ABSTRACT
Resumen Escherichia coli diarreogénica comprende un grupo heterogéneo de cepas que presentan diversos factores de virulencia y causan diferentes síndromes diarreicos. Los patotipos más estudiados son Escherichia coli enteropatogénica (EPEC), Escherichia coli enterotoxigé-nica (ETEC), Escherichia coli enteroagregativa (EAEC), Escherichia coli enteroinvasiva (EIEC) y Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC). El objetivo de este estudio fue estimar la frecuencia de infección de los diversos patotipos de E. coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en el Hospital Sor María Ludovica de La Plata, Argentina, durante el período mayo-octubre de 2017. Los patotipos fueron detectados mediante la amplificación molecular de ocho genes de virulencia característicos. Se estudiaron las heces de 211 ninos (76% menores de 5 años). Se detectó infección con E. coli diarreogénica en el 12,3% (n = 26/211) de los niños con diarrea. Los patotipos identificados fueron EAEC, ETEC (todos lt positivos), EPEC y STEC (stx2 y eae positivos). El patotipo EAEC fue prevalente en todos los grupos etarios, mientras que los patotipos ETEC, EPEC y STEC solamente se observaron en niñnos menores de 5 anños. Este estudio constituye el primer reporte de detección por técnicas de amplificación molecular de Escherichia coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, de la zona de La Plata. Se necesitan estudios más amplios que incluyan la caracterización de los aislamientos abarcando un mayor número de genes, controles asintomáticos, distintas épocas del ano y población de diversas áreas geográficas para esclarecer la relevancia de la infección por E. coli diarreogénica en niños de Argentina.
Abstract Diarrheagenic Escherichia coli is a heterogeneous group of strains that presents various virulence factors and causes different diarrheal syndromes. The most studied pat-hotypes are enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), enteroaggregative Escherichia coli (EAEC), enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC). The objective was to estimate the frequency of infec-tion of diarrheagenic E. coli pathotypes in children with diarrhea, attended at the Sor María Ludovica Hospital in La Plata, Argentina, during the period May-October 2017. E. coli pathotypes were detected by molecular amplification of eight characteristic virulence genes. The feces of 211 children (76% under 5 years) were studied. Infection with diarrheagenic E. coli was detected in 12.3% of the samples. The pathotypes were EAEC (10.43%), ETEC (1.42%, all of them positive for thermolabile toxin), EPEC (0.95%) and STEC (0.47%, positive for Shiga toxin 2). The EAEC pathotype was prevalent in children of all age groups, while ETEC, EPEC and STEC were only observed in children under 5 years of age. This study constitutes the first report of diarrheagenic Escherichia coli detection in an outpatient pediatric population with diarrhea from La Plata, using molecular amplification techniques. Broader future studies, including the charac-terization of the isolates with the largest number of genes, asymptomatic controls, different times of the year and population from different geographic areas will be necessary to clarify the relevance of diarrheagenic E. coli infection in children from Argentina.
ABSTRACT
Resumen Las infecciones de las vías respiratorias inferiores se encuentran entre aquellas en las que el uso inadecuado de antimicrobianos es frecuente, por lo que es fundamental contar con una prueba diagnóstica rápida, sensible y específica. El sistema de FilmArray es un análisis de PCR múltiple con un panel de neumonía que incluye 26 microorganismos y 7 marcadores de resistencia antimicrobiana. Los objetivos de este estudio fueron: a) establecer la correlación entre los cultivos cuantitativos para agentes bacterianos de muestras de vías respiratorias inferiores (MRVB) y la detección fenotípica de mecanismos de resistencia con los correspondientes resultados de FilmArray; b) determinar el cambio terapéutico generado con el informe del resultado inmediato. Se incluyó un total de 194 MRVB correspondientes a 191 pacientes con neumonía y se documentaron 277 bacterias. FilmArray identificó 253/277 (91%) bacterias y 161/277 (58%) se aislaron del cultivo, 58 (23%) coincidieron con el mismo recuento, 116 (46,7%) dieron mayores recuentos con FilmArray y 72 (28,9%) fueron detectadas por este método pero el cultivo fue negativo. Se detectaron marcadores de resistencia antimicrobiana en 63 aislados, pero solo 28 fueron confirmados por métodos fenotípicos. Estos resultados podrían haber provocado cambios en el tratamiento antibiótico en el 74,6% (174/194). FilmArray es una herramienta útil para optimizar el tratamiento antimicrobiano en pacientes con neumonía.
