Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina / Caracterización de aislamientos clínicos de Escherichia coli resistente a cefalosporinas de tercera generación de Ushuaia, Argentina

Abstract Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.

Resumen Escherichia coli es uno de los principales patógenos humanos causantes de diferentes infecciones de inicio hospitalario y comunitario. Se determinó que el 1,96% (32/1.632) de los aislamientos de E. coli recuperados entre enero de 2013 y marzo de 2015 en el Hospital Regional de Ushuaia, provincia de Tierra del Fuego, fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación (CTG). Estos aislamientos fueron resistentes a cefotaxima (91%) y/o a ceftazidima (28%). No se detectó resistencia a los carbapenemes. Veintiséis aislamientos fueron positivos para el gen blaCTX-M, agrupados como CTX-M-1/15 (54%), CTX-M-9/14 (25%), CTX-M-2 (17%) y CTX-M-1/15 más CTX-M-9/14 (4%). Cinco cepas resistentes a CTG dieron positivo para el gen blaCMY, mientras que un aislamiento presentó la BLEE TEM-19. Doce aislamientos se identificaron como clon hiperepidémico E. coli ST131 y uno como ST69. El análisis de las secuencias del genoma de siete aislamientos seleccionados de E. coli blaCTX-M-15 confirmó la circulación de los clones internacionales de alto riesgo ST131, ST617 y ST405 en la ciudad de Ushuaia.

Meningitis por Aeromonas complejo hydrophila productora de carbapenemasa: a propósito de un caso / Meningitis due to carbapenemase-producing Aeromonas hydrophila: a case report

Se describe una presentación clínica inusual de infección por Aeromonas complejo hydrophila y se destaca la importancia del correcto diagnóstico microbiológico para adecuar el tratamiento. Paciente de 6 años consultó por fiebre y drenaje de líquido serohemático de herida quirúrgica por antecedente de craneotomía con duroplastia la semana previa. Laboratorio con parámetros normales y tomografía computada sin cambios relevantes. Punción lumbar: leucocitos 91/mm3, proteínas 89 mg/dl, glucosa 36 mg/dl. Comenzó tratamiento con vancomicina y ceftazidima. Cultivo de líquido cefalorraquídeo: bacilo gramnegativo, oxidasa positivo, fermentador de glucosa. Se rotó a meropenem. A las 72 horas, se informó, por método difusión y Vitek2, Aeromonas complejo hydrophila: sensible a trimetoprimasulfametoxazol, ciprofloxacina, cefotaxima y meropenem. Se realizó método Blue Carba para detección de carbapenemasas con resultado positivo. Se rotó a trimetoprima-sulfametoxazol. Completó 21 días de tratamiento con evolución clínica favorable

Here we describe an unusual clinical presentation of infection due to Aeromonas hydrophila and underline the importance of a correct microbiological diagnosis for an adequate treatment. A 6-year-old patient with a history of craniotomy with duraplasty the week before consulted for fever and drainage of serosanguineous fluid from the surgical wound. The laboratory parameters were normal and the computed tomography scan showed no relevant changes. Lumbar puncture: leukocytes: 91/mm3; proteins: 89 mg/dL; glucose: 36 mg/dL. Treatment with vancomycin and ceftazidime was started. Cerebrospinal fluid culture: oxidase-positive, glucose-fermenting Gram-negative bacillus. Treatment was changed to meropenem. At 72 hours, using a diffusion method and Vitek 2, it was reported as Aeromonas hydrophila sensitive to trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem. The Blue-Carba method was performed to detect carbapenemases; the result was positive. Treatment was changed to trimethoprimsulfamethoxazole. The patient completed 21 days of treatment with a favorable clinical course.

Occurrence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) and carbapenemases among ampicillin-resistant enterobacteriales recovered from a municipal raw sewage in Minas Gerais, Brazil

SUMMARY Introduction: The capacity of resistance to ß-lactam among enterobacteriales is notable, mainly into water environment. Herein, many species of this family have the ability to carrier and produce ß-lactamases enzymes, such as extended-spectrum ß-lactamases (ESBLs) and carbapenemases. However, contrary to clinical settings, where the distribution of resistant bacteria is well documented, the evidence of resistant pathogens in the domestic sewage has been little explored, especially in Brazil. Thus, we aimed to investigate the occurrence of ESBL and carbapenemases between ampicillin-resistant enterobacteriales recovered from a municipal raw sewage in Minas Gerais, Brazil. Methods: Enterobacteriales were isolated from sewage samples on MacConkey agar supplemented with ampicillin. Species identification was performed by biochemical and morphological methods and the resistance profile determined by the Kirby-Bauer test. The production of ESBL and carbapenemase was investigated in all isolates by phenotypic tests. Results and discussion: A total of 45 species of enterobacteriales resistant to ampicillin were recovered (37 Escherichia coli, four Klebsiella pneumoniae, and one Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii and Pantoea agglomerans). Most isolates showed a high ß-lactam susceptibility profile (14/45, 31.1 %), however E. coli with decreased susceptibility to imipenem was detected (2/37; 2.7 %). ESBL-positive isolates were mostly identified as E. coli (10/45; 22.2 %), but no isolates were positive carbapenemase. Conclusion: Domestic sewage is an important source of ß-lactams resistant determinants in Brazil.

Introdução: a capacidade de resistência aos beta-lactâmicos entre enterobacteriales é notável, principalmente no ambiente aquático. Nessa direção, muitas espécies desta família têm a capacidade de transportar e produzir enzimas ß-lactamases, especialmente a ß-lactamases de espectro estendido (ESBL) e as carbapenemases. Porém, ao contrário do cenário clínico, onde a distribuição de bactérias resistentes é bem documentada, as evidências de patógenos resistentes no esgoto doméstico têm sido pouco exploradas, principalmente no Brasil. Assim, objetivamos investigar a ocorrência de ESBL e carbapenemases entre enterobacteriales resistentes à ampicilina recuperadas de um esgoto bruto municipal em Minas Gerais, Brasil. Métodos: enterobacteriales foram isoladas de amostras de esgoto em ágar MacConkey suplementado com ampicilina. A identificação das espécies foi realizada por métodos bioquímicos e morfológicos e o perfil de resistência determinado pelo teste de Kirby-Bauer. A produção de ESBL e carbapenemase foi investigada em todos os isolados por testes fenotípicos. Resultados e discussão: foram recuperadas 45 isolados de enterobacteriales resistentes à ampicilina (37 Escherichia coli, quatro Klebsiella pneumoniae e uma Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii e Pantoea agglomerans). A maioria dos isolados apresentou um perfil de alta susceptibilidade aos ß-lactâmicos (14/45, 31,1 %), porém E. coli com susceptibilidade diminuída ao imipenem foi detectada (2/37; 2,7 %). Os isolados ESBL-positivos foram identificados principalmente como E. coli (10/45; 22,2 %), mas nenhum isolado foi positivo para a carbapenemase. Conclusão: o esgoto doméstico é uma importante fonte de determinantes de resistência aos ß-lactâmicos no Brasil.

