A new emerging zoonotic virus of concern: the 2019 novel Coronavirus (SARS CoV-2) / Un nuevo virus zoonótico emergente de preocupación: el Coronavirus novel 2019

We review here the origin, outbreak characteristics and main epidemiological features of the novel Coronavirus (2019nCoV) responsible of a new coronavirus disease (COVID-19). Rapid global health authorities' responses are now in course and international scientific collaboration is urgently need. Previous outbreaks experiences with similar viral agents have increased the capacity to containment and control of these recurrent health menaces.

Revisamos aquí el origen, características del brote y la epidemiología del nuevo Coronavirus (2019nCoV) responsable de una nueva enfermedad por coronavirus (COVID-19). Una rápida respuesta de las autoridades de salud mundiales está en marcha y se ha hecho un llamado urgente para colaboración científica internacional. Las lecciones aprendidas de brotes previos con agentes virales similares han aumentado las capacidades para contener y controlar estas amenazas recurrentes a la salud global.

Identificación molecular de Aspergillus fumigatus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva / Molecular identification of Aspergillus fumigatus isolated from patients with invasive aspergillosis

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente cepas de aspergillus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva (AI), que fueron tipificadas primariamente como Aspergillus fumigatus sensu lato por métodos fenotípicos convencionales. Se trabajó con 20 cepas de la micoteca de la sección de micología del Instituto de Medicina Tropical "Daniel A. Carrión". Para obtener el ADN fúngico se emplearon las técnicas de choque térmico, tratamiento enzimático y columnas de silica-gel; y se almacenó a -20 0C para conservarlo. En el procedimiento de la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR) se incluyeron primers marcados con fluorocromo, los cuales amplificaron las secuencias específicas de A. fumigatus. La fluorescencia se midió con el termociclador al final de la fase de hibridación de cada ciclo. Se identificó molecularmente que sólo el 50% de las cepas estudiadas pertenecen a la especie Aspergillus fumigatus sensu stricto.

ABSTRACT The objective of the study was to identify molecularly-isolated strains of Aspergillus from patients with invasive aspergillosis (IA); these strains were primarily typed as Aspergillus fumigatus sensu lato by conventional phenotypic methods. We worked with 20 strains from the mycology section of the Institute of Tropical Medicine "Daniel A. Carrión." To obtain the fungal DNA, thermal shock, enzymatic treatment, and silica gel column techniques were used; and it was stored at -20°C to preserve it. The real-time polymerase chain reaction (qPCR) procedure included fluorochrome-labeled primers, which amplified the specific sequences of A. fumigatus. Fluorescence was measured with the thermocycler at the end of the hybridization phase of each cycle. It was molecularly-identified that only 50% of the strains studied belong to the species Aspergillus fumigatus sensu stricto.

Consumo autoreportado de sustancias psicoactivas ilegales en una población habitante de calle de Cali-Colombia / Self-Reported consumption of illegal psychoactive substances in a street inhabitant population from Cali, Colombia

Objetivo Determinar la prevalencia autoreportada de consumo de sustancias psicoactivas ilegales en una población habitante de calle de la ciudad de Cali. Métodos: Estudio descriptivo de prevalencia de periodo. La población objetivo fueron 763 habitantes de calle registrados durante el año 2010 en la base de datos proporcionada por un hogar de paso de la ciudad de Cali. El análisis estadístico se realizó en R versión 3.2.0. Investigación sin riesgo según la resolución 8430 de 1993. Resultados El 76,9 % de los habitantes de calle reconoce que consume algún tipo de sustancia psicoactiva ilegal (SPAI). Las sustancias que presentaron mayor prevalencia de consumo en esta población fueron: la marihuana (51,2 %), el bazuco (44,6 %) y la cocaína (11,3 %). Se encontró que 28,6 % de los habitantes de calle consumen SPAI más de tres veces por día y que la principal vía de administración es fumada (54,7 %). La mitad de los entrevistados manifestó haber estado internado alguna vez en un centro de rehabilitación. Discusión Las cifras del presente estudio muestran que el consumo de SPAI afecta de manera significativa la población habitante de calle, siendo la marihuana y el bazuco las de mayor uso, situación compleja si se tiene en cuenta su fácil acceso y los graves efectos degenerativos que causan en la salud física y mental de quienes las consumen. Por esto es necesario apoyar iniciativas encaminadas a intervenir este fenómeno social.(AU)

