Trend of transplants and organ and tissue donations in Brazil: a time series analysis / Tendencia de trasplantes y donaciones de órganos y tejidos en Brasil: análisis de la serie de tiempos / Tendência dos transplantes e doações de órgãos e tecidos no Brasil: análise de séries temporais

ABSTRACT Objectives: to indentify the time trend of rates of organs and tissues effective donors, of reports and types of transplanted organs per million people of the Brazilian population. Methods: ecological study, of time series, about reports of organ donations and on transplants. The data were provided by the Registro Brasileiro de Transplantes and analyzed using polynomial regression. Results an increasing trend was found for potential donors and effective donors, with an average increase of 2.33 and 0.92 per year, respectively. The South Region had the highest rate of potential donors (83.8) and effective donors (34.1) and the North Region, the lowest rate (20.2 and 3.9). The family refusal was the main obstacle to accomplish the donation. Conclusions the results show an increasing trend of potential donors and effective donors throughout Brazil, with emphasis on the southern region of the country. Among the main reasons for non-donation, it is worth emphasizing family refusal and medical contraindication prescription.

RESUMEN Objetivos: identificar la tendencia temporal de las tasas de donantes efectivos de órganos y tejidos, de notificaciones y tipos de órganos trasplantados por millón de población en Brasil. Métodos: estudio ecológico, de series temporales, sobre notificaciones de donaciones y trasplantes de órganos. Los datos fueron proporcionados por el Registro Brasileño de Trasplantes, analizados mediante regresión polinomial. Resultados: se detectó una tendencia creciente para donantes potenciales y donantes efectivos, con un incremento promedio de 2,33 y 0,92 por año. La Región Sur tuvo la tasa más alta de donantes potenciales (83,8) y donantes efectivos (34,1) y la Región Norte, la más baja (20,2 y 3,9). La negativa familiar fue el principal impedimento para efectuar la donación. Conclusiones: los resultados demuestran una tendencia creciente de donantes potenciales y donantes efectivos en todo Brasil, con énfasis en la Región Sur. Entre los principales motivos para no donar destacan el rechazo familiar y contraindicación médica.

RESUMO Objetivos: identificar a tendência temporal das taxas de doadores efetivos de órgãos e tecidos, de notificações e tipos de órgãos transplantados por milhão da população no Brasil. Métodos: estudo ecológico, de séries temporais, sobre notificações de doações de órgãos e transplantes. Os dados foram fornecidos pelo Registro Brasileiro de Transplantes e analisados por meio de regressão polinomial. Resultados detectou-se tendência crescente de potenciais doadores e doadores efetivos, com aumento médio ao ano de 2,33 e 0,92, respectivamente. A Região Sul apresentou a maior taxa de potenciais doadores (83,8) e doadores efetivos (34,1) e a Região Norte, a menor (20,2 e 3,9). A recusa familiar consistiu no principal impedimento para efetivar a doação. Conclusões os resultados demonstram tendência crescente de potenciais doadores e doadores efetivos em todo o Brasil, com destaque para a região Sul. Dentre os principais motivos para a não doação, destacam-se a recusa familiar e a contraindicação médica.

Establishment and application of a database for hepatitis C virus NS3/4A protease inhibitors and their drug resistance data / 临床肝胆病杂志

ObjectiveTo establish a database for direct-acting antiviral agents (DAAs) targeting hepatitis C virus (HCV) NS3/4A protease and related resistance-associated variants, and to investigate its application in drug resistance analysis. MethodsThe published data and information of anti-NS3/4A DAAs and related drug resistance data were collected and mined. The in vitro data of viral drug-resistant mutations and resistance-associated variants identified in clinical treatment were entered into the database, and a statistical analysis was performed based on the type of drugs, HCV genotypes, positions of drug-resistant mutations, and type of substituted amino acids. Some of the results were available for online query on a website. Then the database was used to perform a multi-data analysis of the drug resistance of genotype 3 HCV, a well-known difficult-to-treat viral genotype. ResultsA database for anti-NS3/4A DAAs and their drug resistance data was established and some data were available for online query on a website (http://www.biosino.org/hcv/). This database consisted of the following four parts, with over ten thousands of pieces of information: the information of DAAs; the in vitro drug-resistance data of viral strains with different genotypes containing drug-resistant mutations; the prevalence of pre-existing resistance-associated variants and their detection rates in patients with treatment failure; the three-dimensional structures of the DAA-NS3/4A protease complex. This database was used to analyze drug resistance of all genotypes of HCV, and it was found that anti-NS3/4A DAAs had the poorest therapeutic effect in patients with genotype 3 HCV. Although the third-generation anti-NS3/4A DAAs had a good antiviral effect in patients with wild-type genotype 3 HCV, drug-resistant mutations might occur. ConclusionThis database is the first one in China for anti-NS3/4A DAAs and their drug-resistance data and provides an important resource of information and guidance for research on drug resistance and clinical treatment of HCV.

