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2.
Acta biol. colomb ; 21(1): 111-122, Jan.-Apr. 2016. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-769038

ABSTRACT

En este estudio se determinaron las relaciones filogenéticas y los niveles de variación de aislamientos de PVX obtenidos en tejidos foliares de plantas de Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro y S. phureja var. Criolla Colombia en Antioquia, utilizando métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) y de Sanger. Inicialmente, se detectó el PVX mediante DAS-ELISA (Agdia-PSA10000), confirmándose su presencia en ocho de las muestras por Inmunocaptura-RT-PCR en tiempo real (IC-RT-qPCR). Los resultados de las pruebas serológicas indicaron la infección de PVX en 14,7 % y 13,3 % de las muestras de Diacol-Capiro y Criolla Colombia, respectivamente. Su identidad fue confirmada por IC-RT-qPCR, con valores de ciclo umbral (Ct) de 15,04 a 27,59 y dos temperaturas de fusión (Tm) (Tm1 = 80,3 °C ± 0,5 y Tm2 = 83,3 °C ± 0,5), encontrándose así dos variantes de PVX en Antioquia. Utilizando NGS se detectó el PVX en bajos niveles de infección en las muestras de Criolla Colombia, siendo posible obtener contigs parciales para todos los ORFs del genoma viral. Con NGS no se detectó el virus en las muestras de Diacol-Capiro evaluadas. Los análisis filogenéticos realizados con base en secuencias de cápside y replicasa viral separaron los aislamientos de PVX de Antioquia en dos grupos, relacionados con el clado Eurasiático (I) de este virus. Los altos niveles de infección de PVX detectados en los cultivos de papa de Antioquia y la ocurrencia de al menos dos variantes, enfatizan en la necesidad de fortalecer los programas de certificación de tubérculos-semilla de papa, como principal herramienta para el control de este virus.


In this study, the phylogenetic relationships and molecular variability of PVX isolates from leaf samples of Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro and S. phureja var. Criolla Colombia in Antioquia were analyzed. Sequences were obtained using Next Generation Sequencing (NGS) of bulk samples and Sanger sequencing. DAS-ELISA (Agdia-PSA10000) revealed infection levels of 14.7 % and 13.3 % leaf samples of Diacol-Capiro and Criolla Colombia, respectively. The presence of PVX was further confirmed by IC-RT-qPCR in eight samples, which resulted in Ct values in the 15.04-27.59 range and two melting temperatures (Tm1 = 80.3 °C ± 0.5 and Tm2 = 83.3 °C ± 0.5). These results suggest the presence of at least two PVX variants in Antioquia. Using NGS, PVX was detected at low levels in leaf samples of Criolla Colombia, which resulted in contigs for most ORFs of the viral genome; NGS did not detect PVX in Diacol-Capiro samples. Phylogenetic analysis using capsid and replicase sequences separated PVX isolates into two groups within the Eurasian class (I). The high levels of PVX infection detected in potato crops in Antioquia and the presence of at least two variants highlight the need to strenghten current tuber seed certification programs aimed at controlling the spread of this virus.

3.
Rev. colomb. biotecnol ; 18(1): 104-111, ene.-jun. 2016. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-791238

ABSTRACT

El Potato virus X (PVX) es uno de los virus más limitantes del cultivo de la papa en el mundo. Es transmitido solamente por contacto y por tubérculo-semilla. Su control se fundamenta en la siembra de tubérculos certificados por su sanidad viral y en la disponibilidad de metodologías de diagnóstico altamente sensibles. En este trabajo se evaluó la prevalencia del PVX en cuatro diferentes tejidos de tubérculos de Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro y S. phureja var. Criolla Colombia utilizando pruebas de DAS-ELISA para 128 submuestras y de RT-qPCR para 32 grupos de submuestras (4 submuestras/grupo). Los resultados de las pruebas serológicas indicaron la presencia de PVX en el 6,25 y 50% de las submuestras analizadas para la variedad Diacol-Capiro y Criolla Colombia, respectivamente; mientras que los niveles de prevalencia del PVX utilizando la detección por RT-qPCR fueron del 93,75%, independientemente de la variedad de papa y del tejido evaluado. Los valores promedio del ciclo umbral (Ct) en las RT-qPCR fueron de 25,6 (Ct=18,02 a 34,49) y el análisis de las curvas de desnaturalización permitió identificar dos variantes del virus con valores de Tm de 79,5±1°C y 83,7±1°C. La secuenciación de los amplicones obtenidos por RT-qPCR para los controles positivos y para dos de las muestras, confirmó su naturaleza viral. Estos resultados señalan unos muy altos niveles de prevalencia de PVX en el material de siembra de papa en Antioquia y la necesidad de fortalecer los programas de certificación de semilla con pruebas de detección como RT-qPCR.


