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1.
Invest. clín ; 57(4): 402-408, dic. 2016. ilus
Article in English | LILACS | ID: biblio-841129

ABSTRACT

Besides the importance of Enterobacter cloacae species complex as a nosocomial pathogen, little is known about the frequency of each species/genotype. Here, we describe a strain of E. hormaechei subsp. hormaechei isolated from a bronchial secretion of a patient, in the Intensive Care Unit at the General Hospital of Cumaná, Venezuela, who died due to complications of his infection. The molecular identification was done by sequencing the 16S rRNA gene and comparing it to sequences from the GenBank. This strain showed resistance to multiple families of antibiotics (MDR), and the genes blaKPC and blaVIM were detected by PCR. This is the first time E. hormaechei has been identified in Venezuela.


A pesar de la importancia de las especies del complejo Enterobacter cloacae como patógeno nosocomial, poco se conoce sobre la frecuencia de cada especie/genotipo. Aquí se describe una cepa de E. hormaechei subsp. hormaechei aislada de una secreción bronquial de un paciente internado en la Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital General de Cumaná, Venezuela, quien murió producto de complicaciones de su infección. La identificación molecular fue hecha por secuenciación del gen ARNr 16S y porcomparación con las secuencias del GenBank. Esta cepa mostró resistencia a múltiples familias de antibióticos (MDR) y se detectaron los genes blaKPCyblaVIMpor PCR. Este es el primer reporte de E. hormaechei en Venezuela.


Subject(s)
Humans , Male , Middle Aged , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Enterobacter/classification , Enterobacter/drug effects , Enterobacteriaceae Infections/microbiology , Venezuela , Microbial Sensitivity Tests , Fatal Outcome , Enterobacter/isolation & purification
2.
Biomédica (Bogotá) ; 36(supl.1): 118-127, dic. 2016. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-783529

ABSTRACT

Introducción. Escherichia coli es uno de los principales agentes causales del síndrome diarreico agudo. Objetivo. Identificar grupos clonales de E. coli enteropatógena en 485 casos de diarrea aguda en niños entre 0 y 10 años de edad atendidos en centros de salud de los municipios de Arismendi, Benítez y Sucre del estado Sucre, Venezuela, entre marzo y diciembre de 2011. Materiales y métodos. Previo consentimiento informado, se recolectaron muestras fecales y se identificó E. coli mediante coprocultivo estándar y serología con antisueros polivalentes y monovalentes. Se aisló el ADN y se amplificaron los genes eae (intimina) y bfpA (bundlina) mediante dos pruebas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) múltiples. Resultados. En 39,6 % de los coprocultivos se determinó la presencia de infección bacteriana. La prevalencia de E. coli fue de 54,7 %; 82,9 % de estas cepas fue positivo por serología para los serogrupos y el serotipo evaluados, principalmente en niños entre los 0 y los 2 años (37,9 %). El 48,6 % de las cepas de E. coli amplificaron para el gen eae y, de estas, 58,8 % se clasificó como cepas de E. coli enteropatógena típica (eae+ y bfp+). El ECEP II fue el serogrupo más frecuente (38,7 %), con predominio de bacterias E. coli enteropatógenas típicas (60 %). El alelo ß de la intimina fue el más identificado (74,5 %) en las cepas positivas para el gen eae. Solo se identificaron cuatro cepas con el serotipo O157:H7 utilizando antisueros, las cuales no amplificaron mediante PCR para los genes eae y bfpA. Conclusiones. Este estudio demostró la importancia de aplicar pruebas moleculares en la identificación de las cepas de E. coli causantes de diarrea de diversa gravedad.


Introduction: Diarrheagenic Escherichia coli is an important causative agent of acute diarrheic syndrome. Objective: To identify clonal groups of enteropathogenic E. coli (EPEC), in 485 children with acute diarrhea aged 0 to 10 years attending health care centers in Arismendi, Benítez and Sucre municipalities, Sucre state, Venezuela, from March to December, 2011. Materials and methods: After obtaining the informed consent, stool samples were collected. Escherichia coli was identified using standard coproculture methods and serology with polyvalent and monovalent antisera. DNA was isolated, and eae (intimin) and bfpA (bundlin) genes were amplified through two multiplex polymerase chain reactions (PCR). Results: The presence of bacterial infection was determined in 39.6% of coprocultures. The prevalence of E. coli was 54.7%; 82.9% of these isolates were positive by serology for the evaluated serogroups and serotypes, which were mostly identified in children between 0 and 2 years (37.9%); 48.6% of E. coli strains amplified the eae gene; of these, 58.8% were classified as typical EPEC (eae+ y bfp+). EPEC II was the most common serogroup (38.7%), with predominance of typical EPEC (60%). In positive strains for eae gene, the ß intimin allele was the most frequently identified (74.5%). Only four strains with O157:H7 serotype were identified, which showed no PCR amplification of the eae and bfpA genes. Conclusion: This study showed the importance of molecular tests to identify diarrheagenic E. coli strains causing clinical conditions of varying severity.


