Genetic diversity among cassava genotypes (Manihot esculenta crantz) collected in the south-central mesoregion of the state of Mato Grosso-Brazil

The aim of this research was to evaluate the genetic divergence between 164 genotypes of Manihot esculenta from the South-Central mesoregion of the State of Mato Grosso. The genotypes are from projects conducted by the Laboratory of Genetic Resources & Biotechnology of the University of the State of Mato Grosso, Cáceres-Mato Grosso (UNEMAT), and the Brazilian Public Agricultural Research Corporation - Agrosilvopastoral (EMBRAPA). The agronomic descriptors evaluated were plant height, height of first branching, branching levels, weight of the aerial part of the plant, total weight of the plant, number of roots per plant, average weight of roots per plant, yield of commercial roots, yield of non-commercial roots, number of rotten roots per plant and harvest index. For the analysis of genetic divergence, multivariate analysis based on the standardized Euclidean mean distance was employed, later performing the Hierarchical UPGMA and Tocher Optimization agglomerative methods. The degree of preservation of the genetic distances in the dendrogram was verified using the Cophenetic Correlation Coefficient. The Singh criterion was used to quantify the relative contribution of characteristics to genetic divergence. The genotypes presented genetic dissimilarity for the evaluated characteristics and based on the results of the dissimilarity matrix and groupings, it is recommended the crossings between the genotypes allocated in group II with the genotype allocated in group V, for the development of segregated populations with high genetic variability.

Estimates of genetic divergence in cowpea by multivariate analysis in different environments / Estimativa de divergência genética em feijão-caupi por meio de análise multivariada em diferentes ambientes

Cowpea is a legume of great importance in the Brazilian nutrition, mainly in the Northeast region. Despite the low yield of Brazilian cowpea, the species presents a genetic potential to be explored. Thus, this work aimed to characterize the genetic diversity of cowpea genotypes by agronomic traits and select genotypes for possible crosses by multivariate analysis. Four value for cultivation and use tests were carried out with cowpea genotypes in 2005 and 2006, in the municipalities of Aquidauana, Chapadão do Sul, and Dourados, in the state of Mato Grosso do Sul. The experimental design was a complete randomized block with 20 genotypes and four replications. The evaluated traits were value for cultivation, plant lodging, pod length, grain weight of five pods, number of grains per pod, pod weight, severity of powdery mildew, and grain yield. To estimate the genetic diversity among the genotypes, the optimization methods of Tocher and UPGMA were used. The generalized distance of Mahalanobis was used as a dissimilarity measure. The clustering methods revealed genetic variability among the cowpea genotypes evaluated. The methods used formed a different number of groups for each environment. Genotypes TE97-309G-24, MNC99-542F-5, BRS Paraguaçu, BRS Paraguaçu, BR 17-Gurguéia, and CNC x 409-11F-P2 can be used to obtain promising combinations and high genetic variability.

O feijão-caupi é de grande importância na nutrição brasileira, principalmente na região Nordeste. Apesar do baixo rendimento do feijão-caupi no Brasil, esta leguminosa apresenta potencial genético a ser explorado. Dessa forma, o objetivo do trabalho foi caracterizar a variabilidade genética de caracteres agronômicos e estimar a divergência genética entre genótipos de feijão-caupi por meio de análise multivariada. Quatro ensaios de valor de cultivo e uso com genótipos de feijão-caupi foram conduzidos nos anos de 2005 e 2006, nos municípios de Aquidauana, Chapadão do Sul e Dourados. Os experimentos foram conduzidos em delineamento blocos casualizados, com 20 genótipos e quatro repetições. Os caracteres avaliados foram acamamento de plantas, comprimento de vagem, peso de grãos de cinco vagens, número de grãos por vagem, peso de vagem e produtividade de grãos. Realizou-se análise de variância individual e conjunta. Para estimar a diversidade genética entre os genótipos, foram utilizados o métodos de otimização de Tocher e UPGMA. A distância generalizada de Mahalanobis foi utilizada como medida de dissimilaridade. Foi possível detectar variabilidade genética entre os genótipos de feijão-caupi avaliados por meio dos métodos de agrupamento utilizados. Os métodos utilizados formaram números de grupos distintos para cada ambiente. Os genótipos TE97-309G-24, MNC99-542F-5, BRS Paraguaçu, BRS Paraguaçu, BR 17-Gurguéia e CNC x 409-11F-P2 podem ser usados para obter combinações promissoras e elevada variabilidade genética.

Abiotic factors drives floristic variations of fern's metacommunity in an Atlantic Forest remnant / Fatores abióticos regulam as variações florísticas na metacomunidade de samambaias em um remanescente de Floresta Atlântica

Abstract We analyzed floristic variations in fern's metacommunity at the local scale and their relationship with abiotic factors in an Atlantic Forest remnant of northeastern Brazil. Floristic and environmental variations were accessed on ten plots of 10 × 20 m. We performed cluster analyses, based on Bray-Curtis dissimilarity index to establish the floristic relationship. The influence of abiotic factors: luminosity, temperature, relative air humidity and relative soil moisture was evaluated from a redundancy analysis. We found 24 species belonging to 20 genera and 12 families. The fern's flora showed high floristic heterogeneity (>75% for most of the plot's associations). The fern's metacommunity was structured along an abiotic gradient modulated by temperature, luminosity, and relative soil moisture.

