Structural features of the two-component systemLisR/LisK suggests multiple responses for the adaptation and survival of Listeria monocytogenes

Se caracterizó la estructura del sistema deregulación de dos componentes LisR/LisK de Listeriamonocytogenes. Se emplearon herramientas bioinformáticas ybases de datos para predecir la estructura e interacciones delas dos proteínas y se modelaron. Los resultados predicenque la proteína LisK está embebida en la membrana celulary su composición modular (dominios HAMP, histidinakinasa and ATPasa) está asociada a su autofosforilación(His-266). Un efecto estímulo respuesta determina lapropagación secuencial de la señal desde la membranacelular hacia componentes citoplasmáticos. A su vez, sepredice que LisR es una proteína citosólica con un dominiode receptor (homólogo a cheY) que incluye el residuofosfo-aceptor (Asp-52) y el dominio de unión a ADN,el cual puede permitir la transmisión de una respuestaespecífica a nivel transcripcional. Los componentes LisR/LisK han sido bioquímica y funcionalmente caracterizadosexperimentalmente en la patofisiología de otros bacilos. Espor ello, que la aproximación de los resultados basados enestructura-función podría facilitar el diseño de inhibidoresespecíficos...

Here, we characterized the structure of the two-component regulatory system, LisR/LisK, in Listeriamonocytogenes. To predict the structure of both proteins and the relationship between them, we employedseveral bioinformatic tools and databases. Based on our results, LisK protein is embedded in the cellmembrane and its modular composition (HAMP, histidine kinase and ATPase domains) is associatedwith its autophosphorylation (His-266). A stimulus-response likely determines the sequential signalpropagation from the bacterial cell surface to its cytoplasmic components. According to our results,LisR is a cytoplasmic protein with a receptor domain (homologous to CheY) that comprises a phosphoacceptorresidue (Asp-52) and a DNA-binding domain, which may allow the transmission of a specifictranscriptional response. LisR/LisK has been experimentally characterized both biochemically andfunctionally in other Bacilli pathophysiology; our structure-function approach may facilitate the design ofsuitable inhibitors...

O objetivo do estudo foi caracterizarestruturalmente o sistema de regulação de dois componentesLisR/LisK de Listeria monocytogenes. Foram utilizadasdiversas ferramentas de bioinformática e bancos de dadospara predizer a estrutura das duas proteínas, modelálase prever suas interações. Os resultados predizemque a proteína Lisk está incorporada na composição damembrana celular e sua composição modular (domíniosHAMP, histidina quinase e ATPase) está associada com asua autofosforilação (His-266). Um efeito de estímulo eresposta determina a propagação sequencial do sinal a partirda membrana celular em componentes citoplasmáticos. Osresultados predizem que LisR é uma proteína citosólicacom um domínio recetor (homólogo a CheY) que inclui oresíduo fosfo-aceitador (Asp-52) e o domínio de ligação aoADN, o que pode permitir a transmissão de uma respostaespecífica a nível transcricional. Como LisR/Lisk foi,química e funcionalmente, caracterizada experimentalmentena fisiopatologia de outros bacilos, esta abordagem baseadana estrutura-função pode facilitar a conceção de inibidoresespecíficos...

Estrategias metacognitivas y comprensión lectora en universitarios miembros de comunidades indígenas / Metacognitive strategies and reading comprehension in universitary students members of indigenous communities

Son escasos los estudios realizados sobre estrategias metacognitivas y compresión lectora en estudiantes indígenas, y menos aún en población universitaria. Este estudio descriptivo buscó identificar y analizar las estrategias metacognitivas usadas en relación con la comprensión lec-tora durante actividades estructuradas, con el fin de generar unas recomendaciones académicas generales para el programa institucional. El diseño metodológico incluyó informes verbales, en-trevistas, observación y cuestionarios para indagar sobre el uso de las estrategias metacognitivas de los universitarios. Participaron un grupo de 7 estudiantes miembros de comunidades indí-genas, 3 mujeres y 4 hombres, en edades comprendidas entre 17 y 22 años. Se encontró que los participantes conocen las estrategias metacognitivas que permiten mejorar el nivel de compren-sión lectora, aunque presentan dificultad en la planificación, supervisión y evaluación de estas. Se encontraron rasgos que denotan procesos de adaptación a una nueva cultura académica. Los resultados evidenciaron un cambio y una adaptación a nuevas culturas académicas, que traen consigo una serie de retos y dificultades que se reflejan en el rendimiento académico.