Subject(s)
Enteropathogenic Escherichia coli , Diarrhea , Escherichia coli , Gastrointestinal Diseases , Polymerase Chain Reaction
3.
Rev. chil. infectol ; 33(5): 519-523, oct. 2016. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-844403

ABSTRACT

In order to study the clonal relationship and blaKPC gene detection in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae resistant to carbapenems, we analyzed 22 clinical isolates of K. pneumoniae with resistance to imipenem and/ or meropenem, isolated in the laboratory of bacteriology at the University Hospital "Antonio Patricio de Alcalá" (HUAPA) from the Cumana city, Sucre state, Venezuela, for a period of five consecutive years. Susceptibility to different antimicrobials was determined, and the presence of carbapenemases was detected by modified Hodge method, phenyl boronic acid synergy and combination discs. blaKPC gene detection was conducted by polymerase chain reaction and the clonal relationship was determined by pulsed field electrophoresis. High rates of antimicrobial resistance were found, five strains were negative, at least one phenotypic method, and all carried the blaKPC gene. Clonal spread was observed only in the intensive care unit (ICU), while in other services, polyclonality was found. We concluded that blaKPC gene is present in K. pneumoniae strains resistant to carbapenems isolated in the HUAPA and clonal spread it was only in the ICU.


Con el objetivo de estudiar la relación clonal y detección del gen blaKPC en aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenémicos, se analizaron 22 cepas clínicas de K. pneumoniae con resistencia a imipenem y/o meropenem, aisladas en el laboratorio de bacteriología del Hospital Universitario "Antonio patricio de Alcalá" (HUAPA) de la ciudad de cumaná, Estado Sucre, Venezuela, durante un período de cinco años continuos. Se determinó la susceptibilidad a diversos antimicrobianos, y se detectó la presencia de carbapenemasas por los métodos de Hodge modificado, sinergia con ácido fenil borónico y combinación de discos. La detección del gen blaKPC se llevó a cabo mediante la técnica de reacción de polimerasa en cadena y la determinación de la relación clonal se realizó por electroforesis de campo pulsado. Se encontraron elevados porcentajes de resistencia antimicrobiana, cinco cepas resultaron negativas, al menos, a un método fenotípico y todas portaban el gen blaKPC. Se observó diseminación de clones únicamente en la Unidad de cuidados Intensivos (UCI), mientras que, en otros servicios, se halló policlonalidad. Se concluye que el gen blaKPC se encuentra presente en cepas de K. pneumoniae resistentes a carbapenémicos aisladas en el HUAPA y que hubo diseminación clonal sólo en UCI.


Subject(s)
Humans , beta-Lactamases/genetics , Klebsiella Infections/microbiology , Carbapenems/pharmacology , Klebsiella pneumoniae/drug effects , Klebsiella pneumoniae/genetics , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Bacterial Proteins/genetics , Venezuela , DNA, Bacterial/genetics , Microbial Sensitivity Tests , Polymerase Chain Reaction , Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field , Clone Cells
4.
Rev. Soc. Venez. Microbiol ; 36(1): 10-15, jun. 2016. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-842860

ABSTRACT

Las infecciones por Klebsiella pneumoniae, constituyen un problema creciente en los centros hospitalarios. El objetivo de la presente investigación fue evaluar la resistencia a los aminoglucósidos, así como la presencia de genes que codifican enzimas modificadoras de aminoglucósidos (EMA) en aislados intrahospitalarios de Klebsiella pneumoniae. Se analizaron 56 cepas provenientes de pacientes con diagnóstico de infección intrahospitalaria del Hospital Universitario “Antonio Patricio de Alcalá”, durante el periodo enero-septiembre de 2008. Se determinó la susceptibilidad antimicrobiana mediante los métodos de difusión y dilución en agar, siguiendo los lineamientos del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio. Se empleó la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detectar los genes que codifican EMA. Se encontró resistencia a gentamicina y tobramicina en el 33,9% y 35,7%, respectivamente. Los fenotipos de resistencia a aminoglucósidos más frecuentes fueron I (ANGMKTob) y II (GMKTob). Se identificaron los genes aadA (21,4%), aac(3)-IIa (16,1%), aadB (14,3%), aac (6`)-Ib (3,6%) y aph (3`)-Ia (1,8%). En 10 cepas se observó la presencia de más de un gen y en 13 cepas se correlacionó el fenotipo con los genes encontrados. La resistencia a los aminoglucósidos en los aislados evaluados se debe, principalmente, a enzimas de tipo acetiltransferasas.