Abstract Lower respiratory tract infections are among those in which the inappropriate use of antimicrobials is common, so it is essential to have a rapid, sensitive and specific diagnostic test. The FilmArray system is a multiplex PCR assay with a pneumonia panel that includes 26 microorganisms and 7 antibiotic resistance markers. The objectives of this study were: a) to establish the correlation between quantitative cultures for bacterial agents from lower respiratory tract samples (MRVB) and the phenotypic detection of resistance mechanisms with the corresponding results of FilmArray b) to determine the therapeutic change generated with the immediate result report. A total of 194 MRVB corresponding to 191 patients with pneumonia were included and 277 bacterial strains were documented. FilmArray identified 253/277 (91%) bacteria and 161/277 (58%) were isolated from culture, 58 (23%) matched the same count, 116 (46.7%) yielded higher counts with FilmArray, and 72 (28.9%) with negative culture were detected by this method. Antibiotic resistance markers were detected in 63 strains, but only 28 were confirmed by phenotypic methods. These results may cause changes in the antimicrobial treatment in 74.6% (174/194). FilmArray is a useful tool to optimize antimicrobial therapy in patients with pneumonia.
Resumo As infecções do trato respiratório inferior estão entre aquelas em que o uso inadequado de antimicrobianos é comum, por isso é essencial um teste diagnóstico rápido, sensível e específico. O sistema FilmArray é um ensaio de PCR multiplo com um painel de pneumonia que inclui 26 microrganismos e 7 marcadores de resistência antimicrobiana. Os objetivos deste estudo foram: a) estabelecer a correlação entre as culturas quantitativas de agentes bacterianos de amostras do trato respiratório inferior (MRVB) e a detecção fenotípica de mecanismos de resistência com os resultados correspondentes do FilmArray b) determinar a alteração terapêutica gerada com o relatório de resultado imediato. Um total de 194 MRVB correspondendo a 191 pacientes com pneumonia foram incluídos e 277 cepas bacterianas foram documentadas. FilmArray identificou 253/277 (91%) bactérias e 161/277 (58%) foram isoladas da cultura, 58 (23%) coincidiram com mesma contagem, 116 (46,7%) deram contagens mais altas com FilmArray e 72 (28,9%) foram detectados por este método, mas a cultura foi negativa. Marcadores de resistência antimicrobiana foram detectados em 63 cepas, mas apenas 28 foram confirmados por métodos fenotípicos. Esses resultados puderam causar alterações no tratamento antibiótico em 74,6% (174/194). FilmArray é uma ferramenta útil para otimizar a terapia antimicrobiana em pacientes com pneumonia..
Subject(s)
Pneumonia/diagnosis , Infections/diagnosis , Anti-Infective Agents/administration & dosage , Airway ResistanceABSTRACT
Las infecciones graves causadas por levaduras del género Candida son frecuentes en la población hospitalaria. Debido a las diferencias en la distribución de especies y la sensibilidad a los antifúngicos según el área geográfica y el tipo de paciente, resulta importante estudiar la epidemiología de cada institución. Con este propósito, hemos realizado un estudio retrospectivo y descriptivo sobre las candidemias ocurridas en el Hospital de Ninos «Superiora Sor María Ludovica¼ de la ciudad de La Plata. En un período de 6 años (2010-2015) se registraron 177 episodios de candidemia. Las especies predominantes fueron Candida albicans (45%) y Candida parapsilosis (28%). Las salas de internación con mayor cantidad de episodios fueron las unidades de terapia intensiva de pediatría, la neonatal y la cardiovascular (58%). En los casos donde se realizaron pruebas de sensibilidad a los antifúngicos, no se observó resistencia a la anfotericina B en todo el período y la resistencia a azoles se limitó a 4 aislamientos de especies menos frecuentes.