Introducción: la capacidad de resistencia a betalactámicos entre enterobacteriales es notable, principalmente en el medio acuático. En este sentido, muchas especies de esta familia tienen la capacidad de transportar y producir enzimas ß-lactamasas, especialmente ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) y carbapenemasas. Sin embargo, en contraste con el escenario clínico, donde la distribución de bacterias resistentes está bien documentada, la evidencia de patógenos resistentes en las aguas residuales domésticas ha sido poco explorada, especialmente en Brasil. Por lo tanto, nuestro objetivo es investigar la ocurrencia de BLEE y carbapenemasas entre enterobacteriales resistentes a ampicilina recuperadas de un alcantarillado municipal sin tratar en Minas Gerais, Brasil. Métodos: se aislaron enterobacteriales de muestras de aguas residuales en agar MacConkey suplementado con ampicilina. La identificación de las especies se realizó mediante métodos bioquímicos y morfológicos y el perfil de resistencia se determinó mediante la prueba de Kirby-Bauer. La producción de BLEE y carbapenemasa se investigó en todos los aislamientos mediante pruebas fenotípicas. Resultados y discusión: se recuperaron 45 aislamientos de enterobacteriales resistentes a ampicilina (37 Escherichia coli, cuatro Klebsiella pneumoniae y una Klebsiella oxytoca, Citrobacter freundii y Pantoea agglomerans). La mayoría de los aislamientos tenían un perfil de susceptibilidad alto a los (3-lactámicos (14/45, 31,1 %), pero se detectó E. coli con susceptibilidad reducida al imipenem (2/37; 2,7 %). Los aislamientos positivos para BLEE se identificaron principalmente como E. coli (10/45; 22,2 %), pero ningún aislado fue positivo para carbapenemasa. Conclusión: las aguas residuales domésticas son una fuente importante de determinantes de la resistencia a los ß-lactámicos en Brasil.

Caracterización clínica, epidemiológica y microbiológica de bacteriemias producidas por enterobacterias resistentes a carbapenems en un hospital universitario de Córdoba, Argentina / Clinical, epidemiological and microbiological characterization of bacteremia produced by carbapenem-resistant enterobacteria in a university hospital in Córdoba, Argentina

Resumen Introducción: Las enterobacterias son una causa principal de infecciones del torrente sanguíneo y su resistencia antimicrobiana se encuentra en aumento. Esto lleva a un incremento de la morbilidad-mortalidad y de los costos en la salud pública. Las enterobacterias resistentes a carbapenems representan un grave desafío a nivel global ya que existen escasas opciones terapéuticas disponibles. Objetivo: Caracterización clínico/microbiológica de las bacteriemias resistentes a carbapenémicos observadas en un período de 4 años. Material y Método: Estudio retrospectivo, observacional y descriptivo, sobre las bacteriemias por enterobacterias resistentes y sensibles a carbapenems. Resultados: Se analizó un total de 84 pacientes con bacteriemia por enterobacterias resistentes y sensibles a carbapenems. Entre las resistentes, observamos una mayor proporción de: tratamiento antimicrobiano previo, hospitalización en unidad de terapia intensiva (UTI), inicio de la bacteriemia en UTI y antecedentes de β-lactamasas de espectro extendido. Además, se detectó un amplio predominio de Klebsiella pneumoniae productor de KPC y una mortalidad atribuible de 52,4%. Discusión: El estudio posibilitó profundizar el conocimiento de una enfermedad emergente de elevada mortalidad, en vistas al diseño y aplicación de estrategias de control de infecciones y de esquemas de tratamiento efectivos adaptados a la epidemiologia local.

Abstract Background: Enterobacteriaceae are a major cause of bloodstream infections and their antimicrobial resistance continues to increase. This leads to higher morbidity-mortality rates and public health costs. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae represent a serious challenge globally, since there are few therapeutic options available. Aim: Clinical/microbiological characterization of the carbapenem-resistant bacteremia observed over a period of 4 years. Methods: Retrospective, observational and descriptive study about bacteremia caused by carbapenem-resistant and susceptible Enterobacteriaceae. Results: A total of 84 patients with bacteremia including carbapenem-resistant and susceptible Enterobacteriaceae were analyzed. We found that patients infected with carbapenem-resistant strains presented a higher proportion of: previous antibiotic treatment, hospitalization in intensive care unit (ICU), onset of the bacteremia during hospitalization in ICU and previous infection with extended-spectrum-beta-lactamase producing Enterobacteriaceae. Additionally, we observed a predominance of KPC-producing Klebsiella pneumoniae and an attributable mortality rate of 52.4%. Discussion: This study allowed for a better understanding of an emerging problem with high mortality, which in turn is useful for the design and adoption of infection control strategies and effective treatment regimens adapted to our local epidemiology.

Factors Associated with the Presence of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Pathogens in Urinary Tract Infections in a Private Clinic in Lima, Peru / Factores asociados con la presencia de patógenos productores de betalactamasas de espectro extendido en infecciones urinarias en una clínica privada, Lima (Perú) / Fatores associados á presença de patógenos produtores de betalactamases de espectro estendido em infecções urinárias em uma clínica privada, Lima (Peru)

Abstract Introduction: Urinary tract infections (UTIS) are the second most frequent reason for healthcare visits, and antibiotic resistance among gram-negative bacteria of the Enterobacteriaceae family has increased significantly worldwide. The emergence of microorganisms that produce extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) is especially problematic. This study aims to identify factors associated with the presence of UTI caused by ESBL-producing pathogens. Material and methods: An analytical cross-sectional study was conducted, and the urine culture database from a private healthcare clinic was analyzed. Factors possibly associated with the appearance of UTIS due to ESBL-producing pathogens were analyzed, including sex, age, number of hospitalizations, and previous UTIS. Results: A total of 1405 positive urine cultures were studied, 85.48% of which belonged to women. The mean age of the subjects was 39.98 ± 24.51 years, 24.13% of whom were over 60 years old. Of these, 55.56% had been attended on an outpatient basis. Almost half (49.18%) of the cultures tested positive for ESBL-related UTI, 96.58% of which had not presented with a previous UTI. A statistically significant association was found between sex and the development of UTI caused by ESBL-producing microorganisms (p = 0.007), with the male sex having the highest association (prevalence ratio, 1.224; 95% confidence interval: 1.035-1.448). In addition, age, number of previous hospitalizations, and prior intensive care unit admissions also showed associations with UTI development. No association was found with the presence of previous UTIS. Conclusion: A high frequency of UTIS were ESBL-related, and the factors associated with ESBL-related UTIS were male sex, age >60, and previous hospitalizations.

Resumen Introducción: las infecciones del tracto urinario (ITU) son el segundo motivo más frecuente de atención médica, y la resistencia a los antibióticos entre las enterobacterias gramnegativas ha aumentado de manera importante en todo el mundo, dada la aparición de organismos productores de betalactamasa de espectro extendido (BLEE). Se busca identificar factores asociados a la presencia de ITU por patógeno productor de BLEE. Materiales y métodos: se realizó un estudio trasversal analítico, un análisis de la base de datos de urocultivos de una clínica privada y una evaluación de los factores posiblemente asociados a la presentación de ITU por el microorganismo BLEE, como el sexo, la edad, el número de hospitalizaciones e ITU previas. Resultados: se estudiaron 1405 urocultivos positivos y se encontró que el 85.48 % fueron de sexo femenino. La edad media de la población fue de 39.98 ± 24.51 años, el 24.13 % de edad mayor a 60 años, y el 55.56 % habían sido atendidos ambulatoriamente. El 49.18 % de los cultivos fue positivo para ITU BLEE, de los cuales el 96,58 % no habían presentado una ITU previa. Se encontró que existe una asociación estadísticamente significativa (0,007; p < 0,05) entre el sexo y el desarrollo de ITU por microorganismo productor de BLEE. El masculino es el de mayor asociación (OR 1,224; IC95 %: 1,035-1,448). También se encontró una asociación con la edad, el número de hospitalizaciones previas y haber estado en UCI. No se encontró ninguna asociación entre la presencia de ITU previas. Conclusiones: existe una elevada frecuencia de ITU BLEE, y los factores asociados a dicha infección fueron tener sexo masculino, una edad mayor a 60 años y hospitalizaciones previas.

