Caracterización del polimorfismo genético del gen bola DRB3.2 en vacas holstein y bonxholstein de un hato lechero de Antioquia

Introducción. El gen DRB3 del antígeno leucocitario bovino (BoLA) ha sido ampliamente estudiado, dado que sus variantes alélicas han sido asociadas con enfermedades infecciosas y características productivas. Objetivo. Determinar las frecuencias de los alelos del exón 2 del gen BoLA DRB3 obtenidos mediante la técnica PCR-RFLP en vacas Holstein y BONxHolstein (BxH) de un hato lechero de Antioquia. Materiales y métodos. Fueron genotipificadas 101 vacas, 76 de raza Holstein y 25 del cruce BON x Holstein (BxH) para el exón 2 del gen DRB3 del antígeno leucocitario bovino (BoLA). Los alelos BoLA DRB3.2 fueron identificados por PCR-RFLP, empleando las enzimas de restricción RsaI, HaeIII y BstYI y confirmados por secueciación. Resultados. En este estudio fueron identificados 27 alelos BoLA DRB3.2 con un rango de frecuencias de 0.007 a 0.151 en la raza Holstein y de 0.02 a 0.20 en BxH. Los cuatro alelos más frecuentes para la raza Holstein fueron: BoLA DRB3.2* 23, 22, 24 y 16, con una frecuencia acumulada de 0.506 y los cuatro alelos más frecuentes en BxH fueron: BoLA DRB3.2*23, 24, 20 y 37, con una frecuencia acumulada de 0.54. Conclusiones. El gen BoLA DRB3.2 fue altamente polimórfico en los dos grupos genéticos (Holstein y BxH) y en los dos grupos se presentó un perfil de alelos similar.

Introduction. DRB3 gene of the bovine leukocyte antigen (BoLA) has been widely studied, given the fact that its allelic variations have been associated to infectious diseases and production characteristics. Objective. To determine the frequencies of the alleles of the exon 2of the BoLA DRB3.2 gene obtained by means of the PCR-RFLP technique in Holstein y BONxHolstein (BxH) cows from a dairy herd in Antioquia, Colombia. Materials and methods. 101 cows were genotyped, 76 were Holstein and 25 of the BON X Holstein genetic cross (BxH) for the exon 2 of the DRB3 gene of the bovine leukocyte antigen (BoLA). The BoLA DRB3.2 alleles were identified by means of the PCR-RFLP technique using the Rsal, Haelll and BstYI restriction enzymes and were confirmed with a sequencing process. Results. 27 BoLA DRB3.2 alleles were identified with a frequency ratio from 0.007 to 0.151 in the Holstein cows and from 0.02 to 0.20 in BxH. The four most frequent alleles for Hostein cows were: BoLA DRB3.2 * 23, 22, 24 and 16, with an accumulated frequency of 0.506, and the four most frequent alleles in BxH were: BoLA DRB3.2*23, 24, 20 and 37, with an accumulated frequency of 0.54. Conclusions. The BoLA DRB3.2 gene was highly polymorphic in both genetic groups (Holstein and BxH) and also in both groups there was a similar allelic profile.

Introdução. O gene DRB3 do antígeno leucocitário bovino (BoLA) ha sido amplamente estudado, dado que sus variantes alélicas hão sido associadas com doenças infecciosas e características produtivas. Objetivo. Determinar as frequências dos alelos do Exão 2 do gene BoLA DRB3 obtidos mediante a técnica PCR-RFLP em vacas Holstein e BONxHolstein (BxH) de um rebanho leiteiro de Antioquia.Materiales e métodos. Foram genotipificadas 101 vacas, 76 de raça Holstein e 25 do cruze BON x Holstein (BxH) para o Exão 2 do gene DRB3 do antígeno leucocitário bovino (BoLA). Os alelos BoLADRB3.2 foram identificados por PCRRFLP, empregando as enzimas de restrição RsaI, HaeIII e BstYI e confirmados por sequenciamento. Resultados. Neste estudo foram identificados 27 alelos BoLA DRB3.2 com um gama de frequências de 0.007 a 0.151 na raça Holstein e de 0.02 a 0.20 em BxH. Os quatro alelos mais frequentes para a raça Holstein foram: BoLA DRB3.2* 23, 22, 24 y 16, com uma frequência acumulada de 0.506 e os quatro alelos mais frequentes en BxH foram: BoLA DRB3.2*23, 24, 20 e 37, com uma frequência acumulada de 0.54. Conclusões. O gene BoLA DRB3.2 foi altamente polimórfico nos dos grupos genéticos (Holstein e BxH) e nos dois grupos se apresentou um perfil de alelos similar.

