Web-tools for the genomic analysis of the 2022 Monkeypox virus global outbreak / Herramientas web para el análisis genómico del virus de la viruela símica durante el brote mundial de 2022

Abstract The resources and platforms available on the internet for collecting and sharing information and performing genomic sequence analysis have made it possible to follow closely the evolution the evolution of SARS-CoV-2. However, the current monkeypox outbreak in the world brings us back to the need to use these resources to appraise the extent of this outbreak. The objective of this work was an analysis of the information presented so far in the genomic database GISAID EpiPox™, using various tools available on the web. The results indicate that the monkeypox outbreak is referred as MPXV clade II B.1 lineage and sub-lineages, isolated from male patients mainly from the European and American continents. In the current scenario, the access to genomic sequences, epidemiological information, and tools available to the scientific community is of great importance for global public health in order to follow the evolution of pathogens.

Resumen Los recursos y plataformas disponibles en Internet para recopilar, compartir información y realizar análisis de secuencias genómicas han permitido seguir de cerca la evolución del SARS-CoV-2. El actual brote global de viruela del mono en el mundo, requiere de nuevo utilizar estos recursos para conocer el alcance de este brote. El objetivo de este trabajo fue un análisis de la información presentada hasta el momento en la base de datos genómica EpiPox™ de GISAID, utilizando diversas herramientas disponibles en la web. Los resultados indican que el brote de la viruela del mono o símica está referido al linaje y sub-linajes B.1 del clado II de MPXV, aislado principalmente de pacientes hombres de Europa y América. En el escenario actual, el acceso a las secuencias genómicas, la información epidemiológica, y las herramientas disponibles para la comunidad científica son de gran importancia para la salud pública mundial con el fin de seguir la evolución de los patógenos.

Sub-lineages of the Omicron variant of SARS-CoV-2: characteristic mutations and their relation to epidemiological behavior / Sub-linajes de la variante Ómicron del SARS-CoV-2: mutaciones características y su relación con el comportamiento epidemiológico

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of SARS-CoV-2, the coronavirus responsible for COVID-19, emerges, causing immediate concern, due to the explosive increase in cases in South Africa and a large number of mutations. This study describes the characteristic mutations of the Omicron variant in the Spike protein, and the behavior of the successive epidemic waves associated to the sub-lineages throughout the world. The mutations in the Spike protein described are related to the virus ability to evade the protection elicited by current vaccines, as well as with possible reduced susceptibility to host proteases for priming of the fusion process, and how this might be related to changes in tropism, a replication enhanced in nasal epithelial cells, and reduced in pulmonary tissue; traits probably associated with the apparent reduced severity of Omicron compared to other variants.

Resumen A finales de 2021 surge la variante Omicron del SARS-CoV-2, el coronavirus responsable de la COVID-19, causando preocupación inmediata, debido al aumento explosivo de casos en Suráfrica, y a su gran cantidad de mutaciones. Este estudio describe las mutaciones características de la variante Ómicron en la proteína de la Espiga (S) y el comportamiento de las sucesivas olas epidémicas asociadas a la circulación de sus sub-linajes en todo el mundo. Las mutaciones en la proteína S descritas están relacionadas con su capacidad para evadir la protección provocada por las vacunas actuales, así como su posible susceptibilidad reducida a las proteasas del hospedero para la preparación del proceso de fusión. Se infiere cómo esto podría estar relacionado con su cambio en el tropismo, con una replicación mayor en las células epiteliales nasales y menor en el tejido pulmonar, rasgos probablemente asociados a su aparente menor gravedad en comparación con otras variantes.

Detection of the Omicron variant of SARSCoV-2 by restriction analysis targeting the mutations K417N and N440K of the spike protein / Detección de la Variante Ómicron del SARS-CoV-2 por análisis de restricción de dos mutaciones de la proteína de la espiga

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of concern (VOC) emerges in South Africa. This variant caused immediate concern, due to the explosive increase in cases associated with it and the large number of mutations it exhibits. In this study, the restriction sites that allow detecting the mutations K417N and N440K in the Spike gene are described. This analysis allows us to propose a rapid method for the identification of cases infected with the Omicron variant. We show that the proposed methodology can contribute to provide more information on the prevalence and rapid detection of cases of this new VOC.