Serious infections caused by Candida yeasts are frequent in the hospital population. Due to differences in species distribution and antifungal susceptibility testing depending on the geographic area and the type of patient, it is important to study the epidemiology of each institution. For this purpose, we conducted a retrospective, descriptive study on the occurrence of candidemia in the Children's Hospital "Superiora Sor María Ludovica" of the city of La Plata. In a 6-year period (2010-2015), 177 candidemia episodes were recorded. The predominant species were Candida albicans (45%) and Candida parapsilosis (28%). The hospital wards with the highest number of candidemia episodes were the pediatric, neonatal and cardiovascular intensive care units (58%). No resistance to amphotericin B was observed throughout the period whereas resistance to azoles was limited to 4 strains of less frequent species.
Subject(s)
Child , Humans , Microbial Sensitivity Tests , Candidemia , Antifungal Agents , Pediatrics , Candida/isolation & purification , Candida/drug effects , Retrospective Studies , Candidemia/drug therapy , Antifungal Agents/therapeutic useABSTRACT
El tratamiento empírico con antibióticos adecuados requiere del conocimiento de la epidemiología bacteriana local. Para ello se realizo un estudio retrospectivo de la sensibilidad a los antibióticos de los microorganismos recuperados durante 2005 de los pacientes internados.Los microorganismos mas frecuentemente aislados fueron: Staphylococcus aureus (S. aureus) (24.1 %), Escherichia coli (E. coli) (15.8 %), Klebsiella pneumoniae (K. Pneumoniae) (12.4%) y Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) (10.1 %). En S. aureus la resistencia a meticilina supero el 40 %, con alto porcentaje de resistencia acompañante a otros antibióticos y total sensibilidad a TMS. La resistencia en E. coli y K. pneumoniae a cefalosporinas de tercera generación llego a niveles alarmantes (34.1% y 60%, respectivamente). P. aeruginosa mostró altos niveles para ceftazidima, carbapenemes y gentamicina (entre el 10% y 20%), mantenido total sensibilidad al colistin.Resulta evidente que el control de la infección Hospitalaria y el uso racional de los antimicrobianos son las únicas alternativas para impedir el incremento de la residencia de las bacterias.
Subject(s)
Child , Anti-Bacterial Agents , Escherichia coli , Hospitalization , Klebsiella pneumoniae , Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureusABSTRACT
El streptococcus pyogenes (estreptococo beta hemolítico grupo A) (S. pyogenes) es el microorganismo aislado mas frecuentemente en la faringo amigdalitis bacteriana. No existen hasta el momento cepas resistentes a penicilina, por lo tanto sigue siendo el antibiótico de elección para su tratamiento. En los últimos años se ha detectado un aumento de la resistencia a antibióticos de la familia de los macrólidos, tanto en nuestro país como en el resto del mundo. Debido a esta realidad decidimos vigilar que ocurre con los aislamientos de S. pyogenes obtenidos de muestras de hisopados de fauces en nuestro hospital.Se estudiaron 152 cepas entre mayo de 2002 y mayo de 2006. El cultivo y la identificación bioquímica se realizaron por la metodología convencional. Las pruebas de sensibilidad se ensayaron de acuerdo a las normas CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). Se realizo antibiograma por difusión en agar Mueller-Hinton con 5% de sangre ovina, probándose penicilina, eritromicina y clindamicina.Todos los aislamientos estudiados fueron sensibles a los antibióticos ensayados. Dado su bajo costo y su baja selección de resistencia en el resto de la flora oro-faríngia, la penicilina sigue siendo el antibiótico de elección para el tratamiento de las faringitis estreptocóccicas.