"Terra é vida, despejo é morte": saúde e luta Kaiowá e Guarani / "Territory is life, eviction is death": Kaiowá and Guarani health and fight / "Tierra es vida, desalojo es muerte": salud y lucha Kaiowá y Guaraní

Partindo da psicologia, este texto compõe nosso exercício ético-político de assumir a perspectiva dos povos e de suas organizações, neste caso em específico, da Aty Guasu, movimento étnico-social dos Kaiowá e Guarani de Mato Grosso do Sul. A colonização e expropriação violenta dos territórios tradicionais destes povos, o tekoha guasu, culminou na limitação do modo originário de ser, segundo os princípios cosmológicos, desdobrando-se na precarização da saúde, visível pelos altos índices de desnutrição, suicídio, violência e mortalidade. Com este estudo, visamos descrever e analisar aspectos da dimensão saúde para os Kaiowá e Guarani a partir de suas próprias narrativas. Como estratégia metodológica, realizamos a análise documental de todos os comunicados, em formato de notas, publicados entre 2011 e 2013 no blog do movimento na internet. Também participamos, de 2015 a 2020, de momentos importantes para as comunidades, como as Grandes Assembleias Kaiowá e Guarani, com registros em diário de campo. Esses procedimentos, articulados às produções teóricas da antropologia, psicologia da libertação, estudos decoloniais e anticoloniais, possibilitaram o entendimento da indissociabilidade da saúde indígena dos processos de colonização territorial e intersubjetiva. Nesse sentido, a saúde dos Kaiowá e Guarani, tendo o tekoha como aspecto vital, segundo a cosmopolítica, encontra-se em profundo conflito devido à expropriação, expulsão e confinamento empreendido pelas políticas colonialistas. Portanto, propomos a compreensão do tekoha como indicador da saúde Kaiowá e Guarani e os movimentos de reocupação dos territórios, protagonizados pela organização autônoma das comunidades e sintetizados pela sentença: "terra é vida", como retomada da saúde.(AU)

From the psychology, this text makes up our ethical-political exercise of regarding the perspective of the peoples and their organizations, in this specific case, Aty Guasu, ethnic-social movement of the Kaiowá and Guarani of Mato Grosso do Sul. Colonization and violent expropriation of the traditional territories of these peoples, the tekoha guasu, resulted in limiting the original way of being, according to cosmological principles, unfolding in the precariousness of health, visible from the high rates of malnutrition, suicide, violence, and mortality. With this research, we aim to describe and analyze aspects about the health dimension for the Kaiowá and Guarani from their own narratives. As a methodological strategy, we carry out the Document Analysis of all communications, in the form of notes, published between 2011 and 2013 on the organization's blog on the internet. We also participated, from 2015 to 2020, of important moments for the communities, such as the Highs Assemblies Kaiowá and Guarani, with records in a field diary. These proceedings, articulated with the theoretical productions of anthropology, liberation psychology, decolonial and anticolonial studies, made it possible to understand the inseparability of indigenous health from the processes of territorial and intersubjective colonization. In this sense, the health of the Kaiowá and Guarani, taking the tekoha as a vital aspect, according to cosmopolitics, is in deep conflict due to the expropriation, expulsion, and confinement undertaken by colonialist policies. Therefore, we propose the understanding of the tekoha as an indicator of Kaiowá and Guarani health, and the movements of reoccupation of territories, led by the autonomous organization of communities and synthesized by the sentence: "land is life," as a recovery of health.(AU)

Este texto realiza un ejercicio ético-político desde el aporte de la Psicología al asumir la perspectiva de los pueblos y sus organizaciones, en este caso, de la Aty Guasu, un movimiento étnico y social de los Kaiowá y Guaraní. La colonización y expropiación violenta de los territorios tradicionales de estos pueblos, los tekoa guasu, culminó en la limitación de los modos originarios de ser según los principios cosmopolíticos, que tienen como resultado la precarización de la salud, visibles por los altos índices de desnutrición, suicidio, violencia y mortalidad. En este estudio se busca tejer aproximaciones acerca la dimensión salud para los Kaiowá y Guaraní a partir de sus proprias narrativas. La metodología utilizada realizó un Análisis Documental de todos los anuncios en formato de "notas", publicados en los años 2011 y 2013, en el blog del movimiento en la internet. También hubo participación, de 2015 a 2020, en momentos importantes para las comunidades, tales como en las Gran Asambleas Kaiowá y Guaraní, con registro en diario de campo. Estos procedimientos articulados a las producciones de la Antropología, Psicología de la Liberación, Estudios Decoloniales y Anticoloniales permiten comprender la condición indisociable de la salud indígena en los procesos de colonización territorial e intersubjetiva. En este sentido, la salud de los Kaiowá y Guaraní, por el tekoha ser aspecto vital según la cosmovisión de estos pueblos, se encuentra en profundo conflicto debido a la expropiación, expulsión y confinamiento practicado por las políticas colonialistas. Por lo tanto, comprender el tekoha como indicador de la salud Kaiowá y Guaraní, y los movimientos de reocupación de los territorios, protagonizado por la autonomía de las comunidades, como recuperación de la salud, sintetiza en la sentencia: "tierra es vida".(AU)

Serological markers of hepatitis B virus in indigenous populations from Amazonas state, Venezuela / Marcadores serológicos del virus de hepatitis b en pueblos indígenas del estado amazonas, venezuela

