Meta-análisis para evaluar eficiencia de selección genómica en cereales: Meta-analysis for evaluating the efficiency of genomic selection in cereals

La selección genómica (SG) es usada para predecir el mérito de un genotipo respecto a un carácter cuantitativo a partir de datos moleculares o genómicos. Estadísticamente, la SG requiere ajustar un modelo de regresión con múltiples variables predictoras asociadas a los estados de los marcadores moleculares (MM). El modelo se calibra en una población en la que hay datos fenotípicos y genómicos. La abundancia y la correlación de la información de los MM dificultan la estimación, y por ello existen distintas estrategias para el ajuste del modelo basadas en: mejor predictor lineal insesgado (BLUP), regresiones Bayesianas y aprendizaje automático. La correlación entre el fenotipo observado y el mérito genético predicho por el modelo ajustado, provee una medida de eficiencia (capacidad predictiva) de la SG. El objetivo de este trabajo fue realizar un meta-análisis de la eficiencia de la SG en cereales. Se realizó una revisión sistemática de estudios relacionados a SG y se llevó a cabo un meta-análisis, para obtener una medida global de la eficiencia de la SG en trigo y maíz, bajo diferentes escenarios (cantidad de MM y método estadístico usado para la SG). El metaanálisis indicó un coeficiente de correlación promedio de 0,61 entre los méritos genéticos predichos y los fenotipos observados. No se observaron diferencias significativas en la eficiencia de la SG realizada con modelos basados en BLUP (RR-BLUP y GBLUP), enfoque estadístico más comúnmente usado. El incremento de MM no cambia significativamente la eficiencia de la SG.

Genomic selection (GS) is used to predict the merit of a genotype with respect to a quantitative trait from molecular or genomic data. Statistically, GS requires fitting a regression model with multiple predictors associated with the molecular markers (MM) states. The model is calibrated in a population with phenotypic and genomic data. The abundance and correlation of MM information make model estimation challenging. For that reason there are diverse strategies to adjust the model: based on best linear unbiased predictors (BLUP), Bayesian regressions and machine learning methods. The correlation between the observed phenotype and the predicted genetic merit by the fitted model provides a measure of the efficiency (predictive ability) of the GS. The objective of this work was to perform a metaanalysis on the efficiency of GS in cereals. A systematic review of related GS studies and a meta-analysis, in wheat and maize, was carried out to obtain a global measure of GS efficiency under different scenarios (MM quantity and statistical models used in GS). The meta-analysis indicated an average correlation coefficient of 0.61 between observed and predicted genetic merits. There were no significant differences in the efficiency of the GS based on BLUP (RR-BLUP and GBLUP), the most common statistical approach. The increase of MM data, make GS efficiency do not vary widely.

Predictibilidad de las notas de enseñanza media según establecimiento de origen sobre el rendimiento académico en estudiantes de Odontología / Predictability of the secondary school grade point averages according to the educational center in the academic achievement of dentistry students

Introducción: la aparición de las universidades privadas ha producido cambios en la procedencia de los alumnos que ingresan a las universidades. Dentro de los requisitos de ingreso a la carrera de Odontología de la Universidad de Concepción, el promedio de notas de enseñanza media tiene una ponderación de 25 %, es importante determinar su capacidad predictiva y verificar si es similar para los distintos tipos de establecimientos educacionales. Objetivos: determinar la evolución de la dependencia y la capacidad predictiva de las notas de enseñanza media comparándola según tipo de colegio. Métodos: estudio observacional descriptivo longitudinal, con alumnos de 1er. año de Odontología. Se revisaron las planillas del perfil de ingreso, obteniendo información referida a las notas de enseñanza media y dependencia. El rendimiento académico se obtuvo de la Oficina de Registro y Control. Resultados: se observó un incremento de alumnos procedentes de establecimientos subvencionados, 33,3 % en el 2004 a 57,4 % en el 2011; versus una disminución de alumnos de establecimientos particulares, 44,9 % el 2004 a 22,0 % el 2011. El porcentaje de aporte de las notas de enseñanza media a la explicación del rendimiento académico correspondió a un 10,8 %. El mayor porcentaje de aporte fue para las NEM de los colegios particulares, 15,0 %, seguidas por las notas de enseñanza media de los establecimientos municipalizados y subvencionados con 9,6 % y 8,6 %. Conclusiones: existe una tendencia al alza de alumnos provenientes de establecimientos subvencionados versus una baja de los procedentes de colegios particulares. La capacidad predictiva de las notas de enseñanza media fue limitada, existe un sesgo de predicción a favor de los colegios municipalizados y subvencionados.