Studies of metacognitive strategies in relation to reading comprehension in college Indians stu-dents are very few. However, there are studies and research in basic secondary students. What drove this research in the university population to expand speech therapy practice. Identify and analyze students' metacognitive strategies in indigenous members of the Universidad Nacional de Colombia in relation to reading comprehension during structured activities. We conducted a descriptive study in which we used: verbal reports, interviews, observation and questionnaires to investigate the use of metacognitive strategies of Indian students. The study included a sample of 7 student members of indigenous communities, 3 women and 4 men, aged between 17 and 22. It was found that the participants know the metacognitive strategies that improve reading com-prehension level, but have difficulty in planning, monitoring and evaluation of these. Features were found which denote processes of adaptation to a new academic culture. The results are evidence of change and adaptation to new academic cultures, which brings a number of conse-quences that are reflected in academic performance.

Characterizatio of the adsorption process analogous peptides on alumina gel / Carcterización ddelproceso de adsorción de péptidos análogos sobree gel de alúmina / Caracterização do processo de adsorção peptídeos análogos em gel alumnaa

Peptide antigen adsorption on aluminum hydroxide gel must be characterized when formulating vaccines. In this work a peptide belonging to the amino-terminal region of Plasmodium falciparum Merozoite Surface Protein and its analogues have been characterized. The adsorption of 17 analogues on aluminum hydroxide which had greater than 10 mmol/L solubility was quantified at 298 K. Adsorption capacity and affinity constant parameters were calculated by applying the Langmuir's adsorption model. The results have been presented in three groups according to adsorption isotherm trajectory. The first group consists of analogues where the first organization of peptide molecules was presented at low concentrations, followed by a rapid increase in adsorption to high concentrations. The second group consists of analogues having an adsorption pattern showing the formation of a first layer at low peptide concentrations and a second layer at greater concentrations. The third group contains analogues whose adsorption involved the formation of two simple layers, this being differentiated from the second group in that after the second layer had been completed, the amount adsorbed grew notably with increased concentration. The results revealed a more complex pattern that monolayer or bilayer formation. This work constitutes the first approach towards establishing an adsorbed layer structure model using a peptide system.

La adsorción de un antígeno peptídico sobre gel de hidróxido de aluminio debe ser caracterizada para la formulación de vacunas. En este trabajo se caracterizó la adsorción de un péptido que pertenece a la región amino-terminal de la proteína de superficie del merozoite de Plasmodium falciparum y sus análogos. Se cuantificó la adsorción a 298 K sobre hidróxido de aluminio de 17 análogos con una solubilidad mayor de 10 mmol/L. Los parámetros de capacidad de adsorción y constante de afinidad se calcularon aplicando el modelo de adsorción de Langmuir. Los resultados se presentan en tres grupos, de acuerdo con la trayectoria de la isoterma de adsorción. El primer grupo consta de los análogos que presentaron la primera organización de las moléculas de péptido en concentraciones bajas, seguida de un rápido incremento de la adsorción a altas concentraciones. El segundo grupo de análogos tiene un patrón de adsorción que muestra la formación de una primera capa a concentraciones bajas de péptido y una segunda capa a concentraciones mayores. El tercer grupo contiene los análogos cuya adsorción muestra la formación de dos capas simples y se diferencia del segundo grupo en que después de la segunda capa, la cantidad adsorbida crece notablemente con el aumento de la concentración. Los resultados revelaron un patrón de adsorción más complejo que la formación de monocapa o bicapa. Este trabajo constituye la primera aproximación hacia el establecimiento de un modelo de estructura de la capa adsorbida en un sistema peptídico.