RESUMEN Venezuela presenta un nivel de prevalencia intermedia de Hepatitis B, con cuatro focos de alta endemicidad asociados principalmente a población indígena. Las prevalencias halladas en el Amazonas venezolano tienen distintas distribuciones entre los pueblos, observándose diferentes particularidades epidemiológicas. El objetivo del presente trabajo fue reportar la prevalencia de VHB en población indígena de diferentes pueblos y regiones geográficas del estado Amazonas, que no habían sido evaluados hasta la fecha, mediante la determinación de los marcadores serológicos: Antígeno de Superfìcie del Virus de Hepatitis B (AgsHB) y Anticuerpos Anticore (Anti-HBc). Se estudiaron 1390 individuos de 15 pueblos indígenas (Baniva, Baré, Curripaco, Jivi, Mapoyo, Maco, Piapoco, Piaroa, Puinave, Sáliba, Warekena, Yabarana, Yanomami, Yekuana, Yeral), resultando una prevalencia de exposición al Virus de 37,6 % (Anti-HBc), y una prevalencia de infección activa de 5,6 % (AgsHB). La prevalencia de exposición al virus es proporcional a la edad. No se encontró diferencia significativa en relación al sexo. La exposición al virus en el pueblo Sáliba fue significativamente menor al resto de los pueblos indígenas (p<0,001), y la observada en Yabarana, significativamente mayor (p<0,001). Se encontró una prevalencia de AgsHB significativamente mayor (p<0,01) en el pueblo indígena Yabarana. Se puede predecir que existe relación entre prevalencia de exposición al virus de hepatitis B y la distancia geográfica al centro urbano.

ABSTRACT Venezuela has a level of intermediate prevalence of Hepatitis B, with four foci of high endemicity associated mainly to indigenous population. The prevalence found in the Venezuelan Amazon have different distributions among the peoples, observing different epidemiological particularities. The aim of this study was to report the prevalence of Hepatitis B in the indigenous population of different geographical regions of the Amazonas State that have not yet been evaluated, by determining serological markers: HBV surface antigen (HBsAg) and HBV core antibody (Anti-HBc). Blood samples were tested from 1390 individuals from 15 indigenous populations (Baniva, Baré, Curripaco, Jivi, Mapoyo, Maco, Piapoco, Piaroa, Puinave, Sáliba, Warekena, Yabarana, Yanomami, Yekuana, Yeral. Prevalence of exposure to the virus (Anti-HBc) was 37.6 % and the prevalence of active infection (HBsAg) was 5.6 %. Prevalence of exposure to the virus was directly proportional to age. No significant difference was found in relation to sex. A significant difference was found in Sáliba people who show prevalences significantly smaller than the rest of the indigenous peoples (p<0.001), while the observed in Yabarana was significantly higher (p<0.001). A significantly higher prevalence of HBsAg was found in Yabarana people (p<0.001). It can be predicted that there is a relationship between prevalence of exposure to hepatitis B virus and geographic distance to urban centers.

Epidemiología de los desórdenes venosos crónicos y factores asociados en amerindios nativos embera-chamí, Antioquia / Epidemiology of chronic venous disorders and associated factors in embera-chami native amerindians, Antioquia / Epidemiologia das doenças venosas crônicas e fatores associados em ameríndios nativos embera-chamí, Antioquia

Resumen Objetivo: Analizar la prevalencia de los desórdenes venosos crónicos (dvc) en los embera-chamí de Cristianía (Karmata Rua), en el suroeste de Antioquia, y conocer sus posibles factores asociados (fa). Metodología: Estudio de corte de una muestra aleatoria de 488 sujetos. El diagnóstico se realizó mediante ecoduplex venoso. Se recolectó información sobre fa sociodemográficos, comportamentales y antropométricos. Los fa más relevantes se seleccionaron por regresión logística binaria múltiple. Resultados: La prevalencia de várices fue del 27,5 % y la de insuficiencia venosa crónica (ivc) del 0,8 %. Hubo compromiso de segmentos anatómicos superficiales en el 34,8 % de los individuos. La edad fue el fa más importante, con Odds Ratio (or) entre 3,33 y 6,30 según el tipo de dvc (excepto C1). El sexo femenino, la paridad, la grasa en el muslo y pierna y la talla alta se asociaron a telangiectasias. La edad, la grasa abdominal y la forma de la pierna fueron fa de várices. A las venas superficiales, en ambos sexos, se asociaron la edad y la grasa abdominal y, en mujeres, también los antecedentes familiares de várices. A las profundas y perforantes se asociaron la edad y la depleción de grasa periférica. Conclusiones: El patrón de baja prevalencia de los dvc en embera-chamí puede ser consecuencia de los estilos de vida relacionados con la actividad física diaria y las diferencias genéticas compartidas con amerindios. En los programas de atención en salud diferencial deberían considerarse los desórdenes profundos y perforantes respecto a mestizos.

Abstract Objective: To analyze the prevalence of chronic venous disorders (CVD) in the embera-chamí from Cristianía (Karmata Rua), in the southwest of Antioquia, and to study possible associated factors (AF). Methodology: A cross sectional study of a random sample of 488 subjects. The diagnosis was performed through Doppler ultrasonography. Information about sociodemographic, behavioral and anthropometric AFs was collected. The most relevant AFs were selected through multiple binary logistic regression. Results: The prevalence of varicose veins was 27.5% and that of chronic venous insufficiency (cvi) was 0.8%. Superficial anatomical segments were compromised in 34.8% of individuals. Age was the most important AF, with an Odds Ratio (OR) between 3.33 and 6.30 according to the type of cvd. Being a female, parity, fat in the thigh/leg and large size were associated with telangiectasias. Age, abdominal fat and leg shape were AF of varicose veins. Superficial veins in both sexes were associated with age and abdominal fat and in women, also with a family background of varicose veins. Deep and perforator veins were associated with age and peripheral fat depletion. Conclusions: The low prevalence pattern of CVDs in embera-chamí may be a consequence of lifestyles involving daily physical activity and genetic differences shared with Amerindians. Deep and perforating disorders should be considered in differential health care programs in relation to mestizos.