Resumo Introdugao: as infeções do trato urinário (ITU) são o segundo motivo mais frequente de atenção médica e a resistência aos antibióticos entre as enterobactérias gram-negativas tem aumentado de maneira importante no mundo todo; destacado pela aparição de organismos produtores de betalactamase de espectro estendido (BLEE). Busca-se identificar fatores associados á presenta de ITU por patógeno produtor de BLEE. Materiais e métodos: se realizou estudo transversal analítico, analisando a base de dados de urocultura de uma clínica privada, avaliando fatores possivelmente associados á apresentação de ITU por microrganismo BLEE, como o sexo, a idade, o número de hospitalizar es e ITU prévias. Resultados: estudaram-se 1405 uroculturas positivas, encontrado que o 85,48% foram de sexo feminino. A idade média da populacho foi de 39.98 ± 24.51 anos, 24.13% de idade maior a 60 anos, 55.56% tinham sido atendidos ambulatoriamente. O 49.18% dos cultivos foi positivo para ITU BLEE, dos quais 96.58% não tinham apresentado uma ITU prévia. Se encontrou que existe associação estatisticamente significativa (0.007; p < 0.05) entre o sexo e o desenvolvimento de ITU por microrganismo produtor de BLEE, sendo o masculino o de maior associação (OR 1,224; IC 95%: 1,035-1,448). Além disso, tanto a idade quanto o número de hospitalizares prévias, e ter estado em UCI também mostraram associação. Não se encontrou associação entre a presença de ITU prévias. Conclusoes: existe uma elevada frequência de ITU BLEE e os fatores associados a infecto por ITU BLEE foram o sexo masculino, idade > 60 anos e hospitalização prévias.

Nuevos antibióticos en la era de la multiresistencia: revisión sobre ceftolozano/tazobactam y ceftazidima/avibactam / New antibiotics in the multiresistance era: review about ceftolozane/tazobactam and ceftazidime/avibactamISSN 2314-3193. Actualizaciones en sida e infectología. Buenos Aires. noviembre 2020. volumen 28. número 103: 57-71

En los últimos años se han desarrollado nuevos antimicrobianos destinados a combatir infecciones causadas por microorganismos multirresistentes a drogas (MDR), incluyendo combinaciones entre agentes ß-lactámicos (BL) e inhibidores de ß-lactamasas (IBL). En nuestro país se encuentran disponibles dos nuevas combinaciones de BL/IBL: ceftolozano/tazobactam (C/T) y ceftazidima/avibactam (CAZ/AVI). La adición de tazobactam a ceftolozano incrementa la actividad in vitro contra microorganismos productores de BL de espectro extendido (BLEE), por lo que la combinación presenta una potente actividad intrínseca frente a P. aeruginosa. Por su parte, CAZ/AVI conserva las características que definen el perfil de actividad de ceftazidima, por lo que con el agregado de avibactam presenta una potente actividad inhibidora frente a las BLEE y carbapenemasas (KPC, ß-lactamasas de clase C y algunas de clase D). Se presenta a continuación una revisión de la evidencia publicada. A partir de la misma, y considerando la situación actual de tasas crecientes de resistencia antimicrobiana, particularmente en bacilos Gram negativos, se considera que el uso de C/T o CAZ/AVI constituye una excelente alternativa para el manejo de infecciones graves causadas por microorganismos multirresistentes. Sin embargo, su utilización en forma empírica no es recomendable, salvo en situaciones puntuales y estrictamente seleccionadas, y en el contexto un programa de uso racional de antibióticos, bajo el control por parte del equipo de infectología responsable

In recent years, new antimicrobials have been developed to combat infections caused by multidrug-resistant microorganism (MDR), including combinations between ß-lactam agents (BL) and ß-lactamase inhibitors (IBL). Two new combinations of BL / IBL are available in our country: ceftolozano / tazobactam (C / T) and ceftazidime / avibactam (CAZ / AVI). The addition of tazobactam to ceftolozano increases in vitro activity against microorganisms producing extended spectrum BL (ESBL), so the combination has a potent intrinsic activity against P. aeruginosa. For its part, CAZ / AVI retains the characteristics that define the activity profile of ceftazidime, to which with the addition of avibactam it presents a potent inhibitory activity against ESBL and carbapenemases (KPC, ß-lactamases of class C and some of class D). A review of the published evidence is presented below. Based on this, and considering the current situation of increasing rates of antimicrobial resistance, particularly in Gram-negative bacilli, we consider that the use of C/T or CAZ/AVI is an excellent alternative for the management of serious infections caused by multi-resistant microorganisms. However, its use empirically is not recommended, except in specific and strictly selected situations, and in the context of a program for the rational use of antibiotics, under the control of the responsible infectious disease team

Distribution of extended-spectrum beta-lactamase TEM and CTX-M resistance genes among Proteus species Isolated in Sudan

Proteus species are found in the human intestinal tract as part of normal flora. Proteus species are also found in multiple environmental habitats, including long-term care facilities and hospitals, and can cause both community and nosocomial infections. For a long time Proteus was known to be susceptible to beta-lactam antibiotics but nowadays they become resistant. The aim of this study was to detect the Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) TEM and CTX-M genes in 90 Proteus species isolated from urine and wound swabs, obtained from different hospitals in Khartoum state, Sudan, from January to August 2018. Antimicrobial sensitivity was carried out using the following set of antibiotics: amoxiclav, ceftazidime, gentamicin, meropenem, cefotaxime, ciprofloxacin, amoxicillin, ceftriaxone and cotrimoxazole. ESBL producing strains were detected by double disc diffusion synergy test and the resistance genes TEM and CTX-M were detected by Polymerase Chain Reaction (PCR). Antibiotic resistance was found: amoxicillin 40 percent, ceftazidime 25.6 percent, ceftriaxone 23.3 percent, gentamicin 22.2 percent, cotrimoxazole 21.1 percent, and cefotaxime 18.9 percent. Most of the isolates were sensitive to meropenem 92.2 percent and ciprofloxacin 86.7 percent. In double-disk diffusion synergy test, 20 isolates (22.2 percent) were found to be positive for ESBL. The PCR demonstrated that TEM gene was present in 18 isolates (90 percent). It was present alone in 11 isolates (55 percent) and in combination with CTX-M gene in seven isolates (35 percent). The percentage of ESBL producing strains of Proteus was 23.5 percent. This percentage is a bit lower than in previous studies in Sudan. In conclusion; it seems that the CTX-M gene is emerging among Proteus species in SudanAU)

Las especies de Proteus se encuentran en el tracto intestinal humano y forman parte de su flora normal. También se localizan en el medio ambiente y otros hábitats, incluyendo hospitales y diversas instituciones de salud, provocando tanto infecciones en la comunidad como nosocomiales. Durante mucho tiempo, las especies de Proteus fueron susceptibles a los antibióticos betalactámicos, pero actualmente se han tornado resistentes. El propósito de este estudio fue detectar genes de resistencia betalactamasas de espectro extendido (BLEE) TEM y CTX-M, en 90 especies de Proteus aisladas en orina y heridas, provenientes de diversos hospitales del estado de Jartum, Sudán, entre enero y agosto de 2018. La sensibilidad antimicrobiana se determinó con el siguiente juego de antibióticos: amoxiclav, ceftazidima, gentamicina, meropenem, cefotaxima, ciprofloxacina, amoxicilina, ceftriaxona y cotrimoxasol. Las cepas productoras de BLEE se detectaron mediante la técnica de sinergia de doble disco, y los genes de resistencia TEM y CTX-M mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Se encontró resistencia antibiótica: amoxicilina 40 por ciento, ceftazidima 25,6 por ciento, ceftriaxona 23,3 por ciento, gentamicina 22,2 por ciento, cotrimoxasol 21,1 por ciento y cefotaxima 18,9 por ciento. La mayor parte de los aislamientos fueron sensibles a meropenem (92,2 por ciento) y ciprofloxacina (86,7 por ciento). Con la técnica de sinergia de doble disco se detectó positividad a BLEE en 20 aislamientos (22,2 por ciento). Mediante PCR se demostró que el gen que codifica TEM estaba presente en 18 aislamientos (90 por ciento); de forma aislada en 11 aislamientos (55 por ciento) y combinado con el gen CTX-M en los otros siete (35 por ciento). El porcentaje de cepas de Proteus productoras de BLEE fue de 23,5 por ciento. Este valor es ligeramente inferior que los detectados en estudios previos en Sudán. En conclusión, hay evidencias de que el gen CTX-M está emergiendo entre las especies de Proteus en Sudán(AU)