Resumen Para finales de 2021 surge la variante de preocupación (VOC por sus siglas en inglés) Ómicron en Sudáfrica. Esta variante causó de forma inmediata preocupación, debido al aumento explosivo de casos asociados a ella y al gran número de mutaciones que exhibe. En este estudio, se describen los sitios de restricción que permiten detectar dos de estas mutaciones en el gen de la espiga, las mutaciones K417N y N440K. Este análisis permite proponer un método rápido para la identificación de casos infectados con la variante Ómicron. Mostramos que la metodología propuesta puede contribuir a proporcionar más información sobre la prevalencia y a detectar rápidamente los casos de esta nueva VOC.

Metaplasia ósea del endometrio. Reporte de un caso y revisión de la bibliografía / Endometrial osseous metaplasia. Case report and literatura review

RESUMEN La metaplasia ósea endometrial es una patología poco común que se asocia a infertilidad secundaria. La mayoría de casos se presenta en mujeres con antecedente de gestación no evolutiva. La sospecha se hace mediante el hallazgo de un endometrio hiperecogénico que se asemeja a la imagen de un dispositivo intrauterino. El gold standard para el diagnóstico y tratamiento es la histeroscopia con el estudio histopatológico del material obtenido en el pre-cedimeinto. La importancia de su descripción es su presentación en una paciente nuligesta. Se describe el caso clínico y revisión de la literatura. Palabras claves: Metaplasia ósea endometrial, infertilidad secundaria, endometrio hiperecogénico

ABSTRACT Endometrial osseoum metaplasia is a rare condition associated with secondary infertility. Most cases occur in women with a histo-ry of non-evolutionary pregnancy. The suspicion is made by the finding of a hyperechoic endometrium that is similar of an intrauterine de-vice. The diagnostic and therapeutic gold standard is made by hysteroscopy with histopathological study of the material obtained in the precedure. The importance of this case is its presentation in a nulliparous patient. The clinical case and literature review are described

Presente y futuro de la terapia contra la hepatitis C / Present and future of therapy against hepatitis C

Un 3% de la población mundial está infectado por el virus de la hepatitis C (VHC). Un 70-80% de los individuos infectados desarrollan una infección crónica. No se dispone de una vacuna contra la hepatitis C y aproximadamente 50% de los pacientes infectados no responden a la terapia estándar basada en la combinación de interferón-alfa (IFN-α) y ribavirina. Recientemente se han hecho disponibles drogas antivirales de acción directa contra el VHC, que representan una mejora significativa en el éxito terapéutico. En el 2014, la agencia reguladora de drogas y alimentos de Estados Unidos (de sus siglas en inglés FDA), aprobó el uso de ledipasvir más sofosbuvir para el tratamiento crónico de la infección, siendo el primer régimen aprobado que no requiere la administración de IFN-α ó ribavirina. Estos avances hacen esperar la erradicación de esta enfermedad, si no fuera por los altos costos asociados al tratamiento. Una alternativa emergente es la terapia enfocada a la inhibición de blancos celulares que intervienen en la infección por el VHC. Esta terapia podría aumentar tanto el número de opciones para la terapia como la barrera genética para la selección de variantes virales resistentes. El tratamiento de la hepatitis C podría llevar al uso de la terapia enfocada en blancos celulares en combinación con la terapia tradicional, esperando un posible efecto sinérgico.

