Estimation of genetic and phenotypic parameters for production traits in Holstein and Jersey from Colombia / Estimación de parámetros genéticos y fenotípicos para características de producción en ganado Holstein y Jersey Colombiano

Objective. Determine the genetic and phenotypic parameters for milk yield, fat percentage, protein percentage and somatic cell score. Materials and methods. 18134 lactation records were used to Holstein and 1377 lactations for Jersey in different herds. The (co) variance components and genetic parameters were estimated using the software Multiple Trait Derivative-Free Restricted Maximum Likelihood MTDFREML. Results. The Holstein and Jersey heritability's (and standard error) for milk yield were: 0.16 (0.082) and 0.15 (0.306), 0.30 (0.079) and 0.37 (0.319) for protein percentage, 0.32 (0.076) and 0.46 (0.313) for fat percentage and for somatic cell score were: 0.01 (0.054) and 0.01 (0.233), respectively. The largest genetic correlations were found between the percentage of fat and percentage of protein, with values of 0.82 (0.126) and 0.98 (0.852) for Holstein and Jersey respectively. The lowest correlations were between fat percentage and somatic cell score with -0.01 (1.147) and -0.01 (1. 734). Phenotypic correlations were generally found low and repeatability showed a significant effect of permanent environment on milk production per lactation. Conclusions. It is important to emphasize the development of research to help guide breeding programs in the tropics, using selection indices of multi-traits.

Objetivos. Determinar los parámetros genéticos y fenotípicos para producción de leche, porcentaje de grasa, porcentaje de proteína y puntaje de células somáticas. Materiales y métodos. Se utilizó información de 18134 lactancias para Holstein y 1377 para Jersey de diferentes hatos del departamento de Antioquia (Colombia). La determinación de los componentes de varianza, covarianza y los parámetros genéticos se realizó mediante el método de máxima verosimilitud restricta libre de derivadas usando el programa MTDFREML. Resultados. La heredabilidad y el error estándar en Holstein y Jersey para producción de leche fueron 0.16 (0.082) y 0.15 (0.306), para porcentaje de proteína 0.30 (0.079) y 0.37 (0.319), para el porcentaje de grasa de 0.32 (0.076) y 0.46 (0.313) y para el puntaje de células somáticas fue de 0.01 (0.054) y 0.01 (0.233), respectivamente. Las mayores correlaciones genéticas encontradas fueron entre porcentaje de grasa y porcentaje de proteína, con valores de 0.82 (0.126) y 0.98 (0.852) para Holstein y Jersey, respectivamente. La menores correlaciones fueron obtenidas entre porcentaje de grasa y puntaje de células somáticas con valores de -0.01 (1.147) y -0.01 (1.734), respectivamente. Las correlaciones fenotípicas encontradas por lo general fueron bajas y la repetibilidad evidenció un efecto importante del ambiente permanente sobre la producción de leche por lactancia. Conclusiones. El presente trabajo encuentra algunas diferencias con los reportes de parámetros genéticos en otros países, lo que resalta la importancia del desarrollo de trabajos de investigación que permitan orientar los programas de mejoramiento genético en el trópico.

Estimation and comparison of conventional and genomic breeding values in Holstein cattle of Antioquia, Colombia / Estimación y comparación de valores de cría convencionales y genómicos en ganado Holstein de Antioquia, Colombia

Objective. To estimate and compare breeding values (EBV) using the conventional method (BLUP) and genomic breeding values (MEBV and GEBV) estimated through bayes C method for milk yield and milk quality traits in dairy cattle in Antioquia, Colombia. Materials and methods. Two methods were used to estimate breeding values: BLUP to estimate conventional breeding value (EBV) and bayes C to estimate genomic values (MEBV and GEBV). The traits evaluated were: milk yield (PL), protein percentage (PPRO), fat percentage (PGRA) and score somatic cell (SCS). The methods (BLUP and bayes C) were compared using Person correlation (r p), Spearman rank correlation (r s) and linear regression coefficient (b). Results. The Pearson and Spearman correlations among EBVs and genomic values (MEBV and GEBV) (r pMEBV;EBV and r sGEBV;EBV) were greater than 0.93 and the linear regression coefficients of EBVs on genomic values (MEBV and GEBV) (bMEBV;EBV, and bGEBV;EBV) ranged between 0.954 and 1.051 in all traits evaluated. Conclusions. The predictions of genomic values (MEBV and GEBV), using bayes C method were consistent with the predictions of the EBVs estimate through the conventional method (BLUP) in conditions of high Colombian tropic, allowing to obtain high associations between the breeding values.