Perfil de sensibilidad de Escherichia coli aislados de infecciones del tracto urinario de pacientes del Hospital Regional de Villarrica en el periodo de julio 2013 a agosto 2015 / Sensitivity profile of Escherichia coli isolated from urinary tract infections of patients of the Regional Hospital of Villarrica from July 2013 to August 2015

Introducción: El uso inapropiado de los antimicrobianos está conduciendo a la disminución de la sensibilidad antimicrobiana de microorganismos que producen enfermedades infecciosas. El uso clínico de los antimicrobianos ha sido paralelo al surgimiento de bacterias resistentes a su acción. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo, retrospectivo de corte transversal, con muestreo no probabilístico de casos consecutivos. La selección de antibióticos incluyó solo aquellos que tienen actividad frente a bacilos gram negativos y para la interpretación de los diámetros de los halos de inhibición se tomaron en cuenta los estándares de la Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI versión 2015). Resultados: La ampicilina presentó una resistencia del 100%, en cambio la ciprofloxacina presentó una sensibilidad del 73%, la amikacina del 100% y la gentamicina del 82%. La familia de los carbapenemicos presentó una sensibilidad del 100%. Dentro del grupo de los nitrofuranos se constató una sensibilidad del 96%. El trimetoprim/ sulfametoxazol, presentó una sensibilidad del 57%. Se determinó la presencia de Beta Lactamasa de Espectro Extendido (BLEE) en 13% de las cepas de Escherichia coli estudiadas. Conclusiones: La gentamicina, la nitrofurantoína y los carbapenemes presentaron una elevada sensibilidad, por lo que en presencia de cepas con BLEE serían opciones factibles acompañados siempre de la evaluación del perfil renal y clasificando la ITU como complicada o no.

Introduction: The inappropriate use of antimicrobials is leading to a decrease in the antimicrobial sensitivity of microorganisms that cause infectious diseases. The clinical use of antimicrobials has been parallel to the emergence of bacteria resistant to its action. Materials and methods: The sensitivity profile of Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections (UTI) concurrent to the Regional Hospital of Villarrica in the period from 2013 to 2015 was determined. Results: Ampicillin showed a resistance of 100%, ciprofloxacin showed a sensitivity of 73%. Amikacin showed a sensitivity of 100% and gentamicin 82%. The family of carbapenem showed a sensitivity of 100%. Within the group of nitrofurans a sensitivity of 96% was found. Trimethoprim / sulfamethoxazole had a sensitivity of 57%. The presence of Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) was determined in 13% of the strains of Escherichia coli studied. Conclusions: Gentamicin, nitrofurantoin and carbapenem have a high sensitivity, so in the presence of strains with ESBL they would be feasible options always accompanied by the evaluation of the renal profile and classifying the UTI as complicated or not.

Estudio teórico de compuestos derivados de cefalosporinas con potencial actividad inhibitoria frente a proteína de unión a penicilina (PBP) y resistencia a enzimas betalactamasa de espectro extendido (BLEE) producidas por Escherichia coli / Theoretical study of compounds derived from cephalosporins with inhibitory activity potential front to penicillin binding proteins (PBP) and resistance to Extended spectrum Beta-lactamase (ESBL) produced by Escherichia coli

RESUMEN Se han utilizado herramientas computacionales para proponer moléculas derivadas de cefalosporinas con potencial actividad antibacteriana, frente a cepas de Escherichia Coli, con mayor afinidad como inhibidores de enzimas de unión a penicilinas y que a su vez disminuyan o no tengan afinidad por betalactamasas de espectro extendido. Se diseñaron 20 moléculas con base en la estructura molecular de la cefalosporina, las estructuras fueron optimizadas utilizando la teoría del funcional de la densidad, se calcularon descriptores moleculares de reactividad, de forma paralela se sometieron a acoplamiento molecular con las enzimas antes mencionadas. Las moléculas presentaron valores de energía de unión negativos, doce moléculas mostraron una orientación e interacciones favorables en el sitio activo de la enzima de unión a penicilinas y trece moléculas presentaron menor afinidad que el ligando nativo (cefotaxima) por la betalactamasa. Tres moléculas pueden considerarse como potenciales inhibidores de enzimas de unión a penicilinas resistentes y betalactamasas.

SUMMARY Computational tools have been used to propose molecules derived from cephalosporins with potential antibacterial activity, against strains of Escherichia Coli, with higher affinity as inhibitors of penicillin-binding enzymes and which in turn decrease or do not have affinity for extended-spectrum beta-lactamases. 20 molecules were designed based on the molecular structure of the cephalosporin, the structures were optimized using the density functional theory, molecular descriptors of reactivity were calculated, and in parallel form they were subjected to molecular docking with the enzymes mentioned above. The molecules showed negative binding energy values, 12 molecules showed an orientation and favorable interactions in the active site of the penicillin binding enzyme and thirteen molecules had lower affinity than the native ligand (Cefotaxime) for betalactamase. Three molecules can be considered as potential inhibitors of binding enzymes to resistant penicillins and betalactamases.

Carbapenem Resistance in Gram-negative Bacteria in South-western Nigeria: The Role of Extended-spectrum lactamase CTX-M-15 / Resistencia al carbapenem en las bacterias gramnegativas en Nigeria Suroccidental: papel de la betalactamasa de espectro extendido tipo CTX-M-15

ABSTRACT Objective: To determine the role of extended-spectrum β-lactamases in carbapenem-resistant Gram-negative bacteria from south-western Nigeria. Methods: Twenty-seven carbapenem-resistant isolates that were found to be non-carbapenemase producers (15 Escherichia coli, 9 Klebsiella pneumoniae and 3 Pseudomonas aeruginosa) were further studied. These isolates were subjected to analysis including phenotypic and genotypic detection of various β-lactamases, efflux activity, outer membrane protein, plasmids replicon typing, detection of transferable genes and resistances and typing using random amplified polymorphic DNA tests. Results: No isolates demonstrated de-repression of efflux, but all showed either complete loss or reduced production of outer membrane proteins. Transconjugants from these strains contained various genes including plasmid-mediated quinolone resistance and extended-spectrum beta-lactamases. All the transconjugants carried the blaCTX-M-15 gene. The transconjugants had varying minimum inhibitory concentrations of carbapenems ranging from 0.03 μg/ml to 8 μg/ml. Varying resistances to other antimicrobial agents were also transferred with the plasmids. The donor isolates were not clonally related by molecular typing. Conclusion: Resistance to carbapenem antibiotics in this sample was not mediated only by carbapenemases but also by production of extended-spectrum β-lactamases (largely CTX-M-15), accompanied by protein loss. This was an important mechanism underpinning carbapenem resistance in these clinical isolates of various species.