Around 3% of the human population is infected with hepatitis C virus (HCV) and 70-80% of these individuals develop a chronic infection. There is no vaccine available against HCV and up to 50% of the infected patients do not respond to standard therapy, based on the combination of interferon-alpha (IFN-α) and ribavirin. Recently, direct acting antiviral drugs against HCV have been made available for treatment, leading to a significant improvement in therapeutic success. In 2014, the U.S. Food and Drug Administration approved ledipasvir plus sofosbuvir to treat the chronic infection, the first IFN- and ribavirin-free approved treatment. With such treatment, the eradication of the disease would be feasible, although drug costs are high. Host target therapy represents an emerging alternative, based on the understanding of host factors involved in the HCV infection. This therapy might show at least two theoretical benefits, increasing the number of options for therapy and raising the genetic barrier for selection of resistant variants. New treatment regimens may consist of classical therapy combined with host target-based therapy, hopefully in a synergistic manner.

Perfil mineral de vacas mestiças Girolanda no período de transição em sistema semi-intensivo em duas estações do ano / Serum mineral profile of Girolanda cows during transition period in semi-intensive system in two seasons

Neste estudo foi avaliado o perfil metabólico de vacas leiteiras no período de transição durante o verão e o inverno. Foram utilizados 31 animais pluríparos mestiços girolando em cada estação, totalizando 62 vacas. No verão permaneciam em pasto com suplementação de silagem de milho e concentrado. No inverno, a exigência nutricional era suprida apenas com silagem de milho e concentrado. Foram feitas um total de 11 coletas de sangue de cada animal segundo o seguinte protocolo: quatro coletas pré-parto espaçadas semanalmente, no dia do parto e com 2, 5, 10, 15, 21 e 30 dias pós-parto. Foram avaliadas as concentrações de cálcio, fósforo e magnésio. Todos os analitos variaram em função do estatus fisiológico. As concentrações médias de cálcio e magnésio foram maiores no verão do que no inverno. Em ambas as estações, as menores concentrações médias de cálcio ocorreram próximas ao parto, sendo que 75% dos animais no inverno e 35,48% dos animais no verão estavam hipocalcêmicos. Apenas no décimo dia as concentrações de cálcio voltaram aos níveis do pré-parto, demonstrando que esse tempo é necessário para a adaptação da nova condição de lactante. As concentrações de magnésio foram menores no pós-parto do que no pré-parto nas duas estações, demonstrando a necessidade desse mineral para a produção de leite. As concentrações médias de magnésio permaneceram sempre dentro dos valores de referência, porém 19% dos animais aos dois dias pós-parto no inverno e 7% dos animais aos 10 dias pós-parto no verão tinham concentrações inferiores a esses limites. As concentrações de fósforo sofreram grande variação ao longo do peri-parto, porém sempre em níveis elevados, sendo que 49,8% dos animais no inverno e 37,3% no verão tinham níveis de fósforo acima dos valores de referência.

The metabolic profile of dairy cows in the transition period during summer and winter was evaluated. Were used 31 crossbred Holstein/Gir cows at each season, totaling 62 cows. During summer they remained in pasture with supplementation of corn silage and concentrate and in the winter, corn silage and concentrate was offered to furnish the nutritional requirements. A total of 11 blood samples from each animal were taken according to the following protocol: four collections weekly antepartum, at birth and at 2, 5, 10, 15, 21 and 30 days postpartum. Concentrations of calcium, phosphorus and magnesium were evaluated. All analytes varied according to the physiological status. The average concentrations of calcium and magnesium were higher in summer than in winter. In both seasons, the lowest mean calcium concentrations occurred near calving, and 75% of the animals in winter and 35.48% of the animals in the summer were hypocalcemic. Only on the tenth day postpartum, the calcium concentrations returned to levels of prepartum, demonstrating that this time is necessary for the adaptation of the new condition of lactating. Magnesium concentrations were lower postpartum than prepartum in both seasons, demonstrating the need for this mineral for the production of milk. The average concentrations of magnesium remained always within the reference values for the species, but 19% of the animals at two days postpartum in winter and 7% of the animals at 10 days postpartum in summer had concentrations below these limits. Phosphorus concentrations suffered large variation along the peri-partum, but always at high levels, with 49.8% of the animals in winter and 37.3% in summer had phosphorus levels above the reference range of the species.

