ABSTRACT
The use of DNA sequences analysis has been an important mean to distinguish and to identify populations of organisms at different levels. By molecular markers several complex organisms have been successful detected in plants for distinct aims. Ribosomal DNA (rDNA) has been used to evaluate genetic variability, microorganism phylogeny and to develop specific primers for detection of plant pathogens in plant tissues. In this study, the objective was to characterize isolates of Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides and Colletotrichum gossypii, collected in different regions of Brazil, by analyzing the nucleotide sequence of rDNA regions. ITS1, ITS2, and the intervening 5.8S gene were amplified by PCR and their sequences compared to each other and to those from other species registered in the GenBank. The rDNA of isolates associated with Gossypium spp. showed sequence identities ranging from 96 to 100% in the ITS1 region, 98 to 100% in the 5.8S gene, and 97 to 100% in the ITS2 region. The sequences were submitted to UPGMA analysis, and according to the phylogenetic trees, the C. gossypii var. cephalosporioides and C. gossypii species clustered together along with isolates of Glomerella cingulata from mango and papaya, and thus no distinction could be made between isolates of those organisms.
O uso de sequências de fragmentos de DNA tem sido importante ferramenta para distinguir e identificar populações de organismos em diferentes níveis de variação. Por meio de marcadores moleculares alguns organismos com variações taxonômicas complexas têm sido detectados com sucesso em tecidos vegetais. O DNA ribossomal tem sido utilizado para avaliar variabilidade genética, filogenia de micro-organismo e para desenvolver oligonucleotídeos específicos visando à detecção de fitopatógenos. Nesse estudo o objetivo foi comparar isolados do complexo Colletotrichum, incluindo C. gosssypii var. cephalosporioides e C. gossypii, coletados em diferentes regiões do Brasil, todos associados às sementes de algodão, pela análise de sequências de nucleotídeos de regiões de rDNA. ITS1, ITS2 e o gene 5.8S que foram amplificados por PCR e suas sequências comparadas entre si com outras sequências depositadas no GenBank. O rDNA de isolados associados com Gossypium spp. mostraram identidades de sequências na faixa de 96 to 100% na região ITS1, 98 to 100% na região de 5.8S, e 97 a 100% na região ITS2. As sequências foram submetidas a análise UPGMA, e de acordo com as árvores filogenéticas , C. gossypii var. cephalosporioides e C. gossypii fizeram parte de um mesmo cluster junto com isolados de Glomerella cingulata de manga e mamão, e assim nenhuma distinção pode ser feita entre os isolados destes organismos.
Subject(s)
Phylogeny , DNA, Ribosomal , Base Sequence , Colletotrichum , Plant PathologyABSTRACT
Avaliou-se o potencial de rizobactérias na indução de resistência do algodoeiro à Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. Após o isolamento das rizobactérias, foram selecionados os isolados capazes de reduzir os sintomas da mancha angular bacteriana em casa de vegetação, os quais foram aplicados espacialmente separados do patógeno desafiador. Os melhores isolados foram testados quanto à capacidade de reduzir os sintomas da ramulose e da murcha de Verticillium e de inibir diretamente os patógenos in vitro. Do total de 123 isolados de rizobactérias foram selecionados cinco, L2-1 (Bacillus cereus), MT5-6 (Bacillus cereus), L2-2 (Achromobacter xylosoxidans), MT5-5 (Bacillus cereus) e MT5-11 (Brevibacterium sp.), os quais apresentaram controle da mancha angular acima de 40 por cento, em relação à testemunha. Nenhum isolado reduziu a severidade da ramulose e da murcha de Verticillium em relação à testemunha, nem apresentou efeito inibitório direto in vitro a X. axonopodis pv. malvacearum e Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides. Para V. dahliae, apenas o isolado L2-1 apresentou efeito inibitório.
The potential of rhizobacteria was evaluated for resistance induction against Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. After isolation, the rhizobacteria were screened for the reduction of angular leaf spot severity under greenhouse conditions. They were spatially separated from the challenging pathogen. The best isolates were tested for the capacity to reduce ramulose and Verticillium wilt severity and directly inhibit pathogens in vitro. From a total of 123 rhizobacterial isolates, five were selected, L2-1 (Bacillus cereus), MT5-6 (Bacillus cereus), L2-2 (Achromobacter xylosoxidans), MT5-5 (Bacillus cereus) and MT5-11 (Brevibacterium sp.), which showed angular leaf spot control above 40 percent as compared to the control. The tested isolates neither reduced the severity of ramulose and verticillium wilt compared to the control nor showed in vitro direct inhibition to X. axonopodis pv. malvacearum and Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides. For V. dahliae, only isolate L2-1 showed direct inhibition.