RESUMEN Objetivo: Determinar el papel de las betalactamasas de espectro extendido en la resistencia al carbapenem en las bacterias gramnegativas en Nigeria. Métodos: Veintisiete aislados resistentes al carbapenem que fueron hallados productores de no carbapenemasas (15 Escherichia coli, 9 Klebsiella pneumoniae, y 3 Pseudomonas aeruginosa) fueron estudiados con mayor profundidad. Estos aislados fueron sometidos a análisis incluyendo la detección fenotípica y genotípica de varias betalactamasas, la actividad de eflujo, las porinas de la membrana externa, la tipificación del replicón plasmídico, la detección de genes transferibles y resistencias y tipificación usando pruebas de ADN polimórficas amplificadas aleatorias. Resultados: Ninguno de los aislamientos mostró desrepresión de eflujo, pero todos demostraron la pérdida completa o la producción reducida de porinas externas de la membrana. Los transconjugantes de estas cepas contenían varios genes incluyendo resistencia a la quinolona mediada por plásmidos y betalactamasas de espectro extendido. Todos los transconjugantes portaban el gen blaCTX-M-15. Los transconjugantes tenían diversas concentraciones inhibitorias mínimas de carbapenemas que oscilaban entre 0.03 μg/ml y 8 μg/ml. Varias resistencias a otros agentes antimicrobianos fueron también transferidas con los plásmidos. Los aislamientos del donante no estuvieron relacionados clonalmente por tipificación molecular. Conclusión: La resistencia al antibiótico carbapenem en esta muestra no fue mediada solamente por las carbapenemasas, sino también por la producción de betalactamasas de espectro extendido (en gran parte CTX-M-15), acompañado por pérdida de porina. Éste era un mecanismo importante que sustentaba la resistencia al carbapenem en estos aislados clínicos de varias especies.

Perfil de sensibilidad antimicrobiana de microorganismos causantes de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes con diabetes mellitus en Colombia / Antimicrobial susceptibility profile in urinary pathogens causing community-acquired infections in diabetic patients in Colombia

Resumen Introducción. La infección de las vías urinarias es la más frecuente en pacientes diabéticos, y es un factor determinante de la morbilidad y la mortalidad en este grupo de pacientes. El aumento de la resistencia de los microorganismos adquiridos en la comunidad a los antibióticos comúnmente utilizados para combatirla es alarmante. Objetivo. Determinar el perfil de sensibilidad a los antibióticos de los microorganismos responsables de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes diabéticos atendidos en algunos hospitales de Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de un subgrupo de pacientes diabéticos en el marco de una investigación en adultos con infección de origen comunitario de las vías urinarias. Durante un año, se recolectaron aislamientos de Escherichia coli, Klebsiella spp. y Proteus mirabilis en nueve hospitales de Colombia y se determinó su perfil de sensibilidad mediante métodos microbiológicos y moleculares, para establecer la presencia de betalactamasas de espectro extendido del tipo AmpC y de carbapenemasas del tipo KPC. Resultados. Se recolectaron 68 aislamientos (58 de E. coli, nueve de Klebsiella spp. y uno de P. mirabilis). Cuatro (6,9 %) de los aislamientos de E. coli expresaron dichas betalactamasas, en dos (3,4 %) de ellos, pertenecientes al grupo filogenético B2 y al clon ST131, se detectaron las betalactamasas TEM-1 y CTM-X-15. En otros cuatro (6,9 %) aislamientos de E. coli se encontró el fenotipo AmpC, y en tres de ellos se produjeron las betalactamasas TEM-1 y CMY-2. Un aislamiento de K. pneumoniae expresó la carbapenemasa KPC-3. Conclusión. Se confirmó la presencia de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido y carbapenemasas en microorganismos responsables de infección urinaria adquirida en la comunidad en pacientes diabéticos.

Abstract Introduction: Urinary tract infection is the most common pathology in diabetic patients, and an important determinant of morbidity and mortality among them. The increasing resistance of uropathogens acquired in the community to commonly used antibiotics is alarming. Objective: To identify the profile of antibiotic susceptibility of uropathogens responsible for community-acquired infections among diabetic patients in hospitals in Colombia. Materials and methods: We conducted a descriptive study in a subgroup of diabetic patients in the framework of a larger study in adults with urinary tract infection acquired in the community. Over one year, we collected Escherichia coli, Klebsiella spp. and Proteus mirabilis isolates from nine hospitals in Colombia. Their susceptibility profile was determined using microbiological and molecular methods to establish the presence of extended-spectrum AmpC betalactamases and KPC carbapenemases. Results: We collected 68 isolates (58 E. coli, nineKlebsiella spp. and oneProteus mirabilis). Four (6.9%) of the E. coli isolates expressed extended spectrum betalactamases,two (3.4%) of thembelonged to the phylogenetic group B2 andto ST131 clone and expressed the TEM-1 and CTM-X-15 betalactamases. The AmpC phenotype was found in four(6.9%) of the E. coli isolates, three of which producedTEM-1 and CMY-2 betalactamases. One K. pneumoniaeisolate expressed the KPC-3 carbapenemase. Conclusion: The presence of extended spectrum betalactamases and carbapenemases in uropathogens responsible for community-acquired infection was confirmed in diabetic patients.

Klebsiella pneumoniae Nueva Delhi metalo-betalactamasa en el Hospital Nacional Dos de Mayo. Lima, Perú / Klebsiella pneumoniae NEW DELHI METALO-LACTAMASE IN A PERUVIAN NATIONAL HOSPITAL

RESUMEN La emergencia de enterobacterias productoras de carbapenemasas de tipo Nueva Delhi Metalo beta-lactamasas (NDM), representan, hoy en día, un verdadero problema de salud pública mundial. La presencia de este mecanismo de resistencia limita o anula las opciones terapéuticas para combatir a estas bacterias. En Latinoamérica, las cifras son cada vez más elevadas, pues se reportan en Guatemala, Colombia, Chile, Argentina, entre otros. Perú no ha descrito, hasta la fecha, la presencia de este patrón de resistencia; sin embargo, desde hace varios años se presume de su existencia. Se describen nueve casos de Klebsiella pneumoniae NDM, como agentes infecciosos o colonizantes, en pacientes críticamente enfermos, en su mayoría con patología neuroquirúrgica, del Hospital Nacional Dos de Mayo, en Lima - Perú. Los pacientes de la serie descrita a continuación, representan los primeros reportes de Klebsiella pneumoniae NDM en el Perú.

ABSTRACT The emergence of Enterobacteria producing carbapenemases of type New Delhi Metalo beta-lactamases (NDM), >represent, today, a real problem of world public health. The presence of this resistance mechanism limits or nullifies the therapeutic options to combat these bacteria. In Latin America, the figures are getting higher, as they are reported in Guatemala, Colombia, Chile, Argentina, among others. Peru has not, to date, described the presence of this resistance pattern; however for several years it has been presumed to exist. Nine cases of Klebsiella pneumoniae NDM are described, as infectious or colonizing agents, in critically ill patients, mostly with neurosurgical pathology, of Hospital Nacional Dos de Mayo in Lima - Peru. The patients in the series described below represent the first reports of Klebsiella pneumoniae NDM in Peru.

Escherichia Coli productora de Nueva Delhi metalo-ß-lactamasa en Colombia: reporte de caso / Escherichia Coli producing New Delhi metallo-ß-lactamase in Colombia: A case report

Notificamos un caso de infección por Escherichia coli productora de Nueva Delhi metalo-b-lactamasa (NDM) en un paciente que desarrolló un absceso subcapsular hepático como complicación de una colecistectomía laparoscópica. La NDM es una carbapenemasa adquirida tipo Ambler B, que confiere resistencia a todos los b-lactámicos, excepto al aztreonam, aunque existen reportes de resistencia a este último. En Colombia, la primera descripción de cepas productoras de NDM se realizó en aislamientos de Klebsiella pneumoniae en una unidad de cuidados intensivos neonatales en Bogotá. Desde entonces se han realizado reportes de distintas cepas, siendo esta la primera reportada en el país relacionada con Escherichia coli productora de NDM.

We report a case of infection by New Delhi metallo-β-lactamase (NDM)-producing Escherichia coli in a patient who developed a subcapsular hepatic abscess as a complication of laparoscopic cholecystectomy. NDM is an acquired carbapenemase Ambler class B, which confers resistance to all b-lactams except aztreonam, although there are reports of resistance to the latter. In Colombia, the first report of NDM-producing strains was made on isolates of Klebsiella pneumoniae in a neonatal intensive care unit in Bogota. There have since been reports of different strains, marking the first reported in the country of NDM-producing Escherichia coli.