Resumo Analisamos as variações florísticas na metacomunidade de samambaias em escala local e sua relação com fatores abióticos em um remanescente de Floresta Atlântica no Nordeste do Brasil. Variações florísticas e ambientais foram acessadas a partir de dez parcelas de 10 × 20 m. Realizamos análises de cluster, baseado no índice de similaridade de Bray-Curtis para estabelecer relações florísticas. A influência de fatores abióticos: luminosidade, temperatura, umidade relativa do ar e umidade relativa do solo foram avaliadas a partir da análise de redundância. Encontramos 24 espécies pertencentes a 20 gêneros e 12 famílias. A flora de samambaias exibiu uma elevada heterogeneidade florística (>75% para a maioria das associações entre plots). Observou-se que a metacomunidade de samambaias estava estruturada ao longo de um gradiente abiótico modulado pela temperatura, luminosidade e umidade relativa do solo.

Fish beta diversity responses to environmental heterogeneity and flood pulses are different according to reproductive guild

In floodplain communities, beta diversity is influenced by different factors; however, environmental heterogeneity and floods are believed to be particularly influential. The influence of environmental heterogeneity and floods on beta diversity may vary among guilds that present different ecological traits. This study evaluated the correlation between the environmental heterogeneity and flood periods and the beta diversity of trophic and reproductive guilds of fish assemblages. Sampling was conducted quarterly between 2000 and 2012 in the upper Paraná River floodplain. The environmental heterogeneity and period (i.e., dry or flood) were associated with the beta diversity of each guild based on the results of generalized least squares linear models. Only guilds with parental care were influenced by the interaction between environmental heterogeneity and period. The beta diversity of the other guilds presented no relationship between environmental heterogeneity and period. It is likely that species with parental care presented less dispersal capacity, which increased the dissimilarity among assemblages. The higher dispersion rates of the other guilds may be responsible for the lack of relationship between the beta diversity and the environmental heterogeneity and period. In sum, these results suggest that reproductive guilds influence how environmental heterogeneity and floods affect beta diversity variation.(AU)

A diversidade beta é influenciada por diferentes fatores em comunidades de planícies de inundação; contudo, acredita-se que a heterogeneidade ambiental e inundações sejam particularmente influentes. A influência da heterogeneidade ambiental e inundações na diversidade beta podem variar entre guildas que apresentam diferentes características ecológicas. Este estudo avaliou a correlação entre heterogeneidade ambiental, os períodos de inundação e a diversidade beta de guildas tróficas e reprodutivas de peixes. A amostragem foi realizada trimestralmente entre 2000 e 2012 na planície de inundação do Alto rio Paraná. Heterogeneidade ambiental e o período (i.e., seca ou cheia) foram associados à diversidade beta de cada guilda por modelos lineares de quadrados mínimos generalizados. Somente guildas com cuidados parentais foram influenciadas pela interação entre heterogeneidade ambiental e período. A diversidade beta das outras guildas não apresentou relação com heterogeneidade ambiental e período. É provável que espécies com cuidados parentais apresentem menor capacidade de dispersão, o que aumenta a diferença entre as assembleias. As maiores taxas de dispersão de outras guildas podem ser responsáveis pela ausência de relação entre a diversidade beta e heterogeneidade ambiental e o período. Em suma, os resultados sugerem que as guildas reprodutivas influenciam a forma como a heterogeneidade ambiental e as inundações afetam a variação da diversidade beta.(AU)

Abiotic factors drives floristic variations of ferns metacommunity in an Atlantic Forest remnant

Abstract We analyzed floristic variations in ferns metacommunity at the local scale and their relationship with abiotic factors in an Atlantic Forest remnant of northeastern Brazil. Floristic and environmental variations were accessed on ten plots of 10 × 20 m. We performed cluster analyses, based on Bray-Curtis dissimilarity index to establish the floristic relationship. The influence of abiotic factors: luminosity, temperature, relative air humidity and relative soil moisture was evaluated from a redundancy analysis. We found 24 species belonging to 20 genera and 12 families. The ferns flora showed high floristic heterogeneity (>75% for most of the plots associations). The ferns metacommunity was structured along an abiotic gradient modulated by temperature, luminosity, and relative soil moisture.

Resumo Analisamos as variações florísticas na metacomunidade de samambaias em escala local e sua relação com fatores abióticos em um remanescente de Floresta Atlântica no Nordeste do Brasil. Variações florísticas e ambientais foram acessadas a partir de dez parcelas de 10 × 20 m. Realizamos análises de cluster, baseado no índice de similaridade de Bray-Curtis para estabelecer relações florísticas. A influência de fatores abióticos: luminosidade, temperatura, umidade relativa do ar e umidade relativa do solo foram avaliadas a partir da análise de redundância. Encontramos 24 espécies pertencentes a 20 gêneros e 12 famílias. A flora de samambaias exibiu uma elevada heterogeneidade florística (>75% para a maioria das associações entre plots). Observou-se que a metacomunidade de samambaias estava estruturada ao longo de um gradiente abiótico modulado pela temperatura, luminosidade e umidade relativa do solo.