Determinar el efecto de la fibra de (Brassica rapa L) Nabo silvestre sobre el peso, grasa corporal y proteínas totales en ratas (Rattus novergicus variedad Sprague dawley) con obesidad inducida, Arequipa 2015 / To determine the effect of (Brassica rapa L) fiber on wild weight, body fat and total proteins in rats (Rattus novergicus variety Sprague dawley) with induced obesity, Arequipa 2015

Este estudio fue diseñado para investigar la efectividad de la administración de micropulverizado de Brassica rapa L. (Nabo silvestre) en la disminución de la grasa corporal en ratas con obesidad inducida. Fue un estudio experimental realizado en 30 ratas macho adultas (Rattus norvergicus variedad Sprague Dawley).Los animales experimentales fueron sometidos a 30 días de engorde y posteriormente fueron tratadas con Brassica rapa L. (Nabo Silvestre) con dosis diarias de10, 25 y 50 mg/kg de peso durante 30 días. El porcentaje de grasa, medido utilizando el método Soxhlet, disminuyó significativamente de 18,17 ± 0,61% a 4,23 ± 0,39% en el tratamiento con 10 mg/kg. de peso de Brassica rapa L. (nabo silvestre) con 25 mg/kg. de Brassica rapa L. (nabo silvestre) el promedio fue 8,62 ± 0,46% y en el tratamiento con 50 mg/kg de Brassica rapa L. (nabo silvestre) el promedio fue de 11,50 ± 0,95%.Por lo tanto concluimos que la administración diaria de 10 mg/kg de peso Brassica rapa L. (nabo silvestre) es efectiva para la disminución de porcentaje de grasa corporal y puede ser utilizado como complemento para un programa de reducción de peso y grasa corporal.

Evaluación de la glándula mamaria y composición química de la leche en vacas primíparas mestizas lecheras en el preparto, hasta el quinto mes de la lactación / Mammary gland evaluation and milk chemical composition in crossbreed milking primaparas cpws before calving, up to the fifth month of lactation

La glándula mamaria y la composición química de los componentes de la leche en animales mestizos lecheros y su inter-relación con la aparición de problemas clínicos y productivos fueron evaluados en 10 vacas primíparas mestizas (Girolando), pertenecientes a una hacienda, situada en el municipio de Sabinópolis, estado de Minas Gerais, Brasil. Un examen clínico, la prueba de Califórnia Mastitis (CMT), el contaje celular somático (CCS) y la determinación de las concentraciones de los componentes de la leche a los días 17; 37; 54; 78; 110; 130 y 153 después del parto fueron realizados. En el examen clínico se detectaron lesiones de baja severidad en los pezones y al CMT, un 77,86% de los cuartos fueron negativos. El promédio y desviación estandar para el CCS fue de 167.857,1 (± 585.859,5) y para grasa, proteínas, lactosa y sólidos totales de 3,17 (± 0,74); 3,05 (± 0,29); 4,65 (± 0,22) y 10,38 (± 0,80) por ciento, respectivamente, valores estos semejantes a los reportados en la literatura. Se concluye que los resultados obtenidos fueron un buen indicador de la calidad de la leche producida y que la composición química de los componentes de la misma en vacas primíparas mestizas lecheras fue diferente del día 17 al 153 de la lactación.

To evaluate the mammary gland and the milk chemical composition in crossbreed milking primiparus cows and their interrelationship with clinical problems, 10 crossbreed primiparus cows (Girolando) from one farm, located in Sabinópolis Municipality, Minas Gerais State, Brasil were used to perform clinic evaluation of the mammary gland, California Mastitis Test (CMT), Somatic Cell Count (SCC) and determination of the concentration of the milk components, on days 17; 37; 54; 78; 110; 130 and 153 after calving. The clinical evaluation showed low percentage of injury in the teats, and the CMT was negative in 77.86% of the quarters. The mean values (±SD) for SCC were 167,857.1 (± 585,859.5) and for the milk components fat, protein, lactose and total solid 3.17 (± 0.74); 3.05 (± 0.29); 4.65 (±0.22) and 10.38 (± 0.80)%, respectively, alike values to reported in the literature. In conclusion, the results showed to be a good indicator of the milk quality and satisfactory to follow the milk chemical composition in crossbreed milking primiparus cows, which were different from day 17 to day 153 of lactation.

