Respiratory infections and coinfections: geographical and population patterns / Infecciones y coinfecciones respiratorias: patrón geográfico y de circulación poblacional

Abstract Introduction: Acute respiratory infections are the second cause of mortality in children younger than five years, with 150.7 million episodes per year. Human orthopneumovirus (hOPV) and metapneumovirus (hMPV) are the first and second causes of bronchiolitis; type 2 human orthorubulavirus (hORUV) has been associated with pneumonia in immunocompromised patients. Objective: To define hOPV, hMPV and hORUV geographical distribution and circulation patterns. Method: An observational, prospective cross-sectional pilot study was carried out. Two-hundred viral strains obtained from pediatric patients were genotyped by endpoint reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: One-hundred and eighty-six positive samples were typed: 84 hOPV, 43 hMPV, two hORUV and 57 co-infection specimens. Geographical distribution was plotted. hMPV, hOPV, and hORUV cumulative incidences were 0.215, 0.42, and 0.01, respectively. Cumulative incidence of hMPV-hORUV and hMPV-hOPV coinfection was 0.015 and 0.23; for hOPV-hMPV-hORUV, 0.035; and for hORUV-hOPV, 0.005. The largest number of positive cases of circulating or co-circulating viruses occurred between January and March. Conclusions: This study successfully identified circulation and geographical distribution patterns of the different viruses, as well as of viral co-infections.

Resumen Introducción: Las infecciones respiratorias agudas constituyen la segunda causa de mortalidad en los niños menores de cinco años, con 150.7 millones de episodios anuales. Entre los principales agentes etiológicos están Orthopneumovirus (hOPV) y metapneumovirus (hMPV) humanos como primera y segunda causa de bronquiolitis, respectivamente; Orthorubulavirus humano tipo 2 (hORUV) se ha asociado a neumonía en pacientes inmunocomprometidos. Objetivo: Definir patrones de distribución geográfica y de circulación de hOPV, hMPV y hORUV. Método: Se llevó a cabo un estudio piloto transversal prospectivo observacional. Se genotipificaron 200 aislamientos virales de pacientes pediátricos mediante transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa en punto final (RT-PCR). Resultados: Se tipificaron 186 muestras positivas: 84 de hOPV, 43 de hMPV, dos de hORUV y 57 de coinfecciones. Se trazó la distribución geográfica. Las incidencias acumuladas de hMPV, hOPV y hORUV fueron de 0.215, 0.42 y 0.01, respectivamente. Las incidencias acumuladas de la coinfección de hMPV-hORUV y hMPV-hOPV fueron de 0.015 y 0.23; de hOPV-hMPV-hORUV, de 0.035; y de hORUV-hOPV, de 0.005. El mayor número de casos positivos de virus circulantes o cocirculantes se presentó entre enero y marzo. Conclusiones: Fue posible identificar patrones de circulación y distribución geográfica de los diferentes virus, así como de las coinfecciones virales.

Metapneumovirus humano: epidemiología y posibles tratamientos profilácticos / Human Metapneumovirus: Epidemiology and Possible Prophylactic Treatments

Resumen En el 2001, se identificó en Holanda al metapneumovirus humano (hMPV) como un "nuevo" agente etiológico causante de infecciones respiratorias agudas en infantes menores de 5 años; sin embargo, también se ha aislado en personas de la tercera edad e inmunocomprometidos. Este virus se considera como el segundo agente etiológico en enfermedades agudas del tracto respiratorio. En la actualidad, el costo estimado de las infecciones respiratorias agudas (IRA) en nuestro país es de 9,000 dólares estadounidenses por paciente hospitalizado. El hMPV es un miembro del género Metapneumovirus, familia Pneumoviridae, que pertenece al orden de los Mononegavirales, correspondiente a virus de ácido ribonucleico (RNA) monocatenario negativo, que consta de 8 genes en el orden 3'-N-P-M-F-M2-SH-G-L-5', y que codifica para 9 proteínas. De estas proteínas, la glicoproteína de fusión F está altamente conservada en el género Metapneumovirus y es el mayor determinante antigénico, y al no existir aún vacuna aprobada para este virus, se ha utilizado como un epítopo candidato para el diseño de una vacuna que confiera inmunidad al hospedero o como un blanco terapéutico en la creación de péptidos antivirales que inhiban la fusión del virus a su célula blanco y se evite la infección en sujetos de alto riesgo de contagio, ya que en la actualidad no se ha aprobado por la COFEPRIS ningún tratamiento profiláctico contra hMPV.

Abstract In 2001 in the Netherlands, Human metapneumovirus (hMPV) was identified as a "new" etiologic agent causing acute respiratory infections in children younger than 5 years old; however, it has also been isolated in the elderly and immunocompromised people. This virus is considered the second etiological agent in acute diseases of the respiratory tract. Currently, the estimated cost of IRAs in our country is of 9,000 USD per inpatient. hMPV is a member of the genus Metapneumovirus, family Pneumoviridae, and it belongs to the order Mononegavirales that is part of the negative single-stranded ribonucleic acid (RNA) virus, consisting of eight genes ordered: 3'-N-P-M-F-M2-SH-G-L-5 ', and which encodes for 9 proteins. Of these proteins, the F fusion glycoprotein is highly conserved in the genus Metapneumovirus, and is the major antigenic determinant, and because an approved vaccine doesn't exist, it has been used as a candidate epitope for the design of a vaccine that confers host immunity or as a therapeutic target in the creation of antiviral peptides that inhibit the fusion of the virus to its target cell and to avoid infection in subjects at high risk of contagion since there is currently none accepted by COFEPRIS as a prophylactic treatment against hMPV.