Correlation between genetic differences of mates and pathogenicity of Schis-tosoma japonicum in definitive host / 中国血吸虫病防治杂志

Objective To explore the correlation between the genetic dissimilarity and heterozygosity of mates and the patho?genicity of Schistosoma japonicum in the definitive host. Methods By using seven microsatellite loci markers,S. japonicum genotyping of sixteen pairs randomly mated was performed,the genetic dissimilarity and heterozygosity were calculated between the mates,and the correlation between the genetic dissimilarity and heterozygosity of the mates and the pathogenicity of S. japon?icum in the definitive host was evaluated. Results There was a significant correlation between the genetic similarity of S. ja?ponicum mates and the mean number of eggs per worm pair in the liver and intestinal tissue (r = 0.501 6 ,P 0.05;r=0.265 3,P>0.05,respectively)and the average diameter of granuloma in the liver(r=-0.272 7,P>0.05),respec?tively. There was no correlation between the heterozygosity of the mates and all the pathological parameters of S. japonicum in the definitive host(P > 0.05). Conclusions There is the correlation between the genetic dissimilarity of the mates and the pathogenicity of S. japonicum in the definitive host,and the genetic dissimilarity is greater,pathogenicity is weaker. There is no correlation between heterozygosity of the mates and the pathogenicity of S. japonicum in the definitive host.

Feature selection using feature dissimilarity measure and density-based clustering: Application to biological data.

Reduction of dimensionality has emerged as a routine process in modelling complex biological systems. A large number of feature selection techniques have been reported in the literature to improve model performance in terms of accuracy and speed. In the present article an unsupervised feature selection technique is proposed, using maximum information compression index as the dissimilarity measure and the well-known density-based cluster identification technique DBSCAN for identifying the largest natural group of dissimilar features. The algorithm is fast and less sensitive to the user-supplied parameters. Moreover, the method automatically determines the required number of features and identifies them. We used the proposed method for reducing dimensionality of a number of benchmark data sets of varying sizes. Its performance was also extensively compared with some other well-known feature selection methods.

Genetic divergence among maize hybrids in cerrado-pantanal ecotone / Divergência genética entre híbridos de milho no ecótono cerrado-pantanal

In maize breeding programs can arise difficulties in relation to combination capacity studies for determination of heterotic groups, which are highly correlated with genetic divergence among the parents. The aim of this study was to estimate the genetic divergence measured for nine quantitative morphological traits in eleven single-cross hybrids of maize cultivated in the Cerrado-Pantanal ecotone. The experiment was conducted at Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul ­ University Unit of Aquidauana. The experimental design was a randomized blocks with four replications. At harvest time, it were measured the following traits: plant height, ear insertion height, ear length, ear diameter, stem diameter, number of kernels per rows, number of rows per ear, weight of hundred grains and grain yield. In the application of hybrids cluster technique was adopted the Mahalanobis's generalized distance as dissimilarity measure, and for establishment of similar groups was applied the Tocher's method. The results indicated the existence of genetic variability among tested hybrids. The greatest genetic divergence was observed among the pairs MAXIMUS and XB6012, implying in heterotic gains. Crossings of lines extracted from hybrids 2B587HX and XB6012 with lines obtained from the other hybrids provide greater heterosis. The traits grain yield and ear insertion height were those who more and less contributed, respectively, for genetic divergence among hybrids.

Em programas de melhoramento em milho podem surgir dificuldades quanto a estudos de capacidade de combinação para determinação de grupos heretóticos, que estão altamente correlacionados com a divergência genética entre os genitores. O objetivo deste trabalho foi estimar a divergência genética mensurada para nove descritores morfológicos quantitativos em onze híbridos simples de milho cultivado no ecótono Cerrado-Pantanal. O experimento foi conduzido na área experimental da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, Aquidauana (MS). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados com quatro repetições. No momento da colheita, foram mensurados os seguintes descritores: altura de planta, altura de inserção da primeira espiga, diâmetro da espiga, diâmetro do colmo, número de grãos por fileira, número de fileiras por espiga, massa de cem grãos e rendimento de grãos. Na aplicação da técnica de agrupamento de híbridos foi adotada a distância generalizada de Mahalanobis como medida de dissimilaridade, e para o estabelecimento de grupos similares foi aplicado o método de Tocher. Os resultados indicaram a existência de variabilidade genética entre os híbridos testados. A maior divergência genética foi observada entre os pares MAXIMUS e XB6012, implicando em ganho heterótico. Cruzamentos de linhagens extraídas dos híbridos 2B587HX e XB6012 com linhagens obtidas a partir dos demais híbridos proporcionaram maior heterose. Os descritores rendimento de grãos e altura de inserção da espiga foram os que mais e menos contribuíram, respectivamente, para a divergência genética entre os híbridos.

Determinação da diversidade genética entre acessos de algodão por meio de marcadores microssatélites / Genetic diversity determination among accessions of cotton by microsatellites markers

A utilização de marcadores moleculares microssatélites ou SSR (Simples Sequência Repetitiva) tem se mostrado uma excelente técnica para identificação de cultivares, análise genealógica e de distância genética entre organismos. O conhecimento da diversidade genética entre grupos de genitores por meio da utilização de marcadores moleculares vem permitindo estabelecer diferenças entre acessos de algodão, facilitando a seleção de genitores a serem empregados em programas de melhoramento. O trabalho teve por objetivo avaliar a diversidade genética entre acessos provenientes do Banco de germoplasma de algodão da Empresa de Pesquisa de Minas Gerais (EPAMIG) por meio de marcadores moleculares SSR. Os 37 oligonucleotídeos da série BNL amplificaram um total de 106 alelos. Uma média de 2,86 alelos por locus foi detectada, com uma média de conteúdo informativo de polimorfismo (PIC) de 0,068. A maior taxa de heterozigosidade (0,15) foi obtida para o acesso Dendera e (0,12) para o acesso Giza 80. As menores taxas de heterozigosidade (0,05) foram observadas para os acessos T-7044 e Coker-310. A partir das estimativas de dissimilaridade de Nei a maior distância genética foi obtida entre os acessos Giza 80 e T-7044 (0,88), e a menor distância (0,042) entre os acessos SL 24-82885 e o T-295. O dendrograma gerado apresentou a formação de nove grupos distintos, sendo os acessos Giza 80 e Dendera os mais divergentes entre os todos os estudados.

