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1.
Rev. biol. trop ; 65(3): 1142-1151, Jul.-Sep. 2017. tab
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-897609

ABSTRACT

Resumen: La concha negra Anadara tuberculosa es una especie emblemática del ecosistema manglar que está actualmente en condición vulnerable. El desarrollo de su acuicultura requiere identificar biomarcadores moleculares, en particular asociados al estrés por salinidad en mira al inicio de programas de mejoramiento genético. Se recolectaron ejemplares de Anadara tuberculosa del manglar colindante a la Bahía de Puerto Pizarro (Tumbes, Perú) entre enero 2015 y febrero 2016. Estos individuos fueron sometidos a condiciones de estrés hipo-osmótico (extremo: 5 y 10 ppt); (moderado: 15 y 25 ppt) y sin estrés (grupo control: 33 ppt) por 16 días después de haber sido separados en grupos de diez animales y por triplicado. La presencia de biomarcadores del estrés por salinidad fue evaluada a nivel genético con la detección por PCR de 19 genes reportados como actores claves de la osmorregulación en bivalvos como ostras y mejillones y a nivel proteomico con la secuenciación de péptidos expresados en tejidos de animales expuestos a diferentes salinidades por espectrometría de doble masa. Ninguno de los marcadores genéticos probados pudo ser amplificado por PCR lo que sugiere que A. tuberculosa presente diferencias genéticas significativas en comparación con otros moluscos. El análisis proteómico realizado por MALDI TOF/TOF a nivel de tejido branquial de A. tuberculosa permitió identificar 26 péptidos expresados de formas presenciales y diferenciales a las diferentes salinidades evaluadas, resaltando posibles marcadores como la HSP70 y una proteína transmembrana de transporte de cloruro que están relacionadas con la adaptación a la salinidad. Estas secuencias aminoacídicas permitirán diseñar iniciadores nucleotidicos específicos a A. tuberculosa para la puesta en marcha de futuras investigaciones en ecofisiología de este importante recurso.


Abstract: The pustulose ark A. tuberculosa is an emblematic species of mangrove ecosystem that is currently in a vulnerable condition. The development of its aquaculture, to begin with genetic breeding programs, requires the identification of molecular biomarkers, particularly those associated with salinity stress. With this purpose, specimens of A. tuberculosa were collected from the adjacent mangroves of Puerto Pizarro bay (Tumbes, Perú), from January 2015 to February 2016. Different assays (groups of ten animals in triplicate) were undertaken in separated periods of 16 days: hypo-osmotic stress (extreme: 5, 10 ppt); (Moderate: 15, 25 ppt) and no stress (control group: 33 ppt). The presence of salinity stress biomarkers was assessed at the genetic level throughout PCR detection of 19 genes reported to be key actors in osmoregulation, and at the proteomic level with the sequencing of peptides (tandem mass spectrometry MALDI TOF/TOF), expressed in ark tissues exposed to different salinities. None of the tested genetic markers could be amplified by PCR, suggesting that A. tuberculosa has significant genetic differences compared to other mollusks. Proteomic analysis by mass spectrometry on A. tuberculosa gill tissue, allowed to identify 26 peptides expressed in presential and differential forms at different salinities, highlighting possible markers such as HSP70 and trans-membrane chloride channel transportation protein, to be related with salinity adaptation. These amino acid sequences will allow the design of target specific primers for A. tuberculosa, to implement future research in ecophysiology of this important fishery resource. Rev. Biol. Trop. 65 (3): 1142-1151. Epub 2017 September 01.