Objective To determine the prevalence of self-reported use of illegal psychoactive substances in a homeless population of the city of Cali. Method Descriptive study of prevalence of period. The target population was 763 homeless people registered during 2010 in the database provided by a temporary shelter facility in the city of Cali. Statistical analysis was performed using R version 3.2.0. Research safe according to the resolution 8430 of 1993. Results 76.9 % of the homeless population recognizes that they consume some type of illegal psychoactive substance (IPAS). The substances with a higher prevalence of use in this population were: marijuana (51.2 %), the crack cocaine (44.6 %) and cocaine (11.3 %). 28.6 % of homeless people were found to consume IPAS more than three times a day and that the main route of administration is smoke (54.7 %). 50% of respondents reported having been hospitalized at some time in a rehabilitation center. Discussion The results in this study show that the problem of PASI consumption significantly affects the population of homeless people, with marijuana and crack cocaine being the most commonly used, which is a complex situation if the easy access of these substances and the severe physical and mental degenerative effects the cause in those who consume them are taken into account. Therefore it is necessary to support initiatives aimed at intervening in this social phenomenon.(AU)

Eficacia de la erradicación del Helicobacter pylori en la prevención del cáncer gástrico: Revisión sistemática y metanálisis / Efficacy of Eradicating Helicobacter Pylori for Prevention of Gastric Cancer: Systematic Review and Meta-Analysis

Esta revisión sistemática y metanálisis ha tenido como objetivo definir la eficacia de la erradicación de Helicobacter pylori sobre la prevención del cáncer gástrico. Realizamos una revisión de la literatura utilizando las principales bases de datos como PUBMED, EMBASE, CINAHL (EBSCO), Google académico, LILACS, Cochrane, ProQuest, disertaciones y tesis, obteniendo 3934 referencias, aplicando los criterios de inclusión y exclusión se seleccionaron 7 experimentos clínicos aleatorizados controlados. Utilizando la valoración de riesgo de sesgos de Cochrane, se evaluó la calidad de los estudios. El análisis estadístico se realizó con REVMAN 5.2. Con un total de 5.552 sujetos, se encontró desarrollo de cáncer gástrico en 55 (2,41%) de 2278 pacientes a quienes se erradicó el H. pylori y en 96 (4,22%) de 2.272 a quienes no se les erradicó, RR: 0,57 (IC= 0,42-0,79). El tiempo de seguimiento osciló entre 3 y 15 años. El análisis de heterogeneidad (Chi cuadrado) tuvo un valor de p no significativo (p= 0,48) confirmando la NO presencia heterogeneidad, permitiendo el metanálisis. Con el gráfico de embudo (Funnel Plot), se descartó el sesgo de publicación y el análisis de sensibilidad no mostró cambios significativos. En conclusión, este estudio sugiere que la erradicación del H. pylori disminuye el riesgo de cáncer gástrico, particularmente en poblaciones de alto riesgo, con una calidad de evidencia moderada. Recomendando en la práctica, la terapia de erradicación de H. pylori como medida de prevención.

The aim of this systematic review and meta-analysis is to determine the efficacy of eradicating Helicobacter pylori for prevention of gastric cancer. We conducted a literature review using major databases including PUBMED, EMBASE, CINAHL (EBSCO), Google Scholar, LILACS, Cochrane, ProQuest Dissertations and Theses. Seven experiments were selected out of the 3,934 references obtained by applying our inclusion and exclusion criteria. All seven were randomized controlled trials. The quality of the studies was assessed with the Cochrane assessment of risk of bias. Statistical analysis was performed with REVMAN 5.2. Out of a total of 5,552 subjects, 55 (2.41%) of the 2,278 patients who had had H. pylori eradicated developed gastric cancer, but 96 (4.22%) of the 2,272 patients who had not had the bacteria eradicated developed gastric cancer (RR: 0.57, CI = 0.42 to 0.79). Follow-up time ranged from 3 to 15 years. The analysis of heterogeneity (Chi square) had a non-significant p value (p = 0.48) confirming the absence of heterogeneity and allowing the meta-analysis. Funnel Plot analysis was used to discard publication bias, and the sensitivity analysis showed no significant changes. In conclusion, this study suggests that eradication of H. pylori reduces the risk of gastric cancer, particularly in high-risk populations with medium quality evidence. We recommend the practice of using eradicate of H. pylori as a preventive measure.