A adsorção de um antígeno peptídico sobre um gel de hidróxido de alumíniodeve de ser caracterizado para a formulação de vacinas. Neste estudo foi caracterizada a adsorção de um peptídeo que pertence á região amino-terminal da proteína de superfície do merozoito de Plasmodium falciparum e seus análogos. Foi quantificada a adsorção a 298 K sobre hidróxido de alumínio de 17 análogos com uma solubilidade maior de 10 mmol/L. Os parâmetros de capacidade de adsorção e constante de afinidade foram calculados aplicando o modelo de adsorção de Langmuir. Os resultados sãoapresentados em três grupos de acordo á trajectória da isoterma de adsorção. O primeiro grupo consta dos análogos que apresentaram a primeira organização das moléculas de peptídeoem concentraçõesbaixas, seguido de um rápido incremento da adsorção a altas concentrações. O segundo grupo de análogos tem um padrão de adsorção que mostra a formação de uma primeira camada a concentraçõesbaixas de peptídeo e uma segunda camada a concentraçõesmaiores. O terceiro grupo contém os análogos cuja adsorçãomostra a formação de duas camadas simples e é diferenciado do segundo grupo em que depois da segunda camada, a quantidade adsorvida cresce notavelmente com o aumento da concentração. Os resultados revelaram um padrão de adsorçãomais complexo que a formação de monocamada ou bicamada. Este trabalho constitui a primeira aproximaçãoao estabelecimento de um modelo de estrutura da camada adsorvida num sistema peptídico.

Construcción de una filogenia molecular para las especies de los géneros Klebsiella y Raoultella basada en los genes ARNr 16S y ARN polimerasa subunidad / Construction of a molecular phylogeny for klebsiella and Raoultella SP based on rRNA 165 and RNA polimarase subunit genes

Las bacterias de los géneros Raoultella y Klebsiella son patógenos oportunistas para las cuales no existe un sistema uniforme de clasificación taxonómica internacional. En el presente estudio se propone una filogenia molecular basada en el gen ribosomal 16S (ADNr 16S) y el gen codificante de la subunidad de la ARN polimerasa (rpoB) de los géneros Klebsiella y Raoultella con el fin de establecer relaciones evolutivas entre dichos géneros. Los resultados evidencian una agrupación acorde con la taxonomía y las propiedades bioquímicas características, reportadas en el Genbank. Se estableció una bifurcación en los árboles, lo cual confirma la separación de los géneros Klebsiella y Raoultella. Adicionalmente, se confirmó el carácter polifilético de K. aerogenes por el gen ADNr 16S y la agrupación de R. terrigena y K. oxytoca de acuerdo con el gen rpoB. La comparación entre los árboles obtenidos permitió determinar relaciones evolutivas entre las especies, a partir de los genes evaluados, lo cual refleja cambios aparentes a nivel taxonómico y corrobora la importancia del análisis a nivel de multilocus. Este tipo de estudios permite monitorear la estabilidad de los genotipos microbianos sobre la escala temporal y espacial, mejorar la precisión de las anotaciones taxonómicas (mejor descripción de taxones o subdivisiones genéticas) y evaluar la diversidad genética y adaptabilidad en términos de virulencia o resistencia a drogas.

The bacteria belonging to Raoultella and Klebsiella genera are opportunistic pathogens for which there is no consensus about a unique internationally taxonomic system. In this study, we suggest a molecular phylogeny based on 16S (rDNA 16S) ribosomal gene and the beta subunit RNA polymerase (rpoB) encoding gene of Klebsiella and Raoultella in order to set up evolutionary relationships among these genera. Results showed a cluster with similar biochemical and taxonomy characteristics in agreement to Genbank description, and a tree bifurcation which confirms the Klebsiella and Raoultella genera separation. Moreover, we verified the polyphyletic character of K. aerogenes by rDNA 16S and particularly the clustering for both R. terrigena and K. oxytoca based on rpoB gene. The evolutionary relationships recognition was obtained by comparison among the corresponding trees for both genes unraveling significant changes at taxonomic level and stressing the importance of multilocus analysis approach. These studies are useful for tracking the microbial genotype stability over time and space scale; as well as on improving taxonomic annotations (taxa descriptions and genetic subdivisions) and evaluation of genetic diversity in terms of virulence and drug resistance.