Klebsiella pneumoniae infection is a growing problem in hospitals. The objective of this study was to evaluate resistance to aminoglycosides and detection of genes encoding for aminoglycoside modifying enzymes (AME) in hospital isolates of K. pneumoniae. Fifty-six isolates from patients with diagnosis of nosocomial infection at the University Hospital Antonio Patricio de Alcala, during the period January to September 2008 were included for study. Antimicrobial susceptibility was determined by the methods of diffusion and agar dilution, following the Institute for Clinical and Laboratory Standards Guidelines. Genes encoding AME were determined by the polymerase chain reaction procedure. Resistance results for Gentamycin were 33.9% and for Tobramycin 35.7%. Aminoglycoside resistance phenotypes most frequently identified were I (ANGMKTob) and II (GMKTob). The genes involved were aadA (21.4%), aac(3)-IIa (16.1%), aadB (14.3%), aac (6`)-Ib (3.6%) y aph (3`)-Ia (1.8%) For 10 of the isolates studied more than one gene was identified. In 13 isolates the phenotype corresponded to the genes found. Aminoglycoside resistance in the isolates studied is mainly due to the presence of acetyltransferase enzymes.

5.
Invest. clín ; 56(2): 182-187, jun. 2015. ilus, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-841077

ABSTRACT

An 83-year-old male patient is admitted to the central hospital in Cumaná, Venezuela with severe urinary infection, history of hospitalizations and prolonged antimicrobial treatments. A strain of Enterobacter cloacae was isolated showing resistance to multiple types of antibiotics (only sensitive to gentamicin), with phenotype of serine- and metallo-carbapenemases. Both, blaVIM-2 and blaKPC genes were detected in the isolate. This is the first report of an Enterobacteriaceae species producing both KPC carbapenemase and VIM metallo carbapenemase in Venezuela. This finding has a great clinical and epidemiological impact in the region, because of the feasibility of transferring these genes, through mobile elements to other strains of Enterobacter and to other infection-causing species of bacteria.


En un paciente masculino de 83 años, que ingresó al Hospital de Cumaná, Venezuela, con diagnóstico de infección urinaria severa, antecedentes de hospitalización y diferentes tratamientos antimicrobianos durante largos periodos de tiempo, se aisló una cepa de Enterobacter cloacae, la cual evidenció resistencia a múltiples tipos de antibióticos (solo sensible a gentamicina) y con fenotipo de carbapenemasas de tipo serina y metalobetalactamasa. Los genes blaVIM-2 y blaKPC fueron detectados en esta cepa. Este representa el primer reporte de una especie de Enterobacteriaceae productora simultánea de carbapenemasa KPC y metalobetalactamasa VIM en Venezuela. Esto tiene un gran impacto clínico y epidemiológico en la región por la posibilidad de transferencia de estos genes a otras cepas de Enterobacter u otras especies bacterianas causantes de infecciones, por medio de elementos móviles.


Subject(s)
Aged, 80 and over , Humans , Male , beta-Lactamases/genetics , Enterobacter cloacae/isolation & purification , Enterobacteriaceae Infections/genetics , Urinary Tract Infections/microbiology , Urinary Tract Infections/drug therapy , Venezuela , Enterobacter cloacae/genetics , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Enterobacteriaceae Infections/microbiology , Enterobacteriaceae Infections/drug therapy , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
6.
Invest. clín ; 53(4): 365-377, dic. 2012. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-687429

ABSTRACT

The aim of this study was to identify the presence of Entamoeba histolytica and E. dispar by nested PCR in children attending the “Dr. Luis Razetti” Hospital, Barcelona, Anzoátegui State. Of the 1,141 fecal samples coproparasitologically evaluated by conventional microscopy, 150 were diagnosed positive for E. histolytica in 0-10 year-old-children, of both sexes. The signs, symptoms and a full coproparasitological report were obtained from all of these and nested PCR was performed to identify E. histolytica and E. dispar. The conventional microscopy results showed a diagnostic frequency of E. histolytica in 13.2% of the cases, of which 79.3% were positive only for this pathogen. However, nested PCR showed that of these, only 28% (42/150) were actually infected by Entamoeba spp., revealing a high over-diagnosis of E. histolytica. We also identified 9.3% E. histolytica, 4% E. dispar and 4.7% mixed infections. Diarrhea was the most common symptom, followed by abdominal pain and fever. Bloody stools were statistically associated with E. histolytica, but were also found for E. dispar infections. This study demonstrates that molecular techniques complementary to conventional methods enable the correct identification of Entamoeba spp., thus contributing to an improved epidemiological assessment of these parasites and implementation of the appropriate treatment.