The use of microsatellite molecular markers or SRS (Simple Repetitive Sequence) has proved to be an excellent technique for cultivar identification, genealogical analysis and genetic distance between organisms. The knowledge of genetic diversity among groups of parents through the use of molecular markers has allowed establishing differences among accessions of cotton, facilitating the selection of parents to be used in breeding programs. The study aimed to assess the genetic diversity among accessions from the germplasm bank Cotton Research Company of Minas Gerais (EPAMIG) using SRS markers. The 37 primers from BNL series amplified a total of 106 alleles. An average of 2.86 alleles per locus was detected with average polymorphism information content (PIC) of 0.068. The highest rate of heterozygosity (0.15) was obtained for access Dendera and (0.12) for Giza 80. The lowest rates of heterozygosity (0.05) were observed for the accessions Coker T-7044-310. From the Nei ´s dissimilarity estimation the largest genetic distance was observed between Giza 80 and T-7044 (0.88), and the shortest distance (0.042) between accessions 24-82885 SL and T-295. The dendrogram generated showed the formation of nine distinct groups, accesses Giza 80 and Dendera were the most divergent among all studied.

Relationship between heterosis and genetic divergence for phosphorus use efficiency and its components in tropical maize / Relação entre heterose e divergência genética para a eficiência no uso do fósforo e seus componentes em milho tropical

The objective of this study was to determine the relationship between heterosis and genetic divergence for phosphorus use efficiency (PUE) in tropical maize. It was used two groups of genitors, each consisting of seven lines, contrasting with each other in the nitrogen and phosphorus use efficiency. It was obtained 41 hybrid combinations between these groups, which were evaluated in low phosphorus. Randomized complete block design with two replications was used. For obtaining the components of variance and the breeding values were used REML/BLUP method. In the genotyping of the parental lines were used 80 microsatellite markers. Through the correlation between genetic distance obtained by the markers and specific combining ability it was not possible to determine with accuracy by molecular markers, the crosses that produced hybrids with the highest heterosis for PUE. Thus, is possible to conclude that there is no relationship between genetic divergence and heterosis for phosphorus use efficiency and its components in tropical maize.

O objetivo deste estudo foi determinar a relação entre divergência genética e heterose para a eficiência no uso de fósforo (EUP) em milho tropical. Utilizaram-se dois grupos de genitores, compostos de sete linhagens cada, contrastantes entre si para as eficiências no uso de nitrogênio e fósforo. Foram obtidas 41 combinações híbridas entre esses grupos, as quais foram avaliadas em baixo fósforo. Usou-se o delineamento em blocos ao acaso com duas repetições. A obtenção dos componentes de variância e valores genéticos foi realizada via REML/BLUP e, para genotipagem das linhagens genitoras, foram utilizados 80 marcadores microssatélites. Através da correlação entre a distância genética obtida pelos marcadores e a capacidade específica de combinação, observou-se não ser possível a determinação com acurácia, via marcadores moleculares, dos cruzamentos que produziram os híbridos com as maiores heteroses para EUP. Com isso, é possível concluir que não há relação entre divergência genética e heterose para eficiência no uso de fósforo e seus componentes em milho tropical.

A survey on the different use of the study strategies in English learning between the brilliant and inferior students / 中华医学教育探索杂志

The article mainly explores the dissimilarities of the use of strategies in English learning between the brilliant and inferior students in a university in Chongqing by means of rational analysis.It was found that the width and frequency of the study strategies used by the brilliant students were obviously more often than those by the inferior ones.And there was a lot of difference in the use of study strategies between the two.It showed that the former often adopted the approaches of imagining when reading,actively participating in the classroom activities,and process monitoring,etc.which are generally regarded as effective strategies and will contribute a great deal to successful English study,while the latter tended to use the way of looking for the surface meaning and word for word translation because they are always plagued by their mother tongue.