Frecuencia de escherichia coli betalactamasa de espectro extendido (BLEE), en pacientes con infeccion de vías urinarias. Hospital José Carrasco Arteaga / Frequency of escherichia coli beta lactamase extended spectrum (ESBL), in patients with urinary tract infection. Hopital José Carrasco Arteaga

OBJETIVOS: Determinar la Frecuencia de Eschericia coli Beta Lactamasa de Espectro Extendido en Infecciones de Vías Urinarias, en el hospital José Carrasco Arteaga 2012-2013. MÉTODOLOGÍA: Observacional de tipo descriptivo prospectivo transversal. La población estudiada estuvo conformada por 605 muestras de urocultivos de pacien-tes de las áreas de: consulta externa, emergencia, hos-pitalización y cuidados intensivos. Se efectuó la prueba del método de confirmación apropiado, basado en la inhibición de la enzima ß-Lactamasas de confirmación productora de ß-Lactamasa según las normas Stan-dard Institute Clinical Laboratory. Se realizó el análisis estadístico descriptivo para comprensión e interpreta-ción de datos. RESULTADOS: Se cultivó 605 muestras, se reportó E. coli en 455 muestras de las cuales 82 correspondieron a la cepa productora de ß-Lactamasas de Expectro Ex-tendido un 18%. Según las variables consideradas, de acuerdo al sexo las mujeres representaron el mayor por-centaje con un 87,8%, el grupo etario con mayor repor-te fue el de 51-60 años con el 20,7%, seguido del grupo de 61-70 con el 17,1%, según la procedencia, el área urbana representó 69,5%, de acuerdo a los servicios en consulta externa se reportó 37,8% y en emergencia el 34,1%. CONCLUSIÓN: en el hospital José Carrasco Arteaga en el periodo septiembre 2012-enero 2013 se reportó una prevalencia del 18% de E. coli productora de ß-Lacata-masa en muestras de urocultivo de pacientes de los ser-vicios de consulta externa, emergencia, hospitalización y cuidados intensivos. Las mujeres fueron las más afec-tadas, según procedencia el mayor porcentaje fue del área urbana, el grupo de adultos representó el mayor porcentaje y la consulta externa fue el servicio con mayor frecuencia. (Impacto de los resultados

OBJECTIVES: To determine the frequency of Escherichia coli extended spectrum lactamasa in urinary tract in-fections, at José Carrasco Arteaga Hospital, 2012-2013. METHODOLOGY: It is an observational descriptive cross-sectional study. The population consisted of 605 samples of urine cultures of patients from the areas of: external consultation, emergency, hospitalization and intensive care. The appropriate confirmatory method was tested, it was based on the inhibition of ß-Lacta-masa-producing confirmation enzyme according to the Standard Institute Clinical Laboratory. A descriptive sta-tistical analysis was performed for data comprehension and interpretation. RESULTS: A total of 605 samples were cultured, E. coli was reported in 455 samples, and only 82 corresponded to the extended Expectrum ß-lactamase producing strain with 18%. According to the variables considered, regar-ding sex, women represented the highest percentage with 87.8%, the highest age group was 51-60 years with 20.7%, followed by the group of 61-70 with 17.1%, de-pending on the source, the urban area accounted for 69.5%, according to the services in external consultation 37.8% were reported, and 34.1% were emergency ones. CONCLUSION: A prevalence of 18% of E. coli producing ß-Lactamasa was reported at the José Carrasco Artea-ga Hospital in the period September 2012-January 2013 in urine samples of patients from external consultation, emergency, hospitalization and Intensive care servi-ces. The women were the most affected, according to provenance, the highest percentage was of the urban area, the group of adults represented the highest per-centage and the external consultation service was the most frequent. (Impact of results).

Caracterización clínica de infecciones de vías urinarias producidas por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido en Duitama (Colombia), durante 2010-2015 / Clinical characterisation of urinary tract infections produced by extended-spectrum beta-lactamase-producing enterobacteria in Duitama (Colombia) from 2010-2015

Objetivo: Caracterizar las infecciones de vías urinarias (IVU) producidas por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en Duitama (Colombia) durante 2010-2015. Metodología: Se realizó un estudio descriptivo en 2 instituciones prestadoras de salud a partir de los aislamientos de patógenos BLEE asociados a IVU. Se tomaron variables sociodemográficas, comorbilidades, hospitalizaciones por IVU en el último año, agentes aislados, tratamiento empírico y dirigido, y respuesta clínica. Resultados: Se obtuvo un registro de 169 pacientes, con edad promedio de 66,01 ± 19,19; el 55,62% eran mayores de 65 años; el 59,2% eran de género femenino y el 73,6% provenían del área urbana. Las comorbilidades más frecuentes fueron enfermedad pulmonar obstructiva crónica (26%), diabetes (24,9%) y enfermedad renal crónica (16%), con un índice de Charlson de 4,43 ± 2,61. El 61,6% había sido hospitalizado en el último año a causa de IVU. Los agentes aislados más comunes fueron Escherichia coli (94,7%) y Klebsiella spp. (2,4%). Los tratamientos empíricos usados fueron ampicilina/sulbactam (15%), ciprofloxacino (29,6%) y nitrofurantoína (10,7%). Frente al tratamiento dirigido, el 36,7% no recibió ningún escalonamiento, el 32% fue tratado con ertapenem y el 8,9% con piperacilina/tazobactam. La mortalidad fue del 5,9% y la estancia hospitalaria fue en promedio de 7,24 ± 7,43 días. Conclusión: Los datos regionales son similares a los datos mundiales. Frente al tratamiento empírico se debe realizar una revaloración, ya que las guías actuales no recomiendan el uso de ciprofloxacino. También se debe hacer mejor seguimiento a las BLEE, ya que hay fallas en cuanto al tratamiento dirigido en gran porcentaje de las cepas.

Objective: To characterise epidemiologically urinary tract infections (UTI) caused by extended-spectrum betalactamase producing (ESBL)-producing Enterobacteriaceae in Duitama (Colombia) from 2010-2015. Methodology: A descriptive study was conducted on ESBL isolates of pathogens associated with UTI in 2 health institutions. Sociodemographic variables, comorbidities, hospitalisations in the last year for UTI, isolated agents, empirical and directed treatment, and clinical response were recorded. Results: A total of 169 patients were included, with an average age of 66.01 ± 19.19; 55.62% were over 65; 59.2% were female and 73.6% were from an urban area. The most frequent comorbidities were chronic obstructive pulmonary disease in 26%; 24.9% had diabetes and 16% had chronic kidney disease, with a Charlson index of 4.43 ± 2.61. Some 61.6% had been hospitalised in the last year due to UTIs. The most common isolated agents were Escherichia coli in 94.7% and Klebsiella spp. in 2.4%. The empirical treatments used were ampicillin/sulbactam in 15%, ciprofloxacin in 29.6% and nitrofurantoin in 10.7%. Regarding directed treatment, 36.7% do not have des-escalation, 32% of patients were treated with ertapenem and 8.9% were treated with piperacillin/tazobactam. Mortality was 5.9% and the average hospital stay was 7.24 ± 7.43 days. Conclusion: Regional data are similar to global data. Empirical treatment should be revaluated, since current guidelines do not recommend the use of ciprofloxacin. In addition, better tracking of ESLB is needed due to flaws in empirical treatment for a large percentage of the strains.