Esta investigación planteó detectar por nested PCR Entamoeba histolytica y E. dispar en niños del Hospital “Dr. Luis Razetti” de Barcelona, estado Anzoátegui y su asociación con síntomas clínicos. De 1.141 muestras fecales evaluadas parasitológicamente por microscopía convencional, 150 fueron positivas a E. histolytica en niños de 0-10 años y de ambos sexos. Se obtuvo información de signos, síntomas y reporte parasitólogico completo de cada uno de los pacientes y se realizó nested PCR para identificar E. histolytica y E. dispar. Los resultados de la microscopía convencional demostraron una frecuencia de diagnóstico de E. histolytica del 13,2%. En el 79,3% de estas positivas se reportó esta especie como único patógeno. Sin embargo, la nested PCR evidenció que sólo 28,0% (42/150) de las mismas presentaron infecciones por Entamoeba, evidenciándose un elevado sobrediagnóstico de E. histolytica. Además se identificaron 9,3% infecciones por E. histolytica, 4,0% E. dispar, y 4,7%infecciones mixtas. La diarrea fue el síntoma más común, seguido de dolor abdominal y fiebre. La presencia de sangre demostró asociación estadísticamente significativa con E. histolytica, pero también se reportó en infecciones por E. dispar. Este estudio demuestra que las técnicas moleculares complementarias a los métodos convencionales, permiten la identificación correcta de especies de Entamoeba, contribuyendo con una mejor evaluación epidemiológica de estos parásitos y la aplicación adecuada del tratamiento.


Subject(s)
Child , Child, Preschool , Female , Humans , Infant , Male , Entamoeba histolytica/genetics , Entamoeba histolytica/isolation & purification , Entamoebiasis/diagnosis , Feces/parasitology , Polymerase Chain Reaction , Venezuela
7.
Invest. clín ; 51(4): 445-455, dic. 2010. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-630903

ABSTRACT

El objetivo de este trabajo fue evaluar la resistencia a isoniacida (INH), rifampicina (RIF), estreptomicina (STR) y etambutol (EMB) de 59 cepas de Mycobacterium tuberculosis, aisladas en el período agosto 2005-diciembre 2006, en el estado Sucre, Venezuela, empleando el método de proporciones de Canetti y de nitrato reductasa. Se encontró 6,3% de resistencia primaria y 14,3% de adquirida. Una cepa fue considerada MDR, al presentar resistencia a RIF e INH. Se comparó la prueba de nitrato reductasa con el método de las proporciones, encontrándose 100% de concordancia entre los resultados de los dos métodos para INH, RIF y EMB, y 95,65% para STR. Además, la prueba nitrato reductasa produjo resultados en 10 a 14 días, comparado con 42 días para el método de proporciones, por lo que la primera se postula como una alternativa muy valiosa para acortar el tiempo de respuesta en la valoración de la susceptibilidad de M. tuberculosis. La secuencia del gen rpoB en la cepa resistente a RIF demostró la presencia de una mutación no descrita anteriormente en la región hipervariable de 81 pares de bases, donde se ha reportado el mayor número de mutaciones de cepas resistentes a RIF. Esta mutación produjo un cambio en el codón 456 de TCG > CAG. Al comparar nuestros resultados con los hallados en el último estudio de prevalencia de resistencia realizado en el estado, se demuestra una disminución en la circulación de cepas resistentes en la zona de estudio.


The objective of this study was to evaluate the resistance to isoniazid (INH), rifampicin (RIF), streptomycin (STR) and ethambutol (EMB), with the Canetti’s proportions method (PM) and the nitrate reductase assay (NRA) of 59 clinical strains of Mycobacterium tuberculosis, isolated in the period of august 2005 to december 2006, in Sucre state, Venezuela. Primary and acquired drug resistance was 6.3% and 14.3%, respectively. Only one strain was found to be multidrug resistant (MDR). The overall agreement between the NRA and PM was 100% for INH, RIF and EMB, and 96% for STR. The time to obtain results was 10 to 14 days for the NRA, compared to 42 days for the PM. The NRA was easy to perform and therefore represents a useful tool for rapid and accurate determination of drug-resistant M. tuberculosis. The sequence of the rpoB gene of the RIF resistant strain demonstrated a never described mutation (change in the codon 456; TCG > CAG) in the hypervariable region of 81 base pairs where most of the mutations of the RIF resistant strains have been reported. Comparison of our results with those of the last resistance prevalence study carried out in the years 1998-1999, shows a decrease in the studied area.


Subject(s)
Humans , Antitubercular Agents/pharmacology , Drug Resistance, Microbial , Microbial Sensitivity Tests/methods , Mycobacterium tuberculosis/drug effects , Tuberculosis/microbiology , Base Sequence , Bacterial Proteins/analysis , Bacterial Proteins/genetics , Drug Resistance, Multiple, Bacterial/genetics , Ethambutol/pharmacology , Isoniazid/pharmacology , Molecular Sequence Data , Mutation, Missense , Morbidity/trends , Mycobacterium tuberculosis/enzymology , Mycobacterium tuberculosis/genetics , Nitrate Reductase/analysis , Point Mutation , Prevalence , Rifampin/pharmacology , Sequence Alignment , Sequence Homology, Nucleic Acid , Sputum/microbiology , Streptomycin/pharmacology , Tuberculosis, Multidrug-Resistant/epidemiology , Tuberculosis, Multidrug-Resistant/microbiology , Tuberculosis/epidemiology , Venezuela/epidemiology
8.
Invest. clín ; 50(2): 187-201, jun. 2009. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-564809