Análise dialélica e uso de marcadores microssatélites na avaliação de cultivares de trigo / Diallel analysis and use of microsatellite markers for the evaluation of wheat cultivars

Foi avaliada a capacidade combinatória de oito cultivares de trigo, por meio de um esquema dialélico analisado segundo o modelo quatro da metodologia de Griffing. Paralelamente, foi realizada uma análise de dissimilaridade com marcadores SSR, a partir de estimativas de distância genética baseadas em pedigree. Oito características foram avaliadas num experimento delineado em blocos ao acaso, com duas repetições. O agrupamento das cultivares a partir das distâncias genéticas foi efetuado com os métodos UPGMA e Tocher. Ficou evidenciada a variabilidade entre os genótipos de trigo. As cultivares 'CD 108', 'CD 0542' e 'CD 104' apresentaram grande capacidade geral de combinação para vários caracteres. Os maiores valores de capacidade específica de combinação foram detectados nos híbridos mais heterozigotos, formados pelo cruzamento de parentais integrantes de grupos diferentes. Os agrupamentos indicados pelo pedigree não coincidiram com os indicados a partir dos marcadores moleculares. As distâncias dos marcadores SSR provavelmente refletem melhor as relações entre as cultivares de trigo do que as distâncias medidas com base na genealogia. A falta de associação entre os padrões de agrupamento foi provavelmente devida às propriedades intrínsecas de cada forma de estimação das distâncias genéticas, as quais podem modificar a interpretação e a distribuição da variabilidade genética entre os genótipos avaliados.

The combining ability of eight wheat varieties was evaluated according to the fourth model of the Griffing's diallelic methodology. Studies on genetic dissimilarity based on microsatellite markers and genetic distance among genotypes from pedigree data were also performed. The experiment was carried out in a randomized block design with two replications. Eight traits were evaluated in the diallel. Genotypes were grouped according to the UPGMA and Tocher methods. Genetic variability among genotypes was evident. Varieties 'CD 108', 'CD 0542' and 'CD 104' were those who showed high values for general combining ability in several traits. Since the effects of specific combining ability were more important in those particularly heterozygous combinations obtained from varieties allocated in different clusters, field and molecular results coincided in a certain way. There was no a good coincidence between the dendrogram based on parentage coefficient and the one based on microssatellite markers. The very small association between standards of grouping was probably related to the intrinsic properties of each way of estimating the genetic distance, which can modify the interpretation and the distribution of the genetic variability in the evaluated genotypes.

Consistência do padrão de agrupamento de cultivares de milho / Clustering pattern consistency of corn cultivars

O objetivo deste trabalho foi avaliar a consistência do padrão de agrupamento obtido a partir da combinação de duas medidas de dissimilaridade e quatro métodos de agrupamento, em cenários formados por combinações de número de cultivares e número de variáveis, com dados reais de cultivares de milho (Zea mays L.) e com dados simulados. Foram usados os dados reais de cinco variáveis mensuradas em 69 experimentos de competição de cultivares de milho, cujo número de cultivares avaliadas oscilou entre 9 e 40. A fim de investigar os resultados com maior número de cultivares e de variáveis, foram simulados, sob distribuição normal padrão, 1.000 experimentos para cada um dos 54 cenários formados pela combinação entre o número de cultivares (20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 e 100) e o número de variáveis (5, 6, 7, 8, 9 e 10). Foram realizadas análises de correlação, de diagnóstico de multicolinearidade e de agrupamento. A consistência do padrão de agrupamento foi avaliada por meio do coeficiente de correlação cofenética. Há decréscimo da consistência do padrão de agrupamento com o acréscimo do número de cultivares e de variáveis. A distância euclidiana proporciona maior consistência no padrão de agrupamento em relação à distância de Manhattan. A consistência do padrão de agrupamento entre os métodos aumenta na seguinte ordem: Ward, ligação completa, ligação simples e ligação média entre grupo.

The objective of this research was to evaluate the clustering pattern consistency obtained from the combination of the two dissimilarity measures and four clustering methods, in scenarios consist of combinations number of cultivars and number of variables, with real data in corn cultivars (Zea mays L.) and simulated data. We used real data from five variables measured in 69 trials involving corn cultivars, the number of cultivars ranged between 9 and 40. In order to investigate the results with more cultivars and variables, were simulated under the standard normal distribution, 1,000 experiments for each of the 54 scenarios formed by the combination among the number of cultivars (20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 and 100) and the number of variables (5, 6, 7, 8, 9 and 10). Analyses of correlation, diagnoses of multicollinearity ans cluster were carried out. Clustering pattern consistency was evaluated by the cophenetic correlation coefficient. There is a decrease of clustering pattern consistency with the increase in the number of cultivars and variable. The euclidean distance provides greater clustering pattern consistency in relation to Manhattan distance. The clustering pattern consistency among the methods increases as follows: Ward's, complete linkage, single linkage and average linkage between groups.

Diferencial de salários entre homens e mulheres segundo a condição de migração / Diferencia de salarios entre hombres y mujeres según la condición de migración / Wage differences between men and women according to condition of migration

Este trabalho analisa a diferença salarial por sexo, segundo a condição de migração da população. Por meio do cálculo do índice de dissimilaridade de Duncan e da decomposição de Oaxaca para os salários de homens e mulheres migrantes e não-migrantes, encontraram-se situações diferenciadas para a Região Sudeste e o restante do país. Os resultados mostram que a elevada diferença salarial entre sexo verificada na população migrante residente fora da Região Sudeste mantém-se devido à diferente valorização no mercado de trabalho do local de destino dos atributos masculinos vis-à-vis os femininos. Já no caso do Sudeste, a menor diferença salarial constatada entre homens e mulheres migrantes deve-se mais às características específicas das trabalhadoras do que à valorização diferenciada no mercado de trabalho.