Genetic diversity of BoLA-DRB3 gene in Colombian creole Hartón del Valle cattle / Diversidad genética del gen BoLA-DRB3 en el ganado criollo colombiano Hartón del Valle / Diversidade genética do gene BoLA-DRB3 em gado crioulo colombiano Hartón del Valle

The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of ball-DRB3 gene in the Colombian creole Hartón del Valle cattle. A total of 93 Hartón del Valle (HV), 30 Lucerne (LUC), and 30 Holstein (HOL) animals were evaluated for DRB3 gene polymorphism using the PCR-SBT method. The number of alleles found were 27, 17 and 14 for HV, LUC, HOL, respectively. The most frequent alleles were DRB3*1101 (14.5%) in HV; LUC DRB3 * 0701 in LUC; and *1107, *1501 and *2301 in HOL (11.7%). Expected heterozygosity values were higher than observed, which resulted in a low fixing index, positive F IS (significant only for HV), and no significant deviations from Hardy- Weinberg equilibrium for LUC. The molecular analysis of variance reflected little variation between breeds (3%) and a moderate genetic differentiation (F ST = 0.056 p<0.01). Regarding sequence, LUC was the most diverse breed, no neutral selection is occurring, and none of the breeds is in selection equilibrium. Comparison with reports on other breeds showed high genetic diversity in Colombian breeds. We conclude that HV has high genetic diversity in BoLA-DRB3 locus. The cause of this polymorphism may be due in part to the origin of HV. This high variation can be maintained by selection equilibrium.

El objetivo de esta investigación fue evaluar la diversidad genética del gen BoLA-DRB3 en el ganado criollo Colombiano Hartón del Valle. En 93 animales Hartón del Valle (HV), 30 Lucerna (LUC) y 30 Holstein (HOL) se evaluó el polimorfismo del gen DRB3 usando la metodología PCR-SBT. Se encontraron 27 alelos en la raza HV, 17 en LUC y 14 en HOL. El alelo más frecuente en HV fue el DRB3*1101 (14,5%), en la raza LUC los alelos DRB3*0701, *1107, *1501 y *2301 al igual que el alelo DRB3*0701 en la raza HOL tuvieron la frecuencia más alta (11,7%). Los valores de heterocigocidad esperada fueron más altos que la observada, lo que se tradujo en un valor bajo del índice de fijación, valores de F IS positivos solo significativo en el HV y desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg no significativos en LUC. El análisis de varianza molecular reflejó poca variación entre razas (3%) y una diferenciación genética moderada (F ST= 0,056 p<0,01). A nivel de secuencia se resalta que, la raza más diversa es LUC, que no se está presentando selección neutral y que ninguna de las razas se encuentra en equilibrio de selección balanceadora. La comparación con otras razas reportadas, mostró alta diversidad genética en las razas colombianas. Se concluye que la raza HV tiene alta diversidad genética en el locus BoLA-DRB3, que el origen del polimorfismo puede deberse en parte al origen de la raza y que esta alta variación puede ser mantenida mediante equilibrio de selección.

O objetivo desta pesquisa foi avaliar a diversidade genética do gene BoLA-DRB3 no gado crioulo colombiano Hartón del Valle. O estudo se fez com 93 animais Hartón del Valle (HV), 30 Lucerna (LUC) e 30 Holandês (HOL). Avaliou-se o polimorfismo do gene DRB3 utilizando a metodologia PCR-SBT. Encontraram-se 27 alelos na raça HV, 17 em LUC e 14 em HOL. O alelo com maior frequência em HV foi o DRB3*1101 (14,5%), na raça LUC os alelos DRB3*0701, *1107, *1501 e *2301 ao igual que o alelo DRB3*0701 na raça HOL tiveram a maior frequência (11,7%). Os valores de heterocigocidade esperada foram maiores que a observada, o que se traduz em um valor baixo do índice de fixação, valores de F IS positivos só foram significativos no HV e desvio do equilíbrio de Hardy- Weinberg foram não significativos em LUC. O Analice de variância molecular reflexou pouca variação entre raças (3%) e uma diferenciação genética moderada (F ST= 0,056 p<0,01). No nível de sequência destacasse que, a raça mais diversa é LUC, que não está apresentando seleção neutral e que nenhuma das raças encontra-se em equilíbrio de seleção balanceadora. Se comparar com outras raças reportadas, as raças colombianas exibiram uma alta diversidade genética. Conclui-se que a raça HV tem alta diversidade genética no locus BoLA DRB3, que a origem do polimorfismo pode se dever em parte àorigem da raça e que essa alta variação pode ser mantida mediante o equilíbrio de seleção.