Detección y caracterización molecular de virus respiratorios causantes de infección respiratoria aguda en población adulta / Detection and molecular characterization of respiratory viruses that cause acute respiratory infection in the adult population

Resumen Introducción: Las infecciones respiratorias agudas son una de las principales causas de morbimortalidad en adultos mayores y pacientes con enfermedades crónicas. Dentro de los agentes etiológicos responsables se encuentran los virus respiratorios humanos, tales como: virus sincitial respiratorio, virus parainfluenza y metapneumovirus. Objetivo: Realizar un estudio de diagnóstico diferencial de virus respiratorios que circulan y cocirculan en una población adulta. Método: Se realizó un estudio tipo piloto en pacientes mayores de 18 años, que presentaron signos y síntomas sugestivos de infección respiratoria aguda y cuyo cuadro clínico no sobrepasara los 15 días de evolución; se realizaron ensayos de reacción en cadena de la polimerasa de punto final con el uso de oligonucleótidos específicos para el diagnóstico molecular. Resultados: Se tipificaron 72 especímenes de pacientes con una edad de 51.33 ± 19.33 años, con predominio del sexo femenino (4.5:1); originarios en su totalidad de la Ciudad de México; solo 22 fueron positivos para virus respiratorios, siendo en su mayoría infecciones por metapneumovirus. Conclusiones: El conocimiento de las cepas virales circulantes en la población permitirá determinar cambios que puedan declarar una alerta epidemiológica llevando a la mejor toma de decisiones en beneficio de los pacientes.

Abstract Introduction: Acute respiratory infections are one of the main causes of morbidity and mortality in older adults and patients with chronic diseases. Among the responsible etiological agents are human respiratory viruses, such as: respiratory syncytial virus, parainfluenza virus and metapneumovirus. Objective: To carry out a differential diagnostic study of respiratory viruses circulating and co-circulating in an adult population. Methods: A pilot study was conducted in patients older than 18 years, who presented signs and symptoms suggestive of acute respiratory infection and whose clinical picture did not exceed 15 days of evolution; end-point polymerase chain reaction assays were performed with the use of specific oligonucleotides for molecular diagnosis. Results: 72 specimens of patients with an age of 51.33 ± 19.33 years, with a predominance of females (4.5:1); original inhabitants of Mexico City; only 22 were positive for respiratory viruses, being mostly metapneumovirus infections. Conclusions: The knowledge of the circulating viral strains in the population will allow to determine changes that can declare an epidemiological alert leading to the best decision making for the benefit of the patients.

¿Es la patogenia del virus sincitial respiratorio humano un factor de riesgo para el desarrollo de asma infantil? / Is the pathogenesis of the human respiratory syncytial virus a risk factor for the development of childhood asthma?

Resumen El virus sincitial respiratorio humano (VSRh) es considerado como el principal agente causal de infecciones del tracto respiratorio en niños. Su presentación clínica varía en cuanto a la gravedad: desde infecciones no complicadas de la vía aérea superior en adultos y niños sanos, hasta bronquiolitis y bronconeumonía en niños con factores de riesgo y menores de 2 años. Perteneciente a la familia Pneumoviridae y al género Orthopneumovirus, el VSRh es un virus envuelto que contiene un genoma de ácido ribonucleico (RNA) monocatenario de polaridad negativa, que codifica para 7 proteínas estructurales (G, F, SH, M, P, N y L) y 4 no estructurales (NS1, NS2, M1, M2). La presencia del virus se ha considerado como factor de riesgo para el desarrollo de asma infantil, que es una enfermedad inflamatoria de la vía aérea caracterizada por episodios recurrentes de obstrucción de la vía aérea inferior ante estímulos ambientales generalmente inocuos. El riesgo de desarrollar asma aumenta si la primoinfección sucede a edad temprana y si hay factores de riesgo como prematuridad y broncodisplasia pulmonar. En México, debido a la morbilidad y mortalidad asociada al VSRh, y como profilaxis en pacientes de alto riesgo; desde el año 2008, se recomienda el uso del biofármaco Pavilizumab. El objetivo de la presente revisión es describir los factores asociados a la patogénesis VSRh que podrían estar implicados en el desarrollo del asma infantil y, con ello, plantear que población está en riesgo. Para estos fines, se presenta un breve análisis de la biología del virus, la respuesta inmune que se induce durante la infección, así como aquellos fármacos aprobados en México para el tratamiento y profilaxis de infecciones asociadas al VRSh.

Abstract The human respiratory syncytial virus (hRSV) is the main pathogen of respiratory tract infections in children. The severity of the infection is depending of its clinical presentation that is moving from uncomplicated upper airway infections, in healthy adults and children, to bronchiolitis and bronchopneumonia that could be developed, in presence of risk factors, in children younger than 2 years. The virus belongs to the Pneumoviridae family and Orthopneumovirus genus, it is an enveloped virus with a single-stranded RNA genome of negative polarity that is codifying 7 structural proteins (G, F, SH, M, P, N and L) and four non-structural proteins (NS1, NS2, M1, M2). The viral infection has been considered as a risk factor for the development of childhood asthma, which is the most common airway inflammatory disease in children and characterized, by recurrent episodes of lower airway obstruction, by harmless environmental stimuli. The risk increases if primary infection occurs at an early age and in risk factors as prematurity and pulmonary broncho-dysplasia. Due to the morbidity and mortality associated with hRSV, since 2008 it has been approved the use of biopharmaceuticals as Palivizumab for prophylaxis in high-risk patients. In the present review, the aim is to present those factors that could be involved in the development of childhood asthma and their possible link to the presence of hRSV. In addition, it is an intention for presenting the possible facts of the risks in the potentially infected population. For a better comprehension of the virus, it is presented a briefly analysis of the viral structure, the induced immune response against the viral infection and those drugs that are approved in Mexico for the treatment and prophylaxis against hRSV.