HIDROGENACIÓN SELECTIVA DE CITRAL EN FASE LÍQUIDA SOBRE CATALIZADORES Ir-Fe/TiO2 REDUCIDOS A ALTA TEMPERATURA / SELECTIVE HYDROGENATION OF CITRAL IN LIQUID PHASE OVER Ir-Fe/TiO2 REDUCED AT HIGH TEMPERATURE

En este trabajo se muestra la hidrogenación del citral sobre catalizadores de Ir e Ir-Fe/TiO2 reducidos a 773 K (HTR). La preparación de los catalizadores se realizó con soluciones acuosas de H2IrCl6 para obtener una carga de metal al 1% y por impregnación de FeCl3, lo cual permitió obtener los correspondientes sistemas bimetálicos. Todos los catalizadores presentaron una selectividad del 100% hacia los alcoholes insaturados (geraniol y nerol). La caracterización de los sólidos se efectuó mediante quimisorción selectiva de hidrógeno a 298 K, DRX, TPR y XPS. Los resultados de actividad intrínseca y selectividad se explican con base en los datos de caracterización que ponen en evidencia el efecto de una fuerte interacción metal-soporte (SMSI). También se muestra la descripción de un reactor tipo STR donde se efectuó la evaluación de la actividad intrínseca del catalizador.

The citral hydrogenation was studied over Ir-Fe/TiO2 catalysts reduced at 773 K (HTR: high temperature reduction). The catalysts synthesis was made using H2IrCl6 aqueous solution to get ca. 1% wt Ir load and by impregnating FeCl3 solution to obtain bimetallic catalysts. The results showed that all of the studied Ir/TiO2 and Fe-Ir/TiO2 catalysts display high selectivities (ca. 100%) towards the unsaturated alcohols (geraniol and nerol) during citral hydrogenation. Solids were charac-terized by selective H2 chemisorption, XRD, TPR and XPS. Intrinsic activity and selectivity data are explained in agreement to the characterization results showing the metal support interaction effect (SMSI). Also is showed the description of a reactor STR (stirred tank reactor) for the evaluation of the intrinsic catalytic activity.

Hidratación en el transoperatorio del recién nacido quirúrgico: diez años de experiencia / Hydration during surgical procedures in newborn: ten years of experience

Evaluar la utilización de la hidratación por el método de Berry modificado, en el transoperatorio de los recién nacidos que fueron sometidos a intervenciones quírurgicas desde enero de 1990 a diciembre de 2000. Estudio retrospéctivo, descriptivo de 525 recién nacidos, que ingresaron al Servicio de Cirugía Neonatal de la Maternidad "Concepción Palacios" y que requirieron intervención quirúrgica; en 426 de ellos, se utilizó la hidratación. Servicio de Cirugía Neonatal Departamento de Pediatría Maternidad "Concepción Palacios". Caracas. Los valores metabólicos y electrolíticos, determinados en el posoperatorio inmediato, en los 426 pacientes donde se utilizó la hidratación en estudio se mantuvieron estables. la glicemia fue normal en el 93.90 por ciento de los casos, al igual que el calcio en 96,60 por ciento, el fósforo en 99 por ciento, el sodio en 98,60 por ciento, y el potasio en 98,13 por ciento. El grupo que no recibió hidratación presentó importantes trastornos electrolíticos y metabólicos. El esquema de Berry modificado, utilizado en el transoperatorio, evita complicaciones posoperatorias debido a que logra dar estabilidad hidroelectrolítica y metabólica en el recién nacido quirúrgico