Detección molecular de belactamasas de espectro extendido (BLEE) en enterobacterias aisladas en Asunción / Molecular detection of extended spectrum beta-lactamase (esbl) in enterobacteria isolated in Asunción

Las betalactamasas de espectro extendido (BLEE), son enzimas responsables de la hidrólisis del anillo betalactámico de penicilinas y cefalosporinas, excepto carbapemenes, inhibiendo así su actividad terapéutica. Si bien es posible la detección fenotípica de este mecanismo de resistencia por métodos convencionales, sólo los métodos moleculares permiten la identificación del gen responsable de dicha resistencia. El objetivo de este estudio descriptivo retrospectivo fue identificar los genes blaCTX-M2, blaPER-2, blaSHV y blaTEM, en aislamientos de enterobacterias productoras de BLEE,; de muestras clínicas colectadas entre julio 2007 y abril 2008, provenientes de dos hospitales de referencia de Asunción, Paraguay. La detección molecular de los genes se realizó por reacción en cadena de la polimerasa empleando oligonucleótidos específicos. De los 232 aislados BLEE analizados, el 83% (n=192) portó al menos un gen bla, en el 17% (n=40) restante no fue detectado ninguno de los genes incluido en el estudio. Se observaron las siguientes frecuencias: 49% (94/192) blaCTX-M2, 45% (86/192) blaSHV, 40% (77/192) blaTEM y 7% (13/192) blaPER-2. En el 47% (90/192) se detectó más de un gen, siendo la combinación blaCTX-M2+blaTEM+blaSHV, la más frecuente observada en 32 aislados. El blaCTX-M2 como el gen más frecuente en este estudio; concuerda con lo reportado en nuestro país y en Argentina. Este es el primer reporte de la presencia de blaTEM y blaSHV en Paraguay. Es de gran importancia el estudio de otros genes codificantes de resistencia, considerando la emergencia de otras BLEE en la región como blaCTX-M15 con actividad predominantemente ceftazidimasa.

Extended spectrum beta-lactamases (ESBLs), are enzymes responsible for thehydrolysis of the beta-lactam ring and resistance to both cephalosporins and penicillins,except carbapenems, therefore inhibiting its therapeutics activity. Even though, detectionof the phenotypic resistance mechanism by conventional methods is possible, onlymolecular methods allow identification of the gene responsible for the resistance. Theobjective of this retrospective study was to identify the blaCTX-M2, blaPER-2, blaSHV, blaTEMgenes in ESBL-producing enterobacteriaceae isolates, recovered from clinical samples collected between July 2007 and April 2008, from two reference hospitals in Asunción,Paraguay. Molecular gene detection was performed by polymerase chain reaction usingspecifics oligonucleotides. Out of the tested 232 ESBL-producing isolates, 83% (n=192)carried at least one of the bla genes as follows; 49% (94/192) blaCTX-M2, 45% (86/192)blaSHV, 40% (77/192) blaTEM and 7% (13/192) blaPER-2. In the rest 17% (n=40) none of thegenes included in this study was detected; in 47% (90/192) more than one gene wasdetected, resulting blaCTX-M2 + blaTEM + blaSHV as the most frequent combination in 32isolates. The presence of blaCTX-M2, as the most frequent codifying genes of BLEE is inagreement with previous reports in Paraguay and Argentina. This is the first report of thepresence of blaTEM and blaSHV circulating in Paraguay. It is of much importance the study ofothers codifying resistance genes, taking into account the emergence of other BLEE in theregion, such as blaCTX-M15, predominantly with ceftazidimase activity.

Determinación de genes que codifican la resistencia de betalactamasas de espectro extendido en bacilos Gram negativos aislados de urocultivos / Determination of genes encoding beta-lactamase resistance spread spectrum Gram negative bacteria isolated from urine cultures

Introducción. Las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) son un grupo de enzimas que confieren resistencia bacteriana a un amplio espectro de antibióticos betalactámicos codificados en plásmidos y que deben estudiarse como herramientas de vigilancia del comportamiento de microorganismos frente al uso de antibióticos. Objetivo. Determinar los genes que codifican la resistencia en bacilos gramnegativos con fenotipo BLEE aislados de urocultivos, en una institución prestadora de servicios de salud del departamento de Boyacá. Métodos. Se llevó a cabo un estudio observacional, descriptivo y de corte transversal. Se identifica-ron 19 cepas resistentes con fenotipo BLEE, siguiendo los lineamientos del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI M100-S23), y se estableció el índice de concordancia para la identificación microbiológica. Por medio de la estandarización de la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), se determinó la presencia de los genes blaTEM, blaSHV, blaCTX y Amp-C en estas 19 cepas. Resultados. Se encontró que las 19 cepas con fenotipo BLEE (100 %) presentaban resistencia a la ampicilina; 12 (63,2 %) a la ampicilina-sulbactam; 17 (89,5 %) a la cefalotina; 16 (84,2 %) a la cefuroxima; 17 (89,5%) a la cefotaxima; 17 (89,5 %) a la ceftriaxona y 14 (73,7%) al cefepime. En 18 aislamientos se hizo amplificación de los genes, de los cuales 12 (61,11 %) posiblemente presentaron el gen blaCTX; 10 (55,6 %) el gen AmpC; 9 (50 %) el gen blaSHV y 7 (38,88 %) el gen blaTEM. Conclusión. La presencia de los genes blaCTX, AmpC, blaSHV y blaTEM presenta importancia epide-miológica, probablemente por la capacidad para movilizar la información genética de la resistencia en el ambiente hospitalario, donde tienen un claro potencial epidémico.

Introduction: Extended spectrum beta lactamases (ESBL) are a group of enzymes that confers bacterial resistance to a wide spectrum of betalactam antibiotics. These are coded in plasmids and should be studied as surveillance tools to watch the behavior of microorganisms towards the use of antibiotics. Objective: To determine the resistance coding genes in gram-negative bacilli with ESBL phenotype isolated from urine cultures, in a health services institution in the department of Boyacá. Methods: An observational, descriptive, cross-sectional study was carried out. Nineteen different strains with ESBL phenotype were identified, by following the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI M100-S23) guidelines; and the microbiological identification concordance index was established. Through polimerase chain reaction (PCR) technique standardization, the presence of blaTEM, blaSHV, blaCTX, and Amp-C genes was determined for the 19 strains mentioned. Results: All of the nineteen strains with ESBL phenotype (100%) were found to be resistant to ampiciline; 12 (63,2%) resistant to ampicilin sulbactam; 17 (89,5%) to cephalothin; 16 (84,2 %) to cefuroxime; 17 (89,5%) to cefotaxime; 17 (89,5%) to ceftriaxione, and 14 (73,7%) to cefepime. Gene amplification was performed on 18 isolates, 12 (61,11%) of them possibly presented the blaCTX gene; 10 (55,6%) the AmpC gene; 9 (50 %) the blaSHV gene, and 7 (38,88%) the blaTEM gene. Conclusion: The presence of blaCTX, AmpC, blaSHV, and blaTEM genes represents epidemiological importance, probably because of its capacity to mobilize genetic resistance information inside the hospitalary environment in which they have a clear epidemic potential.

Enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido en muestras fecales en el Instituto Nacional de Salud del Niño, Perú / Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing enterobacteriaceae in fecal samples at the National Institute of Child Health, Peru

Objetivos. Describir la frecuencia de enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en muestras fecales en el Instituto Nacional de Salud del Niño, Lima, Perú. Materiales y métodos. Se analizaron muestras de heces recibidas entre julio de 2012 y marzo de 2013, se trabajó con colonias sospechosas de ser enterobacterias productoras de BLEE que se desarrollaron en el agar Karmali; se realizó la identificación bioquímica por métodos convencionales y la confirmación del fenotipo BLEE. El análisis genotípico para detectar el gen de betalactamasa de la familia CTX-M se realizó por PCR. Resultados. De 235 muestras fecales se aisló un 64,2% de enterobacterias productoras de BLEE siendo Escherichia coli 86,1%, Klebsiella pneumoniae 7,9%, Salmonella sp. 2,6%, Enterobacter cloacae 2,0% y Proteus mirabilis 1,3%. El 89,1% de las enterobacterias productoras de BLEE presentaron el gen blaCTX-M. Se encontró una alta resistencia al ácido nalidíxico 84,8%, ciprofloxacina 74,2% y trimetoprimsulfametoxazol 81,5%. La resistencia a la amikacina fue de 1,3% y todos los aislados fueron sensibles al imipenem y meropenem. Conclusiones. Se encontró una alta frecuencia de enterobacterias productoras de BLEE en muestras fecales de pacientes ambulatorios atendidos en los consultorios externos y emergencia del Instituto Nacional de Salud del Niño en Perú.