Hallazgo de patrones para péptidos-vacuna con capacidad de acople universal en moléculas de HLA-II / Identification of patterns for peptide-vaccines in universal capacity coupling HLA-II molecules / Identificagáo de padroes para peptídeos-vacina com capacidade de acoplamento universal em moléculas HLA-II

Partiendo del alineamiento múltiple de secuencias proteicas humanas obtenidas de las bases de datos del National Center of Biotechnology Information (NCBI) y su posterior análisis espacial tridimensional, se estableció la existencia de un patrón de acople universal para péptidos presentados por las moléculas de histocompatibilidad HLA-II (DR, DP y DQ), siendo una base para el diseño de vacunas proteicas. Estos patrones espaciales fueron claramente exhibidos por los residuos altamente conservados de los tres tipos de moléculas de HLA-II. La aplicación de este nuevo hallazgo permitió diseñar péptidos con mejores valores de acople péptido-HLA-II, que los generados por el péptido de acople universal conocido como CLIP (class Il-associated invariant chain peptide).

Starting from the multiple alignment of human protein sequences obtained from the NCBI database (National Center of Biotechnology Information) and subsequent three-dimensional spatial analysis, the existence of a pattern of universal coupling to peptides presented by MHC molecules HLA-II (DR, DP and DQ) was established, being a basis for the design of protein vaccines. These spatial patterns were clearly exhibited by highly conserved residues of the three kinds of HLA-II molecules. The application of this new finding made it possible to design peptides with better Peptide -HLA-II coupling values than those generated by the universal coupling peptide called CLIP (class II-associated invariant chain peptide).

FA partir do alinhamento múltiplo de sequéncias de proteínas humanas obtidas a partir das bases de dados do NCBI (National Center of Biotechnology Information) e análise espacial tridimensional subsequente, estabeleceu-se a existéncia de um padráo de acoplamento universal para peptídeos apresentados pelas moléculas de histocompatibilidade HLA-II (DR, DP e DQ), sendo uma base para o desenho de vacinas proteicas. Estes padroes espaciais foram claramente exibidos pelos residuos altamente conservados dos trés tipos de moléculas de HLA-II. A aplicagáo deste novo achado permitiu desenhar peptídeos com melhores valores de acoplamento peptídeo-HLA-II, do que aqueles gerados pelo peptídeo de acoplamento universal conhecido como CLIP (classe II-peptídeo associado a cadeia invariante).

Herpes simples: atualização clínica, epidemiológica e terapêutica / Herpes simplex: clinical update, epidemiology and therapeutics

Herpes é uma infecção causada por dois vírus da família Herpesviridae (herpes simples tipos 1 e 2; HSV-1 e HSV-1), que apresenta curso clínico variável e para o qual atualmente não existe cura. As manifestações da infecção por HSV-1 incluem herpes simples orofacial primário e recorrente, enquanto as do HSV-2 em geral ocorrem na forma de herpes simples genital, embora casos de lesões genitais pelo HSV-1 e orais pelo HSV-2 possam ocorrer. As infecções pelo vírus herpes simples (HSV-1 e HSV-2) representam as doenças sexualmente transmissíveis mais comuns a nível global, alcançando uma soroprevalência de 80% em adultos. Nesta revisão da literatura, abordaremos os aspectos clínicos da infecção pelo HSV, incluindo a epidemiologia, etiologia, manifestações clínicas, métodos diagnósticos e tratamento, bem como uma breve descrição da imunogenética da infecção pelo HSV

Herpes is an infection caused by two viruses in the Herpesviridae family (herpes simplex types 1 and 2; HSV-1 and HSV-2), which presents a variable clinical course and for which there is currently no cure. The manifestations of HSV-1 infection include primary and recurrent orofacial herpes simplex, while HSV-2 infection usually manifests in the form of genital herpes simplex, although cases of genital lesions from HSV-1 infection and oral lesions form HSV-2 infection can occur. Infections by the herpes simplex virus (HSV-1 and HSV-2) represent one of the most common sexually transmitted diseases globally, reaching a serum prevalence of 80% in adults. In this review of the literature, we discuss the clinical aspects of HSV infection, including epidemiology, etiology, clinical manifestations, diagnosis and treatment, as well as a brief description of the immunogenetics of HSV infection.