2.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 23(2): 117-126, mayo-agos. 2016. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1094255

ABSTRACT

Se estudia la diversidad de anélidos poliquetos asociados al biotopo intermareal del manglar del Santuario Nacional los Manglares de Tumbes, Perú. El muestreo se realizó en dos sitios, uno cercano a la desembocadura y el otro distante aproximadamente 6 km rio arriba. En cada lugar se establecieron dos estaciones fijas, una asociada a zonas bajas del intermareal con presencia de Anadara tuberculosa (ZBI) y otra asociada a la zona altas del intermareal con presencia de Ucides occidentalis (ZBI). Los muestreos se repitieron en diciembre del 2012 y marzo del 2013. El número total de especies de poliquetos registrado fue 57, la composición de especies no fue similar entre las asociaciones y entre las estaciones fijas. Las estaciones asociadas a ZBI tuvieron un mayor número de especies, abundancias e índices de diversidad mayores que las estaciones asociadas a ZAI. En cuanto a los grupos tróficos, las estaciones asociadas a ZAI tuvieron 4 grupos mientras que las estaciones asociadas a ZBI tuvieron 6 grupos tróficos. En la poliquetofauna asociada a ZBI dominaron, en número de especie los carnívoros mientras que en la asociada a ZAI, fueron los carnívoros y los alimentadores de depósito superficial, asimismo dominaron en abundancia los alimentadores de depósito sub superficial. El análisis multivariado demostró diferencia significativa en la estructura y composición trófica de las asociaciones, con mayor dispersión y variabilidad en el ZAI.


The diversity of annelids polychaete associated with intertidal mangrove biotope of the Santuario Nacional los Manglares de Tumbes is studied. Sampling was conducted at two sites, one near the river mouth and the other distant about 6 km upstream. In each place, two fixed stations were established, one associated to high intertidal zone with the presence of Anadara tuberculosa (ZBI) and other associated to low intertidal zone with the presence of Ucides occidentalis (ZAI). The samples were taken in December 2012 and March 2013. The total number of species registered was 57 species composition was not similar between associations and between fixed stations. The stations associated to ZBI had more number of species abundances and indices greater diversity than to ZAI. As trophic groups, the stations associated to ZAI had four groups whereas stations associated to ZBI had 6 trophic groups. The poliquetofauna associated with ZBI dominated in number of species, the carnivores while poliquetofauna associated to ZAI, was carnivores and surface deposit feeders also dominated in abundance subsurface deposit feeders. Multivariate analysis showed significant differences in the structure and trophic composition of partnerships, with greater dispersion and variability in the ZAI.

3.
Rev. biol. trop ; 63(supl.1): 287-298, abr. 2015. tab, graf
Article in Spanish | LILACS, SaludCR | ID: biblio-958140

ABSTRACT

Resumen El presente estudio describe la dinámica de la población del bivalvo Anadara tuberculosa conocido en Costa Rica como piangua, en varios manglares de Golfito y Playa Blanca de Puerto Jiménez, Golfo Dulce en la costa Pacífica de Costa Rica. El estudio está basado en varios muestreos realizados mensualmente durante el periodo 2008-2010. A cada individuo recolectado se midió la longitud, el peso total y el peso fresco para calcular variables como el rendimiento, densidad y distribución de esta especie. La población de pianguas en los manglares de Golfito presentó mayor densidad (2.77 individuos/m2) que el manglar de Playa Blanca (0.14 individuos/m2). Se observó que los individuos de Playa Blanca presentaron mayor longitud (48.35mm) que los reportados para los manglares de Golfito (42.51mm), este último valor, por debajo del mínimo de extracción estipulado por Ley. Playa Blanca presentó también el mayor peso total (36.35g) que Golfito (24.48g). Este aumento del peso total en los individuos de Playa Blanca incide en que el rendimiento de la carne en este manglar resulte menor (17.01%) que en Golfito (23.45%). Los resultados sugieren que la población de A. tuberculosa puede encontrase en estado de reducción en estos manglares y por consiguiente, es necesario implementar proyectos de repoblamiento de este molusco en los manglares del Golfo Dulce, en conjunto con proyectos de manejo en una acción en conjunto con las autoridades gubernamentales responsables, organizaciones no gubernamentales y la Sociedad Civil, para hacer de esta especie un recurso que sea sostenible y aprovechada por diferentes actores de la comunidad.


