1 in OS. Interphase FISH allowed to confirm 8q gain in two cases. A high amplification level of 11q12-qter was detected in one OS. The Ewing's sarcoma showed gain at 1p32-36.1 as the sole chromosome alteration. These studies demonstrate the value of molecular cytogenetic methods in the characterization of recurrent genomic alterations in bone tumor tissue

Clonal chromosome abnormalites found in three non-neoplastic proliferative brain lesions

Chromosome analysis was made of brain lesions from three patients which, according to classical histopathological criteria, did not contain tumor cells. In addition to normal cells, we identified abnormal karyotypes with clonal numerical and structural chromosome alterations in at least two independently originated primary cultures from each lesion. Our data suggest that chromosomal aberrations can exist in vivo in non-neoplastic lesions. Other abnormalities may be due to genetic instability manifested only in vitro (culture artifacts) or may already have been present in brain tissue, reflecting previous chromosome damage (as a result of exposure to chemical treatment or enviromental clastogens).

Cytogenetic analysis of human meningiomas

Quatro meningiomas primários humanos foram colocados em cultura e tiveram suas células analisadas citogenéticamente: 1 me meningioma transicional com número modal de 46 cromossomos (I), 2 meningiomas fibroblásticos ambos com número modal de 45 cromossomos (II e III) e 1 meningioma meningoendoteliomatoso com uma classe modal correspondente a 78 - 82 cromossomos (IV). A alteraçäo mais consistente encontrada em todos os tumores foi a monossomia total ou parcial do cromossomo 22 (I - 30%; II - 25%; III - 69% e IV - 30%). O tumor I apresentou também perda do cromossomo Y (80% das célulkas), além de outros marcadores nao identificados. O tumor II apresentou a deleçäo 12p12 - 12pter (65% das células) e del (19) (qter - p13:) (50% das células). O tumor III apresentou 3 marcadores recorrentes, näo identificados. O tumor IV apresentou um marcador acrocêntrico grande, näo identificado. Monossomias, trissomias e tetrassomias esporádicas também foram encontradas nesses tumores. Os pontos de quebra recorrentes foram comparados com os locais de sítios frágeis, pontos específicos de quebras neoplásicas, genes muito ativos de células diferenciadas e oncogenes, já descritos na literatura

A specific recurrent chromosomal break region (2q-24-2q.32) in human gliomas

Doze gliomas humanos foram estudados citogeneticamente e 06 deles apresentaram uma regiäo de quebra cromossômica (2q24 - 2q32), nunca antes descrita em nenhuma neoplasia

Cytogenetic study of a gastric human tumor

Um tumor primário humano de estômago e sete clones dele derivados, foram estudados citogeneticamente e tiveram o tempo de duplicaçäo das populaçöes determinado. A análise do n§ modal revelou números cromossômicos na regiäo peridiplóide. Tanto a linhagem parental como os clones apresentaram "micro-marcadores". O marcador mais característico deste tumor foi um cromossomo submetacêntrico grande envolvendo um rearranjo entre os cromossomos 1 e 8, assim descrito: t(1;8) (1qter-1q12::8p23-8qter), aparecendo em altas freqüências na linhagem parental e em todos os clones. Outros marcadores de origem näo identificada e ocorrendo em freqüências mais baixas foram encontrados: 1 cromossomo submetacêntrico grande, de tamanho semelhante ao cromossomo 3; um cromossomo acrocêntrico grande, maior que os cromossomos do grupo D; um cromossomo semelhante aos cromossomos do grupo B, porém com o braço longo maior e um cromossomo em anel. Além de perdas e ganhos ocasionais, havia em todos os clones e na linhagem parental, uma perda consistente do cromossomo 17