Resumo Objetivo: Analisar a prevalência de doenças venosas crônicas (dvc) na Embera-Chami Christiania (KarmataRua), no sudoeste do estado de Antioquia, e conhecer seus fatores associados (AF). Metodologia: Um estudo de coorte de uma amostra aleatória de 488 indivíduos. O diagnóstico foi feito por ecoduplex venoso. Informações sobre FA sócio demográficas, comportamentais e antropométricas foram coletadas. Os FAs mais relevantes foram selecionados para múltipla regressão logística binária. Resultados: A prevalência de varizes foi de 27,5% e a de insuficiência venosa crônica (ivc) foi de 0,8%. Houve comprometimento dos segmentos anatômicos superficiais em 34,8% dos indivíduos. A idade foi a FA mais importante, com Odds Ratio (OR) entre 3,33 e 6,30 de acordo com o tipo de dvc. Sexo feminino, paridade, gordura na coxa e perna e altura foram associados a telangiectasias. Idade, gordura abdominal e formato de perna foram FA de varizes. Nas veias superficiais, em ambos os sexos, idade e gordura abdominal estavam associadas e, nas mulheres, também a história familiar de varizes. Às profundas e perfurantes foram associadas a idade e depleção de gordura periférica. Conclusões: O padrão de baixa prevalência de DVC em embera-chamí pode ser uma consequência de estilos de vida relacionados à atividade física diária e diferenças genéticas compartilhadas com ameríndios. Em programas diferenciais de atenção à saúde, distúrbios profundos e perfurantes devem ser considerados em relação aos mestiços.

Culturas, etnicidades y aflicciones. Perspectivas amerindias en la salud intercultural / Cultures, ethnicities and afflictions. Amerindian Perspectives on Intercultural Health

El artículo analiza la incorporación y el reconocimiento de la variable étnica y cultural en la perspectiva conceptual sobre el abordaje de la salud en pueblos amerindios, circunstancia promovida desde instituciones como la OMS y su sede americana OPS. El concepto de persona o el uso diverso de la pertenencia étnica deben ser considerados con suficiente flexibilidad y perspicacia crítica para no caer en criterios monolíticos esencializadores que desvirtúen las posibilidades y los beneficios que dicha perspectiva intercultural puede propiciar en el acceso a la salud de los pueblos amerindios. (AU)

Epidemias e colapso demográfico no México e nos Andes do século XVI: contribuições da biologia evolutiva / Epidemics and demographic collapse in Mexico and the Andes in the sixteenth century: contributions from evolutionary biology

Resumo Discute as epidemias no colapso demográfico de ameríndios no México e na América Andina após a chegada dos espanhóis. A partir das categorias de Ernst Mayr de causas distantes (ou evolutivas) e próximas (ou funcionais), argumenta-se que causas distantes, como causas genéticas, que conferiram resistência imunológica aos espanhóis, manifestaram-se em um cenário muito estratificado, provocando a destruição de incas e astecas. Interpretações recentes do projeto colonialista europeu buscam minimizar a importância das epidemias ou matizá-las com fatores sociais, econômicos e políticos, interpretados aqui como causas próximas. Defendemos que somente pela articulação dessas duas categorias é possível entender a importância das epidemias na conquista espanhola da América Latina.

Abstract The role of epidemics in the demographic collapse of the Amerindians in Mexico and Andean America after the arrival of the Spanish is discussed. Ernst Mayr's categories of ultimate (or evolutionary) and proximal (or functional) causes are used to argue that ultimate causes, such as genetics, which gave the Spanish immunological resistance, were manifested in a very stratified setting, triggering the destruction of the Incas and Aztecs. Recent interpretations of colonization have played down the importance of epidemics or combined them with social, economic, and political factors, interpreted here as proximate causes. We understand that only by articulating these two categories can the importance of epidemics in the Spanish conquest of Latin America be understood.

Obstructive Sleep Apnea and aberrant pneumatization of skull bones / Apnea obstructiva del sueño y neumatizaciòn aberrante de huesos del cráneo

ABSTRACT Objective: We aimed to assess the association between obstructive sleep apnea (OSA) and aberrant pneumatization of skull bones in Amerindians living in rural Ecuador. Methods: A random sample of community-dwelling individuals aged ≥60 years enrolled in the Atahualpa Project, were invited to undergo a single diagnostic night polysomnography (PSG) at the sleep unit of the Atahualpa Project Community Center. Exams were performed with an Embletta® X100™ Comprehensive Portable PSG System. A board-certified sleep neurologist carried out analyses of sleep efficiency, architecture, arousal indexes, apnea/hypopnea index, oxygen saturation, heart rate and motor activity. CT readings were focused on the presence and distribution of pneumatization of intracranial bones, as assessed by CT with bone window settings. Results: Thirty-eight participants were included. Mean age was 74.5 ± 6.8 years and 25 (66%) were women. The apnea/hypopnea index ranged from 0.2 to 56 (mean 15.7 ± 14.6) episodes per hour. Fifteen persons (39%) had ≥10 episodes per hour and were considered to have OSA. Abnormal pneumatization of skull bones was noticed in six persons, included five out of 15 (33%) with OSA and one out of 23 (4%) without (p=0.027). Air was found in the temporal squamas in five (bilateral in four), the occipital bones in one, and in both the temporal squamas and the occipital bones in the remaining person. Conclusion: This study shows a significant association between OSA and aberrant pneumatization of skull bones. These findings are of potential clinical relevance, since these individuals could be at increased risk of painless fractures from minor trauma or may be prone to develop spontaneous cerebrospinal fluid leaks.