Introduction: the emergence of private universities has brought about changes in the origin of students that enter the universities. Among the admission requirements of dentistry studies in Universidad de Concepción, the grade point averages obtained at the secondary education has 25% weighing, so it is important to determine its predictive validity and to verify whether this average is the same for the different educational centers or not. Objectives: to determine the evolution of the dependency and the predictive validity of the grade point averages of the secondary education, by making a comparison among the different types of educational establisments. Methods: longitudinal, observational and descriptive study of first-year dentistry students. The admission profile forms were checked, thus obtaining the information on the secondary education grade point averages and on dependency. The academic performance of students was obtained from grade worksheets of the Register and Control office. Results: it was observed that the number of students from subsidized educational centers increased, 33.3 % in 2004 to 57.4 % in 2011, whereas the number of students from private schools decreased, 44.9 % in 2004 to 22.0 % in 2011. The contributing percentage of the grade point averages to the academic achievement reached 10.8 %. The highest contributing percentages went to the grade point averages of private schools with a 15.0 %, followed by the municipal and subsidized schools with 9.6 % and 8.6 % respectively. Conclusions: there is a tendency to increase of the number of students from subsidized schools, and to decrease of the number of students from private schools. The predictive validity of the grade point averages was limited, since there is prediction bias favoring the municipal and subsidized schools.

Riesgo cardiovascular en pacientes de un consultorio médico del policlínico Ana Betancourt / Cardiovascular risk found in patients from a doctor's office in Ana Betancourt polyclinics

Introducción: la capacidad predictiva del riesgo coronario es superior a la que se establece por la consideración aislada de los factores de riesgo cardiovasculares. Objetivo: determinar la magnitud del riesgo coronario y las prioridades de prevención cardiovascular en pacientes pertenecientes al consultorio médico de la familia No.5, del policlínico Ana Betancourt, en el municipio Playa. Métodos: investigación descriptiva, de corte transversal realizada entre 2009-2010. El universo de estudio estuvo constituido por las 856 personas mayores de 20 años perteneciente a dicho consultorio. Después de aplicados los criterios de selección, la muestra quedó conformada por 242 pacientes. Se utilizaron los criterios de las Tablas de Predicción del Riesgo Coronario de Framingham, que permiten estimar dicho riesgo a diez años, en las personas con factores de riesgo cardiovascular que aún no han tenido enfermedad coronaria establecida y que requieren intervenciones de cambio de su estilo de vida. Resultados: predominaron los pacientes en la categoría de riesgo coronario moderado, 97 (40,1 porciento), seguido por los de alto riesgo, 82 (33, 8 porciento) y finalmente, los de bajo riesgo, 63 (26 porciento). Ninguno de los pacientes estudiados estaba exento de riesgo coronario. Conclusiones: es muy probable, que más de la mitad de la muestra sufra un episodio coronario, mortal o no, durante los próximos diez años. Es urgente aplicar una estrategia de intervención comunitaria, basada en la modificación de los factores de riesgo asociados al estilo de vida, que permita disminuir la actual expresión del riesgo coronario en la población estudiada