ABSTRACT

Para determinar la relación entre parámetros hematológicos, parasitemia y episodios maláricos, se evaluaron 59 individuos de ambos sexos, infectados con Plasmodium vivax y 30 controles del estado Sucre. Se extrajeron muestras de sangre por punción venosa y del lóbulo de la oreja el día del diagnóstico, a los 8 y 30 días postdiagnosis. Se realizó hematología completa, diagnóstico microscópico y molecular (PCR) y grado de parasitemia. Se encontraron diferencias significativas por sexo para la hemoglobina, eritrocitos y hematocrito (p < 0,01 en los tres análisis). Estos valores en los hombres disminuyeron para el día 8 del tratamiento con respecto al día 0 (p < 0,001; p = 0,006 y p = 0,025, respectivamente). En las mujeres, se observaron diferencias sólo entre los controles y los pacientes a las fechas de muestreo para hemoglobina y hematocrito (p < 0,001). El número promedio de los leucocitos para el día diagnóstico se ubicó dentro de los parámetros de referencia, pero significativamente por debajo (p < 0,001) de los del grupo control y de los obtenidos para durante y después del tratamiento. Los valores de eosinófilos se observaron por encima de los parámetros normales en los controles y los pacientes durante y después del tratamiento. Se observó trombocitopenia el día diagnóstico, pero a la semana del tratamiento los valores aumentaron significativamente (p < 0,001). La correlación de los parámetros evaluados con la parasitemia demostró una relación negativa con las plaquetas, y una positiva con la diferencia de plaquetas entre el día diagnóstico y día 8 de tratamiento (p = 0,014). Esta diferencia fue el único parámetro que se correlacionó con los episodios maláricos (p = 0,040). La trombocitopenia demostró ser un indicador de malaria aguda.


In order to determine the relationship between hematological parameters, parasitaemia and malaria episodes, we evaluated 59 individuals of both sexes, infected with Plasmodium vivax and 30 controls from Sucre state. Blood samples were obtained by venous puncture and from the earlobe at day of diagnosis, 8 and 30 days post-diagnosis. We carried out hematological analysis, microscopic and molecular (PCR) diagnosis and the parasitaemia was calculated. There were significant differences by sex for hemoglobin, erythrocytes and hematocrit (p < 0,01 in all three analysis). These values in males, decreased by day 8 with respect to day 0 (p < 0,001; p = 0,006 y p = 0,025, respectively). In females, significant differences were only seen in hemoglobin and hematocrit between controls and patients (p < 0,001). The average number of leucocytes at the day of diagnosis was within the reference values, but slightly lower compared to the controls and the samples during and after the treatment. The average proportion of eosinophils was higher than normal for both, controls and patients, during and after the treatment. Thrombocytopenia was observed at diagnosis, but a week after, the values increased significantly (p < 0,001). There was an inverse relationship between parasitaemia and platelet count and a direct relationship between the first and hemoglobin at day 0, as well as with the difference in platelet counts between day 0 and day 8 (p = 0,044 y p = 0,014, respectively). This difference was the only parameter related to the number of malaria episodes (p = 0,040). Thrombocytopenia showed to be an indicator of acute malaria.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Hematologic Agents/analysis , Malaria , Malaria, Vivax/therapy , Thrombocytopenia/pathology
9.
Genet. mol. biol ; 31(4): 850-856, Sept.-Dec. 2008. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-501447

ABSTRACT

We investigated the effects of family selection on the growth rates of four genetic lines of Litopenaeus vannamei, the Pacific white shrimp, from Venezuela. The mean family weight at selection was 16.79 g and the mean growth rate was 0.169 g d-1 at a mean age of 138 days. The mean growth rates per generation were 0.141 g d-1 for the parental generation (P0), 0.173 g d-1 for the F1 and 0.191 g d-1 for the F2. Survival varied from 83.3 percent to 94.4%. There were statistically significant differences between lines, with lines B and C, growing at higher temperatures and lower salinities, showing the fastest growth. Regression analysis between growth rate and age for each genetic line showed high r² values, but smaller than those shown between growth rate and generation. The mean heritability (h²) estimated for growth rate was 0.25 ± 0.04, with line per generation values ranging from 0.18 to 0.38. The mean heritability for growth rate per line showed some variation but there was no correlation between heritability and growth rate. Females showed a greater gain in growth rate per generation than males due to their faster growth when they were older. This study shows the high potential of these L. vannamei populations for the future of shrimp culture in the Americas.