Parásitos en juveniles de Lutjanus griseus pisces: lutjanidae de la laguna de la restinga Isla de Margarita Venezuela / Parasites in juveniles of lutjanus griseus pisces: lutjanidae at la restinga lagoon Margarita Island Venezuela

Se estudió la fauna parasitaria en 70 juveniles de "pargo dientón", lutjanus griseus, capturados en la Laguna de la Restinga, Isla de Margarita, Venezuela. Los parásitos hallados fueron contabilizados para determinar prevalencia (P), intensidad (I) e intensidad media (IM) parasitarias, y grado de infección (GI). Algunos fueron observados in vivo y otros fijados en preparaciones permanentes, para su descripción e identificados. Se encontró un total de 8 especies. En branquias los protozoos Amyloodinium ocellatum (Mastigophora; P= 21,43 por ciento; GI= I), Trichodina sp. (Ciliophora; P= 82,86 por ciento; GI= I) y Cryptobia sp. (Mastigophora; P= 57,14 por ciento; GI=I), los crustáceos Lernanthropus rathbuni (Copepoda; P= 25,71 por ciento; I= 1-4; IM= 2) y Caligus bonito (Copepoda; P= 23,33 por ciento; I= 1-4; IM=2), y el platelminto Euryhaliotrema sp. (Mogenea; P= 95,7 por ciento; I= 3-70; IM= 28). En piel se encontró Argulus sp. (Branchiura; P= 1,42 por ciento; I=1; IM= 1), y en intestinos y ciegos pilóricos Siphodera vinaledwardsii (Diginea; P= 60 por ciento; I= 1-44; IM=13). A. ocellatum es considerada como la especie de mayor potencial para desarrollar estados patológicos agudos en L. griseus sometido a confinamiento

Prevalencia de los papilomas en la cavidad bucal producidos por el virus del papiloma humano V.P.H. en niños escolares de Guayaquil 1989-1990 / The prevalence of papillomas in the oral cavity caused by the human papillomavirus H.P.V. in schoolchildren from Guayaquil 1989-1990

El estudio de estos tumores de la cavidad bucal y estructuras adyacentes, constituye una fase importante de la odontología por el papel que desempeña el odontólogo en el diagnóstico y tratamiento de estas lesiones. El papiloma es un tumor que se origina en el tejido epitelial de la mucosa bucal, caracterizado por el aumento del volumen de las papilas. Son clínicamente visibles y fáciles de diagnosticar. En esta investigación se reporta la prevalencia de estas patologías en escolares de Guayaquil, llegándose a determinar una tasa de 13.3 por mil, así como el hallazgo de estas diversas lesiones como: hiperplasia epitelial focal, verrugas vulgares, papilomas simples o múltiples, condiloma acuminado y papiloma laríngeo. Todas estas lesiones etimológicamente se presentan por el "virus del papiloma humano" que fue identificado por primera vez en nuestro país por medio de microscopía electrónica. Existiendo serotipos virales que causan tumores premalignos y malignos

Infecciones post-operatorias en pacientes con abdomen agudo H.U.C. profilaxis antibioticoterapia precoz / Post-operative infections in acute-abdominal patients of the H.U.C. antimicrobial prophylaxis precocious

El análisis costo-beneficio de diferentes regimenes de antibióticos en esquema de profilaxis y terapéutica precoz fue estudiado en 88 pacientes intervenidos por abdomen agudo quirúrgico. No se encontró entre la presencia de infección pre-operatoria y la elevación de temperatura o del recuento de leococitos. La infección post-operatoria fue más frecuente en heridas contaminadas tales como: apendicitis, colecistitis y heridas traumáticas con ruptura de vícera hueca. El uso profiláctico de atibióticos disminuyó la frecuencia de infecciones de 16,33%a 40,55%. La estancia hospitalaria fue mayor en un promedio de 11 días en pacientes infectados