Objetivo. Estimar y comparar valores genéticos (EBV) usando el método convencional (BLUP) y valores genómicos (MEBV y GEBV) mediante el método bayes C en características de producción y calidad de la leche en ganado Holstein de Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. Fueron empleados dos métodos para estimar valores genéticos: BLUP para estimar valores genéticos (EBV) y Bayes C para estimar valores genómicos (MEBV y GEBV). Las características evaluadas fueron: producción de leche (PL), porcentaje de proteína (PPRO), porcentaje de grasa (PGRA) y puntaje de células somáticas (SCS). Los métodos BLUP y bayes C fueron comparadas usando correlación de Pearson (r p), correlación por rangos de Spearman (r s) y regresión lineal (b). Resultados. Las correlaciones de Pearson y Spearman entre los EBVs y los valores genómicos (MEBV y GEBV) (r pMEBV;EBV y r sGEBV;EBV) fueron mayores de 0.93 y los coeficientes de regresión entre los EBVs y los valores genómicos (MEBV y GEBV) (bMEBV;EBV, y bGEBV;EBV) oscilaron entre 0.954 y 1.051 en todas las características evaluadas. Conclusiones. La predicción de valores genómicos (MEBV y GEBV) usando el método Bayes C fue consistente con los EBVs estimados mediante el método BLUP en condiciones del trópico alto colombiano, permitiendo obtener altas asociaciones entre los valores genéticos.

Association of gene BoLA DRB32 with production traits in a dairy herd of Antioquia, Colombia / Asociación del gen BoLA DRB32 con características productivas en un hato lechero de Antioquia, Colombiaá

Objective. To determine the associations of BoLA DRB3.2 alleles present in Holstein and BON x Holstein cattle to production and milk quality traits in a dairy herd of Antioquia, Colombia. Materials and methods. Ninety-one cows, 66 Holstein and 25 BxH, were genotyped for the BoLA DRB3.2 gene, through PCR-RFLP technique. Furthermore, the association of the alleles of the gene BoLA DRB3.2 with milk yield (PL305), fat yield (PG305), protein yield (PP305) fat percentage (PGRA) and protein percentage (PPRO) were determined, using a general linear model. Results. Twenty-seven BoLA DRB3.2 alleles were identified; the most frequent alleles in Holstein were: BoLA DRB3.2*23, 22, and 24 with frequencies of: 0.159, 0.129, and 0.106, respectively and the most frequent alleles in BxH were: BoLA DRB3.2*23, 24 and 20 with frequencies of: 0.20, 0.140, and 0.120, respectively. Associations of BoLA DRB3.2 alleles with production and milk quality traits were also determined. In Holstein cows the BoLA DRB3.2*36 allele was associated with low PL305 (p≤0.01), high PGRA in multiparous cows (p≤0.05) and high PG305 in primiparous cows (p≤0.01). The BoLA DRB3.2*33 allele was associated with increased in the PPRO in multiparous cows (p≤0.01). In BXH cows only the BoLA DRB3*19 allele was associated with high PGRA (p≤0.05). Conclusions. The gene BoLA DRB3.2 shows high polymorphism in both groups; Holstein and BxH and some of its allelic variants were associated with production and milk quality traits.

Objetivo. Determinar la asociación de los alelos BoLA DRB3.2 presentes en vacas Holstein y BONxHolstein con características productivas y de calidad composicional de la leche en un hato lechero de Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. Fueron genotipificados 91 animales; 66 Holstein y 25 BONxHolstein (BxH) para el gen BoLA DRB3.2, mediante la técnica PCR-RFLP. También, se determinó la asociación de los alelos del gen BoLA DRB3.2 con producción de leche (PL305), producción de grasa (PG305), producción de proteína (PP305), porcentaje de grasa (PGRA) y porcentaje de proteína (PPRO); usando un modelo lineal generalizado. Resultados. Fueron identificados 27 alelos BoLA DRB3.2; los más frecuentes en Holstein fueron: BoLA DRB3.2*23, 22 y 24 con frecuencias de 0.159, 0.129 y 0.106 respectivamente y los más frecuentes para BxH fueron: BoLA DRB3.2*23, 24, 20 con frecuencias de 0.20, 0.140 y 0.120 respectivamente. También fueron determinadas asociaciones de los alelos BoLA DRB3.2 con características productivas y de calidad composicional de la leche. En vacas Holstein el alelo BoLA DRB3.2*36 fue asociado con baja PL305 (p≤0.01), alto PGRA en vacas multíparas (p≤0.05) y alta PG305 en vacas primíparas (p≤0.01). El alelo BoLA DRB3.2*33 fue asociado con alto PPRO en vacas multíparas (p≤0.01). En vacas BxH sólo el alelo BoLA DRB3.2*19 estuvo asociado con aumento en el PGRA (p≤0.05). Conclusiones. El gen BoLA DRB3.2 presentó un alto polimorfismo en ambos grupos genéticos; Holstein y BxH y algunas de sus variantes alélicas fueron asociadas significativamente con características productivas y características de calidad composicional de la leche.