Subject(s)
Animals , Penaeidae/growth & development , Selection, Genetic , Decapoda/growth & development , Genetic Variation , Heredity , Penaeidae/genetics , Regression Analysis , Venezuela
10.
Invest. clín ; 49(2): 225-237, jun. 2008. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-518684

ABSTRACT

Se realizó un estudio epidemiológico y molecular de cepas de E. histolytica y E. dispar en 428 pacientes con sintomatología gastrointestinal de diarrea, de distintos centros de salud en Cumaná, estado Sucre, Venezuela. Las muestras se procesaron a través de: examen directo con solución salina fisiológica al 0,85% y coloración temporal de lugol, coloración tricrómica y método de concentración de Ritchie, y para el asilamiento de quistes, se uso el gradiente de sacarosa. Para la detección molecular, se amplificó la subunidad pequeña de ARN 16S por Nested-Multiplex PCR. La prevalencia de E. histolytica/E. dispar por el método directo fue de 20,09 por ciento, mientras que por Ritchie se obtuvo un 13,79 por ciento y con coloración tricrómico un 12,15 por ciento. Por PCR la prevalencia para E. histolytica fue de 6,31 por ciento y de E. dispar de 4,44 por ciento, detectándose cuatro casos de infecciones mixtas. La secuenciación de los fragmentos amplificados de E. histolytica indicó un 100 por ciento de homología con las secuencias de cepas de Mérida (Venezuela), Estados Unidos, Brasil, México y del GenBank. Las infecciones por E. histolytica y E. dispar estuvieron asociadas estadísticamente con la edad, pero no con el sexo. La presencia de sangre, moco y dolor abdominal resultaron asociadas sólo en los infectados con E. histolytica. La moderada prevalencia de E. histolytica indica su carácter endémico en esta población y advierte sobre el potencial problema como factor de morbilidad y mortalidad en el estado Sucre. La frecuencia de E. dispar en esta población hace presumir que existe una sobreestimación en el diagnóstico de amibiasis con sus implicaciones clínicas y epidemiológicas y demuestra el poco conocimiento sobre las prevalencias reales de este protozoario. La PCR permitió la identificación diferencial de E. histolytica y E. dispar, así como la presencia de infecciones mixtas, por lo cual es una herramienta indispensable para estudios epidemiológicos.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Diarrhea/epidemiology , Diarrhea/parasitology , Entamoeba histolytica/parasitology , Intestinal Diseases, Parasitic/epidemiology , Sequence Homology
11.
Rev. cient. (Maracaibo) ; 18(1): 7-11, ene.-feb. 2008. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-548666

ABSTRACT

El Virus de la Necrosis Infecciosa Hipodérmica y Hematopoyética (IHHNV) es un virus que causa altas mortalidades en Litopenaeus stylirostris y el síndrome de la deformidad del rostro (RDS) en L. vannamei. Con el fin de determinar la presencia del IHHNV en camarones cultivados asintomáticos, se analizaron muestras de camarones cultivados L. vannamei de cinco granjas camaroneras localizadas en el oriente y occidente de Venezuela. Se analizaron un total de 90 muestras por granja, de tres tallas: PL8-PL15, juveniles de 5-6 g y de 12 a 15gde peso. El ADN total fue extraído de muestras homogeneizadas de pleópodos, mediante el uso de kit comerciales. La detección del IHHNV fue realizado, tanto por hibridación mediante “Dot Blot” como por PCR utilizando los kits de Diagxotics ShrimpProbe y ShrimPCaRe Simplex, respectivamente. Se detectó un total de siete muestras positivas, provenientes de cuatro (B, C, D y E) de las cinco granjas camaroneras estudiadas, variando las prevalencias entre 1,1 y 3,3 por ciento por granja. Todas las muestras positivas correspondieron a individuos de 5 a 6 g de peso. La técnica diagnóstica por PCR fue más sensible para la detección del IHHNV que la hibridación por “Dot Blot”. La presencia del IHHNV en camarones asintomáticosy a bajos niveles de prevalencia puede implicar que las poblaciones de camarones utilizadas para cultivo en Venezuela son resistentes o en todo caso tolerantes a este virus.


The Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus (IHHNV) is a pathogen that may cause high mortalities in Litopenaeus stylirostris and the Runt Deformity Syndrome (RDS) in L. vannamei. In order to detect the presence of IHHNV in asymptomatic, cultivated shrimp, it were analyzed shrimp samples of cultivated L. vannamei from 5 farms located in the east and west costs of Venezuela. A total of 90 samples per farm were analyzed, using three sizes: PL8-PL15, juveniles of 5-6 g and of 12-15 g of weight. The DNA was extracted from homogenized samples of pleopods, using commercial kits. The detection of IHHNV was carried out by both dot blot hybridization and PCR using the Diagxotics kits ShrimpProbe and ShrimPCaRe Simplex, respectively. A total of 7 positive samples from 4 (B, C, D and E) of the 5 shrimp farms studied were detected. The prevalence in the farms ranged from 1.1 to 3.3%. All positive samples corresponded to individuals of 5 to 6 g of weight. PCR was a more sensitive technique than the dot blot hybridization. The presence of IHHNV in asymptomatic shrimp at low values of prevalence could imply that the shrimp populations used for culture in Venezuela are resistant or at least tolerant to this viral pathogen.