Este trabajo analiza la diferencia salarial por sexo, según la condición de migración de la población. Por medio del cálculo del índice de disimilaridad de Duncan y de la descomposición de Oaxaca para los salarios de hombres y mujeres migrantes y no-migrantes, se encontraron situaciones diferenciadas para la Región Sudeste y el resto del país. Los resultados muestran que la elevada diferencia salarial entre sexo verificada en la población migrante residente fuera de la Región Sudeste se mantiene, debido a la diferente valorización en el mercado de trabajo del lugar de destino de los atributos masculinos con respecto a los femeninos. Por otro lado, en el caso del Sudeste, la menor diferencia salarial constatada entre hombres y mujeres migrantes se debe más a las características específicas de las trabajadoras que a la valorización diferenciada en el mercado de trabajo.

This article analyzes wage differences by gender, as per condition of migration of the population. By calculating Duncan's dissimilarity index and the Oaxaca decomposition for wages of male and female migrants and non-migrants, great differences were noted between the southeastern region of Brazil and the rest of the country. The findings show that the great wage differences between genders detected in the migrant population living outside the southeastern region is due to the different valuation on the labor market of male attributes vis-a-vis female. But in the southeast the narrower wage difference between men and women migrants was seen as being due more to the specific characteristics of the workers than to different valuation on the labor market.

Comparação de métodos de agrupamento para o estudo da divergência genética em cultivares de feijão / Comparison of cluster methods for the study of genetic diversity in common bean cultivars

Os objetivos deste trabalho foram comparar métodos de agrupamento, com base nas medidas de dissimilaridade (euclidiana média padronizada e generalizada de Mahalanobis) e obter informações sobre a divergência genética em cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.). Quatorze cultivares de feijão foram avaliadas em nove experimentos conduzidos em Santa Maria, Estado do Rio Grande do Sul (latitude 29°42S, longitude 53°49W e 95m de altitude), nos anos agrícolas de 2000/2001 a 2004/2005. Foi utilizado o delineamento aleatorizado em blocos, com três repetições, e foram avaliados os caracteres produtividade de grãos, número de vagens por planta e de sementes por vagem, massa de cem grãos, população final de plantas, número de dias da emergência ao florescimento e da emergência à colheita, altura de inserção de primeira e de última vagem e grau de acamamento. Agrupamentos com base na distância euclidiana média padronizada são distintos dos formados com base na distância generalizada de Mahalanobis. O método de Tocher e os métodos hierárquicos da ligação simples, de Ward, da ligação completa, da mediana, da ligação média dentro de grupo e da ligação média entre grupo, com base na distância generalizada de Mahalanobis formam grupos concordantes. A cultivar "Iraí" apresenta comportamento distinto das demais cultivares.

The aim of this research was to compare cluster methods, on the basis of the dissimilarity (standardized average euclidian and Mahalanobis generalized) and obtain information on genetic diversity in common bean cultivars (Phaseolus vulgaris). Fourteen common beans cultivars were evaluated in nine experiments conducted in Santa Maria, Rio Grande do Sul State, Brazil (latitude 29°42 S, longitude 53°49 W, altitude 95m), in agricultural years from 2000/2001 to 2004/2005. Randomized blocks design with three repetitions was installed to evaluated the following characters: grain yield, number of pods per plant, number of seeds per pod, weight of 100 grains, final population of plants, number of days of the emergency to flowering, number of days of the emergency to harvest, height of first pod insertion and height of the final pod insertion. Clusters based on the standardized average euclidian distance are distinct from those formed on the basis of Mahalanobis generalized distance. The Tocher's method and hierarchical methods of the single linkage, Ward, complete linkage, median, the average linkage within the group and average linkage between groups, based on the Mahalanobis generalized distance form agreement cluster. The cultivar 'Iraí' presents distinct behavior from other cultivars.

Caracterização da diversidade genética entre acessos crioulos de feijão (Phaseolus vulgaris L.) coletados em Santa Catarina por marcadores RAPD / Characterization of the genetic diversity of landraces of common bean (Phaseolus vulgaris L.) collected in Santa Catarina State by RAPD markers

O conhecimento da diversidade genética, por meio da dissimilaridade entre os genótipos, permite a organização, a amostragem e a utilização eficiente do germoplasma em programas de melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi estimar a dissimilaridade entre acessos crioulos de feijão coletados no Estado de Santa Catarina, integrantes do banco ativo de germoplasma de feijão da UDESC e de três cultivares comerciais ("Pérola", "SCS 202-Guará" e "BRS Valente"), por meio de marcadores moleculares RAPD. Foram utilizados 21 iniciadores decâmeros que permitiram a visualização de 96 bandas, sendo que 41 (42,7 por cento) apresentaram polimorfismo entre os acessos estudados, resultando em bandas entre 650 e 2000pb. A dissimilaridade foi calculada utilizando-se o coeficiente de Sorensen-Dice e o agrupamento foi realizado pelo método UPGMA. Os acessos foram separados em dois grupos principais, com dissimilaridade relativamente alta, quando comparada com a dissimilaridade observada dentro de cada grupo. Os dois grupos formados indicam os centros de domesticação, Mesoamericano ou Andino, dos acessos analisados. A dissimilaridade entre as cultivares avaliadas ("SCS 202-Guará", "BRS Valente" e "Pérola") é baixa (0,15), se comparada com a dissimilaridade entre os demais acessos do banco de germoplasma (0,65). A menor dissimilaridade entre os acessos estudados (BAF63 e BAF04) foi de 0,02. A inexistência de acessos repetidos reforça a necessidade de novas coletas de germoplasma, o que resultará em um banco de germoplasma de feijão mais representativo da variabilidade genética remanescente em Santa Catarina.

