Evaluation of phenotypic and genotypic markers for clinical strains of acinetobacter baumannii

Acinetobacter baumannii es un importante patógeno oportunista. Este microorganismo adquiere con facilidad resistencia a antimicrobianos, involucrándose en infecciones nosocomiales generalmente graves. Estas características promueven el análisis epidemiológico de las infecciones provocadas por el mismo. Sin embargo, no hay aún un esquema de tipificación generalmente aceptado para este patógeno. Hemos evaluado en este trabajo diferentes procedimientos fenotípicos y genotípicos para la caracterización de aislamientos clínicos de A. baumannil aislados en un Hospital Público de Rosario (Hospital de Emergencias Clemente Alvarez, HECA), durante un período de cuatro años. Estos incluyeron PCR con oligonucleótidos degenerados (OD-PCR), PCR empleando cebadores homólogos a secuenciais palindrómicas extragénicas repetitivas (REP-PCR), electroforesis en geles de agarosa con campo pulsado (PFGE) y ensayo de susceptibilidad a antimicrobianos. OD-OCR y PFGE, entre los métodos individuales, fueron los métodos de mayor poder discriminatorio (índice discriminatorio, D, de 0.98 y 0.96; respectivamente). Por otra parte, el antibiotipo y REP-PCR presentaron menor discriminacíon (D: 0.86 y 0.77; respectivamente). La combinación de antibiotipo con cada uno de los procedimientos genotípicos mencionados originó un aumento importante en los índices discriminatorios de cada método. En particular, la combinación de OD-PCR y antibiotipo constituvó la mejor metodología para el estudio epidemiológico de A.baumannii. Así, la combinación de los procedimientos feno- y genotípicos mencionados permitó inferir las relaciones genéticas y la diseminación de clones de A.baumannii multirresistentes en el HECA en el período 1994-99. Una cepa particular, sensible a imipenem, estuvo ampliamente diseminada en el hospital durante 1994-1996. Por otra parte, un clon diferente, con resistencia adicional a carbapenemes, se diseminó rapidamente en el hospital en 1997, en coincidencia con la introducción de imipenem como terapia antibiótica.

Brote de infección por Enterococcus faecium resistentes a glicopéptidos en un hospital de Rosario, Argentina / Infection outbreak due to resistant Enterococcus faecium to glycopeptides in a Hospital of Rosario, Argentina

Enterococci causes serious illness in immunocompromised patients and in severely ill, hospitalized patients. They are commonly isolated from the human gastrointestinal tract, and resistance to vancomycin has increased in frequency during the past few years. We report three cases of nosocomial vancomycin resistant Entrococcus faecium (VRE) infections from September to December of 2000. A 54-year-old man presented post surgical wound infection due to VRE after 2 months of hospitalization. The second is a 65-year-old neutropenic patient with a medical history of acute myeloid leukemia and esophageal carcinoma. In this case, central venous catheter was colonized with EVR. The third, a 65-year-old woman who received therapy with ceftriaxone, ciprofloxacin and clindamicin had a urinary tract infection due to EVR. The three isolates were resistant to vancomycin (MIC value > 256 micrograms/ml). The DNA amplification pattern obtained by OD-PCR were similar in the three cases.

Characterization of clinical isolates of Streptococcus agalactiae by random amplified polymorphic DNA using degenerate oligonucleotides

Epidemioiogicai studies of Streptococcus agalactiae strains have been limited by the lack of sensitive and discriminatory methods for comparing clinical isolates. Serotyping, albeit a widely used methodology, has been shown to possess low capability to distinguish between epidemiologically related and unrelated isolates. We have employed here a random amplification of polymorphic DNA (RAPD) assay, using degenerate oligonucleotides as primers, to characterize S. agalactiae isolates from related or unrelated clinical samples. Epidemioiogically-related isolates (mother-infant pairs) showed identical profiles by this methodology. On the contrary, 12 epidemioiogically-unrelated isolates (ciassified into 5 different serotypes) resulted in ll distinct RAPD patterns. This suggests that the proposed modified RAPD assay provides a highly discriminatory tool for the analysis of genomic diversity among isolates from pathogenic organisms.