Caracterización de cepas cubanas de VIH-1 por ensayos biológicos y métodos bioinformáticos / Characterization of Cuban strains of HIV-1 by bioassays and bio-information methods

Mediante ensayos biológicos clásicos se ha podido determinar el uso del correceptor por las cepas de VIH-1, las cuales se han clasificado en R5, X4 o R5/X4, características que guardan relación con el fenotipo NIS o IS y con la evolución clínica. Por métodos bioinformáticos se han relacionado cambios aminoacídicos en la región del lazo V3 del env con el uso del correceptor. En este trabajo se presentan los resultados del estudio de caracterización de once cepas provenientes de individuos infectados con VIH-1, cinco de ellos seropositivos asintomáticos y seis progresores rápidos al SIDA. Se compararon los resultados del estudio fenotípico realizado por dos ensayos biológicos clásicos, uso de correceptores y capacidad de inducir sincicios en MT2 y tres métodos bioinformáticos, regla 11/25, matrices de puntos en posiciones específicas (PSSM) y el programa geno2pheno. Las cinco cepas de seropositivos asintomáticos coincidieron por todos los métodos como R5/NIS. Cinco de las seis cepas de progresores rápidos se clasificaron R5/X4 e IS por los ensayos biológicos; mientras dos clasificaron R5/X4 por Geno 2 Pheno, una por PSSM y todas fueron X4 puras por la regla 11/25. Los ensayos utilizados en el estudio permitieron caracterizar las cepas aisladas y relacionar el fenotipo con la evolución de la infección, por lo que valoramos que por ensayos biológicos o métodos bioinformáticas se pueden hacer estudios de caracterización, su utilidad está en dependencia del objetivo que se persiga

By the classic biological assays it has been possible to determine the use of HIV-1 strains co-receptor, which have been classified in R5, X4 or R5/X4, characteristic related to the NIS or IS phenotype and to the clinical course. By bio-information methods the amino acid changes in the region of V3 loop of the env using the co-receptor. In present paper are showed the results of a characterization study of eleven strains from HIV-1 infected subjects, five seropositive and six with a fast progression to AIDS. Authors compared the results of phenotype study conducted by two classic assays, use of co-receptors and ability to induce syncytia in MT2 and three bio-information methods, rule 11/25, point matrices in specific locations (PSSM) and the geno2pheno program. The five strains from asymptomatic seropositive patients coincided according all methods used as R5/NIS. Five of the six strains from fast progression patients were classified as R5/X4 and IS by biological assays; whereas two were classified as R5/X4 by Geno 2 Pheno, one by PSSM and all were pure X4 by the rule 11/25. The assays used in the study allowed us to characterize the isolated strains and to relate the phenotype to the infection course, thus, we considered that using biological assays or bio-information methods it is possible to conduct characterization studies, its usefulness depends on the pursued objectives

Eficacia y tolerancia de ribavirina más interferon enpacientes con hepatitis crónica C / Efficacy and permissiveness of ribavirin more interferon in patient with chronic hepatitis C

Evaluar la eficacia y seguridad de un regimen de 1200 mg/día de Ribavirina más 3 MU de Interferon alfa 2b, 3 veces por semana durante 6 meses, en el tratamiento de la hepatitis crónica C. Se realizó estudio doble ciego y aleatorizado que incluyó 47 pacientes con hepatitis crónica tipo C. Veintiseis recibieron Ribavirina oral a la dosis de 1200 mg/día e Interferon subcutáneo 3MU tres veces por semana, durante 24 semanas y los 21 restantes recibieron placebo más Interferon subcutanéo 3MU tres veces por semana durante 24 semanas. Todos los pacientes enrolados en la investigación tenían diagnóstico histológico reciente y Anti VHC y RNA VHC positivos y eran HBsAg y AntiVIH negativos con ALT 1.5 veces o mayor sobre los valores normales (valor normal=12 UI). No se enconttraron diferencias significactivas entre los grupos asignados

Determinación de anticuerpos al virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) en muestras de sangre seca en papel de filtro

Se estudia la posibilidad de detectar anticuerpos al VIH-1 mediante un estuche de Immunoblotting, en un papel de 125 muestras conocidas de sangre seca colectadas en papel de filtro y su correspondiente muestra de suero. No se apreciaron diferencias en los patrones de bandas con ambos tipos de muestras, así como en la sensibilidad y especificidad, donde se alcanzaron cifras del 100 %, lo que permitió concluir que la muestra de sangre tomada en papel de filtro puede ser empleada para la detección de anticuerpos al VIH-1 por el sistema DAVIH-BLOT y puede ser conservada a 4 ºC por 30 semanas.

The possibility of detecting HIV-1 antibodies by an inmunoblotting kit is studied in a panel of 125 known specimens of dried blood spotted on filter paper and their corresponding serum samples. No differences were observed in the patterns of bands with both types of samples or in the sensitivity and specificity, where 100 % figures were attained, allowing to conclude that the blood specimen taken on filter paper may be used for the detection of HIV-1 antibodies by the DAVIH-BLOT system and may be kept at 4 ºC during 30 weeks.

Confirmación de la presencia en Cuba del virus linfotrópico tipo I de las células T humanas mediante la reacción en cadena de la polimerasa / Confirmation of the presence in Cuba of the human T lymphotropic virus type I by polymerase chain reaction

Se estudiaron por reacción en cadena de la polimerasa los primeros casos diagnosticados en Cuba como seropositivos al HTLV-I/II (virus linfotrópicos de las células T humanas), con el objetivos de diferenciar el tipo de virus causante de la infección. Se utilizaron 3 juegos de oligonucleótidos cebadores y los productos de amplificación fueron detectados mediante hibridación con oligosondas específicas. El 100 por ciento de los casos resultaron positivos para el HTLV-I, no se encontró positividad para el HTLV-II. Se confirmó la presencia en Cuba de este retrovirus, aunque la seroprevalencia es baja si se tiene en cuenta que el Caribe es una zona endémica para el HTLV-I