ABSTRACT
@#目的：通过检索挖掘多个肿瘤公共数据库中肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）的相关数据，从转录本、蛋白质、基因突变、蛋白相互作用及相应的信号通路和功能富集等不同层面，揭示BRD（bromodomain）蛋白家族与HCC的相关性，探索BRD蛋白家族作为HCC的肿瘤进展及预后判断的潜在生物标志物价值。方法：从UALCAN数据库中获取BRD蛋白家族所有成员在HCC患者组织样本中的mRNA表达数据和患者临床信息并进行相关性分析。从TCGA数据库中获取BRD蛋白家族mRNA表达水平与HCC患者预后的数据并进行相关性分析。从The Human Protein Atlas数据库中获取BRD蛋白家族在HCC组织和正常肝组织中的免疫组化结果并进行对比分析。使用STRING数据库获取BRD蛋白家族的相互作用蛋白网络，并利用CYTOSCAPE软件对获取的相互作用蛋白进行KEGG和GO分析。结果：BRD家族7个成员均在HCC组织中高表达（P<0.01），并且与HCC患者肿瘤分级和临床分期正相关（P<0.01）,同时BRD8和BRD9的低表达提示HCC患者预后较好（P<0.05）。BRD相互作用蛋白主要参与组蛋白乙酰化修饰，并高度富集于HCC相关的信号通路。TP53基因突变HCC患者的BRD1、BRD3、BRD4、BRD7、BRD8和BRD9表达水平显著高于非突变患者（P<0.05）。结论：BRD蛋白家族分子能够作为HCC患者肿瘤分级、临床分期和预后判断的潜在靶标。
ABSTRACT
SUMMARY: Axolotl limb regeneration is a fascinating characteristic that has attracted attention for several decades. Our previous studies on axolotl limb regeneration indicated that the satellite cells in the remnant muscles move distally into the blastema to regenerate new muscles that are separated by a gap from remnant muscles. Thereafter, the regenerative muscle fibers start to reconnect with remnant ones. In this study, the reconnection at the individual muscle fiber level was elucidated to test the hypothesis that this reconnection happens synchronously among involved muscles. Three pairs of EGFP+ mid-bud stage blastemas were transplanted onto freshly amputated stumps of RFP+ axolotls at the same thigh position to generate double fluorescence chimeric regenerative hindlimbs. These regenerative limbs were harvested very late far beyond they had reached the late differentiation stage. Fluorescence imaging of these limbs in cross sections revealed that in the proximal remnant part of the muscle fiber, reconnection occurred at a different pace among the muscles. In the major thigh muscle gracilis, the reconnection started from the periphery before it was completed. Furthermore, RFP+ muscle fibers contributed to muscle regeneration in the distal regenerative parts. Intriguingly, this red cell contribution was limited to ventral superficial muscles of the calf. This kind of double fluorescence chimeric limb regeneration model may help increase the understanding of the patterning of axolotl limb regeneration in late stages.
RESUMEN: La regeneración del miembro de Axolotl es una característica fascinante que ha llamado la atención durante varias décadas. Nuestros estudios previos sobre la regeneración del miembro del Axolotl indicaron que las células satélite en los músculos remanentes se mueven distalmente hacia el blastema para regenerar nuevos músculos que están separados por una brecha de músculos remanentes. A partir de entonces, las fibras musculares regenerativas comienzan a reconectarse con las restantes. En este estudio, se aclaró la reconexión a nivel de fibra muscular individual para probar la hipótesis de que esta reconexión ocurre sincrónicamente entre los músculos involucrados. Se trasplantaron tres pares de blastemas EGFP+ en la etapa de yema media en tocones recién amputados de axolotls RFP+ en la misma posición del muslo para generar miembros posteriores regenerativos quiméricos de fluorescencia doble. Estos miembros regenerativos se cosecharon muy tarde mucho más allá de haber alcanzado la etapa de diferenciación tardía. Las imágenes de fluorescencia de estos miembros en secciones transversales revelaron que en la parte remanente proximal de la fibra muscular, la reconexión se produjo a un ritmo diferente entre los músculos. En el músculo grácil, la reconexión comenzó desde la periferia antes de completarse. Además, las fibras musculares RFP+ contribuyeron a la regeneración muscular en las partes regenerativas distales. Curiosamente, esta contribución de glóbulos rojos se limitó a los músculos superficiales ventrales de la pantorrilla. Este tipo de modelo de regeneración quimérica de doble fluorescencia del miembro puede ayudar a aumentar la comprensión del patrón de la regeneración del miembro del Axolotl en etapas tardías.