RESUMEN Objetivo: Determinar la asociación entre apnea obstructiva de sueño y neumatización aberrante de huesos del cráneo en una población de Amerindios. Métodos: Una muestra aleatoria de adultos de 60 años o más enrolada en el Proyecto Atahualpa, fue invitada a realizarse una polisomnografía diagnóstica (una noche) en la Unidad de Sueño del Centro de Apoyo Comunitario del Proyecto Atahualpa. Los exámenes fueron realizados con una máquina portátil Embletta® X100™. Un neurólogo certificado en sueño realizó la lectura de todos los exámenes, con atención a eficiencia y arquitectura del sueño, índices de despertar, índice apnea-hipopnea, saturación de oxígeno, frecuencia cardiaca y actividad motora. La lecturas tomográficas se enfocaron en la presencia y distribución de neumatización aberrante de huesos del cráneo, valoradas con ventana ósea. Resultados: Se incluyeron 38 pacientes (edad media 74.5 ± 6.8 años, 66% mujeres). El índice apnea-hipopnea fluctuó entre 0.2 a 56 (promedio: 15.7 ± 14.6) episodios por hora. Quince participantes (39%) tuvieron ≥10 episodios por hora y fueron diagnosticados con apnea de sueño. Seis personas tuvieron neumatización aberrante de huesos craneales, incluyendo 5 de 15 (33%) con apnea de sueño y uno de 23 (4%) sin apnea de sueño (p=0.027). El aire se localizó en las escamas temporales en 5 casos, en los huesos occipitales en uno y en ambas localizaciones en la persona restante. Conclusión: Existe una asociación entre apnea de sueño y neumatización aberrante de huesos del cráneo. Estos hallazgos tienen relevancia clínica ya que estos individuos pueden tener riesgo aumentado de fracturas de cráneo luego de traumas menores o de desarrollar fístulas espontáneas de líquido cefalorraquídeo.

Relevance of the ancestry for the variability of the Drug-Metabolizing Enzymes CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 polymorphisms in a multiethnic Costa Rican population / Relevancia de la ancestría para la variabilidad de polimorfismos de las enzimas metabolizadoras de fármacos CYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 en una población multiétnica de Costa Rica

Abstract:CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 metabolize around 40 % of drugs and their genes vary across populations. The Costa Rican population has a trihybrid ancestry and its key geographic location turns it into a suitable scenario to evaluate interethnic differences across populations. This study aims to describe the diversity of CYP2C9, CYP2C19 and CYP2D6 polymorphisms in Costa Rican populations in the context of their ancestry. A total of 448 healthy individuals were included in the study: Bribri (n= 47), Cabécar (n= 27), Maleku (n= 16), Guaymí (n= 30), Huetar (n= 48), Chorotega (n= 41), Admixed/Mestizos from the Central Valley/Guanacaste (n= 189), and Afro-Caribbeans (n= 50) from Limón. CYP2C9 (alleles *2, *3, *6) and CYP2C19 (*2, *3, *4, *5, *17) genotypes were determined by Real-Time PCR. African, European and Native American ancestry were inferred using 87 ancestry informative markers. The frequency of the decreased activity allele CYP2C9*2 is lower in the self-reported Amerindian groups compared to the admixed population, and the highest frequencies of CYP2C19*2 (null activity) and the CYP2C19*17 (increased activity) were found in the self-reported AfroCaribbean population. Moreover, a frequency of 0.7 % CYP2C9 gPMs in the Admixed population and a variable frequency of CYP2C19 gUMs (0.0-32.6 %, more prevalent in Afro-Caribbeans) in Costa Rican populations, was found. Finally, the following alleles were positively correlated with genomic African ancestry and negatively correlated with genomic Native American ancestry: CYP2D6*5 (null activity), CYP2D6*17 (decreased activity), CYP2D6*29 (decreased activity) and CYP2C19*17 (increased activity). No correlation for CYP2C9 polymorphisms and genomic ancestry was found. Further studies assessing the CYP2C9 and CYP2C19 sequence in these populations, preferentially by sequencing these genes, are warranted. Rev. Biol. Trop. 64 (3): 1067-1076. Epub 2016 September 01.

ResumenCYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 metabolizan aproximadamente el 40 % de los fármacos y los genes que las codifican varían en las distintas poblaciones humanas. La población costarricense posee ancestría trihíbrida y su posición geográfica estratégica la convierten en un escenario idóneo para evaluar la variabilidad interétnica en sus poblaciones multiétnicas. El presente estudio tiene como objetivo describir la diversidad de los polimorfismos CYP2C9, CYP2C19 y CYP2D6 en las poblaciones costarricenses en el contexto de su ancestría. Un total de 448 individuos sanos fueron incluidos: Bribri (n= 47), Cabécar (n= 27), Maleku (n= 16), Guaymí (n= 30), Huetar (n= 48), Chorotega (n= 41), mestizos del Valle Central y Guanacaste (n= 189) y afrocaribeños de Limón (n= 50). Los genotipos CYP2C9 (alelos *2, *3, *6) y CYP2C19 (*2, *3, *4, *5 y *17) fueron determinados mediante PCR tiempo real. Las ancestrías africana, europea y nativa americana fueron inferidas usando 87 marcadores informativos de ancestría. La frecuencia del alelo de actividad disminuida CYP2C9*2 fue menor en los grupos autodefinidos de amerindios que en la población mestiza y las frecuencias más altas de CYP2C19*2 (actividad nula) y CYP2C19*17 (actividad incrementada) se encontraron en la población autodefinida afrocaribeña. Asimismo, se encontró una frecuencia de gPMs CYP2C9 de 0.7 % en la población mestiza y una frecuencia variable de gUMs CYP2C19 (0.0 a 32.6 %, más prevalente en afrocaribeños) en las poblaciones costarricenses. Por último, los siguientes alelos fueron positivamente correlacionados con la ancestría africana y negativamente con la ancestría nativa americana: CYP2D6*5 (actividad nula), CYP2D6*17, CYP2D6*29 (ambos de actividad disminuida) y CYP2C19*17 (actividad incrementada). No se encontró correlación entre los polimorfismos CYP2C9 y la ancestría. Se requieren estudios posteriores que evalúen la secuencia de CYP2C9 y CYP2C19 en estas poblaciones, preferiblemente mediante la secuenciación de estos genes.