Educación continua: bases de datos biomédicas II: Medline/PubMed / Continuing education: biomedical databases II: Medline/PubMed

MEDLINE/PubMed es una de las bases de datos de bibliografía biomédica más grandes e importantes y el principal componente de PUbMed que cubre las áreas de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, sistemas de salud y ciencias preclínicas. La interfaz de PubMed permite realizar búsquedas, no solamente en Medline, sino también en otras 35 bases de datos del NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica). Medline fue desarrollado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM), que forma parte del Instituto Nacional de Salud (NIH). En esta sexta entrega de educación continua se describen la estructura, el funcionamiento y las características de los principales componentes de Medline/PubMed que permitirán al usuario realizar una búsqueda bibliográfica más eficiente.

MEDLINE / PubMed is one of the largest and most important biomedical bibliographic databases and the main component of PUbMed that covers the areas of medicine, nursing, dentistry, veterinary, health systems and preclinical sciences. The PubMed interface allows searching not only of Medline, but also of another 35 NCBI (National Center for Biotechnology Information) databases. Medline was developed by the National Library of Medicine of the United States (NLM), which is part of the National Institute of Health (NIH). This sixth edition of continuing education describes the structure, operation and characteristics of the main components of Medline / PubMed that will allow the user to perform a more efficient bibliographic search.

Perfil das publicações científicas sobre a infecção hospitalar na base de dados SciELO / Profile of scientific publications on hospital infection in the SciELO database

Objetivo - Descrever o perfil das publicações sobre infecção hospitalar disponíveis na base de dados Scientific Electronic Library Online (SciELO)entre 1975 a agosto de 2010. Métodos - Trata-se de uma pesquisa de revisão. Os dados foram coletados por meio da busca eletrônica através do descritor infecção hospitalar. Foram analisados 91 artigos, dos últimos 35 anos seguindo os itens: idioma, revistas, número de autores, data de publicação, tipo de pesquisa, população estudada, local de realização do estudo/base de dados e agentes etiológicos. Resultados - Observou-se uma grande proporção de artigos originais em relação a artigos de revisão. Destaca-se a Região Sudeste do Brasil com aproximadamente 61% dos artigos produzidos. Já em quantidade de artigos por objeto de estudo, os mais afetados foram pacientes internados com 58% e profissionais de saúde com 20%. Outras duas dimensões foram avaliadas, os microrganismos estudados e os agentes etiológicos. Nestas, destacaram-se as bactérias e o Staphylococcus aureus, presentes em 32% e 19% dos artigos, respectivamente. Conclusão - Espera-se que este assunto seja mais discutido no meio acadêmico, pois a prevenção da infecção hospitalar não é uma opção, é um dever para todos os profissionais de saúde.

Objective - To describe the publications available on nosocomial infection in the Scientific Electronic Library Online (SciELO) database from 1975 to August 2010. Methods - This is a research review. Data were collected through electronic search using the descriptor: hospital infection. A total of 91 articles in the last 35 years were analysed by the following items: language, journals, number of authors, publication date, type of research, study population, place of study / data base and etiological agents. Results - There was a large proportion of original articles for review articles. And there is the southeastern region of Brazil with about 61% of the articles produced. Since the quantity of articles by subject matter, the most affected were patients hospitalized in 58% and health professionals with 20%. Other two dimensions were evaluated, microorganisms studied and etiological agents. In these, highlights bacteria and Staphylococcus aureus, present in 32% and 19% of articles, respectively. Conclusion - It is hoped that this matter be further discussed in academia, for the prevention of nosocomial infection is not an option, it is a duty for all health professionals.

In Silico Identification of Drug Targets for Antifertility from Natural Products by Differential Reaction Content Analysis of Metabolic Pathways

Background: One of the major concerns of governments of developing and developed countries is to have a check on their population increase. Realising the importance of avoiding the harmful effects of synthetic compounds, scientists and researchers throughout the world are cooperating in efforts to design new and effective contraceptives from compounds of plant origin. Methods: In this paper, we compared 11 plant species by analysing compounds showing antifertility properties with respect to the metabolic pathways involved. The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome pathway database was the source of metabolic pathway information. Protein sequences and classification numbers of unique enzymes exclusively present in certain species were identified using the Expert Protein Analysis System. Results: Two enzymes, namely, L-aspartate dehydrogenase (EC no. 1.4.1.21) and transhexaprenyltranstransferase (EC no. 2.5.1.30), were identified as novel drug targets from the metabolic pathway analysis. Validation of the essential proteins identified through metabolic pathway comparison was done based on the literature information. Conclusion: The in silico analysis resulted in identification of 2 enzymes that are predicted to be the targets for putative antifertility drug. These enzymes can further be modelled to obtain their 3-dimensional structures with the help of various protein structure modelling softwares.