Abstract The density, population, length, yield and sex proportion of the Anadara tuberculosa Sowerby (1833) were studied in the mangroves of Golfito and Playa Blanca, Golfo Dulce, Costa Rica from 2008-2010. A. tuberculosa was more abundant in Golfito mangroves (2.77 units m2), than Playa Blanca mangrove (0.14 units m2). The average lengths were 42.1mm for Golfito (under the Costa Rican legal minimal length for exploitation: 47mm) and 48.35mm for Playa Blanca mangrove. Maximum densities in Golfito were measured in the outlet of Purruja River (mangrove of Purruja) and mangroves Congo, Ceibo y la Trocha. The average total weights were 24.48g for Golfito and 36.35g for Playa Blanca. The condition index (a meat yield measurement) was higher in Golfito (23.45%) than in Playa Blanca (17.01%). The male ratio was 1:1. These results suggest that A. tuberculosa population is declining in these mangroves. Therefore, it's necessary to implement repopulation projects of the mollusc in the mangroves of Golfo Dulce, in conjunction with government authorities, NGOs and civil society. Mangrove workers and consumers are needed in that potential projects, to make the mollusc a sustainable natural resource exploited by different community members. Rev. Biol. Trop. 63 (Suppl. 1): 287-298. Epub 2015 April 01.


Subject(s)
Animals , Bivalvia/classification , Arcidae/classification , Wetlands , Costa Rica
4.
Rev. biol. trop ; 62(2): 473-482, Jun.-Aug. 2014. graf, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-715445

ABSTRACT

Anadara tuberculosa is one of the most important bivalves along the Western Pacific coast because of its commercial value. Nevertheless, the variability in growth, longlife span, natural mortality and reproductive parameters of this mangrove cockle has not yet been described. The aim of this study was to analyze these lifehistory traits in three areas of the Southern coast of Ecuador. Empirical and length-based methods were used to estimate these biological parameters. Body size data were collected from the commercial fishery between 2004 and 2011 in landing ports near to the Archipelago of Jambeli [Puerto Bolivar (PB), Puerto Jeli (PJ) and Puerto Hualtaco (PH)]. The von Bertalanffy growth parameters for combined sex were estimated between 70.87 to 93.45mm for L∞ and 0.22 to 0.80/year for k. The growth indices (Φ’) ranged from 3.17 to 3.85, while the overall growth performance (OGP) ranged from 5.03 to 5.82. The mean of long-life span (t max), size and age at maturity (L50% and t50%) were estimated in 7.71±2.53years, 39.13±2.24mm and 1.46±0.56years for PB; 9.51±2.85years, 37.78±1.95mm and 1.37±0.41years for PJ and 5.81±2.11years, 39.73±3.31mm and 0.94±0.41years for PH. Natural mortality (M) ranged from 0.46 to 1.28/year. We concluded that significant intra-specific variation was observed in a temporal scale in Φ’ and OGP indices as well as L50% and M. Therefore, temporal changes in these life-history traits should be taken into account when assessing the status of the mangrove cockle fishery.


La pesquería de la concha prieta (Anadara tuberculosa) es una de las más importantes a lo largo de la costa del Pacifico. Las variaciones intra-especificas en el crecimiento, longevidad, mortalidad natural y parámetros reproductivos de la concha prieta, aún no han sido descritas. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue analizar esos parámetros biológicos en tres áreas al Sur de Ecuador. Métodos empíricos y basados en tallas fueron empleados para estimar los parámetros de historia de vida. Los datos de tallas analizados correspondieron al periodo 2004-2011 y son provenientes del muestreo de los desembarques de los puertos adyacentes al Archipiélago de Jambeli [Puerto Bolivar (PB), Puerto Jeli (PJ) y Puerto Hualtaco (PH)], al Sur de Ecuador. Los parámetros de crecimiento oscilaron entre 70.87 y 93.45mm de L∞ y 0.22 a 0.80/año de k. Mientras que los índices de crecimiento entre 3.17 a 3.85 de Φ’ y 5.03 a 5.82 de OGP. Los valores promedio de longevidad (t max), talla y edad de madurez (L50% y t50%) fueron de 7.71±2.53años, 39.13±2.24mm y 1.46±0.56años en PB; 9.51±2.85años, 37.78±1.95mm y 1.37±0.41años en PJ y de 5.81±2.11años, 39.73±3.31mm y 0.94±0.41años en PH. Las estimaciones de mortalidad natural (M) oscilaron entre 0.46 y 1.28/año. Importantes cambios intra -especificos se observaron a escala temporal tanto en los índices Φ’ y OGP, así como en L50% y M. Por lo tanto, se sugiere considerar las variaciones temporales en los parámetros biológicos de A. tuberculosa, al momento de caracterizar el estatus de su pesquería y más aun si es sometida a altos niveles de extracción.


