Diversidad genética de la raza criollo limonero utilizando marcadores de ADN microsatélites / Genetic diversity of limonero creole breed using microsatellites molecular markers

Con la finalidad de estudiar la variabilidad genética de la raza Criollo Limonero considerada patrimonio Nacional y orientada a la producción de leche, se analizaron 95 animales puros utilizando 14 marcadores moleculares de ADN del tipo microsatélites. Los animales pertenecen al rebaño de la estación local Carrasquero, adscrita al Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas del estado Zulia (INIA-Zulia) y ubicado al noroeste del Estado. Para medir la diversidad genética se estimaron y discutieron los valores de heterocigosis observada (HO) y esperada (HE) total y entre familias (HMO, HME), probabilidad de exclusión (PE), Índice de Contenido Polimórfico (PIC) y número de alelos por locus. El número promedio de alelos por locus, HE y PIC fueron: 8,7; 0,689 y 0,651, respectivamente. Las HE variaron desde 0,355 hasta 0,787 y el PIC fluctuó de 0,302 a 0,757. El locus menos polimórfico fué el ILST5 y el más polimórfico fue el CSSM66. La PE con los 14 marcadores fue de 0,9962 y 0,9999 para uno y dos padres conocidos, respectivamente. Los resultados indicaron que este grupo de marcadores resultaron ser eficientes para realizar pruebas de paternidad en esta raza, así mismo se muestran que los niveles de heterocigosis indican la existencia de una alta diversidad molecular en la población estudiada, la cual deberá mantenerse como estrategia para la conservación del Criollo Limonero como recurso genético bovino de Venezuela para la producción animal en la región tropical.

In order to study the genetic variability of the Criollo Limonero Breed, a dairy breed considered National Patrimony of Venezuela, 95 purebred animals were analyzed using 14 DNA microsatellites. The animals belonged to the local Carrasquero station, assigned to the National Institute of Agriculture Research of Zulia (INIA-Zulia) and located in the northwest of Zulia State. Average values of observed and expected heterocigocities (HO, HE), between families (HMO, HME) respectively, exclusion probability (PE), Polymorphic Information Content (PIC) and number of alelles by locus were considered and discussed to measure the genetic diversity. The average of alleles by locus, HE and PIC were: 8.7; 0.689 and 0.651, respectively. HE ranged from 0.355 to 0.787 and PIC fluctuated from 0.302 to 0.757. The least polymorphic locus was ILST5 and the most polymorphic was the CSSM66. PE with the 14 markers was of 0.9962 and 0.9999 for one and both known parents, respectively. The results indicate that this set of markers are efficient to make paternity tests in this breed, it is also evident that there are heterozigosity levels indicating the existence of a high molecular diversity in this population, which should be maintained as a strategy for the conservation of the Criollo Limonero breed, a bovine genetic resource of Venezuela for animal production in the tropical regions.

Comparación de modelos para estimar parámetros genéticos de crecimiento en ganado mestizo doble propósito / Comparison of models to estimate genetic parameters of growth traits in dual purpose crossbred cattle

Los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para las características de crecimiento fueron estimados en dos rebaños afiliados a la fundación para la ganadería de doble propósito (GANADOBLE), ubicados en dos ambientes tropicales del estado Zulia, Venezuela. Los análisis fueron realizados bajo la metodología de los modelos mixtos, implementado por un modelo animal utilizando máxima verosimilitud restringida (REML), bajo el enfoque libre de derivadas, usando el paquete MTDFREML. Cuatro modelos mixtos fueron propuestos bajo un enfoque univariado aplicados sobre las características del peso al nacer (PN) y los pesos ajustados a 244 (P244); 365, (P365) y 548, (P548) días de edad, respectivamente. Se utilizaron 11587; 4412; 5774 y 3720 registros, correspondientes a PN, P244, P365 y P548, respectivamente. Los modelos difirieron para cada característica solamente en la parte aleatoria de los mismos: el modelo I incluyó solamente el efecto aditivo directo del animal; en el modelo II se incorporó además el efecto aditivo materno, el cual se asumió independiente del aditivo directo; en el modelo III, se admitió una covarianza entre los efectos genéticos aditivos directo y materno, de carácter proporcional a la matriz de relación y el modelo IV fue similar al III, pero se incluyó además el efecto ambiental permanente. Los efectos fijos incluidos en el modelo fueron: sexo del animal, grupo racial predominante, rebaño-año-época de nacimiento y el número de partos de la madre, el último solo para PN, P244 y P365. La prueba de la razón de verosimilitud (PRV) fue utilizada como criterio para la escogencia del modelo y fue realizada con el logaritmo de la función de verosimilitud de los modelos II vs. I, III vs. II y IV vs. III con la finalidad de encontrar la significancia estadística de: el efecto aditivo materno, la covarianza entre los efectos genéticos aditivos directo y el efecto ambiental permanente con el materno, respectivamente...

(Co)variance components and genetic parameters for growth traits were estimated in two dual purpose herds affiliated to the GANADOBLE foundation. The herds are located in two tropical environments in Zulia State, Venezuela. Animals were from a crisscrossing program between the Holstein and Brahman breeds mainly. Method of analysis was by Mixed Models, implemented under restricted Maximum Likelihood (REML) on an animal model, by using the derivative free algorithm and the MTDFREML package. Four models were proposed for the analyses under univariate mode and applied to the traits birth weight (PN), and adjusted weights at 244, 365 and 558 days of age (P244), (P365) y (P548) respectively. A total of 11587, 4412, 5774 y 3720 records were used for PN, P244, P365 and P548 respectively. Models differed for each trait only in the random part, as well as, in the assumptions made on them: model I was a simple animal model including the direct additive genetic effect; model II included the maternal additive effect as well, which was assumed to be independent of the first; in model III was admitted a covariance between the additive genetic effects proportional to the numerator relationship matrix; model IV was similar to model III but included the permanent maternal effect. The fixed part of the model included the effects: sex of animal, breed predominance, herd-year-season of birth and parity number of the dam, the later only for PN, P244 and P365. The likelihood ratio test (PRV) was performed based on the logarithm of the likelihood function from results of models II vs. I, III vs. II and IV vs. III in order to asses the significance of the additive maternal, the covariance between the additive effects and the maternal permanent effect. The PRV showed the necessity of incorporating the additive maternal along with the direct additive genetic effects on the prediction of the breeding values for PN, P244 and P365 (P<0.01)...