Potato virus X (PVX) is one of the most important virus affecting potato crops worldwide. The virus is only transmitted mechanically and through tuber-seeds. Control of PVX is based on the usage of certified tubers, which in turn depends on the availability of sensitive diagnostic tests that allow its direct detection on seeds. In this work, the prevalence of PVX in four different tuber tissues of Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro and S. phureja var. Criolla was evaluated using DAS-ELISA (128 subsamples) and RT-qPCR (4 subsamples per group). DAS-ELISA revealed the presence of PVX in 6.25 and 50% of Diacol-Capiro and Criolla Colombia subsamples; in contrast, RT-qPCR detected PVX in 93.75% of the samples independent of the potato variety or type of tissue. Ct values were in the 18.02 to 34.49 range with a mean value of 25.6. Melting curve analysis allowed the identification of two virus variants with Tm values of 79.5±1°C and 83.7±1°C. Sanger sequencing of the positive controls and two of the samples confirmed RT-qPCR amplicons to be PVX. These results reveal a high level of prevalence of PVX in potato tuber seeds used in Antioquia and the need to strengthen seed certification programs in Colombia through RT-qPCR detection assays.

5.
Rev. estomat. salud ; 19(1): 30-35, 2011.
Article in Spanish | COLNAL, LILACS | ID: biblio-868185

ABSTRACT

El granuloma periférico de células gigantes es una lesión exofítica de la cavidad bucal, pertenece a las "hiperplasias reactivas" En la literatura solamente se han reportado 12 casos en pacientes infantiles, su crecimien-to es rápido, alcanza gran tamaño y se com-porta de manera agresiva ya que absorbe el hueso alveolar, produciendo movilidad dental e interfiere con la erupción. En este artículo se presenta el caso de un paciente masculino de 9 años, 6 meses de edad, el cual mostraba un crecimiento gingival en la zona de premolares superio-res derechos de color rojo, suave, forma irregular de aproximadamente 4 cm. de diámetro con una úlcera en la superficie oclusal, asintomático y de corta evolución. Refiere recidiva en menos de 6 meses; el diagnóstico histopatológico fue de granulo-ma periférico de células gigantes, el trata-miento fue quirúrgico, consistiendo en una toma de biopsia excisional y realizando el curetaje abierto . El objetivo de este trabajo fue identificar oportunamente al granuloma periférico de células gigantes para evitar destrucción del hueso alveolar, evitando así la pérdida de los dientes permanentes...(AU)


The peripheral giant cell granuloma is an exophytic lesion developing in the oral ca-vity; it is one of the "reactive hyperplasias" The etiology is unknown In the literature only 12 cases have been reported in chil-dren, in these patients, it achieved rapid growth, behaving in an aggressive manner as it absorbed alveolar bone, leading to tooth mobility and interferes with eruption. This article presents the case of a male 9 years, 6 months old patient, who showed a red, soft, irregularly shaped gingival swelling involving the right maxillary premolars of 4cm in diameter with an ulcer in the oclusal side, asymptomatic and with short evolution. Recurrence appeared in less than 6 months; histopathologic diag-nosis was peripheral giant cell granuloma, the treatment was surgical. The purpose of this study was to identify the peripheral giant cell granuloma to avoid destruction of the alveolar bone, thus avoiding the loss of permanent teeth...(AU)


Subject(s)
Humans , Pathology, Oral , Surgery, Oral , Granuloma, Giant Cell , Oral Medicine , Periodontics , Pseudolymphoma , Dentistry
6.
Rev. estomat. salud ; 18(2): 27-32, 2010.
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-868166

ABSTRACT

Los tratamientos odontológicos en niños tienen una gran complejidad en su realización y dependen de distintos factores para alcanzar el éxito clínico, estos pueden ser resumidos en tres, que son: la selección de los materiales, la habilidad o destreza por parte del clínico, además de la cooperación del paciente. Objetivo: Conocer las propiedades biológicas de la pasta CTZ, así como sus ventajas y desventajas frente a otros materiales actualmente usados en la terapia pulpar en niños. Métodos: Se realizó un tratamiento de pulpectomía, a través de la NIET (Técnica de Endodoncia No Instrumentada), en la clínica de Odontopediatría, de la DEPeI, de la Facultad de Odontología, de la UNAM, quien presentó proceso de necrosis pulpar. Resultados: Estudios recientes muestran que los componentes de la pasta CTZ, tienden a ser más efectivos en el tratamiento de pulpectomía que otros materiales, encontrando que pacientes tratado con esta pasta, a la exploración clínica dos semanas después de su colocación se encontraban asintomáticos; y el examen radiográfico realizado a los 2, 4 y 6 meses reveló una reducción o estabilización de la lesión periapical. Conclusiones: La pasta CTZ ha mostrado excelentes resultados y reduce la carga bacteriana hasta niveles mínimos. Las características de la pasta permiten al clínico realizar tratamientos pulpares en menor tiempo y obtener resultados superiores a otras técnicas convencionales...(AU)