Subject(s)
Animals , Female , Male , Bivalvia/physiology , Bivalvia/classification , Bivalvia/growth & development , Ecuador , Life Cycle Stages , Population Density , Population Dynamics , Seasons , Species Specificity
5.
Rev. biol. trop ; 60(1): 203-217, Mar. 2012. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-657773

ABSTRACT

The fisheries and growth of Ark Clams (Arcoida: Arcidae) Anadara tuberculosa in Málaga Bay, Colombian Pacific, 2005-2007. A. tuberculosa, is the most important bivalve species under exploitation in Colombia. Here, this species is found from Cabo Corrientes (Chocó) to the Ecuador border, in muddy substrates of mangrove forests. In order to determine the growth and the state of fisheries of A. tuberculosa, between December 2005 and April 2007, both, biological (in situ) and commercial studies were performed at Bahia Malaga (Colombian Pacific). The growth was estimated using the general equation of von Bertalanffy, with prior application of the methods of Bhattacharya and Powell-Wetherall. Mortality and exploitation rate were determined using the inverse model of von Bertalanffy. For the biological samplings, a total of 446 individuals of A. tuberculosa (0.64±0.13 individuals/m²) and 53 individuals (0.05±0.049 individuals/m²) of Anadara similis were collected. 79% of the catch was below 51mm. In the commercial samplings, 836 individuals of A. tuberculosa (size range: 31.1-92.2mm) were measured, but no A. similis samples were available for this. Recruitment of A. tuberculosa was higher during March, May, July and November. According to the data, A. tuberculosa might be reproducing during December, February, April and August. The data gathered with the biological samples were more reliable on explaining the growth of A. tuberculosa (K=0.332per year, L∞=88.256mm, t0=0.0556years) than the one taken from market samples (K =0.256per year, L∞=89.77mm, t0=0733years). The high exploitation rate (77%), the low density and the high mortality suggest that A. tuberculosa is in overexploitation state in Bahia Malaga and management strategies are urgently required.


Anadara tuberculosa es el bivalvo de mayor explotación en la costa pacífica de Colombia, se distribuye en Colombia desde Cabo Corrientes (Chocó) hasta los límites con el Ecuador, está asociada al bosque de manglar. Con el objetivo de determinar el estado de la pesca y su crecimiento, entre diciembre 2005 y abril 2007, se realizaron muestreos comerciales no sistemáticos y un muestreo biológico intensivo en Bahía Málaga. El crecimiento, se estimó utilizando la forma general de von Bertalanffy, con previa aplicación de los métodos de Bhattacharya & Powell-Wetherall. La mortalidad y tasa de explotación fueron determinadas usando el modelo inverso de von Bertalanffy. Se encontró una densidad de 0.64±0.13 individuos/m². En el muestreo comercial se midieron 836 individuos de Anadara tuberculosa con tallas entre 31.1mm y 92.2mm. Los datos biológicos fueron más confiables para explicar el crecimiento de Anadara tuberculosa (K=0.332 por año, L∞=88.256mm, t0=-0.0556 años) que los datos comerciales (K=0.256 por año, L∞ =89.77mm, t0=0.733 años). La tasa de explotación alta (77%), baja densidad y alta mortalidad, sugieren que Anadara tuberculosa se encuentra en un estado de sobre-explotación y requiere urgentes estrategias de manejo.