Association between HLA-DRB1* polymorphisms and hepatitis B infection in a brazilian population / Associação entre polimorfismos HLA-DRB1* e infecção por hepatite B em uma população brasileira

OBJECTIVE: The aim of the present study was to determine the genotype association for alleles of class II human leukocyte antigens (HLA) in the DRB1* locus among blood donors at the Fundação Hemope (Brazil) infected by or immunized for the hepatitis B virus (HBV). METHODS: A case-control study was performed, comprising a group of individuals infected by HBV and a control group of immunized individuals at a proportion of 1:4. Blood samples were taken for the HLA typing of the DRB1* locus. Univariate and multivariate analyses were performed for the assessment of associations between the categorical variables using the chi-squared test and Fisher's exact test. RESULTS: A total of 320 blood donors were analyzed (241 males [75%] and 79 females [25%] with a mean age of 39 years). The case group consisted of 64 HBV-infected donors and the control group was composed of 256 HBV-immunized donors. The multivariate analysis stratified by gender revealed that the DRB1*09 allele was associated with infected male donors (p = 0.016) and the DRB1*08 allele was associated with infected donors aged 39 years or younger (p = 0.031). CONCLUSION: The results of the present study reveal that younger blood donors and male blood donors who respectively exhibit the DRB1*08 and DRB1*09 alleles are more susceptible to intensification of HBV infection.

OBJETIVO: O objetivo do presente estudo foi determinar a associação genotípica dos alelos de classe II dos antígenos leucocitários humanos (HLA) presentes no locus DRB1* entre doadores de sangue da Fundação Hemope (Brasil), infectados pelo ou imunizados contra o vírus da hepatite B (HBV). MÉTODOS: Estudo caso-controle foi realizado com um grupo de indivíduos infectados pelo HBV e um grupo controle composto de indivíduos imunizados na proporção de 1:4. Amostras de sangue foram coletadas para a tipagem HLA do locus DRB1*. Análises univariada e multivariada foram realizadas para a avaliação de associações entre as variáveis categóricas pelo teste do qui-quadrado e teste exato de Fisher. RESULTADOS: Um total de 320 doadores de sangue foram analisados (241 homens [75%] e 79 do sexo feminino [25%], com idade média de 39 anos). O grupo de casos consistiu de 64 doadores infectados pelo HBV e o grupo controle foi composto de 256 doadores imunes ao HBV. A análise multivariada estratificada por sexo revelou que o alelo DRB1*09 foi associado com os doadores infectados do sexo masculino (p = 0,016) e do alelo DRB1*08 foi associado com os doadores infectados com idade entre 39 anos ou mais jovens (p = 0,031). CONCLUSÃO: Os resultados do presente estudo revelam que doadores de sangue mais jovens e doadores de sangue do sexo masculino que exibem, respectivamente, os alelos DRB1*08 e DRB1*09, são mais suscetíveis à cronificação da infecção pelo HBV.

Alleles of the BoLA DRB3.2 gene are associated with mastitis in dairy cows / Alelos del gen BoLA DRB3.2 están asociados con mastitis en vacas lecheras / Alelos BOLA DRB3.2 estão associados à mastite em vacas leiteiras

The Mayor Histocompatibility Complex (MHC) is a pool of genes which regulate both processing and recognition of antigens. The MHC is the main genetic component of the resistance or susceptibility to infectious diseases. In bovines, MHC is known as Bovine Leukocyte Antigen (BoLA), and some of its alleles have been associated with udder health issues. This study evaluated exon-2 polymorphisms of BoLA DRB3 gene in 91 cows of a dairy farm. A total of 66 Holstein and 25 cross breed BON x Holstein (BxH) cows were evaluated. Twenty seven alleles were identified by PCR-RFLP and PCR-SBT. Allelic frequencies varied from 0.8 to 15.9% for the Holstein, and from 2 to 20% for BxH cows. The BoLA DRB3.2*23 was the most frequent allele in both groups. A prospective study was also conducted for cows in production (n=47) during one lactation to determine subclinical mastitis incidence using the California Mastitis Test (CMT). A 38.69% frequency of positive cases was observed. Additionally, a retrospective study was conducted for all the cows (n=91), finding 9.2% incidence of clinical mastitis per year. Possible associations were established using a statistical model to determine the effect of genetic substitution, in which BoLA DRB3.2*24 was used as the substitution allele. Alleles associated with susceptibility to subclinical mastitis were DRB3.2*8 (p<0.10) and DRB3.2*14 (p< 0.01). Allele DRB3.2*33 was associated with resistance to subclinical mastitis (p<0.01). No significant associations were found for clinical mastitis.