Subject(s)
Animals , Densovirinae/pathogenicity , Aquatic Fauna/analysis , Prevalence , Agriculture
12.
Salus ; 11(1): 16-22, abr. 2007. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-502623

ABSTRACT

Se evaluó el efecto antiparasitario del pamoato de pirantel/oxantel y metronidazol y su relación con parámetros hematológicos, en 166 niños entre 3-14 años de la escuela “Ascanio José Velásquez”, Cumaná. Se recolectaron heces frescas a las que se les realizó examen coproparasitológico directo, el método de Ritchie, cultivo de heces en agar, Kato-Katz cuantificado y cuantificación de protozoarios. Además, se extrajo muestras de sangre para las determinaciones hematológicas. Se emplearon métodos clásicos para determinaciones hematológicas. Se emplearon métodos clásicos para determinar eficacia y porcentaje de cura de los medicamentos. Durante las semanas 1, 4 y 9 post tratamiento se determinó el nhpgh de helmintos, número quistes protozoarios y parámetros hematológicos. La prevalencia de parasitosis intestinal fue 85,54 por ciento (142/166), con predominio de poliparasitismo (62,56 por ciento; 103/166); A. lumbricoides y T. trichiura resultaron los helmintos más frecuentes; B. hominis y E. nana fueron los protozoarios más reportados. El grupo erario más afectado fue el de 7-10 años, encontrándose diferencias significativas entre edad y grado de infección para A. lumbricoides (X²= 6,67; p<0,05) y B. hominis (X²= 8,28; p<0,05). La eficacia de los medicamentos fue elevada, con excepción de T. trichiura, frente al cual la eficacia del pamoato de pirantel/oxantel fue inferior a lo esperado. Se encontró diferencias significativas entre los valores de hemoglobina para los niños tratados con pamoato de pirantel/oxantel (F= 3,95; p<0,05) y metronidazol (F= 3,67; p<0,05), y entre los valores de hematocrito para ambos medicamentos (F= 4,21; p<0,05) y (F= 4,00; p<0,05), respectivamente


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Adolescent , Antiparasitic Agents , Hematologic Agents , Intestinal Diseases, Parasitic , Pediatrics , Venezuela
13.
Kasmera ; 33(2): 109-118, jul.-dic. 2005. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-436430

ABSTRACT

Stenotrophomonas maltophilia, anteriormente conocida como Xanthomonas maltophilia y Pseudomonas maltophilia es un bacilo Gram negativo no fermentador de la glucosa, reconocido como agente causal de diversas infecciones nosocomiales, además de presentar resistencia a múltiples agentes antimicrobianos. El objetivo del presente estudio fué identificar y caracterizar fenotípicamente cepas clínicas de S. maltophilia así como también establecer un patrón de actividad in vitro a diferentes antimicrobianos. Los aislados bacterianos, fueron suministrados por el laboratorio de Bacteriología del Hospital de Cumaná para ser identificadas a través de pruebas bioquímicas convencionales y de un método comercial empleando las galerias API ID32GN. Se determinó la CMI de los antimicrobianos mediante la técnica de dilución en agar Mueller Hinton siguiendo las normas del CLSI. Se identificaron fenotípicamente 24 cepas de S. maltophilia. La identificación fue 100 por ciento coincidente con ambas técnicas. Se mantuvo un patrón uniforme entre las cepas excepto para oxidasa donde 17 (70,83 por ciento) fueron positivas y 7 (29,17 por ciento) negativas. Los resultados de las pruebas de identificación mostraron la presencia de 5 fenotipos prevaleciendo el patrón típico del microorganismo (fenotipo I, 14 aislados). Las cepas mostraron 10 por ciento de resistencia a Imipenem, cefepime, amikacina y ácido nalidixico, 95,83 por ciento a cefotaxima, ceftazidima y ampicilina sulbactam, 91,67 por ciento a ceftriaxona y ciprofloxacina y 75 por ciento a piperacilina tazobactam, siendo más susceptibles a trimetoprim sulfametoxazol (91,67 por ciento), levofloxacina (75 por ciento) y rifampicina (95,83 por ciento)


Subject(s)
Humans , Cross Infection , Phenotype , Photoreceptors, Microbial , Stenotrophomonas maltophilia , Hematology , Venezuela
14.
Kasmera ; 33(2): 142-154, jul.-dic. 2005. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-436433