Subject(s)
Animals , Humans , Male , Arcidae/growth & development , Arcidae/classification , Bays , Colombia , Pacific Ocean , Population Density , Population Dynamics , Rhizophoraceae , Seasons
6.
Rev. biol. trop ; 59(1): 159-170, mar. 2011. graf, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-638053

ABSTRACT

Growth is one of the key processes in the dynamic of exploited resources, since it provides part of the information required for structured population models. Growth of mangrove cockle, Anadara tuberculosa was estimated through length-based methods (ELEFAN I y NSLCA) and using diverse shell length intervals (SLI). The variability of L∞, k and phi prime (Φ`) estimates and the effect of each sample were quantified by jackknife techniques. Results showed the same L∞ estimates from ELEFAN I and NSLCA across each SLI used, and all L∞ were within the expected range. On the contrary, k estimates differed between methods. Jackknife estimations uncovered the tendency of ELEFAN I to overestimate k with increases in SLI, and allowed the identification of differences in uncertainty (PE and CV) between both methods. The average values of Φ`derived from NSCLA1.5 and length-age sources were similar and corresponded to ranges reported by other authors. Estimates of L∞, k and Φ` from NSCLA1.5 were 85.97mm, 0.124/year and 2.953 with jackknife and 86.36mm de L∞, 0.110/year de k and 2.914 de Φ` without jackknife, respectively. Based on the observed evidence and according to the biology of the species, NSCLA is suggested to be used with jackknife and a SLI of 1.5mm as an ad hoc approach to estimate the growth parameters of mangrove cockle. Rev. Biol. Trop. 59 (1): 159-170. Epub 2011 March 01.


El crecimiento es uno de los procesos clave en la dinámica de los recursos explotados. En este estudio se estimó el crecimiento de la concha prieta Anadara tuberculosa por medio de métodos basados en tallas (ELEFAN I y NSLCA) y usando distintos intervalos de clase de talla (ICT). La variabilidad de los estimadores para L∞y k, y el efecto de cada muestra e ICT fueron cuantificados por la técnica de jackknife. ELEFAN I y NSLCA producen una misma estimación de L∞para cada uno de los ICT. Por el contrario, para k ambos métodos estiman diferentes valores. Las estimaciones con jackknife permitieron detectar que ELEFAN I sobreestima k a medida que se aumenta el ICT, y a definir diferencias en el grado de incertidumbre (EP y CV) entre ambos métodos. Los valores promedio de Φ` derivados de NSCLA1.5 son similares a los de tallaedad y están dentro del rango reportado por otros autores. Las estimaciones de NSCLA1.5 fueron 85.97mm de L∞, 0.124/año de k y 2.953 de Φ` con jackknife y 86.36mm de L∞, 0.110/año de k y 2.914 de Φ` sin jackknife. Basado en las evidencias mostradas y acorde a la biología de la especie se sugiere utilizar el NSCLA conjuntamente con jackknife y un ICT de 1.5mm para estimar los parámetros de crecimiento de la concha prieta.


Subject(s)
Animals , Arcidae/growth & development , Arcidae/anatomy & histology , Arcidae/classification , Biometry/methods , Ecuador , Time Factors
7.
Rev. biol. trop ; 49(Supl.2): 315-320, dic. 2001. mapas, tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-502386

ABSTRACT

The density, population, length, yield and sex proportion of the mollusks Anadara tuberculosa and A. similis were studied in Bahía de Golfito, Golfo Dulce, Pacific coast of Costa Rica from February 1998 to February 1999. A. tuberculosa was more abundant (0.9 units m(-2)), than A. similis (0.2 units m(-2)); the highest abundance was found at the canal mouths. The average lengths were 43.3 mm for A. tuberculosa and 42.8 mm for A. similis (both under the Costa Rican legal minimal length for exploitation: 47 mm). Maximum lengths were measured in the middle and upstream Canal Mayor, respectively: 43.0 mm and 43.4 mm. The correlation between length and fresh weight was 0.81 (Pearson). The average total weights were 26.2 g for A. tuberculosa and 19.1 g for A. similis. The condition index (a meat yield measurement) was higher in A. similis (21.2%) than in A. tuberculosa (17.2%). The maximum yield for both species lies in the 31-35 mm range. The male ratio was 43.7%. A species recovery plan is urgent because these results suggest both a decrease in density and illegal exploitation.


Subject(s)
Animals , Male , Female , Mollusca/classification , Trees , Costa Rica , Population Density , Sex Distribution , Mollusca/anatomy & histology , Mollusca/growth & development , Body Weight
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