Spinocerebellar ataxia type 10 in the South of Brazil: the Amerindian-Belgian connection / Ataxia espinocerebelar tipo 10 no sul do Brasil: a conexão Ameríndia-Belga

Spinocerebellar ataxia type 10 (SCA10) is a rare form of autosomal dominant ataxia found predominantly in patients from Latin America with Amerindian ancestry. The authors report the history of SCA10 families from the south of Brazil (the states of Paraná and Santa Catarina), emphasizing the Belgian-Amerindian connection.

A ataxia espinocerebellar tipo 10 (AEC10) é uma forma rara de ataxia cerebelar autossômica dominante, encontrada predominantemente em pacientes da América Latina, de origem Ameríndia. Os autores relatam a história de famílias com AEC10 do sul do Brasil (estados do Paraná e Santa Catarina), enfatizando a conexão Ameríndia-Belga.

Ethnic background and CYP2D6 genetic polymorphisms in Costa Ricans / Antecedentes étnicos y polimorfismo genético del CYP2D6 en los costarricenses

CYP2D6 differences have already been demonstrated within Latin American populations by the CEIBA.FP Consortium of the Ibero-American Network of Pharmacogenetics (RIBEF, as per the acronym in Spanish). However, within the population of Costa Rica, no research has been conducted until now, even though this population has a trihybrid component ancestry that represents an interesting condition. Thus, the present study was aimed to determine the frequency of Ultra-rapid Metabolizers (UMs) and Poor Metabolizers (PMs) in a Costa Rican population, as well as to determine whether there are differences in the CYP2D6-predicted phenotype frequencies among three Costa Rican groups with different ethnic backgrounds. Additionally, these frequencies of PMs and UMs obtained were compared with Ibero-American populations published data. Finally, we also aimed to describe allele frequencies among different Costa Rican ethnic groups. This research has been undertaken within the framework of the RIBEF CEIBA Consortium studies on Latin American populations. A total of 385 individuals were included in the study: 139 mestizos, 197 Amerindians, and 49 Afro-Caribbeans. CYP2D6 genotypes were determined by XL-PCR and Real-Time PCR. The CYP2D6 variant alleles *2, *3, *4, *5, *6, *10, *17, *29, *35 and *41 were also determined. For the entire Costa Rican population, the frequency of PMs and UMs was 6% and 6.5%, respectively. The percentage of UMs in the mestizo population was higher than in the Amerindian population. CYP2D6 UMs vary from 3.6% to 10.1% and PMs from 1.4% to 10.2% among three Costa Rican groups. The highest frequencies of UMs (10.1%) and PMs (10.2%) were found in the mestizo and Amerindian populations, respectively. In conclusion, the frequencies of UMs and PMs for CYP2D6 varied widely across the mestizo, Amerindian and Afro-Caribbean Costa Rican populations. Future research in this population should be oriented to identify new CYP2D6 variants through sequencing methods, as well as to determine CYP2D6 phenotype, in order to establish the phenotype-genotype relation. Finally, further studies involving genetic markers of ancestry are needed in the Costa Rican population.

El Consorcio de la Red Iberoamericana de Farmacogenética CEIBA.FP ha demostrado que existen diferencias en cuanto a CYP2D6 en las poblaciones latinoamericanas. Sin embargo, hasta ahora, se sabe poco de este gen de importancia farmacogenética en la población de Costa Rica, la cual tiene una ancestría trihíbrida. El presente estudio tiene como objetivos: determinar la frecuencia de los fenotipos extrapolados de CYP2D6 en una población costarricense y determinar si existen diferencias en cuanto a las frecuencias de metabolizadores lentos (PMs) y ultra-rápidos (UMs) entre tres grupos con distinto origen étnico. Adicionalmente, las frecuencias de PMs y UMs obtenidas en este estudio fueron comparadas con datos de poblaciones iberoamericanas. Por último, se pretende describir las frecuencias alélicas en los distintos grupos. En el estudio se incluyeron 385 muestras de individuos: 139 mestizos, 197 amerindios y 49 afro-caribeños. Los genotipos CYP2D6 fueron determinados por XL-PCR y PCR tiempo real. Se determinaron las variantes alélicas *2, *3, *4, *5, *6, *10, *17, *29, *35 y *41. Para la población total estudiada las frecuencia de PMs y UMs fueron respectivamente 6% y 6.5%. El porcentaje de individuos UMs fue mayor en la población mestiza que en la amerindia. La frecuencia de UMs varió de 3.6 a 10.1% y la de PMs de 1.4 a 10.1% en los grupos costarricenses. Las frecuencias más altas de UMs (10.1%) y de PMs (10.2%) se encontraron respectivamente en las poblaciones mestiza y amerindia. En conclusión, las frecuencias de UMs y PMs de CYP2D6 varían ampliamente en las poblaciones mestiza, amerindia y afro-caribeña de Costa Rica. Investigaciones futuras en la población de Costa Rica deberían orientarse a identificar nuevas variantes del CYP2D6 mediante métodos de secuenciación, así como a determi- nar el fenotipo de CYP2D6 con el objetivo de establecer la relación fenotipo-genotipo. Finalmente, es necesario realizar estudios adicionales que involucren marcadores genéticos de ancestría en la población costarricense.