Classificação de microáreas de risco com uso de mineração de dados / Classification of risk micro-areas using data mining

Objetivo: Identificar, com o auxílio de técnicas computacionais, regras referentes às condições do ambiente físico para a classificação de microáreas de risco. Métodos: Pesquisa exploratória, desenvolvida na cidade de Curitiba, PR, em 2007, dividida em três etapas: identificação de atributos para classificar uma microárea; construção de uma base de dados; e aplicação do processo de descoberta de conhecimento em base de dados, por meio da aplicação de mineração de dados. O conjunto de atributos envolveu as condições de infra- estrutura, hidrografia, solo, área de lazer, características da comunidade e existência de vetores. A base de dados foi construída com dados obtidos em entrevistas com agentes comunitários de saúde, sendo utilizado um questionário com questões fechadas, elaborado com os atributos essenciais, selecionados por especialistas. Resultados: Foram identificados 49 atributos, sendo 41 essenciais e oito irrelevantes. Foram obtidas 68 regras com a mineração de dados, as quais foram analisadas sob a perspectiva de desempenho e qualidade e divididas em dois conjuntos: as inconsistentes e as que confirmam o conhecimento de especialistas. A comparação entre os conjuntos mostrou que as regras que confirmavam o conhecimento, apesar de terem desempenho computacional inferior, foram consideradas mais interessantes. Conclusões: A mineração de dados ofereceu um conjunto de regras úteis e compreensíveis, capazes de caracterizar microáreas, classificando-as quanto ao grau do risco, com base em características do ambiente físico. A utilização das regras propostas permite que a classificação de uma microárea possa ser realizada de forma mais rápida, menos subjetiva, mantendo um padrão entre as equipes de saúde, superando a influência da percepção particular de cada componente da equipe.

Completude dos dados do Programa de Controle da Tuberculose no Sistema de Informação de Agravos de Notificação no Estado do Espírito Santo, Brasil: uma análise do período de 2001 a 2005 / Completeness of tuberculosis control program records in the case registry database of the state of Espírito Santo, Brazil: analysis of the 2001-2005 period

OBJETIVO: analisar a completude dos dados do Programa de Controle da Tuberculose no Sistema de Informação de Agravos de Notificação do Estado do Espírito Santo no período de 2001 a 2005. MÉTODOS: estudo descritivo de análise de dados secundários. As variáveis estudadas foram: raça/cor, escolaridade, tratamento supervisionado, encerramento de cultura de escarro, situação de HIV, baciloscopia de 6º mês e situação de encerramento. RESULTADOS: Utilizando-se os parâmetros técnicos do Sistema de Informação de Agravos de Notificação do Ministério da Saúde que dizem respeito ao percentual de preenchimento dos campos das fichas de notificação, o banco de dados sobre tuberculose no estado do Espírito Santo pode ser considerado de regular a excelente. Há no estado do Espírito Santo 78 municípios, dos quais 8 são prioritários no controle da tuberculose. Os municípios não prioritários apresentaram maior completude do que os prioritários em relação às variáveis estudadas, exceto na situação de encerramento, com percentual idêntico de preenchimento. CONCLUSÕES: Os municípios prioritários são responsáveis por 70,2 por cento do total de notificações, devendo, portanto, melhorar a qualidade dos registros em relação ao preenchimento dos campos e à atualização dos dados, primordiais para a confiabilidade da análise epidemiológica. Isto possibilitará o planejamento de ações de prevenção e controle da tuberculose no estado.

OBJECTIVE: To investigate the completeness of tuberculosis control program records for the 2001-2005 period in the case registry database of the state of Espírito Santo, Brazil. METHODS: A descriptive study using secondary data analysis. The following variables were studied: race/color; educational level, supervised treatment, sputum culture at treatment outcome, HIV status, smear sputum microscopy at the sixth month of treatment and treatment outcome. RESULTS: Using technical parameters of the case registry database of the Brazilian National Ministry of Health regarding the percentage of completeness of data on the reporting forms, the tuberculosis database of the state of Espírito Santo can be classified as fair to excellent. The state of Espírito Santo has 78 cities, 8 of which are considered priorities for tuberculosis control. For the variables studied, the cities not considered priorities presented better completeness of records than did those considered priorities, the exception being the variable treatment outcome, for which the percentage of completeness was comparable among all of the cities. CONCLUSIONS: Since the cities that are considered priorities accounted for 70.2 percent of the total number of reports, the responsible officials in those cities should improve the quality of those reports in terms of the completeness of forms and the updating of data, which are fundamental to the reliability of epidemiological analyses. That will make it possible to plan activities aimed at the prevention and control of tuberculosis in the state.