The knowledge of the genetic diversity through the divergence among the genotypes allows the organization of the germplasm, sampling and efficient utilization in breeding programs. The objective of this study was to analyze the dissimilarity among germplasm collected in Santa Catarina State, stored in UDESC germplasm active bank of common bean, and of three cultivars ('Pérola', 'SCS 202-Guará' e 'BRS Valente'), using RAPD markers. 21 decamer-primers that allowed the visualization of 96 bands were used, and 41 (42.7 percent) presented polymorphism among the studied accesses, resulting in a band range of 650 to 2000pb. The dissimilarity was calculated using the Sorensen-Dice coefficient and the grouping analyses were derived from UPGMA. The accesses were separated in two main groups, with wide dissimilarity when compared with the divergence inside each group. These two groups indicate the possible center of domestication, Middle-American or Andean, of the accesses in this study. The dissimilarity among the cultivars evaluated ('SCS 202-Guará', 'BRS Valente' e 'Pérola') was small (0.15), if compared with the divergence among the accesses of the germplasm bank (0.65). The smaller dissimilarity among the studied accesses (BAF63 and BAF04) was 0.02. The results reinforce the need of new collection expeditions, which will increase the representation of the genetic variability of the remaining bean landraces in Santa Catarina State.

Seasonal and interpopulational morphometry variation of Platyscytus decempunctatus (Carvalho 1945) (Heteroptera: Miridae) / Variação morfométrica sazonal e interpopulacional de Platyscytus decempunctatus (Carvalho 1945) (Heteroptera: Miridae)

A morphometry study was carried out with Platyscytus decempunctatus (Carvalho 1945) collected during the dry and wet seasons in Viçosa county, state of Minas Gerais, Brazil and in other 23 counties from the states of Minas Gerais and Rio de Janeiro in Brazil. A total of 30 males and 30 females were collected in Viçosa at each season and additional insects (20 males and 20 females) were collected at each county surveyed. The analysis with 27 morphological traits was carried out to verify the seasonal influence, differences between sexes and among populations in specimens from Viçosa. The females of P. decempunctatus collected in Viçosa were larger than the males in most of the traits evaluated in both seasons (dry and wet). The males showed only two body traits larger than the females. Interpopulational morphometry differences of P. decempunctatus were significantly correlated with geographic distance among sampling sites.

Foi realizado um estudo morfométrico com Platyscytus decempunctatus (Carvalho 1945) coletados durante as estações seca e úmida no município de Viçosa, MG e em 23 municípios distribuídos pelos estados de Minas Gerais e Rio de Janeiro. Foram utilizados 30 machos e 30 fêmeas por estação no estudo de Viçosa e insetos adicionais (20 machos e 20 fêmeas) de cada um dos 23 municípios amostrados. Foram analisadas 27 características morfológicas a fim de verificar a influência sazonal e diferenças no dimorfismo sexual em indivíduos de Viçosa e diferenças entre as populações amostradas. As fêmeas de P. decempunctatus coletadas em Viçosa foram maiores que os machos na maioria das características avaliadas em ambas as estação (seca e úmida). Os machos apresentaram somente duas características corporais maiores que as fêmeas. Diferenças morfométricas interpopulacionais em P. decempunctatus se correlacionaram à distância geográfica entre os locais de coleta.

Variabilidade em matrizes de acessos de espinheira-santa / Variability in matrices of espinheira-santa accessions

Maytenus ilicifolia e M. aquifolium são espécies nativas do Brasil, popularmente conhecidas como espinheira-santa, sendo indicadas para gastrite e para úlcera estomacal. A Embrapa Clima Temperado e a Universidade Federal de Pelotas (UFPel) mantêm um banco de germoplasma destas espécies. Com o objetivo de identificar a variabilidade fenotípica para alguns caracteres morfológicos em matrizes de espinheira-santa, estimar a dissimilaridade e agrupar os acessos através de análises multivariadas, 105 acessos foram caracterizados morfologicamente. Foram avaliados os caracteres comprimento e largura de fruto, número de sementes por fruto, comprimento e largura de folha, relação comprimento/largura de folha e número de espinhos por folha. Foi estimada a distância euclidiana e os acessos foram agrupados pelo método de otimização de Tocher. Foi observada uma ampla variabilidade para todos os caracteres analisados. O número de espinhos por folha foi o caráter que mais contribuiu para a divergência. Os caracteres morfológicos permitiram separar os acessos em sete grupos. A maior dissimilaridade foi entre os acessos 57 (M. ilicifolia) e 91 (M. aquifolium). Não foi evidenciada uma separação de acordo com a localização geográfica dos acessos. Na análise de agrupamento foram identificados dois grupos que apresentavam tanto acessos de M. ilicifolia quanto de M. aquifolium, o que indica proximidade filogenética entre estas espécies.