Revisión del rasgo premolar Uto-Azteca en Sudamérica y su presencia en Colombia / A review of the Uto-Aztecan premolar trait in South America and its presence in Colombia

Introducción: el rasgo denominado premolar Uto-Azteca (en adelante PUA) o cresta disto-sagital de los premolares superiores es una variante morfológica muy rara que aparece únicamente en los primeros premolares superiores permanentes de los grupos indígenas americanos. El rasgo PUA se describe como la presencia de una cresta pronunciada que va desde el ápice de la cúspide bucal (paracono) y se extiende hacia el borde disto-oclusal llegando muy cerca del sulcus sagital. El objetivo de esta investigación fue describir la presencia de PUA en Sudamérica y su relación con poblaciones indígenas de Colombia. Métodos: se compilaron 495 individuos registrados en la literatura. Se aplicó estadística convencional descriptiva para observar asimetría y variables atípicas. Luego se hizo una comparación usando la medida media de divergencia de Smith. Resultados: la dispersión de este rasgo en Sudamérica pudo deberse a una interacción entre los grupos representados por dos componentes biológicos observados en la matriz calculada. Discusión: la costa del océano pacífico y los valles interandinos que conectan Andes y Amazonia junto con sus ríos principales debieron desempeñar un papel primordial en la rápida dispersión de este rasgo en muestras tan distanciadas como Minas Gerais (Brasil) y Punta Teatinos (Chile). Conclusiones: el rasgo PUA está presente en Colombia a partir del 3.000 AP aproximadamente. Es necesario observar este rasgo en grupos mestizos.

Introduction: the so-called Uto-Aztecan premolar (hereinafter UAP) or distal-sagittal crest of upper premolars is a rare morphologic trait that appears in the first premolars of American Indian groups only. It is described as the presence of a pronounced crest extending from the tip of the buccal cusp (paracone) towards the distal-occlusal edge, almost reaching the sagittal sulcus. The objective of this study was to describe the presence of UAP in South America and its relation with Colombian indigenous populations. Methods: a total of 495 individuals recorded in the literature were collected. Conventional descriptive statistics was used to observe asymmetry and atypical variables. Comparisons were made using Smith’s mean measure of divergence. Results: the spreading of this trait in South America might have been due to interactions between the groups represented by two biological components observed in the calculated matrix. Discussion: the Pacific Ocean coast and the valleys that connect the Andean and Amazonian regions coupled with their main rivers should have played a role in the rapid spread of this trait in samples located as far apart as Minas Gerais (Brazil) and Punta Teatinos (Chile). Conclusions: UAP is present in Colombia since about 3000 BP (before present). This trait should be evaluated in mestizo groups.

Diversity and genetic structure analysis of three Amazonian Amerindian populations from Colombia / Análisis de la diversidad y la estructura genética de tres poblaciones indígenas amazónicas colombianas

Introduction: In the departments of the Vaupés and Guaviare, in southeastern Colombia, in a transitional area between Amazonia and the eastern plains, inhabit indigenous groups belonging to the Tukanoan (East) and Guahiban linguistic families. Although some studies have dealt with the culture and the cosmology description of these groups, little research has been done on the biological diversity and genetic relationships of such groups.Objective: To estimate the diversity, the structure, and the genetic relationships of one Guahiban and two Tukanoan groups of the Colombian Amazonian region.Methods: Samples were collected (n = 106) from unrelated individuals belonging to the Vaupés native indigenous communities. The DNA was extracted and nine autosomal microsatellites were typed. Several measures of diversity, FST, pairwise FST, and population differentiation between groups were calculated. Finally, it was estimated the genetic distances of the groups studied in relation with other Amazonian, Andean and Central American indigenous people.Results: 1. The genetic diversity found stands within the range of other Amazonian populations, whereas compared to the mestizo and afro-descendant Colombian populations, such diversity showed to be lower. 2. The structure and population differentiation tests showed two clusters; one consisting of the Vaupés Tukanoan and Guaviare Tukanoan groups, and a second one formed by the Guayabero. 3. Tukanoan groups are found to be closer related to the Brazilian Amazonian populations than to the Guayabero.Conclusion: The results of this study suggest that the Guayabero group from Guaviare, are genetically differentiated from those Tukanoan groups of the Vaupés and Guaviare

Estudios sobre ADN mitocondrial sugieren un linaje predominante en la cordillera Oriental de Colombia y un vínculo suramericano para los arcaicos de Puerto Rico / Mitochondrial DNA studies suggest a predominant lineage in the Eastern Cordillera of Colombia and South American link for the archaics of Puerto Rico