ABSTRACT

Se evaluó la eficacia del pamoato de pirantel/oxantel y la reinfección helmíntica, en niños de ambos sexos y entre 3 y 14 años. Se seleccionaron 289 niños, 123 en Agua Blanca, municipio Montes y 166 en Malariología, municipio Sucre. Se recolectaron muestras fecales frescas, procesadas mediante examen coproparasitológico con solución salina y lugol, y los métodos de Ritchie, cultivo de heces en placas de agar, Kato-Katz cuantitativo y cuantificación de protozoarios. Se realizaron cuatro muestreos post tratamiento (semanas 1, 3, 5 y 10). Los resultados obtenidos se expresaron en tablas de prevalencia, además se aplicaron las pruebas de Ji cuadrado (c²) y ANOVA múltiple a un 95 por ciento de confiabilidad, y se utilizaron métodos clásicos para determinar la eficacia del medicamento, de acuerdo con la disminución del número de hpgh; su efectividad, determinando el porcentaje de casos curados que habían estado infectados al inicio del estudio y la reinfección, calculado como la proporción entre las nuevas infecciones y los casos curados, para cada una de las especies evaluadas. La prevalencia de parasitosis intestinal fue 99,19 por ciento en Agua Blanca y 85,54 por ciento en Malariología. Trichuris trichiura resultó el helminto más prevalente en ambas poblaciones (74,84 por ciento y 50,00 por ciento), y por los protozoarios Blastocystis hominis (73,17 por ciento y 40,96 por ciento). Según el grado de infección helmíntica, hubo predominio de infecciones leves, sin que se observara diferencia significativa por población (F=2,76; p>0,05 para Ascaris lumbricoides, F=2,13; p>0,05 para T. trichiura y F=1,17;p>0,05 para Necator americanus). El grupo de 7 a 10 años fue el más afectado. El pamoato de pirantel/oxantel tuvo mayor eficacia y efectividad frente a A. lumbricoides. Hubo asociación entre las reinfecciones y las comunidades estudiadas (c2=14,82;p>0,05). Las características ambientales de las comunidades podrían favorecer la transmisión helmíntica y propiciar reinf...


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Anthelmintics/therapeutic use , Intestinal Diseases, Parasitic , Treatment Outcome , Pediatrics , Venezuela
15.
Kasmera ; 33(1): 36-45, ene.-jun. 2005. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-423752

ABSTRACT

Entamoeba histolytica es considerada un problema de salud pública debido a su alta prevalencia y las consecuencias para los individuos, especialmente a niños quienes puede considerar incluso la muerte. Pocos estudios se han llevado a cabo sobre la prevalencia de estas especies en el nororiente de Venezuela, por lo que se planteó analizar 400 muestras de heces de pacientes con síntomas gastrointestinales de diarrea de ambos sexos y diferentes grupos etarios para determinar la prevalencia del complejo entamoeba histolytica/entamoeba dispar y su asociación con otros parásitos además de su asociación con algunos parámetros epidemiológicos. Las muestras fueron analizadas por métodos coproparasitológicos usando solución salina fisiológica al 0,85 por ciento, lugol coloración tricrómica, sangre oculta y concentración por Ritchie. A cada paciente se le aplicó una encuesta para obtener datos clínicos y epidemiológicos. Se encontró una prevalencia de 16,0 por ciento (n=64) para el complejo entamoeba histolytica/entamoeba dispar. Otros parásitos frecuentes fueron blastocystis hominis 19,3 por ciento (n=77), entamoeba coli 9,3 por ciento (n=37), endolimax nana 8,0 por ciento (n=32), giardia lamblia 5,8 por ciento (n=23), trichuris trichiuria 4,0 por ciento (n=16), ascaris lumbricoides 3,8 por ciento (n=15). Un 15,5 por ciento de los pacientes estaban poliparasitados, mientras que 37,0 por ciento mostraron un único parásito. Blastocystis hominis resultó ser el parásito mayormente asociado con complejo entamoeba histolytica/entamoeba dispar 10,9 por ciento (n=7). La sintomatología fue variable entre lo que podemos mencionar vómitos (26,6 por ciento), nauseas (39,1 por ciento), dolor abdominal (68,8 por ciento), fiebre (28,1 por ciento) y flatulencia (65,6 por ciento). No se encontró asociación significativa entre la presencia de las amibas y el sexo (X²=16,63, P<0,05), pero sí con edad (x²=16,63, p<0,05), siendo el grupo etario 10-19 años el más efectado. Las cifras de prevalencia de parásitos intestinales, especialmente para el complejo entamoeba histolytica/entamoeba dispar, demuestran que existe un problema importante de salud que debe ser abordado por las autoridades sanitarias del estado


Subject(s)
Male , Humans , Female , Child , Diarrhea , Entamoeba histolytica , Intestinal Diseases, Parasitic , Prevalence , Digestive System/immunology , Digestive System/metabolism , Medicine , Public Health , Venezuela
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