Maytenus ilicifolia and M. aquifolium are native Brazilian species popularly known as espinheira-santa, being indicated for gastritis and stomach ulcer. Embrapa Clima Temperado and Universidade Federal de Pelotas (UFPel) keep a gene bank of these species. With the objective of identifing phenotypic variability for some morphological characters in matrices of espinheira-santa, estimating dissimilarity and clustering accessions through multivariate analysis, 105 accessions had been morphologically characterized. The characteristics evaluated were fruit length, fruit width, number of seeds per fruit, leaf length, leaf width, leaf length/leaf width ratio and number of thorns per leaf. The euclidean distance was estimated and accessions were clustered by Tocher optimization method. A wide variability for all the characteristics analyzed was observed. The number of thorns per leaf was the characteristics that more contributed to the divergence. The morphological characteristics enabled to separate the accesses in seven clusters. The higher dissimilarity was between accessions 57 (M. ilicifolia) and 91 (M. aquifolium). There was no evidence of a separation in accordance to the geographic localization of the accessions. In the clustering analysis were identified two clusters that had accessions of both species, M. ilicifolia and M. aquifolium, indicating phylogenetic relatedness between these species.

Diversidade genética entre acessos de açaizeiro baseada em marcadores RAPD / Genetic diversity among accessions of assai palm based on rapd markers

Caracterizou-se a diversidade genética entre acessos de açaizeiro por meio de marcadores RAPD. Foram analisados 116 acessos conservados na coleção de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, Belém, PA com base em 28 primers. A matriz binária foi utilizada para a obtenção das dissimilaridades genéticas, pelo complemento artimético do coeficiente de similaridade de Dice, e também para a análise de bootstrap. As dissimilaridades genéticas foram representadas em um dendrograma gerado pelo método UPGMA. Os primers revelaram 263 bandas polimórficas e apresentaram ampla diversidade genética entre os acessos, variando de 0,06 a 0,67, sendo dois acessos de Chaves, PA, os mais divergentes. Mas, alguns acessos da mesma procedência apresentaram baixas dissimilaridades. O dendrograma permitiu a formação de oito grupos, delimitados pela dissimilaridade genética média (dg m: 0,40): dois formados por um único acesso; dois constituídos por dois acessos e os demais por vários subgrupos com acessos de diferentes locais. O número ideal de bandas para a estimativa da diversidade genética entre os 116 acessos foi de 180. Logo, o número de bandas empregado neste estudo foi eficiente para caracterizar com precisão as relações genéticas entre os acessos de açaizeiro. Os acessos divergentes devem ser úteis na formação de coleções nucleares e em programas de melhoramento genético.

One characterized the genetic diversity among accessions of assai palm using RAPD markers. One hundred and sixteen accessions conserved in the Embrapa Eastern Amazon germplasm collection, in Belém, PA, were analyzed using 28 primers. The data of the binary matrix were used to estimate the genetic dissimilarities using the arithmetical complement of Dice similarity coefficient and also for the bootstrap analysis. The genetic dissimilarities were represented in a dendrogram generated by the UPGMA method. The primers revealed 263 polymorphic RAPD loci presented wide genetic diversity among the accessions, varying from 0,06 to 0,67, being two accessions of the Chaves, PA the most divergent. But, some accessions of the same origin presented low dissimilarities. The dendrogram allowed the formation of eight groups delimited by the genetic mean dissimilarity (dg m: 0,40): two formed by a single accession; two constituted by two accessions and the others for several sub-groups with accessions of different origin. The ideal number of bands for estimating the genetic diversity among 116 accessions was 180. Therefore, the number of bands used in this study was efficient to characterize with precision the genetic relationship among the accessions of assai palm. The accessions divergent should be useful in the formation of nuclear collections and genetic breeding.

Genomic analysis of Mycobacterium foruitum by pulsed-filed gel electrophoresis / 영남의대학술지

Epidemiological studies are important in both the prevention and treatment of mycobacterial infections. This study was initiated to establish the pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method, which are not yet extensively studied. The most apprpriate restriction endonucleases included Dral, AsnI, and XbaI. The optimal PFGE condition was different according to the enzymes used. Two stage PFGE was performed, in case of DraI first stage was performed with 10 seconds of initial pulse and 15 seconds of findA pulse, while the second stage was performed with 60 seconds of initial pulse and 70 seconds of final pu',se. The electrophoresis time for DraI-PFGE was 14 hours for each stage. Electrophoresis was performed for 22 hours, in case of XbaI, with 3 seconds of initial pulse and 12 seconds of final pulse. Electrophoresis was performed for 22 hours, in case of AsnI, with 5 seconds of initial pulse and 25 seconds of final pulse. In all cases the voltage of the electrophoresis was maintained constantly at 200 voltage. Standard mycobacterial strains, which included Mycobacterium bovis BCG, M. tuberculosis, and M. fortuitum, could not be differentiated by PFGE analysis. PFGE analysis was performed to differentiate 9 clinically isolated M. fortuitum strains using AsnI. All M. fortuitum strains showed different genotypes except 2 strains. Cluster analysis divided M. fortuitum strains into 2 large groups. PFGE analysis was performed to further differentiate M. fortuitum isolates using XbaI. The undifferentiated 2 M. fortuitum strains showed different PFGE patterns with Xba I. Cluster analysis of the XbaI-PFGE patterns showed more complex grouping than AsnI-PFGE patterns, which showed that XbaI-PFGE analysis was better than AsnI-PFGE in M. fortuitum genotyping. The top dissimilarity values of AsnI-PFGE and XbaI-PFGE were 0.74 and 0.75, respectively. This value was higher than that of arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR) analysis and lower than that of restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. This suggested that PFGE can be used as a supportive or alternative genotyping method to RFLP analysis.