Objetivo: Este trabajo integra información de la secuencia del ADNmt del norte de Suramérica con Puerto Rico, con el fin de comprender el poblamiento del Caribe, especialmente de los taínos. De paso, arroja información sobre hechos demográficos en la Colombia precolombina. Metodología: Se obtuvieron 59 muestras de Colombia y Venezuela, las cuales fueron analizadas junto a otras dos pertenecientes a los indios warao y disponibles en el Genbank. Se alinearon secuencias HVR-I y II (Hypervariable Region) y se compararon con el rCRS. El 93,4% de las muestras resultaron ser de origen amerindio. Resultados: Un venezolano exhibió mutaciones relacionadas con el linaje antiguo C-II de Puerto Rico, el cual se estima que arribó a Puerto Rico en la era prearahuaca. Mediante secuenciación completa del ADNmt se demostró que esta muestra, VE6, pertenece al cladoamericano nativo C1b. Dos personas de Colombia y Venezuela presentaban la transición 16129 que define el linaje A-VIII de Puerto Rico. Dicha transición dentro del haplogrupo A también se haencontrado en los ciboneyes de Cuba y en otras tribus americanas. La deleción de un par de bases –498d– define el linaje B-I de Colombia (Bogotá y Villa de Leyva, Boyacá), un polimorfismo encontrado en los departamentos correspondientes a la cordillera Oriental y que se extiende al Valle del Cauca y a Panamá. Conclusión: Este linaje experimentó una expansión demográfica en la cordillera Oriental que lo llevó a expandirse geográficamente hasta Panamá. Sería recomendable ampliar el muestreo de la costa norte de Colombia y Venezuela, para encontrar más conexiones precolombinas con Puerto Rico. Además, sería conveniente verificar la distribución geográfica de 498d con un muestreo más numeroso y que cubra una zona más amplia de Colombia.

Objetive: This work integrates sequencing information of mtDNA from Northern South America with Puerto Rico, to reach an understanding of the peopling of the Caribbean, especially the Tainos. At the same time, it sheds light on demographic events in the Pre-Columbian Colombia. Methodology: Fifty nine samples from Colombia and Venezuela were obtained, and then analyzed along with two others from Warao Indians available in Genbank. HVR (Hypervariable Region) I andII sequences were aligned and compared to the rCRS. Fully 93,4% of the mtDNA samples were shown to be of Amerindian origin. Results: A Venezuelan exhibited ancient mutations related to lineage C-II of Puerto Rico, which has been estimated to have arrived to this island in pre-Arawak times. Through complete mtDNA sequencing, it was shown that this sample, VE6, belongs to the Native American C1b clade. Two individuals from Colombia and Venezuela showed the 16129 transition that defines lineage A-VIII of Puerto Rico. This transition has also been found in the Cuban Ciboneys and in various American tribes. A one base pair deletion –498d–defines lineage B-I from Colombia (Bogotá and “Villa de Leyva”, Boyacá), a polymorphism found in the departments belonging to the Eastern cordillera and extending to the Cauca Valley and Panamá. Conclusions: This lineage went through a demographic expansion in the Eastern Cordillera that may have triggered its geographic expansion to Panamá. It would be recommendable to expand the sampling of the Northern Coast of Colombia and Venezuela to find more pre-Columbian connections with Puerto Rico. Furthermore, it would be convenient to verify the geographic distribution of 498d with a bigger sample covering a wider region of Colombia.

Desempeño de estuches comerciales para el diagnóstico serológico de las hepatitis virales B y C en poblaciones yanomami y piaroa del estado Amazonas / Performance of commercial kits for serologic diagnosis of viral hepatitis B and C in yanomami and piaroa populations from Amazonas State

Los virus de hepatitis son una causa importante de morbilidad y mortalidad en la cuenca amazónica. El objetivo de este estudio fue evaluar el desempeño de estuches serológicos para la determinación de marcadores de VHB y VHC en población indígena. Se determinó la presencia de anti-HBc, agsHB, anti-VHC y de genomas virales en sueros de individuos piaroa y yanomami. Más de 50% de las muestras reactivas por un inmunoensayo comercial no resultaron positivas al usar otros estuches. El marcador serológico para el cual se observó una mayor concordancia entre los estuches comerciales fue el anti-HBc, posiblemente porque se trata de un ensayo de inhibición. La concordancia entre los ensayos para agsHB con la positividad de la PCR fue de pobre a moderada, coincidiendo sólo dos de los ensayos con los resultados de la PCR. No existió concordancia entre los distintos ensayos inmunoezimáticos, ni con la presencia del ARN viral para VHC. Las discrepancias inesperadas entre distintos estuches comerciales pudieran deberse a características inherentes a estas poblaciones, tales como múltiples coinfecciones, en especial parasitarias. Estos factores pudiesen estar afectando la especificidad de los estuches diagnósticos, situación observada con menor frecuencia en otras poblaciones venezolanas. Estos estudios refuerzan la importancia de la validación de pruebas serológicas en estas poblaciones, con ensayos confirmatorios y moleculares.

Hepatitis viruses are an important morbility and mortality cause in the Amazon basin. The goal of this study was to evaluate the performance of commercial serologic kits for determination of HVB and HVC markers in indigenous populations. Presence of anti-HBc, HBags, anti-HVC and viral genomes was determined in sera from piaroa and yanomami individuals. Over 50% of the samples reactive with one of the commercial kits were not positive when using other kits. The serologic marker which showed the highest concordance among the commercial kits was anti-HBc, possibly because it is an inhibition assay. Concordance among assays for HBags and PCR positivity varied between poor and moderate; only two of the tests coincided with the PCR results. There was no concordance among the various immunoenzymatic assays, nor in viral RNA presence for HVC. The unexpected discrepancies among the various commercial kits could be due to inherent characteristics of these populations such as multiple co-infections, especially parasitic. These factors could be affecting the specificity of the diagnostic kits, situation less frequently observed in other Venezuelan populations. This study emphasizes the importance of validating serologic tests in these populations, through confirmation and molecular assays.