Dental treatments in children are very complex to carry out and depend on different factors to obtain a clinical success, mainly depending in: selection of materials, clinical abilities and patient´s cooperation. Objective: To know the biological properties of the CZT paste, as well as its advantages and disadvantages compared with other materials currently used in pulpar therapy in children. Method: A pulpectomy treatment was carried out by NIET (non-instrumented endodontic technique in the Pediatric Dentistry Clinic of the Postgraduate School, School of Dentistry, UNAM. All patients presented pulpar necrosis. Results: Recent studies have shown that the components of the CZT paste are more effective in pulpectomy treatment than other materials, finding asymptomatic patients after two weeks of treatment with this paste. Radiographic examination after 2, 4 and 6 months revealed a reduction or stabilization of the periapical lesion. Conclusions: The CZT paste has shown excellent results and reduces the bacteria concentration to minimal level. The characteristics of this paste allow the clinician to carry out pulpar treatment in less time and to obtain superior results comparing with conventional techniques...(AU)


Subject(s)
Pulpectomy , Oral Medicine , Root Canal Filling Materials , Root Canal Therapy , Biocompatible Materials , Gram-Negative Bacterial Infections , Dentistry , Endodontics
7.
Pró-fono ; 9(2): 41-6, set. 1997. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-201971

ABSTRACT

Este trabalho teve como objetivo avaliar o comportamento vocal dos integrantes do grupo de teatro da USP-Bauru. A avaliaçäo proposta foi realizada antes e após treinamento vocal, a fim de se constatar se houve ou näo mudança com relaçäo aos parâmetros vocais pesquisados. Com esse trabalho, pudemos observar melhora variável desses parâmetros, sendo que ressonância e projeçäo vocal foram os de maior significância em termos de benefício


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adolescent , Adult , Voice Quality , Voice Training , Brazil , Evaluation Study
8.
Pró-fono ; 9(1): 27-30, mar. 1997. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-201981

ABSTRACT

A atuaçäo fonoaudiológica no campo da voz profissional é relativamente recente, principalmente no que diz respeito à prevençäo. Advogados, juízes e promotores säo profissionais que utilizam a voz de maneira intensiva e, assim sendo, prováveis candidatos ao aparecimento de disfonias. Em nosso trabalho, investigamos a existência ou näo de queixas por parte desses profissionais por meio de questionário e, consequentemente, as prováveis alteraçöes vocais. Os dados por nós encontrados näo foram significativos com relaçäo ao aparecimento de disfonias, uma vez que as queixas eram isoladas e, na maior parte das vezes, näo caracterizavam uma alteraçäo de voz específica


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Voice Disorders/epidemiology , Occupational Diseases/etiology , Voice Quality , Surveys and Questionnaires
9.
Pró-fono ; 8(2): 31-5, set. 1996.
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-205757

ABSTRACT

Apresentamos neste artigo as principais características do comportamento vocal de 5 pacientes com disostose acrofacial e um tipo particular de comprometimento laríngeo. Os principais parâmetros avaliados foram tipo de voz, ressonância, pitch, loudness, emissäo dos sons da fala, ataque vocal, articulaçäo, velocidade, dinâmica respitatória, estruturas da fonaçäo e avaliaçäo corporal. As principais alteraçöes vocais encontradas foram rouquidäo e soprosidade com ressonância laringo-faríngea e tempos máximos de fonaçäo diminuídos


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Adolescent , Craniofacial Dysostosis/diagnosis , Mandibular Diseases/diagnosis , Pierre Robin Syndrome/diagnosis , Voice Quality
10.
Distúrb. comun ; 8(1): 79-84, jun. 1996. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-254067

ABSTRACT

A medida dos tempos máximos de fonaçäo é um dos parâmetros por meio do qual se obtém de modo mais fácil as medidas respiratórias, podendo ser empregada tanto como meio de diagnóstico, como de acompanhamento da terapia de pacientes disfônicos. Propöe a medida dos tempos máximos de fonaçäo em mulheres fumantes e näo fumantes e a posterior comparaçäo desses achados


Subject(s)
Humans , Female , Adult , Phonation , Lung Volume Measurements , Smoking/adverse effects , Outcome Assessment, Health Care
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