ABSTRACT
Subject(s)
Humans , Acinetobacter baumannii/genetics , Bacterial Proteins/genetics , Drug Resistance, Multiple, Bacterial/genetics , Genome, Bacterial , beta-Lactamases/genetics , Acinetobacter baumannii/drug effects , Brazil , Molecular Sequence Data , Polymerase Chain Reaction , Sequence Analysis, DNAABSTRACT
The high occurrence of nosocomial multidrug-resistant (MDR) microorganisms is considered a global health problem. Here, we report the draft genome sequence of a MDR Pseudomonas aeruginosa strain isolated in Brazil that belongs to the endemic clone ST277. The genome encodes important resistance determinant genes and consists of 6.7 Mb with a G+C content of 66.86% and 6,347 predicted coding regions including 60 RNAs. .
Subject(s)
Drug Resistance, Multiple, Bacterial/genetics , Genome, Bacterial , Pseudomonas aeruginosa/genetics , Sequence Analysis, DNA , Base Composition , Brazil , Cross Infection/microbiology , Genome Size , Open Reading Frames , Pseudomonas aeruginosa/drug effectsABSTRACT
O surgimento de bactérias Gram-negativas resistentes à drogas tem sido progressivo ealarmante. Entre os patógenos de particular importância está Pseudomonas aeruginosamultirresistentes à drogas (MDR). Um clone epidêmico de P. aeruginosa MDR produtor dametalo-beta-lactamase SPM-1, chamado clone SP (ST277), tem sido encontrado em diferentesestados brasileiros. O gene blaSPM-1 foi descrito em uma estrutura genética chamada ISCR4,responsável pela sua mobilização e expressão. Além do gene blaSPM-1, tem sido descrito, nesteclone, a presença de um integron de classe I carreando genes de resistência (In163) e umelemento genético ISCR14 carreando uma metilase de RNAr 16S (rmtD), que confereresistência a altas concentrações de aminoglicosídeos. Este tipo de associação resulta em umperfil de resistência extremamente preocupante. Assim, este estudo teve como objetivoinvestigar a contexto genético dos genes blaSPM-1 e rmtD, além de caracterizar mutações emgenes cromossomais associados a multirresistência a antimicrobianos em amostras de P.aeruginosa pertencentes ao clone ST277, através de Sourthen blot e sequenciamento de novageração. A partir de 50 amostras de P. aeruginosa MDR isoladas entre 2007 e 2010, foramselecionadas 13 amostras pertencentes ao ST277 (através de MLST) que apresentarampositividade para blaSPM-1 e/ou rmtD e In163 (através de PCR), sendo 12 do clone SP (A) euma de um clone diferente, M, através de PFGE. Através de restrição do DNA com asenzimas de restrição SpeI e XbaI, e posterior hibridação com sondas dos genes alvos (blaSPM-1,rmtD e In163) foi possível observar que os genes alvos encontravam-se em fragmentosdistintos e que a amostra do clone M apresentou um perfil de hibridação diferentes das demaisamostras demonstrando a ocorrência de vários rearranjos na mesma, indicando uma maiordistância evolutiva...