Dermatoglyphic traits of six Chibcha-speaking Amerindians of Costa Rica, and an assessment of the genetic affinities among populations

Dermatoglyphic traits have been used to evaluate population structure and microdifferentiation in several populations. For Chibcha-speaking groups of Lower Central America there are few dermatoglyphic studies, but extensive linguistic, anthropological and genetic data support their historical, cultural and biological relationships. The main objectives of this study were to describe new dermatoglyphic data for six Chibcha- speaking Amerindians of Costa Rica, and to assess the relationships between these and other Amerindian and Eskimo groups, at different levels of population differentiation by means of multivariate analyses of quantitative traits. Sexual (2 =227.22, df=33, p<0.01),, and bimanual (2 =554.45, df=33, p<0.01) differences were both significant for the overall population, as has been reported previously. Remarkably, higher frequencies of arches, lower frequencies of whorls and lower means of total ridge counts were observed in the tribes analyzed compared with other American indians. At the lowest level of population differentiation, two Cabecar subpopulations (Aatlantic and Chirripo) were compared and no significant differences were found (FF=0.001, p=0.72),, suggesting that dermatoglyphic variation might not reflect known genetic divergence at this level of association. Comparisons within the Chibchan dataset using Principal Components Analysis (PPCA) placed the Huetar and the Cabecar in close proximity, and separated the Guatuso and the Guaymi. Additionally, the Chibchan tribes, although showing nearer proximity to Non-Andean South American groups, can be separated from other Amerindian and Eskimo populations, confirming previous results based on extensive genetic surveys and linguistic analyses that have demonstrated the existence of a Chibchan cluster within a larger South American phylogenetic group. The results obtained support the use of dermatoglyphics to assess interpopulation affinities, even at the level of tribes. Rev. Biol. Trop. 57 (SSuppl. 1): 357-369. Epub 2009 November 30.

Los dermatoglifos se han utilizado para evaluar la estructura poblacional y microdiferenciación de varias poblaciones. Para los grupos chibcha de Baja Centroamérica hay pocos estudios sobre dermatoglifos pero los datos lingüísticos, antropológicos y genéticos muestran la existencia de relaciones históricas, culturales y biológicas. Los objetivos del presente estudio fueron describir nuevos datos de dermatoglifos para seis tribus amerindias chibcha de Costa Rica y evaluar las relaciones entre estas y otros grupos amerindios y esquimales, a diferentes niveles de diferenciación poblacional por medio de análisis multivariados. Se encontraron diferencias significativas entre ambos sexos (2=27.22, df=3, p<0.01) y ambas manos (2=54.45, df=3, p<0.01), similar a lo descrito para otras poblaciones. Las tribus estudiadas se caracterizan por presentar alta frecuencia de arcos, baja frecuencia de verticilos y bajo conteo total de líneas. Al nivel más bajo de diferenciación poblacional, se compararon dos subpoblaciones cabécar (Atlántico y Chirripo) y no se encontraron diferencias significativas (F=0.001, p=0.72) lo cual sugiere que los dermatoglifos no permiten discriminar entre grupos a este nivel. Las comparaciones entre las tribus chibcha estudiadas por medio de análisis de componentes principales (PCA) ubican a los huetar cercanos a los cabécar; mientras que los guatuso y guaymí aparecen como grupos más aislados. Adicionalmente, el grupo chibcha, aunque muestra mayor afinidad con poblaciones suramericanas, puede separarse de otras tribus amerindias y esquimales, confirmando los resultados de estudios genéticos y lingüísticos que han colocado a los chibchas dentro del un grupo filogenético mayor formado por tribus amerindias de Suramerica. Dichos resultados confirman el valor de las características dermatoglíficas para evaluar las afinidades interpoblacionales aún a nivel de tribus.

Recursos frutícolas na Várzea e na terra firme em onze comunidades rurais do alto Solimões, Amazonas, Brasil

The region known as the Upper Solimões is very rich in crop genetic resources, especially of fruits, but these resources contribute principally to subsistence rather than having a more ample importance in regional development. A preliminary qualitative survey of native and exotic fruit species was carried out in 11 rural communities (8 traditional peasant, 3 Ticuna Indian) in the principal local ecosystems (floodplain, upland). Thirty-seven native fruits, in 20 families, and 10 exotic fruits, in 9 families were observed; of the natives, 9 were rare (observed in 1 or 2 communities) and 3 were common (observed in 10 or 11 communities); of the exotics, 2 were rare and bananas were found in all communities, being important in both subsistence and trade. Communities with immediate access to both the floodplain and the uplands had more species (22.5±6.6 natives and 6.5±2.2 exotics) than communities with access only to the uplands (19.0±2.2 natives and 5.3±0.5 exotics), which in turn had more species than communities with access only to the floodplain (5±2 natives and 1.5±0.9 exotics).

A região do Alto Solimões é muito rica em recursos genéticos agrícolas, especialmente frutícolas, mas estes recursos contribuem principalmente para a subsistência em lugar de ter um papel mais amplo no desenvolvimento regional. Um levantamento qualitativo preliminar das espécies frutícolas nativas e exóticas foi executado em 11 comunidades rurais (8 caboclas, 3 Ticunas) nos ecossistemas principais (várzea, terra firme). Observou-se 37 fruteiras nativas em 20 famílias e 10 fruteiras exóticas em 9 famílias; das nativas, 9 foram raras (observadas em 1 ou 2 comunidades) e 3 foram comuns (observadas em 10 ou 11 comunidades); das exóticas, 2 foram raras e as bananas foram encontradas em todas as comunidades, sendo a fruteira mais importante na subsistência e na comercialização. As comunidades com mais acesso imediato à várzea e à terra firme tiveram mais espécies (22,5±6,6 nativas e 6,5±2,2 exóticas), que comunidades com acesso apenas à terra firme (19,0±2,2 nativas e 5,3±0,5 exóticas), que por sua vez tiveram mais espécies que comunidades com acesso apenas à várzea (5±2 nativas e 1,5±0,9 exóticas).