Introduction: the predictive capacity of the coronary risk is greater than the prediction set by the individual consideration of the cardiovascular risk factors. Objective: to determine the coronary risk and the cardiovascular prevention priorities in patients from the family doctor's office no.5 in Ana Betancourt polyclinics located in Playa municipality. Methods: a cross-sectional descriptive study was conducted in the 2009-2010 period. The universe of study was made up of 856 people aged over 20 years in this doctor's office. After applying the criteria of selection, 242 patients formed the final sample. The criteria of Framingham's coronary risk prediction tables, which allow estimating the risk covering 10 years in those people who present cardiovascular risk factors but not coronary disease and require health interventions to change their lifestyles, were applied. Results: the patients included in the moderate coronary risk category (97 for 40.1 percent), followed by high risk patients (82 for 33.8 percent) and finally, the low risk (63 for 26 percent) predominated. None of the patients were exempted from the coronary risk. Conclusions: it is more likely that over half of the sample would have some coronary event, either deadly or not, in the forthcoming ten years. Therefore, it is urgent to apply a community-based intervention strategy, based on the change of lifestyle-associated risk factors, capable of reducing the current manifestation of the coronary risk in the studied population

Capacidad del período oligoanúrico para predecir secuela renal en niños con síndrome urémico-hemolítico asociado a diarrea / Capacity of the oligoanuric period in the prediction of renal sequelae in patients with postdiarrheal hemolytic uremic syndrome

Introducción. La duración del período oligoanúrico es el principal marcador pronóstico de secuela renal en pacientes con síndrome urémico-hemolítico asociado a diarrea (SUH D+). Realizamos este estudio con el objetivo de determinar la capacidad del período oligoanúrico para predecir secuela renal en niños con SUH D+. Pacientes y métodos. Revisamos los datos de todos los pacientes internados en el Hospital Elizalde con SUH D+ entre 1998-2008 e incluimos sólo a aquellos seguidos más de 1 año. Consideramos secuela renal a la presencia de albuminuria y/o proteinuria patológicas y/o hipertensión arterial y/o caída de fltrado glomerular. Ingresaron al estudio 80 pacientes, que se dividieron en 2 grupos (con secuela y sin ella). Se determinó si tenían diferencias en la duración del período oligoanúrico y se calculó la capacidad de dicha variable para predecir secuela mediante curva ROC. Resultados. 32 pacientes presentaron secuela renal (prevalencia 40%), quienes tuvieron un período oligoanúrico signifcativamente más prolongado [mediana 7 días (intervalo 0-14) contra mediana 0 días (intervalo 0-30); p= 0,0003] que aquellos sin secuela. Mediante curva ROC (área bajo la curva de 0,73) se estableció en ≥ 4 días como mejor punto de corte del período oligoanúrico para predecir secuela renal (sensibilidad 68,75%, especifcidad 70,83%). Conclusión. La curva ROC no permitió identifcar un punto de corte de la duración del período oligoanúrico que permita predecir secuela renal con sensibilidad y especifcidad adecuadas. Esta observación refuerza la importancia del seguimiento periódico y a largo plazo de todos los niños afectados por SUH D+.

Introduction. Length of the oligoanuric period is the main predictor of renal sequelae in children with postdiarrehal hemolytic uremic syndrome (D+ HUS). We aimed to determine the capacity of the oligoanuric period in the prediction of renal sequelae in children with D+ HUS. Patients and methods. We reviewed data from all patients with D+ HUS admitted at Hospital Elizalde between 1998-2008, including only those with at least 1 year of follow-up. Renal sequelae were defned by the presence of pathologic albuminuria and/or proteinuria and/or arterial hypertension and/or chronic renal failure; 80 patients were included, belonging to one of two groups (with or without sequelae). Difference in the duration of the oligoanuric period between groups was determined, and the diagnostic capacity of the oligoanuric period to identifed renal sequelae was assessed by ROC curve. Results. 32 patients presented sequelae, representing a prevalence of 40%. Oligoanuric period was signifcantly longer in patients with sequelae [median 7 days (range 0-14) vs median 0 days (range 0-30); p= 0,0003]. Using ROC curve (aucROC= 0.73) we identifed an oligoanuric period ≥ 4 days as the best threshold to predict renal sequelae (sensitivity 68.75%, and specifcity 70.83%). Conclusions. By ROC curve analysis we were unable to identify a cut-off point on the length of the oligoanuric period which predicts renal sequelae with optimum sensitivity and specifcity. This observation emphasizes the need of periodic and long-term surveillance of all children who suffered from D+ HUS.