El complejo mayor de histocompatibilidad (CMH) es un conglomerado de genes que regulan el procesamiento y reconocimiento de antígenos extraños, siendo el principal componente genético de resistencia o susceptibilidad a enfermedades infecciosas. En bovinos el CMH es conocido como antígeno leucocitario bovino (BoLA) y algunos alelos de este han sido asociados con problemas de salud de la ubre. En este estudio se evaluaron polimorfismos del exón 2 del gen BoLA DRB3 en 91 animales, 66 vacas de raza Holstein y 25 vacas del cruce de razas BON x Holstein (BxH) del Hato Paysandú de la Universidad Nacional de Colombia. Fueron identificados 27 alelos mediante PCR-RFLP y confirmados por PCR-SBT, encontrando frecuencias alélicas desde 0.8 hasta 15.9% en la raza Holstein y desde 2 hasta 20% en BxH. El alelo más frecuente en los dos grupos fue el alelo BoLA DRB3.2*23. Para determinar la frecuencia de mastitis subclínica, se realizó un estudio prospectivo con animales en producción (n = 47) durante un periodo de una lactancia, empleando la prueba CMT (California Mastitis Test) y se determinó una frecuencia de 38.69% de casos positivos (reacciones positivas: una, dos y tres cruces) en promedio. Para mastitis clínica se realizó un estudio retrospectivo en toda la población (n=91), a partir de los registros clínicos y se determinó una incidencia anual de 9.2%. Adicionalmente se establecieron asociaciones potenciales utilizando un modelo estadístico para determinar el efecto de sustitución genética en el cual se empleó el alelo BoLA DRB3.2*24 como alelo de sustitución. Los alelos asociados con susceptibilidad a mastitis subclínica fueron DRB3.2*8 (p<0.10) y el *14 (p< 0.01), de otro lado el alelo *33 fue asociado con resistencia a esta misma enfermedad (p< 0.01). Para mastitis clínica no se encontraron asociaciones significativas.

O complexo principal de histocompatibilidade (CMH) é um conjunto de genes que regulam o processamento e reconhecimento de antígenos estranhos, o principal componente genético da resistência ou suscetibilidade a doenças infecciosas. Em bovinos, o CMH é conhecida como antígeno leucocitário bovino (BoLA) e alguns alelos têm sido associados a problemas de saúde do úbere. Neste estudo, os polimorfismos do éxon 2 do gene BoLA DRB3 em 91 animais, 66 vacas e 25 vacas da raça Holandesa no cruzamento BON x Holandês (BXH) do rebanho Paysandú, da Universidade Nacional da Colômbia. Foram identificados 27 alelos foram identificados por PCR-RFLP e confirmados por PCR-SBT, encontrando frequências alélicas de 0.8 - 15.9% para a raça Holandesa e 2 - 20% em BXH. O alelo mais frequente nos dois grupos foi BoLA DRB3.2*23. Para determinar a frequência de mastite subclínica, um estudo prospectivo foi realizado com animais de produção (n=47) durante o período de lactação, utilizando o CMT (Califórnia Mastite Teste) e foi determinada uma frequência de 38,69% de casos positivos (reacções positivas: uma, duas e três cruzes) em média. Para a mastite clínica foi feito um estudo retrospectivo em toda a população (n=91), a partir de casos clínicos e foi encontrada uma incidência anual de 9.2%. Além disso, foram estabelecidas potenciais associações, utilizando um modelo estatístico para determinar o efeito da substituição genética do alelo DRB3.2*24. Os alelos associados à susceptibilidade à mastite foram DRB3.2 * 8 (p<0.10) e o * 14 (p<0.01), o alelo * 33 esteve associado com a resistência à mesma doença (p<0.01). Para a mastite clínica não foram encontradas associações significativas.