Objectives. To describe the frequency of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing enterobacteriaceae in fecal samples at the National Institute of Child Health, Lima, Peru. Materials and methods. Stool samples received between July 2012 and March 2013 with colonies suspected to be ESBL-producing enterobacteriaceae that developed in Karmali agar were analyzed. Conventional methods were performed for biochemical identification and the confirmation of the ESBL phenotype. Genotypic analysis to detect the beta-lactamase gene CTX-M family was performed by PCR. Results. Of the 235 fecal samples analyzed, 64.2% of ESBL-producing enterobacteria was isolated being 86.1% Escherichia coli, 7.9% Klebsiella pneumoniae, 2.6% Salmonella sp, 2.0% Enterobacter cloacae, and 1.3% Proteus mirabilis. 89.1% of the ESBL-producing enterobacteria presented the CTX-M gene. We found high resistance to nalidixic acid 84.8%, 74.2% ciprofloxacin and trimethoprim-sulfamethoxazole 81.5%.The resistance to amikacin was 1.3% and all isolates were susceptible to imipenem and meropenem. Conclusions. A high frequency of ESBL-producing enterobacteria was found in fecal samples of outpatients seen in the outpatient and emergency departments of the National Institute of Child Health of Peru.

Distribución de grupos filogenéticos y factores de virulencia en cepas de Escherichia coli uropatógena productora de ß-lactamasa CTX-M-15 aisladas de pacientes de la comunidad en Mérida, Venezuela / Distribution of phylogenetic groups and virulence factors in CTX-M-15 ß -lactamase-producing uropathogenic Escherichia coli strains isolated from patients in the community of Mérida, Venezuela

En este estudio se determinó el perfil de distribución de grupos filogéneticos y la detección genética de factores de virulencia en cepas de Escherichia coli uropatógena (ECUP) productoras de ß-lactamasa CTX-M-15. Veintiocho cepas fueron aisladas de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) que asistieron al Laboratorio de Salud Pública del estado Mérida, Venezuela, durante el lapso comprendido entre enero 2009 y julio 2011. La determinación de los grupos filogenéticos y la detección de seis genes de virulencia, fimH, fyuA, kpsMTII, usp, PAI y papAH, se realizó mediante amplificación por PCR. Quince cepas de 28 se ubicaron principalmente en el filogrupo A, seguidos por el B2 (12/28) y D (1/28). No se observó una relación directa entre la recurrencia o gravedad de la ITU y la distribución de los filogrupos. Todos los factores de virulencia estudiados se encontraron con la frecuencia más alta en el grupo B2. El perfil de virulencia prevalente estuvo conformado por la asociación de tres genes principales: fimH, fyuA y kpsMTII y en menor frecuencia, por la presencia de otros determinantes como usp, PAI y/o papAH. Estos resultados indican que la mayoría de ECUP estuvieron dotadas de tres propiedades virulentas importantes: adhesión, captación de hierro y evasión de la fagocitosis, las cuales favorecieron la producción de ITU recurrentes. Este es el primer trabajo que describe la asociación de grupos filogenéticos con el potencial de virulencia de cepas de ECUP productoras de ß-lactamasa CTX-M-15 en Venezuela.

In this study, the distribution of phylogenetic groups and the genetic detection of virulence factors in CTX-M-15 ß-lactamase-producing uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains were analyzed. Twenty eight strains were isolated between January 2009 and July 2011 from patients with urinary tract infection (UTI) who attended the Public Health Laboratory at Mérida, Venezuela. Determination of phylogenetic groups and detection of six virulence genes, fimH, fyuA, kpsMTII, usp, PAI and papAH, were performed by PCR amplification. Fifteen of the 28 isolates were mainly located in the phylogenetic group A, followed by B2 (12/28) and D (1/28). No direct relationship between the severity or recurrence of UTI and the distribution of phylogroups was observed. All studied virulence factors were found in group B2 strains with the highest frequency. The prevalent virulence profile included the combination of three main genes: fimH, kpsMTII and fyuA and, to a lesser extent, the presence of other determinants such as usp, PAI and/or papAH. These results indicate that virulent UPEC incorporated three important properties: adhesion, iron uptake and evasion of phagocytosis, which favored the production of recurrent UTI. This is the first report describing the association of phylogenetic groups with the potential virulence of CTX-M-15 ß-lactamase producing UPEC strains in Venezuela.

Detection and characterization of metallo-β-lactamases in Pseudomonas aeruginosa by phenotypic and molecular methods from clinical samples in a tertiary care hospital / Detección y caracterización de la metallo-betalactamasa en la Pseudomonas aeruginosa mediante métodos fenotípicos y moleculares a partir de muestras clínicas en un hospital de atención terciaria

AIMS: The aim of this study was to detect and characterize the presence of metallo-β-lactamase (MBL) production in multidrug resistant (MDR) P aeruginosa collected from clinical samples in a tertiary care hospital. METHODS AND MATERIALS: A total of 67 non-repetitive isolates of MDR P aeruginosa recovered from various clinical specimens were screened for MBL production by IPM/MEM-EDTA combined disc test. Polymerase chain reaction was performed on all isolates using blaIMP and blaVIM consensus primers to characterize them genotypically. RESULTS: Among 67 P aeruginosa isolates, 62.7% (42/67) and 70.1% (47/67) were resistant to imipenem and meropenem respectively and 47 (70.1%) were found to be MBL producers. Among this 47 MBL-producing isolates, 41 (61.1%) strains carried the blaVIM gene and 2 (3%) strains carried the blaIMP gene. Three strains were phenotypically negative but positive genotypically for blaVIM gene. One strain was resistant to both imipenem and meropenem but did not show phenotypic positivity. CONCLUSION: This study confirms the dissemination of blaVIM genes among MDR Pseudomonas aeruginosa and hence it is indispensible to identify and aptly control the threat of horizontal and vertical transfer.

OBJETIVO: El objetivo de este estudio es descubrir y caracterizar la presencia de producción de metallo-betalactamasa (MBL) en P aeruginosa resistente a los multifármacos (RMF), recogida de muestras clínicas de un hospital de atención terciaria. MÉTODO: Un total de 67 aislados no repetitivos de P aeruginosa RMF obtenidos de varios specímenes clínicos, fueron tamizados en busca de producción de MBL, mediante una prueba de disco combinado IPM/MEM-EDTA. Se efectuó una reacción en cadena de la polimerasa sobre todos los aislados, usando iniciadores de consenso blaIMP y blaVIM para la caracterización genotípica. RESULTADOS: Entre los aislados de P aeruginosa, 62.7% (42/67) y 70.1% (47/67) fueron resistentes al Imipenem y al Meropenem respectivamente, mientras que se halló que 47 (70.1%) eran productores de MBL. De los 47 aislados productores de MBL, 41 (61.1%) cepas eran portadoras del gen blaVIM en tanto que 2 (3%) cepas eran portadoras del gen blaIMP. Tres cepas fueron fenotípicamente negativas, pero genotípicamente positivas con respecto al gen blaVIM. Una cepa fue resistente tanto al Imipenem como al Meropenem, pero no mostró positividad fenotípicamente. CONCLUSIÓN: El presente estudio confirma la diseminación de los genes blaVIM entre las Pseudomonas aeruginosa RMF. Es importante identificar así como controlar adecuadamente la amenaza de la transferencia horizontal y vertical.